吉田秀司 (Hideji Yoshida) - マイポータル

基本情報

所属: 大阪医科薬科大学医学部医学科総合教育講座物理学教室教授

学位: 理学博士

ORCID iD: https://orcid.org/0000-0001-7213-4735
J-GLOBAL ID: 200901089395528989
researchmap会員ID: 1000215112

外部リンク: https://www.ompu.ac.jp/u-deps/phy/

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 分子生物学 /

経歴

論文

‘Tuning’ of ribosome levels mediated by RNase I and hibernating ribosomes

Atsushi Minami, Takehito Tanzawa, Zhuohao Yang, Takashi Funatsu, Tomohisa Kuzuyama, Hideji Yoshida, Takayuki Kato, Tetsuhiro Ogawa

2024年7月29日
Overview of the Molecular Mechanism of Bacterial Environmental Adaptation by Comprehensive Analysis

Tomohiro Shimada, Hideji Yoshida

International Journal of Molecular Sciences 2023年4月20日
Metal-Responsive Transcription Factors Co-Regulate Anti-Sigma Factor (Rsd) and Ribosome Dimerization Factor Expression.

Hideji Yoshida, Tomohiro Shimada, Akira Ishihama

International journal of molecular sciences 24(5) 2023年3月1日査読有り筆頭著者責任著者
Ribosomal Hibernation-Associated Factors in Escherichia coli

Yasushi Maki, Hideji Yoshida

Microorganisms 10(1) 33-33 2021年12月24日査読有り招待有り最終著者責任著者
Functional Sites of Ribosome Modulation Factor (RMF) Involved in the Formation of 100S Ribosome

Hideji Yoshida, Hideki Nakayama, Yasushi Maki, Masami Ueta, Chieko Wada, Akira Wada

Frontiers in Molecular Biosciences 8 661691-661691 2021年5月3日査読有り筆頭著者責任著者
Coordinated Regulation of Rsd and RMF for Simultaneous Hibernation of Transcription Apparatus and Translation Machinery in Stationary-Phase Escherichia coli

Hideji Yoshida, Akira Wada, Tomohiro Shimada, Yasushi Maki, Akira Ishihama

Frontiers in Genetics 10 1153-1153 2019年12月4日査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Coordinated Hibernation of Transcriptional and Translational Apparatus during Growth Transition of Escherichia coli to Stationary Phase

Hideji Yoshida, Tomohiro Shimada, Akira Ishihama

mSystems 3(5) e00057-18 2018年10月30日査読有り筆頭著者責任著者
Differential Regulation of rRNA and tRNA Transcription from the rRNA-tRNA Composite Operon in Escherichia coli

Hiraku Takada, Tomohiro Shimada, Debashish Dey, M. Zuhaib Quyyum, Masahiro Nakano, Akira Ishiguro, Hideji Yoshida, Kaneyoshi Yamamoto, Ranjan Sen, Akira Ishihama

PLOS ONE 11(12) 0163057 2016年12月22日査読有り
100Sリボソーム形成による翻訳制御とリボソームサイクル

Hideji Yoshida

生化学 88(2) 253-256 2016年4月25日招待有り筆頭著者責任著者
22aPS-107 回転軸の長さを半分にしたF1-ATPaseの回転とATP加水分解素過程との連動

遠藤愛子, 牧泰史, 吉田秀司, 横山謙, 古池晶

日本物理学会講演概要集 71 3317-3317 2016年
Systematic search for stress-response factors influencing the 100S ribosome formation

H. Yoshida, T. Shimada, Y. Maki, S. Furuike, M. Ueta, C. Wada, A. Wada, A. Ishihama

FEBS JOURNAL 281 293-293 2014年9月査読有り
The 100S ribosome: ribosomal hibernation induced by stress

Hideji Yoshida, Akira Wada

Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA 5(5) 723-732 2014年9月査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Conservation of two distinct types of 100S ribosome in bacteria

Masami Ueta, Chieko Wada, Takashi Daifuku, Yoshihiko Sako, Yoshitaka Bessho, Aya Kitamura, Ryosuke L. Ohniwa, Kazuya Morikawa, Hideji Yoshida, Takayuki Kato …

Genes to Cells 18(7) 554-574 2013年7月査読有り
Involvement of Cyclic AMP Receptor Protein in Regulation of the rmf Gene Encoding the Ribosome Modulation Factor in Escherichia coli

Tomohiro Shimada, Hideji Yoshida, Akira Ishihama

Journal of Bacteriology 195(10) 2212-2219 2013年5月15日査読有り筆頭著者
YqjD Is an Inner Membrane Protein Associated with Stationary-Phase Ribosomes in Escherichia coli

Hideji Yoshida, Yasushi Maki, Shou Furuike, Akiko Sakai, Masami Ueta, Akira Wada

Journal of Bacteriology 194(16) 4178-4183 2012年8月15日査読有り筆頭著者責任著者
Identification of phosphorylated serine-15 and -82 residues of HSPB1 in 5-fluorouracil-resistant colorectal cancer cells by proteomics

Akiko Sakai, Mieko Otani, Akiko Miyamoto, Hideji Yoshida, Eisuke Furuya, Nobuhiko Tanigawa

Journal of Proteomics 75(3) 806-818 2012年1月査読有り
3D1434 P18 飢餓的ストレス下における細菌の生存戦略(3D 蛋白質_構造機能相関3,日本生物物理学会第49回年会)

Kato Takayuki, Ueta Masami, Miyata Tomoko, Yoshida Hideji, Maki Yasushi, Furuike Shou, Sakai Akiko, Wada Akira, Namba Keiichi

生物物理 51 S120 2011年
Comparative proteomic analysis of the ribosomes in 5-fluorouracil resistance of a human colon cancer cell line using the radical-free and highly reducing method of two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis

Tanigawa

International Journal of Oncology 37(5) 2010年9月22日
Structure of the 100S Ribosome in the Hibernation Stage Revealed by Electron Cryomicroscopy

Takayuki Kato, Hideji Yoshida, Tomoko Miyata, Yasushi Maki, Akira Wada, Keiichi Namba

Structure 18(6) 719-724 2010年6月査読有り筆頭著者
3P032 極低温電子顕微鏡による100Sリボソームの立体構造解析(蛋白質-構造機能相関,第48回日本生物物理学会年会)

Kato Takayuki, Yoshida Hideji, Miyata Tomoko, Maki Yasushi, Furuike Shou, Ueta Masami, Sakai Akiko, Wada Akira, Namba Keiichi

生物物理 50(2) S150 2010年

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MISC

非弾性駆動軸によるF₁-ATPアーゼのトルク伝達

FURUIKE Shou, MAKI Yasushi, YOSHIDA Hideji

生物物理(Web) 62(Supplement 1-2) 2022年
栄養環境に依存した大腸菌RNAの状態

牧泰史, 上田雅美, 和田明, 古池晶, 中東憲治, 吉田秀司, 森浩禎

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 45th 2022年
大腸菌において様々なストレス下で転写・翻訳を同時制御する転写因子群の解析

吉田秀司, 島田友裕, 牧泰史, 古池晶, 石浜明

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 45th 2022年
ミクロの回転モーター(F₁-ATPase)では,弾性のないドライブシャフトでもトルクを伝達するか

古池晶, 牧泰史, 吉田秀司

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 77(2) 2022年
定常期の大腸菌におけるRNAの分解と蓄積

牧泰史, 上田雅美, 和田明, 古池晶, 中東憲治, 吉田秀司, 森浩禎

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 44th 2021年
ドライブシャフトの弾性をゼロにしたF1-ATPaseの回転

古池晶, 牧泰史, 吉田秀司

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 76(2) 2021年
柔らかいドライブシャフトを持つF₁-ATPaseのトルク伝達/発生

FURUIKE Shou, SOGA Naoki, MAKI Yasushi, YOSHIDA Hideji

生物物理(Web) 59(Supplement 1-2) 2019年
ドライブシャフトの弾性がF1-ATPaseの回転へ及ぼす影響

古池晶, 曽我直樹, 牧泰史, 吉田秀司

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 74(1) 2019年
定常期の大腸菌における遺伝子発現とRNA分解

牧泰史, 上田雅美, 和田明, 古池晶, 中東憲治, 吉田秀司, 森浩禎

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年
転写・翻訳活性の同時制御に関係する転写因子

吉田秀司, 島田友裕, 牧泰史, 古池晶, 上田雅美, 和田千恵子, 和田明, 石浜明

日本RNA学会年会要旨集 21st 2019年
弾性的に弱められたドライブシャフトがF1-ATPaseの回転へ及ぼす影響

古池晶, 曽我直樹, 牧泰史, 吉田秀司

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 74(2) 2019年
F1-ATPアーゼ回転に対する柔軟で不連続な伝導軸の影響

FURUIKE Shou, SOGA Naoki, MAKI Yasushi, YOSHIDA Hideji

生物物理(Web) 58(Supplement 1-2) 2018年
大腸菌の栄養環境変化と遺伝子の発現応答

牧泰史, 武藤愛, 上田雅美, 和田明, 古池晶, 中東憲治, 吉田秀司, 森浩禎

日本ゲノム微生物学会年会要旨集 12th 2018年
自由連結部位で繋がれた回転シャフトを持つF1-ATPaseの回転

古池晶, 曽我直樹, 牧泰史, 吉田秀司

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 73(1) 2018年
大腸菌の栄養環境と定常期のRNA分解

牧泰史, 上田雅美, 和田明, 古池晶, 吉田秀司

日本RNA学会年会要旨集 20th 2018年
100Sリボソームの形成に関与する転写因子

吉田秀司, 島田友裕, 牧泰史, 古池晶, 上田雅美, 和田千恵子, 和田明, 石浜明

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st 2018年
100Sリボソーム形成因子RMFの機能部位

吉田秀司, 中山秀喜, 牧泰史, 古池晶, 上田雅美, 和田千恵子, 和田明

日本RNA学会年会要旨集 20th 2018年
F1-ATPアーゼシャフトにおける単一αヘリックス単独では十分トルクを伝達不能であるが,固定子と密接に協調する

FURUIKE Shou, MAKI Yasushi, YOSHIDA Hideji

生物物理(Web) 57(Supplement 1-2) 2017年
定常期大腸菌のRNA-seq解析

牧泰史, 武藤愛, 上田雅美, 和田明, 古池晶, 中東憲治, 吉田秀司, 森浩禎

日本ゲノム微生物学会年会要旨集 11th 2017年
大腸菌における栄養環境の変化と遺伝子発現応答

牧泰史, 武藤愛, 上田雅美, 和田明, 古池晶, 中東憲治, 吉田秀司, 森浩禎

日本生化学会大会(Web) 90th 2017年

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講演・口頭発表等

Searching for functional sites on Ribosome Modulation Factor (RMF)

The 21st Annual Meeting of the RNA Society 2016年6月28日
Systematic search for stress-response factors influencing the 100S ribosome formation

The FEBS EMBO 2014 Conference 2014年8月30日
Transcription regulation by cAMP-CRP of the rmf gene for 100S ribosome formation

The 18th Annual Meeting of the RNA Society 2013年
Structure of the 100S ribosome in the Hibernation Stage

The 16th Annual Meeting of the RNA Society 2011年
Structure of the 100S ribosome revealed by electron cryomicroscopy

Ribosomes 2010 2010年
E.coli YqjD expresses during the stationary phase and binds to ribosomes

Thirteenth annual meeting of the RNA society 2008年
The events before the 100S ribosome formation

Ribosome: Form & Function 2007年
Competitive relationship between IF3 and RMF in 100S ribosome formation

20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology 2006年
Protein factors involved in the 100S ribosome formation

Functional RNAs and Regulatory Machinery 2006年
Ribosome binding proteins involved in the 100S formation

Tenth annual meeting of the RNA society 2005年
RMF inactivates ribosomes by covering PTase center and

The New Frontier of RNA science 2003年

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

Works(作品等)

共同研究・競争的資金等の研究課題

リボソームは備蓄栄養源か - 大腸菌リボソームの分解と再資源化機構の探索

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2024年4月 - 2027年3月

牧泰史, 吉田秀司
栄養飢餓とバクテリアの細胞死－生死選択の個体差の研究－

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

牧泰史, 吉田秀司
休眠段階におけるリボソームのタンパク質合成抑制機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2011年 - 2012年

加藤貴之, 宮田知子, 吉田秀司, 上田雅美, 和田明
微量な塩基性蛋白質を迅速に解析できる二次元電気泳動法の開発

科学技術振興機構 A-STEP 2010年10月 - 2011年3月

吉田秀司
細菌自身の蛋白質合成活性制御機構を利用した耐性菌出現低確率抗生剤の開発

科学技術振興機構シーズ発掘試験 2009年8月 - 2010年3月

吉田秀司
メタボリックシンドロームにおける低酸素応答による酸化プロテオミクス

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(C)) 基盤研究(C) 2008年 - 2010年

境晶子, 林哲也, 吉田秀司
大腸菌100Sリボソームの構造と形成および解消機構の解明

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(C)) 基盤研究(C) 2008年 - 2010年

吉田秀司, 牧泰史, 境晶子
細菌自身のリボソーム不活性化を利用した耐性菌出現低確率抗生剤の開発

科学技術振興機構シーズ発掘試験 2008年8月 - 2009年3月

吉田秀司
高性能RFHR・2D・PAGEのヒトプロテオミクス～抗癌剤抵抗性蛋白を探る

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(B)) 基盤研究(B) 2007年 - 2009年

和田明, 境晶子, 吉田秀司, 牧泰史, 谷川允彦, 古谷栄助, 和田千恵子, 上田雅美, 境晶子, 吉田秀司, 牧泰史, 谷川允信, 古谷栄助
生物が自発的に蛋白合成活性を休止させるシステムの解明

三菱財団第３６回三菱財団自然科学研究助成 2005年10月 - 2006年9月

吉田秀司
100Sリボソームの構造とその形成に関与する蛋白因子の機能の解析

文部科学省科学研究費補助金(特定領域研究) 特定領域研究 2005年 - 2006年

吉田秀司, 和田明
高性能RFHR・2D・PAGEによる一細胞一分子プロテオーム解析

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(B)) 基盤研究(B) 2003年 - 2005年

和田明, 境晶子, 吉田秀司
大腸菌定常期におけるリボソームの構造と動態

文部科学省科学研究費補助金(特定領域研究) 特定領域研究 2003年 - 2004年

和田明, 吉田秀司
Proteins associated to the stationary phase ribosomes in E. coli

（財）加藤記念バイオサイエンス研究振興財団国際交流助成金 2001年9月 - 2002年3月

吉田秀司
リボソームの100S〜70S変換―定常期における蛋白合成制御機構の研究―

文部科学省科学研究費補助金(特定領域研究) 特定領域研究 2002年 - 2002年

和田明, 吉田秀司
プロテオームの新しい解析手段としてのRFHR二次元電気泳動法の実用化

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(B)) 基盤研究(B) 1999年 - 2001年

和田明, 吉田秀司
大腸菌定常期における加齢現象の研究

文部科学省科学研究費補助金(萌芽的研究) 萌芽的研究 1999年 - 2000年

和田明, 吉田秀司
リボソーム研究

科学研究費補助金
RFHR二次元電気泳動法を用いたプロテオーム

科学研究費補助金
大腸菌100Sリボソームの解析

科学研究費補助金

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吉田秀司

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論文

MISC

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

Works(作品等)

共同研究・競争的資金等の研究課題

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