矢城陽一朗 (Yoichiro Yagi) - マイポータル

基本情報

所属: 岡山理科大学理工学研究科システム科学専攻教授

学位: 博士(工学)(岡山理科大学)

J-GLOBAL ID: 200901086882043029
researchmap会員ID: 1000229028

研究キーワード

研究分野

学歴

受賞

2013年9月

平成25年度日本シミュレーション学会学会賞「論文賞」, 日本シミュレーション学会

矢城陽一朗, 直島好伸
2013年

JSST 2012 Outstanding Presentation Award, 日本シミュレーション学会

矢城陽一朗
2012年

JSST 2011 Outstanding Presentation Award, 日本シミュレーション学会

矢城陽一朗
2011年

平成23年度日本シミュレーション学会学会賞「研究賞」, エイズ治療薬の効果に関する生体分子量子化学計算, 日本シミュレーション学会

矢城陽一朗
1996年

仁科賞

論文

Biomolecular Chemical Simulations on Enantioselectivity and Reactivity of Lipase Enzymes to Azulene Derivatives

Yoichiro Yagi, Takatomo Kimura, Makoto Kamezawa

Natural Product Communications 17(6) 1934578X2211085-1934578X2211085 2022年6月22日査読有り筆頭著者責任著者
FMODB: The World’s First Database of Quantum Mechanical Calculations for Biomacromolecules Based on the Fragment Molecular Orbital Method

Daisuke Takaya, Chiduru Watanabe, Shunpei Nagase, Kikuko Kamisaka, Yoshio Okiyama, Hirotomo Moriwaki, Hitomi Yuki, Tomohiro Sato, Noriyuki Kurita, Yoichiro Yagi …

Journal of Chemical Information and Modeling 61(2) 777-794 2021年1月29日査読有り
タンパク質の機能解明に向けた全電子量子化学計算－甘味タンパク質の電子状態と甘味度の関係－

矢城陽一朗, 木村崇知, 亀澤誠

オレオサイエンス 19(8) 315-322 2019年査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Biomolecular Chemical Simulations toward Elucidation of the Enantioselectivity and Reactivity of Lipases in Organic Synthesis 

Yoichiro Yagi, Takatomo Kimura, Makoto Kamezawa, Yoshinobu Naoshima

Chem-Bio Informatics Journal 18 21-31 2018年9月査読有り筆頭著者責任著者
Large-Scale Biomolecular Chemical Computations toward the Prediction of Burkholderia cepacia Lipase Enantioselectivity

Yoichiro Yagi, Takahisa Tanaka, Atsushi Imagawa, Yosuke Moriya, Yoshihiro Mori, Takatomo Kimura, Makoto Kamezawa, Yoshinobu Naoshima

Journal of Advanced Simulation in Science and Engineering 1(1) 141-160 2014年10月査読有り筆頭著者責任著者
Large-Scale All-Electron Quantum Chemical Calculation Toward a Sweet-Tasting Protein, Brazzein, and Its Mutants

Yagi Yoichiro, Naoshima Yoshinobu

日本シミュレーション学会論文誌 4(4) 127-135 2012年10月査読有り筆頭著者責任著者
Large-Scale Quantum Chemical Calculation on the Complexes of HIV-1 Protease and Inhibitors: A Relationship of Calculation Energies with Drug Effects of Inhibitors

Yoichiro Yagi, Yousuke Hattori, Yoshinobu Naoshima

Transaction of Japan Society for Simulation Technology 4(2) 41-50 2012年9月査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Temperature Dependence of Surface States with 3*3-.RAD.3*.RAD.3 Phase Transition on Sn Adsorbed Ge (111) Surface

Hiroko Kaji, Kiminori Kakitani, Yoichiro Yagi

e-Journal of Surface Science and Nanotechnology 8 349-353 2010年8月査読有り
Atomic displacements and electronic properties for 4 × 1–8 × 2 phase transition of In-adsorbed Si(111) surface

Y Yagi, H Kaji, K Kakitani, S Osanaga

Journal of Physics: Conference Series 100(7) 072039-072039 2008年3月1日査読有り筆頭著者
Transformation to soluble model for structural phase transition from (4 × 1) to (8 × “2”) of In-adsorbed Si(1 1 1) surface

Yoichiro Yagi, Akio Yoshimori, Kiminori Kakitani, Hiroko Kaji

Surface Science 601(6) 1642-1645 2007年3月査読有り筆頭著者責任著者
Semi-phenomenological Model for (4×1) to (8×“2”) Phase Transition of In-adsorbed Si(111) Surface

Yoichiro Yagi, Akio Yoshimori

Journal of the Physical Society of Japan 74(3) 831-834 2005年3月査読有り筆頭著者
Ｎｉ（１１１）表面吸着水素の原子配列と振動状態

第42回真空に関する連合講演会プロシ―ディングス 45(3) 258-261 2002年3月査読有り
Thermal desorption in the lattice gas model – H adsorbed on Si(100)

Y. Yagi, H. Kaji, K. Kakitani, A. Yoshimori

Surface Science 493(1-3) 126-130 2001年11月査読有り筆頭著者責任著者
Excitation spectra of incommensurate Li chains on a Cu(100) surface

Y. Yagi, K. Kakitani, A. Yoshimori

Surface Science 363(1-3) 331-336 1996年8月査読有り筆頭著者
Theoretical analysis of coverage-dependent rotational hindrance of PF3 adsorbed on Ru(001)

H. Kaji, K. Kakitani, Y. Yagi, A. Yoshimori

Surface Science 363(1-3) 326-330 1996年8月査読有り
Correlation function of adsorbed Au chain on Si(111) surface

Y. Yagi, K. Kakitani, A. Yoshimori

Surface Science 356(1-3) 47-52 1996年6月査読有り筆頭著者
Theory of Anisotropic Short Range Order on Solid Surfaces

Yoichiro Yagi

1996年3月査読有り
Step-induced short range order on Si(100) reconstructed surfaces

K Kakitani, R Sakagami, T Kawamura, Y Yagi, A Yoshimori

Surface Science 346(1-3) 55-63 1996年2月査読有り
Theory of γ-β Transition in the Superionic ConductorAg₃SI

Yoichiro Yagi, Katsuhiko Fujii, Hironobu Kondo

Journal of the Physical Society of Japan 64(3) 981-986 1995年3月15日査読有り筆頭著者
Theoretical analysis of thermal desorption spectra of hydrogen adsorbed on Si(100)

Y.Yagi, K.Kakitani, H.Kaji, A.Yoshimori

Proceeding of the second symposium on Atomic-scale Surface and Interface Dynamics 159-164 1995年査読有り

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MISC

タンパク質－有機化合物複合体のフラグメント分子軌道計算－酵素生体触媒反応と創薬への応用－

矢城陽一朗, 直島好伸

ケモインフォマティクス討論会予稿集 2015 72-73 2015年
24pXJ-2 Pb/Si(111),Sn/Si(111)表面の相転移に伴う表面電子状態変化(表面界面電子物性,領域9,表面・界面,結晶成長)

垣谷公徳, 加地博子, 矢城陽一朗, 長永伸剛

日本物理学会講演概要集 62(2) 964-964 2007年8月21日
20aPS-34 Pb/Ge(111)相転移の解析(ポスターセッション,領域9,表面・界面,結晶成長)

矢城陽一朗, 垣谷公徳, 加地博子, 長永伸剛

日本物理学会講演概要集 62(1) 902-902 2007年2月28日
20aPS-17 In/Si(111)における構造因子の温度依存性(ポスターセッション,領域9,表面・界面,結晶成長)

長永伸剛, 加地博子, 矢城陽一郎, 垣谷公徳

日本物理学会講演概要集 62(1) 898-898 2007年2月28日
30aPS-37 In/Si(111)(4x1)-(8x"2")相転移の詳細 : イジング模型の妥当性とSTM実験の解釈(30aPS 領域9ポスターセッション(表面,界面,結晶成長),領域9(表面・界面,結晶成長))

矢城陽一朗, 垣谷公徳, 加地博子, 吉森昭夫

日本物理学会講演概要集 61(1) 903-903 2006年3月4日
24aPS-146 In/Si(111)の相転移の理論模型とSTM像の解析(表面・界面, 結晶成長,領域9(表面・界面, 結晶成長))

矢城陽一朗, 垣谷公徳, 加地博子, 吉森昭夫

日本物理学会講演概要集 60(1) 839-839 2005年3月4日
28pPSB-31 Si(111)-Ag 系と Ni(111)-H 系の臨界指数

垣谷公徳, 加地博子, 矢城陽一朗, 吉森昭夫

日本物理学会講演概要集 58(1) 853-853 2003年3月6日
18aTF-4 Ni(111)吸着水素原子の非局在振動状態

加地博子, 垣谷公徳, 矢城陽一朗, 吉森昭夫

日本物理学会講演概要集 56(2) 731-731 2001年9月3日
銅表面吸着リチュウムの1次元的構造

吉森昭夫, 矢城陽一朗, 垣谷公徳

まてりあ : 日本金属学会会報 40(6) 588-585 2001年6月20日
29pPSA-35 Ni(111)吸着水素原子の振動状態

加地博子, 垣谷公徳, 矢城陽一朗, 吉森昭夫

日本物理学会講演概要集 56(1) 821-821 2001年3月9日
銅表面吸着リチュウムの１次元的構造

吉森昭夫, 矢城陽一朗, 垣谷公徳

まてりあ 40(6) 585-588 2001年
24pPSA-19 Au/Si(100)5x3.2の新しい構造模型

矢城陽一朗, 垣谷公徳, 加地博子, 吉森昭夫

日本物理学会講演概要集 55(2) 776-776 2000年9月10日
24aPS-28 Au/Si(100)5x3.2構造の秩序構造

矢城陽一郎, 加地博子, 垣谷公徳, 吉森昭夫

日本物理学会講演概要集 55(1) 784-784 2000年3月10日
24aPS-29 Ag/Si(111)√<3>×√<3>表面の構造相転移の模型

垣谷公徳, 加地博子, 矢城陽一朗, 吉森昭夫

日本物理学会講演概要集 55(1) 784-784 2000年3月10日
24aPS-43 Ru(001)表面吸着PF_3分子対の量子回転状態

加地博子, 垣谷公徳, 矢城陽一朗, 吉森昭夫

日本物理学会講演概要集 55(1) 787-787 2000年3月10日
26aPS-48 H/Si(100)の昇温脱離のモンテカルロシミュレーション

矢城陽一郎, 加地博子, 垣谷公穂, 吉森昭夫

日本物理学会講演概要集 54(2) 824-824 1999年9月3日
29a-PS-50 Pd(110)表面上の低被覆率吸着C_2H_4の短距離秩序

垣谷公徳, 加地博子, 矢城陽一朗, 吉森昭夫

日本物理学会講演概要集 54(1) 320-320 1999年3月15日
27a-PS-12 Ru(001)上のPF_3の基準振動

加地博子, 垣谷公徳, 矢城陽一朗, 吉森昭夫

日本物理学会講演概要集 53(2) 383-383 1998年9月5日
31a-PS-18 Ru(001)上のPF_3ギアネットワークの回転状態III

加地博子, 垣谷公徳, 矢城陽一朗, 吉森昭夫

日本物理学会講演概要集 53(1) 307-307 1998年3月10日
7a-PS-25 2水素化シリコンを含む水素吸着Si(100)の昇温脱離

矢城陽一朗, 垣谷公徳, 加地博子, 吉森昭夫

日本物理学会講演概要集 52(2) 361-361 1997年9月16日

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書籍等出版物

Recent Advances of the Fragment Molecular Orbital Method: Enhanced Performance and Applicability

(担当:共著)

Springer 2021年1月5日 (ISBN: 9811592349)
シミュレーション辞典

日本シミュレーション学会 (担当:分担執筆, 範囲:分子軌道法)

コロナ社 2012年2月 (ISBN: 9784339024586)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

半導体表面に形成された金属ナノ細線の理論的研究

フロンティア研究 2003年
Theory of Metal Nanowire on Semiconductor Surface

Frontier Research 2003年
シリコン表面吸着水素の昇温脱離に関する理論的研究

フロンティア研究 1997年 - 2000年
Theory of Thermal desorption of H on Si(100)

Frontier Research 1997年 - 2000年
固体表面における異方的短距離秩序の理論

フロンティア研究 1993年
Theory of Anisotropic Short Range Order on Soild Surfaces

Frontier Research 1993年

矢城陽一朗

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MISC

書籍等出版物

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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