永田宏次 (Koji Nagata) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院農学生命科学研究科応用生命化学専攻食品生物構造学研究室教授

学位: 博士(農学)(東京大学)

研究者番号: 30280788
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0002-4704-0603
J-GLOBAL ID: 200901040510243820
researchmap会員ID: 1000229485

外部リンク: https://park-ssl.itc.u-tokyo.ac.jp/fbsb/

研究キーワード

研究分野

経歴

2020年4月 - 現在

東京大学大学院農学生命科学研究科応用生命化学専攻 (教授)
2007年4月 - 2020年3月

東京大学大学院農学生命科学研究科応用生命化学専攻准教授
2005年12月 - 2007年3月

東京大学大学院農学生命科学研究科応用生命化学専攻助教授
2002年10月 - 2005年12月

東京大学大学院農学生命科学研究科応用生命化学専攻助手
1997年4月 - 2002年9月

東京大学生物生産工学研究センター助手（2000.04-2002.03 研究休職）
2000年10月 - 2002年3月

Imperial College London Research Associate
2000年4月 - 2002年3月

独立行政法人日本学術振興会海外特別研究員
2000年4月 - 2000年9月

Uppsala University Postdoctoral Fellow
1997年4月 - 1998年3月

東京都臨床医学総合研究所非常勤研究員
1995年4月 - 1997年3月

東京都臨床医学総合研究所研究員
1993年 - 1995年

日本学術振興会特別研究員DC2

受賞

2021年7月

日本生化学会 2021年(第29回）JB論文賞 Crystal structure of the complex of the interaction domains of Escherichia coli DnaB helicase and DnaC helicase loader: structural basis implying a distortion-accumulation mechanism for the DnaB ring opening caused by DnaC binding

Koji Nagata, Akitoshi Okada, Jun Ohtsuka, Takatoshi Ohkuri, Yusuke Akama, Yukari Sakiyama, Erika Miyazaki, Shoichiro Horita, Tsutomu Katayama, Tadashi Ueda, Masaru Tanokura
2007年3月

2007年農芸化学奨励賞発生・分化に関わるペプチド・タンパク質の立体構造解析と構造・機能相関
1999年

日本ペプチド学会平成11年度奨励賞カイコのインスリン族ペプチド、ボンビキシン-IIの立体構造と受容体認識部位
1998年

井上科学振興財団第14回（平成 9年度）井上研究奨励賞カイコのインスリン族ペプチド、ボンビキシン-IIの立体構造と受容体認識部位

論文

171

Structural model for ligand binding and channel opening of an insect gustatory receptor

Satoshi Morinaga, Koji Nagata, Sayoko Ihara, Tomohiro Yumita, Yoshihito Niimura, Koji Sato, Kazushige Touhara

Journal of Biological Chemistry 2022年10月
Lactic acid bacteria-derived γ-linolenic acid metabolites are PPARδ ligands that reduce lipid accumulation in human intestinal organoids.

Makoto Noguchi, Makoto Shimizu, Peng Lu, Yu Takahashi, Yoshio Yamauchi, Shintaro Sato, Hiroshi Kiyono, Shigenobu Kishino, Jun Ogawa, Koji Nagata, Ryuichiro Sato

Journal of Biological Chemistry 102534-102534 2022年9月
Analysis of Purine Metabolism to Elucidate the Pathogenesis of Acute Kidney Injury in Renal Hypouricemia

Miyamoto, D., Sato, N., Nagata, K., Sakai, Y., Sugihara, H., Ohashi, Y., Stiburkova, B., Sebesta, I., Ichida, K., Okamoto, K.

Biomedicines 10(7) 2022年
Adsorption kinetics and thermodynamics of toxic metal ions onto chitosan nanoparticles extracted from shrimp shells

Abomosallam, M., Elalfy, M., Zheng, Z., Nagata, K., Suzuki, M.

Nanotechnology for Environmental Engineering 7(1) 2022年
NMR and HPLC profiling of bee pollen products from different countries

Lu, P., Takiguchi, S., Honda, Y., Lu, Y., Mitsui, T., Kato, S., Kodera, R., Furihata, K., Zhang, M., Okamoto, K., Itoh, H., Suzuki, M., Kono, H., Nagata, K.

Food Chemistry: Molecular Sciences 5 2022年
Rosmarinic Acid and Sodium Citrate Have a Synergistic Bacteriostatic Effect against Vibrio Species by Inhibiting Iron Uptake.

Peng Lu, Miaomiao Sui, Mimin Zhang, Mengyao Wang, Takehiro Kamiya, Ken Okamoto, Hideaki Itoh, Suguru Okuda, Michio Suzuki, Tomiko Asakura, Toru Fujiwara, Koji Nagata

International journal of molecular sciences 22(23) 2021年12月1日
A glutamine sensor that directly activates TORC1

Mirai Tanigawa, Katsuyoshi Yamamoto, Satoru Nagatoishi, Koji Nagata, Daisuke Noshiro, Nobuo N. Noda, Kouhei Tsumoto, Tatsuya Maeda

Communications Biology 4(1) 2021年12月
Quercetin 3,5,7,3′,4′-pentamethyl ether from Kaempferia parviflora directly and effectively activates human SIRT1

Mimin Zhang, Peng Lu, Tohru Terada, Miaomiao Sui, Haruka Furuta, Kilico Iida, Yukie Katayama, Yi Lu, Ken Okamoto, Michio Suzuki, Tomiko Asakura, Kentaro Shimizu, Fumihiko Hakuno, Shin-Ichiro Takahashi, Norimoto Shimada, Jinwei Yang, Tsutomu Ishikawa, Jin Tatsuzaki, Koji Nagata

Communications Biology 4(1) 2021年12月
Fermented food Tempeh induces interleukin 12 and enhances macrophage phagocytosis.

Yoshihito Hosaka, Kei Itoh, Shun Matsutani, Shinya Kawate, Atsuko Miura, Yukaze Mizoura, Sayumi Yamada, Hiroshi Konno, Ewa Grave, Koji Nagata, Hideki Wakui, Hideaki Itoh

Journal of food biochemistry 45(11) e13958 2021年11月
Oxidative deamination of lysine residues by polyphenols generates an equilibrium of aldehyde and 2-piperidinol products.

Kosuke Yamaguchi, Masanori Itakura, Roma Kitazawa, Sei-Young Lim, Koji Nagata, Takahiro Shibata, Mitsugu Akagawa, Koji Uchida

The Journal of Biological Chemistry 297(3) 101035-101035 2021年7月31日
Functional analyses of chitinolytic enzymes in the formation of calcite prisms in Pinctada fucata.

Hiroyuki Kintsu, Alberto Pérez-Huerta, Shigeru Ohtsuka, Taiga Okumura, Shinsuke Ifuku, Koji Nagata, Toshihiro Kogure, Michio Suzuki

Micron (Oxford, England : 1993) 145 103063-103063 2021年6月
Identification and functional analysis of cadmium-binding protein in the visceral mass of Crassostrea gigas.

Zehua Zheng, Kazuhiro Kawakami, Dingkun Zhang, Lumi Negishi, Mohamed Abomosallam, Tomiko Asakura, Koji Nagata, Michio Suzuki

Scientific reports 11(1) 11306-11306 2021年5月28日
Gut microbiome of indonesian adults associated with obesity and type 2 diabetes: A cross-sectional study in an asian city, yogyakarta

Phatthanaphong Therdtatha, Yayi Song, Masaru Tanaka, Mariyatun Mariyatun, Maisaroh Almunifah, Nancy Eka Putri Manurung, Siska Indriarsih, Yi Lu, Koji Nagata, Katsuya Fukami, Tetsuo Ikeda, Yuan Kun Lee, Endang Sutriswati Rahayu, Jiro Nakayama

Microorganisms 9(5) 2021年5月
Application of 2,2′-dipyridyl disulfide-mediated thiazolidine ring-opening reaction to glycoprotein synthesis: Total chemical synthesis of evasin-3

Hidekazu Katayama, Koji Nagata

Journal of Peptide Science 27(2) 2021年2月
Purification, crystallization and X-ray analysis of Pf-SCP (sarcoplasmic Ca-binding protein), related to storage and transport of calcium in mantle of Pinctada fucata

Lingxiao Zhu, Liying Wang, Akihiro Matsuura, Mimin Zhang, Peng Lu, Kurin Iimura, Koji Nagata, Michio Suzuki

Protein Expression and Purification 178 105781-105781 2021年2月
Mechanism of self/nonself-discrimination in Brassica self-incompatibility

Kohji Murase, Yoshitaka Moriwaki, Tomoyuki Mori, Xiao Liu, Chiho Masaka, Yoshinobu Takada, Ryoko Maesaki, Masaki Mishima, Sota Fujii, Yoshinori Hirano, Zen Kawabe, Koji Nagata, Tohru Terada, Go Suzuki, Masao Watanabe, Kentaro Shimizu, Toshio Hakoshima, Seiji Takayama

Nature Communications 11(1) 2020年12月
Identification of methionine -rich insoluble proteins in the shell of the pearl oyster, Pinctada fucata.

Hiroyuki Kintsu, Ryo Nishimura, Lumi Negishi, Isao Kuriyama, Yasushi Tsuchihashi, Lingxiao Zhu, Koji Nagata, Michio Suzuki

Scientific reports 10(1) 18335-18335 2020年10月27日
Characterization of the chalky layer-derived EGF-like domain-containing protein (CgELC) in the pacific oyster, Crassostrea gigas.

Shihori Iwamoto, Keisuke Shimizu, Lumi Negishi, Nobuo Suzuki, Koji Nagata, Michio Suzuki

Journal of structural biology 212(1) 107594-107594 2020年10月1日
Crystal structure of the complex of the interaction domains of E. coli DnaB helicase and DnaC helicase loader: Structural basis implying a distortion-accumulation mechanism for the DnaB ring opening caused by DnaC binding.

Nagata K, Okada A, Ohtsuka J, Ohkuri T, Akama Y, Sakiyama Y, Miyazaki E, Horita S, Katayama T, Ueda T, Tanokura M

J. Biochem. 167 2020年2月査読有り
Modified forearm ischemic test in hypouricemic patients.

Ivan Sebesta, Daisuke Miyamoto, Blanka Stiburkova, Sarka Blahova, Nana Sato, Koji Nagata, Ken Okamoto, Shuichi Tsuruoka, Kimiyoshi Ichida

Nucleosides, nucleotides & nucleic acids 39(10-12) 1432-1439 2020年

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MISC

119

植物由来抗歯周病菌ペプチドの同定と作用機構解析

小澤友弥, ZHANG Mimin, LU Peng, 岡本研, 伊藤英晃, 鈴木道生, 花田耕介, 柘植尚志, 中曽根光, 米倉円佳, 永田宏次

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2021 2021年
カキ(Crassostrea gigas)軟体部におけるカドミウム結合タンパク質の同定と機能解析

鄭澤華, 川上和宏, 根岸瑠美, 朝倉富子, 永田宏次, 鈴木道生

マリンバイオテクノロジー学会大会講演要旨集 21st 2021年
アコヤガイ貝殻内のACC結合タンパク質の構造・機能解析

岩橋晴香, 荒城綾香, 根岸瑠美, 降旗一夫, 永田宏次, 鈴木道生

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2020 2020年
黒生姜由来フラボノイドKPMF-8によるSIRT1活性化機構解析

張迷敏, 陸鵬, 隋苗苗, 飯田季里子, 片山幸江, 鈴木道生, 楊金緯, 石川勉, 立崎仁, 永田宏次

植物化学シンポジウム 56th (CD-ROM) 2019年
ダイズ由来ペプチド,ルナシンの抗がん作用機構の解析

飯田季里子, 鈴木友璃葉, ZHANG Mimin, 片山幸江, LU Yi, 岡本研, 鈴木道生, 名倉敬仁, 西宏起, 伯野史彦, 片岡直行, 高橋伸一郎, 川上浩, 永田宏次

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2019 2019年
エチレン受容体の全長とリガンド結合領域の組換えタンパク質の発現

長谷川恵一, LU Peng, 高橋郁夫, 片山幸江, LU Yi, 岡本研, 鈴木道生, 中村英光, 中嶋正敏, 浅見忠男, 永田宏次

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2019 2019年
アコヤガイ貝殻内のACC結合タンパク質の構造・機能解析

岩橋晴香, 荒城綾香, 永田宏次, 根岸瑠美, 降旗一夫, 鈴木道生

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2019 2019年
共役ポリケトン還元酵素の基質特異性の構造基盤

宮川拓也, 秦慧民, 山村昭裕, 片岡道彦, 片岡道彦, 永井貴大, 北村苗穂子, 浦野信行, 浦野信行, 丸岡慎太郎, 大塚淳, 永田宏次, 清水昌, 田之倉優

バイオイメージング 22(2) 2013年
水酸化アミノ酸の立体選択的合成に有用なアルドラーゼ(asHPAL)-第一基質複合体の結晶構造決定と変異導入による反応機構解析

GUO Linjun, 岡井公彦, 間瀬朋子, IMAI Fabiana Lica, 永田宏次, 日比慎, 宮川拓也, 小川順, 田之倉優

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2013 2013年
水酸化アミノ酸の合成に有用なアルドラーゼ(asHPAL)の基質特異性に関する分子機構の解明

GUO Linjun, 岡井公彦, 間瀬朋子, IMAI FABIANA Lica, 永田宏次, 日比慎, 宮川拓也, 小川順, 田之倉優

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 13th 2013年
構造生物学を利用した機能未知タンパク質の機能解明

石橋純, 逸見光, 永田宏次, 田之倉優

蚕糸・昆虫バイオテック = Sanshi-konchu biotec 81(2) 125-129 2012年8月1日
日本農芸化学会大会

野田陽一, 新井博之, 井上順, 森直紀, 永田晋治, 伏信進矢, 加藤久典, 中嶋正敏, 野尻秀昭, 永田宏次

バイオサイエンスとインダストリー = Bioscience & industry 70(4) 285-293 2012年7月1日
B320 ヤエヤマサソリ毒液由来殺虫性ペプチドLaIT1のNMRによる溶液構造の決定(作用機構,抵抗性天然物化学,一般講演要旨)

宮下正弘, 堀田彰一朗, 宮川拓也, 中川好秋, 永田宏次, 田之倉優, 宮川恒

講演要旨集 (37) 135-135 2012年3月14日
Identification of the Amino-Acid Residues Important for the Recognition of Silkmoth Pheromone Biosynthesis-Activating Neuropeptide by Its Receptor

NAGATA Koji, KAWAI Takeshi, EBISAWA Tatsuki, HAYAKAWA Kou, LEE Jae Min, HULL J. Joe, MATSUMOTO Shogo, NAGASAWA Hiromichi, TANOKURA Masaru

Peptide science : proceedings of the ... Japanese Peptide Symposium 2011 181-182 2012年3月1日
Structure-Activity Relationship Study of the C-Terminal Part of Pheromone Biosynthesis-Activating Neuropeptide

KAWAI Takeshi, LEE Jae Min, NAGATA Koji, HULL J. Joe, MATSUMOTO Shogo, TANOKURA Masaru, NAGASAWA Hiromichi

Peptide science : proceedings of the ... Japanese Peptide Symposium 2011 175-178 2012年3月1日
Solution Structure and Functional Residues of a Short-Chain Insecticidal Toxin LaIT1 from the Venom of Scorpion Liocheles australasiae

MIYASHITA Masahiro, HORITA Shoichiro, MIYAKAWA Takuya, NAKAGAWA Yoshiaki, NAGATA Koji, MIYAGAWA Hisashi, TANOKURA Masaru

Peptide science : proceedings of the ... Japanese Peptide Symposium 2011 169-170 2012年3月1日
Agrobacterium tumefaciens由来キヌクリジノン還元酵素の高活性に関する構造基盤

HOU Feng, 宮川拓也, 片岡道彦, 片岡道彦, 熊代祥子, 竹下大二郎, 永田宏次, 清水昌, 清水昌, 田之倉優

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2012 2012年
腸球菌のクオラムセンシング阻害剤ZBzl-YAA5911の創製とその抗感染症剤としての効果検証

中山二郎, 横畑綾治, 松藤貴久, 鈴木崇, 永田宏次, 園元謙二

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 35th 2012年
Structure-activity relationship studies of the pheromone biosynthesis activating neuropeptide of the silkmoth, Bombyx mori

KAWAI Takeshi, NAGATA Koji, OKADA Akitoshi, HAYAKAWA Koh, HULL J. Joe, LEE Jae Min, MATSUMOTO Shogo, TANOKURA Masaru, NAGASAWA Hiromichi

Peptide science : proceedings of the ... Japanese Peptide Symposium 2010 126-126 2011年3月1日
Structure-based Functional Characterization of Oryctin, a Hemolymph Protein from the Coconut Rhinoceros Beetle, Oryctes Rhinoceros, As a Novel Serine Protease Inhibitor

HORITA Shoichiro, ISHIBASHI Jun, NAGATA Koji, MIYAKAWA Takuya, YAMAKAWA Minoru, TANOKURA Masaru

Peptide science : proceedings of the ... Japanese Peptide Symposium 2010 142-142 2011年3月1日

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書籍等出版物

ミクロの世界を可視化する in 科学の技法東京大学「初年次ゼミナール理科」テキスト (東京大学教養教育高度化機構初年次教育部門, 増田建, 坂口菊恵編)

永田宏次, 木下滋晴 (担当:分担執筆, 範囲:pp. 126-129,)

東京大学出版会 (東京) 2017年
溶液構造解析法 in 21世紀のバイオサイエンス実験農芸化学 (東京大学大学院農学生命科学研究科応用生命化学専攻・応用生命工学専攻編)

永田宏次, 宮川拓也 (担当:分担執筆, 範囲:pp. 150-151,)

朝倉書店 (東京). 2013年
ゲル濾過クロマトグラフィー in 21世紀のバイオサイエンス実験農芸化学 (東京大学大学院農学生命科学研究科応用生命化学専攻・応用生命工学専攻編),

永田宏次 (担当:分担執筆, 範囲:pp. 136-138,)

朝倉書店 (東京). 2013年
タンパク質試料の定量, 純度検定, 一次構造確認 in タンパク質の結晶化－回折構造生物学のために (坂部知平監修，相原茂夫編著)

永田宏次, 田之倉優 (担当:共著, 範囲:pp. 58-68,)

京都大学学術出版会 (京都) 2005年
クロマトグラフィーによる試料の分離精製 in タンパク質の結晶化－回折構造生物学のために (坂部知平監修，相原茂夫編著)

永田宏次, 田之倉優 (担当:共著, 範囲:pp. 51-58,)

京都大学学術出版会 (京都). 2005年
タンパク質の発現 in ゲノミクス・プロテオミクスの新展開－生物情報の解析と応用－(今中忠行編)

永田宏次, 田之倉優 (担当:共著, 範囲:pp. 534-538,)

エヌ・ティー・エス (東京) 2004年
タンパク質工学 in 分子生物学 (田沼靖一編)

田之倉優, 永田宏次 (担当:共著, 範囲:pp. 274-288,)

丸善(東京) 1999年
X線およびNMRによる三次元構造解析 in 魚介類筋肉タンパク質－その構造と機能 (西田清義編)

田之倉優, 永田宏次, 佐々木宏 (担当:共著, 範囲:pp. 38-45,)

恒星社厚生閣(東京) 1999年
Three-dimensional structure and receptor-recognition site of bombyxin-II, an insulin-like brain-secretory peptide of the silkmoth Bombyx mori. (共著)

Molecular Mechanisms of Insect Metamorphosis and Diapause(Industrial Publishing & Consulting, Inc. , Tokyo) 1995年

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

特開P2008-137961A タンパク質結晶化方法.

株式会社テクノメデイカ, 発明者, 鳥居徹, アルハックムハマッドイムラン, ルブラッスルエリック, 山崎浩樹, 永田宏次, 田之倉優
特開WO2007/063898 タンパク質結晶化方法及び装置並びにタンパク質結晶化処理装置

株式会社テクノメデイカ, 発明者, 鳥居徹, アルハックムハマッドイムラン, ルブラッスルエリック, 山崎浩樹, 永田宏次, 田之倉優
特開2005-289898 平滑筋弛緩剤とその有効成分の抽出方法

小濱一弘, 田之倉優, 発明者, 小濱一弘, 中村彰男, 吉山伸司, 田之倉優, 永田宏次

永田宏次

基本情報

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研究分野

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受賞

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MISC

書籍等出版物

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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