内海利男 (Toshio Uchiumi) - マイポータル

基本情報

所属: 新潟大学理学部理学科教授
: (兼任)自然科学研究科生命・食料科学専攻教授
: (兼任)自然科学研究科生命・食料科学専攻教授

学位: 医学博士「生化学」(新潟大学)
理工学修士「生化学」(青山学院大学)

研究者番号: 50143764
J-GLOBAL ID: 200901070977272463
researchmap会員ID: 1000241233

研究分野

経歴

2017年4月 - 現在

新潟大学, 理学部理学科, 教授
2004年4月 - 現在

新潟大学, 自然科学研究科生命・食料科学専攻, 教授
2003年10月 - 2017年3月

新潟大学, 理学部生物学科, 教授
1996年8月 - 2003年9月

信州大学繊維学部, 助教授
1981年6月 - 1996年7月

新潟大学, 医学部, 助手

委員歴

2010年4月 - 現在

日本RNA学会評議員
2008年10月 - 現在

日本生化学会評議員
2002年4月 - 2008年3月

日本RNA学会評議員
1999年4月 - 2002年3月

日本RNA学会会計幹事

受賞

2015年3月

BBB論文賞, 日本農芸化学会

内海利男
2009年6月

平成21年度JB論文賞, 日本生化学会

野村隆臣, 内海利男

論文

High-resolution crystal structure of peptidyl-tRNA hydrolase from Thermus thermophilus.

Ami Matsumoto, Yuji Uehara, Yoshihiro Shimizu, Takuya Ueda, Toshio Uchiumi, Kosuke Ito

Proteins 87(3) 226-235 2019年3月査読有り
The ribosomal stalk protein is crucial for the action of the conserved ATPase ABCE1.

Imai H, Abe T, Miyoshi T, Nishikawa SI, Ito K, Uchiumi T

Nucleic acids research 46(15) 7820-7830 2018年9月査読有り
The Interaction between the Ribosomal Stalk Proteins and Translation Initiation Factor 5B Promotes Translation Initiation.

Murakami R, Singh CR, Morris J, Tang L, Harmon I, Takasu A, Miyoshi T, Ito K, Asano K, Uchiumi T

Molecular and cellular biology 38(16) 2018年8月査読有り
The C-terminal helix of ribosomal P stalk recognizes a hydrophobic groove of elongation factor 2 in a novel fashion.

Tanzawa T, Kato K, Girodat D, Ose T, Kumakura Y, Wieden HJ, Uchiumi T, Tanaka I, Yao M

Nucleic acids research 46(6) 3232-3244 2018年4月査読有り
Binding of translation elongation factors to individual copies of the archaeal ribosomal stalk protein aP1 assembled onto aP0

Takayoshi Honda, Hirotatsu Imai, Takahiro Suzuki, Tomohiro Miyoshi, Kosuke Ito, Toshio Uchiumi

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 483(1) 153-158 2017年1月査読有り
Structural basis for the recognition of guide RNA and target DNA heteroduplex by Argonaute

Tomohiro Miyoshi, Kosuke Ito, Ryo Murakami, Toshio Uchiumi

NATURE COMMUNICATIONS 7 11846 2016年6月査読有り
Crystal structure of translation initiation factor 5B from the crenarchaeon Aeropyrum pernix

Ryo Murakami, Tomohiro Miyoshi, Toshio Uchiumi, Kosuke Ito

PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS 84(5) 712-717 2016年5月査読有り
Involvement of ribosomal protein L6 in assembly of functional 50S ribosomal subunit in Escherichia coli cells

Yuta Shigeno, Toshio Uchiumi, Takaomi Nomura

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 473(1) 237-242 2016年4月査読有り
Characterization of silk gland ribosomes from a bivoltine caddisfly, Stenopsyche marmorata: translational suppression of a silk protein in cold conditions

Takaomi Nomura, Miho Ito, Mai Kanamori, Yuta Shigeno, Toshio Uchiumi, Ryoichi Arai, Masuhiro Tsukada, Kimio Hirabayashi, Kousaku Ohkawa

Biochemical and Biophysical Research Communications 469(2) 210-215 2016年1月査読有り
Functional role of the C-terminal tail of the archaeal ribosomal stalk in recruitment of two elongation factors to the sarcin/ricin loop of 23S rRNA

Hirotatsu Imai, Tomohiro Miyoshi, Ryo Murakami, Kosuke Ito, Yoshizumi Ishino, Toshio Uchiumi

GENES TO CELLS 20(7) 613-624 2015年7月査読有り
Molecular insights into the interaction of the ribosomal stalk protein with elongation factor 1α.

Ito K, Honda T, Suzuki T, Miyoshi T, Murakami R, Yao M, Uchiumi T

Nucleic acids research 42(22) 14042-14052 2014年12月査読有り
Crystal structure of α-amylase from Oryza sativa: molecular insights into enzyme activity and thermostability.

Ochiai A, Sugai H, Harada K, Tanaka S, Ishiyama Y, Ito K, Tanaka T, Uchiumi T, Taniguchi M, Mitsui T

Bioscience, biotechnology, and biochemistry 78(6) 989-997 2014年6月査読有り
Solution structure of human P1•P2 heterodimer provides insights into the role of eukaryotic stalk in recruiting the ribosome-inactivating protein trichosanthin to the ribosome.

Lee KM, Yusa K, Chu LO, Yu CW, Oono M, Miyoshi T, Ito K, Shaw PC, Wong KB, Uchiumi T

Nucleic acids research 41(18) 8776-8787 2013年10月査読有り
[The dynamic functional structure of the ribosome discovered by the analysis of the autoimmune target].

Uchiumi T, Baba K, Onozuka M

Seikagaku. The Journal of Japanese Biochemical Society 85(10) 924-931 2013年10月査読有り
Molecular dissection of the silkworm ribosomal stalk complex: the role of multiple copies of the stalk proteins

Kentaro Baba, Kazuhiro Tumuraya, Isao Tanaka, Min Yao, Toshio Uchiumi

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 41(6) 3635-3643 2013年4月査読有り
Crystallization and preliminary X-ray analysis of peptidyl-tRNA hydrolase from Thermus thermophilus HB8

Ami Matsumoto, Yoshihiro Shimizu, Chie Takemoto, Takuya Ueda, Toshio Uchiumi, Kosuke Ito

Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications 69(3) 332-335 2013年3月査読有り
Identification of L-3-hydroxykynurenine O-sulfate in the buccal gland secretion of the parasitic lamprey, Lethenteron japonicum

Shoji Odani, Naoko Ito, Mai Hasegawa, Toshio Uchiumi, Sumihiro Hase

AMINO ACIDS 43(6) 2505-2512 2012年12月査読有り
Analysis of chimeric ribosomal stalk complexes from eukaryotic and bacterial sources: structural features responsible for specificity of translation factors

Masahiro Mochizuki, Masumi Kitamyo, Tomohiro Miyoshi, Kosuke Ito, Toshio Uchiumi

GENES TO CELLS 17(4) 273-284 2012年4月査読有り
Archaeal ribosomal stalk protein interacts with translation factors in a nucleotide-independent manner via its conserved C terminus

Naoko Nomura, Takayoshi Honda, Kentaro Baba, Takao Naganuma, Takehito Tanzawa, Fumio Arisaka, Masanori Noda, Susumu Uchiyama, Isao Tanaka, Min Yao …

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 109(10) 3748-3753 2012年3月査読有り
Crystallization and preliminary X-ray analysis of peptidyl-tRNA hydrolase from Escherichia coli in complex with the acceptor-TΨC domain of tRNA.

Ito K, Qi H, Shimizu Y, Murakami R, Miura K, Ueda T, Uchiumi T

Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications 67(Pt 12) 1566-1569 2011年12月査読有り

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MISC

リボソームの構造・機構研究に対するノーベル賞

内海利男

月刊マテリアルステージ 9(10) 1-3 2010年1月10日
リボソーム構造と創薬

内海利男

遺伝子医学 MOOK4-RNAと創薬 4 181-188 2006年1月31日
X線結晶解析から見えてきたリボソームの実像

内海利男

実験医学 20(10) 1408-1414 2002年7月1日

書籍等出版物

アーキア生物学

内海利男 (担当:共著)

共立出版 2017年10月
ハーパー・生化学（30版）

内海利男 (担当:共訳)

丸善出版社 2016年11月
ハーパー・生化学（29版）

内海利男 (担当:共訳)

丸善出版社 2013年10月
ハーパー・生化学（28版）

内海利男 (担当:共訳)

丸善株式会社 2011年1月 (ISBN: 9784621083284)
RNA研究の最前線

内海利男 (担当:共著)

シュプリンガー・フェアラーク東京 2000年9月30日 (ISBN: 4431708952)
遺伝子発現研究法 (生物化学実験法43)

内海利男 (担当:共著)

学会出版センター 2000年3月10日 (ISBN: 4762229407)

講演・口頭発表等

立体構造に基づくペプチジル tRNA 分解酵素の酵素学的機能解析

村上僚, 伊東孝祐, 望月正弘, 斉浩, 清水義宏, 三浦謹一郎, 上田卓也, 内海利男

第34回日本分子生物学会年会 2011年12月13日
高度好熱菌 T. thermophilus ペプチジル tRNA 加水分解酵素の X 線結晶構造解析

松本愛弥, 伊東孝祐, 竹本千重, 内海利男

第34回日本分子生物学会年会 2011年12月13日
リボトキシンによる rRNA 機能部位の脱プリン作用にはリボソーム stalk タンパク質の C 末端部位が関与する

遊佐和之, 三好智博, Ka-Ming Lee, 円山亮, 大野萌, 伊東孝祐, Kam-Bo Wong, 内海利男

第34回日本分子生物学会年会 2011年12月13日
真核リボソームstalkに存在する２対のヘテロ二量体の翻訳伸長反応における機能の非等価性

馬場健太朗, 姚閔, 田中勲, 内海利男

第34回日本分子生物学会年会 2011年12月13日
Omnipotent role of archaeal elongation factor 1 alpha in translation elongation, and termination, and quality control of protein synthesis

Kazuki Saito, Kan Kobayashi, Miki Wada, Izumi Kikuno, Akira Takusagawa, Masahiro Mochizuki, Toshio Uchiumi, Ryuichiro Ishitani, Osamu Nureki, Koichi Ito

The 16th Annual Meeting of the RNA Society 2011年6月14日
Introduction of a Lepidoptera-specific sequence within the GTPase-associated center of 28S rRNA into Escherichia coli 23S rRNA: Effects of the mutations

Ryo Maruyama, Kazuyuki Yusa, Masahiro Mochizuki, Kosuke Ito, Takaomi Nomura, Toshio Uchiumi

The 16th Annual Meeting of the RNA Society 2011年6月14日
Structural Basis of the Substrate Recognition Mechanisms of Peptidyl-tRNA Hydrolase from Escherichia coli

Kosuke Ito, Ryo Murakami, Hao Qi, Yoshihiro Shimizu, Kin-ichiro Miura, Takuya Ueda, Toshio Uchiumi

The 16th Annual Meeting of the RNA Society 2011年6月14日
Archaeal elongation factor acts as an omnipotent carrier GTPase in translational elongation, termination and mRNA surveillance

Osamu Nureki, Kan Kobayashi, Kazuki Saito, Toshio Uchiumi, Ryuichiro Ishitani, Toshifumi Inada, Koich Ito

The 16th Annual Meeting of the RNA Society 2011年6月14日
動物リボソームstalkヘテロ二量体の分子集合モードの解析

馬場健太朗, 姚閔, 田中勲, 内海利男

第11回日本蛋白質科学会年会 2011年6月7日
真核型リボソームのストークアンカータンパク質P0を構成する3ドメインの機能解析

望月正弘, 北名真澄, 伊東孝祐, 内海利男

第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会 2010年12月7日
翻訳伸長・終結過程の遺伝暗号解読における古細菌EF1αの普遍的機能の発見

斎藤和紀, 小林幹, 和田美紀, 菊野泉, 田草川彰, 望月正弘, 内海利男, 石谷隆一郎, 濡木理, 伊藤耕一

第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会 2010年12月7日
大腸菌リボソームタンパク質L11がもたらすrRNA-タンパク質間相互作用への影響

坂井貴昭, 橋本昌征, 内海利男, 野村隆臣

第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会 2010年12月7日
リボソーム変異型大腸菌株の真核生物タンパク質発現系への利用

伊東孝祐, 水口伊玖磨, 青木健, 浅妻悟, 三ツ井敏明, 内海利男

第5回無細胞生命科学研究会年会 2010年9月29日
動物リボソームストークタンパク質複合体 P0(P1-P2)2 に 5 コピー存在する共通Ｃ末端ドメインの機能解析

馬場健太朗, 姚閔, 田中勲, 内海利男

第12回日本RNA学会年会 2010年7月27日
翻訳伸長因子 eEF-1αのリボソーム認識領域の解析

久津見知, 澤田剛, 内海利男, 野村隆臣

第12回日本RNA学会年会 2010年7月27日
遺伝子組換えカイコ eEF-2 は何故トランスロケーション不活性型か？

澤田剛, 久津見知, 内海利男, 野村隆臣

第12回日本RNA学会年会 2010年7月27日
リボソームの翻訳因子作用中心に位置する動的タンパク質複合体

Toshio Uchiumi

第10回日本蛋白質科学会年会, ノーベル賞特別シンポジウム 2010年6月18日
The stalk protein complex at the ribosomal GTPase-associated center

Toshio Uchiumi

Current Issues of Ribosomal Structur and Function 2010年4月9日
Pth（Peptidyl-tRNA hydrolase）-tRNAミニへリックス複合体のX線結晶構造解析

伊東孝祐, 斉浩, 清水義宏, 三浦謹一郎, 上田卓也, 内海利男

第32回日本分子生物学会年会 2009年12月9日
リボソームGTPaseセンターを構成するストークと翻訳因子の相互作用解析

野村直子, 長沼孝雄, 姚閔, 内海利男, 田中勲

第32回日本分子生物学会年会 2009年12月9日

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担当経験のある科目(授業)

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

翻訳リサイクルにおけるリボソームstalk蛋白質の機能解明

日本学術振興会科学研究費補助金基盤研究（B) 2016年4月 - 2019年3月

内海利男
蛋白質の特定部位に自在に抗体を産出させる新たな免疫法の確立

日本学術振興会挑戦的萌芽研究 2015年4月 - 2017年3月

内海利男
極限環境下におけるアーキアの遺伝情報維持機構の解明

日本学術振興会科学研究費補助金基盤研究（A) 2014年4月 - 2017年3月

石野良純
蛋白質合成サイクルを駆動するリボソームのストーク複合体：高速・高効率化の分子機構

日本学術振興会科学研究費補助金基盤研究（B) 2012年4月 - 2015年3月

内海利男
自己抗原複合体ユニットを利用するテーラーメイド抗体産出系の作成

日本学術振興会挑戦的萌芽研究基盤研究(B) 2011年4月 - 2013年3月

内海利男
翻訳反応駆動部となるリボソームタンパク質複合体の分子機能解剖研究課題

日本学術振興会科学研究費補助金基盤研究（B) 2009年4月 - 2012年3月

内海利男
自己免疫の優先標的となるリボソーム機能部位のタンパク質・rRNA複合体構造解析

民間財団等内藤記念科学振興財団研究奨励金 2007年12月 - 2009年9月

内海利男
高度好熱菌リボソームストーク領域の機能・構造解析

独立行政法人理化学研究所共同研究 2004年1月 - 2008年3月
動物遺伝子の機能発現に適した新規翻訳系の開発：リボソーム機能工学の利用

日本学術振興会科学研究費補助金基盤研究B 基盤研究(B) 2004年4月 - 2007年3月

内海利男
リボソーム機能構造の分子解剖

文部科学省科学研究費助成事業特定領域研究 2002年4月 - 2007年3月

内海利男
リボソームの構造機能解析

文部科学省文部科学省新世紀重点研究創生プラン、タンパク3000プロジェクト 2002年4月 - 2007年3月
翻訳反応の駆動部となるリボソーム機能部位の結晶構造解析

文部科学省特定領域研究 2001年4月 - 2003年3月

内海利男
リボソームRNAの高度保存部位に見られる蚕に特異的な塩基配列とその機能解析

日本学術振興会科学研究費補助金基盤研究（C) 2000年4月 - 2003年3月

内海利男
リボソームGTPaseセンターにおけるrRNAとタンパク質の機能的相互作用

文部科学省特定領域研究（A) 1997年4月 - 2001年3月

内海利男

産業財産権

特願2016-120039 抗原結合用キャリア及びその使用

内海利男
特開2007-300858 大腸菌を用いたタンパク質の合成方法

内海利男