種田晃人 (Akito Taneda) - マイポータル

基本情報

学位: 修士(工学)(東北大学)
博士(工学)(東北大学)

J-GLOBAL ID: 200901010894773107
researchmap会員ID: 1000248103

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研究キーワード

研究分野

受賞

1997年

財団法人青葉工学振興会第1回「及川研究奨励賞」

論文

Coincident sequence-specific RNA degradation of linked transgenes in the plant genome

Megumi Kasai, Maiko Koseki, Kazunori Goto, Chikara Masuta, Shiho Ishii, Roger P. Hellens, Akito Taneda, Akira Kanazawa

Plant Molecular Biology 78(3) 259-273 2012年2月査読有り
Multi-objective genetic algorithm for pseudoknotted rna sequence design

Akito Taneda

Frontiers in Genetics 3 2012年査読有り
Accumulation of Potato spindle tuber viroid-specific small RNAs is accompanied by specific changes in gene expression in two tomato cultivars

Ying Wang, Makoto Shibuya, Akito Taneda, Tasuku Kurauchi, Mineo Senda, Robert A. Owens, Teruo Sano

Virology 413(1) 72-83 2011年4月25日査読有り
A web server for multi-objective pairwise RNA sequence alignment with an index for selecting accurate alignments

Akito Taneda

IPSJ Transactions on Bioinformatics 4 2-8 2011年査読有り
Multi-objective pairwise RNA sequence alignment

Akito Taneda

BIOINFORMATICS 26(19) 2383-2390 2010年10月査読有り
A small nucleolar RNA functions in rRNA processing in Caenorhabditis elegans

Yusuke Hokii, Yumi Sasano, Mayu Sato, Hiroshi Sakamoto, Kazumi Sakata, Ryuzo Shingai, Akito Taneda, Shigenori Oka, Hyouta Himeno, Akira Muto …

Nucleic Acids Research 38(17) 5909-5918 2010年5月11日査読有り
Characterization of a new Apple dimple fruit viroid variant that causes yellow dimple fruit formation in 'Fuji' apple trees

Ying-Hong He, Sayaka Isono, Yoko Kawaguchi-Ito, Akito Taneda, Ken-ichi Kondo, Akihiko Iijima, Kazuaki Tanaka, Teruo Sano

Journal of General Plant Pathology 76(5) 324-330 2010年査読有り
Endogenous short interfering RNAs of chalcone synthase genes associated with inhibition of seed coat pigmentation in soybean

Tasuku Kurauchi, Takuro Matsumoto, Akito Taneda, Teruo Sano, Mineo Senda

Breeding Science 59(4) 419-426 2009年査読有り
An efficient genetic algorithm for structural RNA pairwise alignment and its application to non-coding RNA discovery in yeast

Akito Taneda

BMC Bioinformatics 9 2008年12月5日査読有り
Tight-binding method for Cu clusters; Ground state studies of Cu-3-Cu-12

A Taneda, K Esfarjani, Y Hashi, Y Kawazoe

SIMILARITIES AND DIFFERENCES BETWEEN ATOMIC NUCLEI AND CLUSTERS (416) 471-474 1998年査読有り

MISC

Cofolga: a genetic algorithm for finding the common folding of two RNAs（単著）

Comput. Biol. Chem. 29(2) 111-119 2005年4月
Cofolga: a genetic algorithm for finding the common folding of two RNAs（単著）

Comput. Biol. Chem. 29(2), 111-119. 2005年
Adplot: detection and visualization of repetitive patterns in complete genomes（単著）

Bioinformatics. Mar 22;. Epub 2004 Jan 22. 20(5) 701-708 2004年3月22日
Adplot: detection and visualization of repetitive patterns in complete genomes

A Taneda

BIOINFORMATICS 20(5) 701-U316 2004年3月
Automatic brain tissue extraction method using erosion-dilation treatment (BREED) from three-dimensional magnetic resonance imaging T1-weighted data（共著）

J. Comput. Assist. Tomogr. 26(6) 927-932 2002年11月
Automatic brain tissue extraction method using erosion-dilation treatment (BREED) from three-dimensional magnetic resonance imaging T1-weighted data

N Miura, A Taneda, K Shida, R Kawashima, Y Kawazoe, H Fukuda, T Shimizu

JOURNAL OF COMPUTER ASSISTED TOMOGRAPHY 26(6) 927-932 2002年11月
Automatic Brain Tissue Segmentation Method from MRI T1-weighted Data

Miura N, Taneda A, Shida K, Kawashima R, Fukuda H, Kawazoe Y, Shimizu T

8th International Conference on Functional Mapping of the Human Brain 2002年6月査読有り
3次元頭部MRI画像脳領域自動抽出法の提案とその性能評価

三浦直樹, 種田晃人, 志田和人, 川島隆太, 川添良幸, 福田寛, 清水俊夫

情報処理学会全国大会講演論文集 64th(2) 2.243-2.244 2002年3月12日
Stable disordered structures of vanadium clusters(共著)

TANEDA A, SHIMIZU T, KAWAZOE Y

Journal of Physics : Condensed Matter 13(16) L305-L312 2001年4月
Stable disordered structures of vanadium clusters

A Taneda, T Shimizu, Y Kawazoe

JOURNAL OF PHYSICS-CONDENSED MATTER 13(16) L305-L312 2001年4月
Ground state structures of neutral and charged Ti clusters containing 2 to 16 atoms(共著)

Materials Transactions, JIM 41(5) 635-638 2000年5月
Ground state structures of neutral and charged Ti clusters containing 2 to 16 atoms

A Taneda, Y Kawazoe

MATERIALS TRANSACTIONS JIM 41(5) 635-638 2000年5月
タイトバインディング分子動力学法による3d遷移金属クラスターの構造と磁性(共著)

超微粒子とクラスター懇談会第4回研究会講演論文集 2000年
A tight-binding molecular-dynamics study of copper clusters(共著)

Materials Transactions, JIM 40(11) 1255-1257 1999年11月
Stable Structures of Neutral and Chaged Clusters by Self-Consistent Tight-Binding Molecular-Dynamics(共著)

Materials Transactions, JIM 40(9) 859-862 1999年9月
電荷移動を考慮したタイトバインディング分子動力学法による遷移金属クラスターの安定構造(共著)

超微粒子とクラスター懇談会第3回研究会講演予稿集 59-62 1999年
Structure and Magnetism of Small Fe Clusters(共著)

Taneda A., Kawazoe Y.

Journal of the Magnetics Society of Japan 23(1) 679-681 1999年
Structure and Magnetism of Small Fe Clusters

Taneda A., Kawazoe Y.

日本応用磁気学会誌 23(1) 679-681 1999年
Stable Structures of Neutral and Chaged Clusters by Self-Consistent Tight-Binding Molecular-Dynamics(共著)

Materials Transactions, JIM 40(9) 859-862 1999年
Tight-binding molecular-dynamics study of copper clusters

Akito Taneda, Yoshiyuki Kawazoe

Materials Transactions, JIM 40(11) 1255-1257 1999年

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書籍等出版物

Tight-binding method for Cu clusters ; Ground state studies of Cu₃-Cu12(共著)

SIMILARITIES AND DIFFERENCES BETWEEN ATOMIC NUCLEI AND CLUSTERS, The American Institute of Physics 1998年
Tight-binding method for Cu clusters ; Ground state studies of Cu₃-Cu12(共著)

SIMILARITIES AND DIFFERENCES BETWEEN ATOMIC NUCLEI AND CLUSTERS, The American Institute of Physics 1998年

所属学協会

Works(作品等)

共同研究・競争的資金等の研究課題

タンデム接続されたRNAスイッチのリガンド結合ダイナミクスシミュレーション

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

種田晃人
シュードノット構造を考慮したRNA二次構造分布ダイナミクスのシミュレーション

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2018年4月 - 2022年3月

種田晃人
ダイアモンド・ブラックファン貧血の発症機構の解明と新規治療標的分子の同定

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2017年4月 - 2020年3月

土岐力, 種田晃人
人工ＲＮＡ回路のコンピュータ援用自動設計

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2015年4月 - 2019年3月

種田晃人
環状ＲＮＡ病原体ウイロイドの病原性－miＲＮＡ/遺伝子発現ネットワーク撹乱作用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2015年4月 - 2018年3月

佐野輝男, 種田晃人, 葛西厚史
構造変化を伴う機能性ＲＮＡのバイオインフォマティクス

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2012年4月 - 2015年3月

種田晃人
ウイロイド特異的スモールＲＮＡの品種・組織特異的生合成経路と病原性発現機構の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2012年4月 - 2015年3月

佐野輝男, 原田竹雄, 種田晃人
真核生物ゲノムにおけるRNAインタラクトーム予測

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2010年 - 2011年

種田晃人
自然栽培リンゴ樹の自然免疫獲得機構と葉・根圏微生物相互作用の大規模塩基配列解析

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2010年 - 2011年

佐野輝男, 柏木明子, 種田晃人
シュードノット構造を持つ真核生物非翻訳RNAの網羅的探索

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2007年 - 2008年

種田晃人
ノンコーディングRNA病原体"ウイロイド"の自律複製能と病原性発現の分子機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2006年 - 2008年

佐野輝男, 千田峰生, 種田晃人
ペアワイズ比較ゲノムによる新規非翻訳RNAの探索

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2005年 - 2006年

種田晃人
非翻訳RNAのための構造予測・遺伝子予測手法の開発

2003年
Structure and gene prediction of non-coding RNAs

2003年
反復DNA配列の検出および可視化アルゴリズム

2001年
Algorithm for detecting and analysing DNA repeat sequences

2001年
遷移金属クラスターの物性

1996年
Physical properties of transition metal clusters