
門田 幸二
カドタ コウジ (Koji Kadota)
更新日: 01/10
基本情報
- 所属
- 東京大学 大学院農学生命科学研究科 アグリバイオインフォマティクス教育研究ユニット 准教授
- (兼任)大学院情報学環・学際情報学府 総合分析情報学コース 准教授
- (兼任)微生物科学イノベーション連携研究機構 准教授
- 学位
-
博士(農学)(2002年3月 東京大学)
- 研究者番号
- 60392221
- ORCID iD
https://orcid.org/0000-0002-3907-4336
- J-GLOBAL ID
- 200901092851874372
- Researcher ID
- C-9168-2011
- researchmap会員ID
- 1000292808
- 外部リンク
バイオインフォマティクス分野の教育関連業務がエフォートの大半を占めるかなりユニークなヒトです。おそらく公式には、教育はアグリバイオインフォマティクス教育研究プログラム、研究は生命情報解析研究室という感じですが、実質的には前者の部分集合が後者という感じです。
研究のほうは、トランスクリプトーム解析手法の開発がメインではありますが、バイオインフォマティクス分野の研究全般を取り扱います。アルゴリズムやGUI開発などのIT上級者向けの研究テーマから、わからないヒトの気持ちに寄り添ったデータ解析ガイドラインの構築まで、寄せられるニーズや学生のスキルに応じた多様な研究を行います。革新的な実験技術やAIの進展を意識しつつ、実際に役立つソフトウェア開発を目指す独創的な研究スタイルを志向しています。大学院受験やもう少し具体的な研究テーマの詳細は、生命情報解析研究室のウェブページをご覧ください。
教育のほうは、上記の教育プログラムの活動の一環として、2022年10月に「Web連携テキスト バイオインフォマティクス」という教科書を刊行しています。
研究キーワード
11経歴
8-
2022年4月 - 現在
-
2020年4月 - 2022年3月
-
2018年4月 - 2020年3月
-
2012年4月 - 2018年3月
-
2007年4月 - 2012年3月
-
2005年2月 - 2007年3月
-
2003年11月 - 2005年2月
-
2002年4月 - 2003年10月
学歴
4-
1999年4月 - 2002年3月
-
1997年4月 - 1999年3月
-
1995年4月 - 1997年3月
-
1990年4月 - 1995年3月
委員歴
12-
2009年4月 - 現在
-
2020年11月 - 2021年3月
-
2019年7月 - 2021年3月
-
2019年11月 - 2020年3月
-
2017年4月 - 2019年3月
-
2016年8月 - 2018年7月
-
2017年5月 - 2017年7月
-
2010年 - 2017年
-
2014年4月 - 2016年3月
-
2013年10月 - 2014年3月
-
2013年 - 2013年
-
2006年 - 2007年
受賞
6-
2021年3月
-
2018年8月
論文
54-
MethodsX 14 103149-103149 2025年6月 最終著者責任著者
-
MethodsX 12 102518-102518 2024年6月
-
BMC Bioinformatics 22(1) 511 2021年10月 査読有り最終著者責任著者
-
Frontiers in Genetics 11 941 2020年9月4日 査読有り筆頭著者責任著者
-
The New phytologist 227(5) 1434-1452 2020年9月 査読有り
-
Bioinform Biol Insights 13 1177932219860817 2019年7月 査読有り
-
BMC Res Notes 12 133 2019年3月 査読有り
-
PLoS Genetics 14(10) e1007651 2018年10月 査読有り
-
Biological Procedures Online 20(1) 5-5 2018年3月1日 査読有り
-
INSECT BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY 82 11-20 2017年3月 査読有り
-
Research Journal of Life Sciences, Bioinformatics, Pharmaceutical, and Chemical Sciences (RJLBPCS) 3 1-26 2017年 査読有り
-
BMC BIOINFORMATICS 16 361 2015年11月 査読有り
-
MUSCLE & NERVE 51(2) 276-281 2015年2月 査読有り
-
BMC BIOINFORMATICS 14 219 2013年7月 査読有り
-
ALGORITHMS FOR MOLECULAR BIOLOGY 7 5 2012年4月 査読有り
-
RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY 17(12) 2144-2151 2011年12月 査読有り
-
RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY 17(7) 1401-1407 2011年7月 査読有り
-
BMC BIOINFORMATICS 12 227 2011年6月 査読有り
-
JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY 92(1) 200-203 2011年1月 査読有り
MISC
48-
日本乳酸菌学会誌 35(3) 185-193 2024年10月 最終著者責任著者
-
日本乳酸菌学会誌 35(2) 121-128 2024年6月 最終著者責任著者
-
日本乳酸菌学会誌 35(1) 51-58 2024年3月 最終著者責任著者
-
培風館発行 大学用 図書目録 B 2024 34-34 2024年
-
日本乳酸菌学会誌 34(2) 83-90 2023年7月 最終著者責任著者
-
日本乳酸菌学会誌 34(1) 21-29 2023年3月 最終著者責任著者
-
日本乳酸菌学会誌 33(3) 195-205 2022年11月 最終著者責任著者
-
日本乳酸菌学会誌 33(2) 94-103 2022年6月 最終著者責任著者
-
日本乳酸菌学会誌 32(3) 129-137 2021年11月 筆頭著者責任著者
-
日本乳酸菌学会誌 32(3) 123-128 2021年11月 筆頭著者責任著者
-
研究紀要「東京大学大学院情報学環紀要 情報学研究」 (99) 33-36 2020年10月
-
バイオインフォマティクス学会ニュースレター (37) 6-6 2020年3月
-
日本乳酸菌学会誌 31(1) 25-34 2020年 責任著者
-
日本乳酸菌学会誌 30(2) 153-161 2019年11月 招待有り
-
日本乳酸菌学会誌 30(1) 38-45 2019年3月 招待有り
-
日本乳酸菌学会誌 29(2) 79-88 2018年7月 責任著者
-
日本乳酸菌学会誌 28(3) 167-175 2017年11月 招待有り
-
日本乳酸菌学会誌 28(2) 94-100 2017年7月 招待有り
-
日本乳酸菌学会誌 28(1) 3-11 2017年3月 招待有り
-
日本乳酸菌学会誌 27(3) 187-195 2016年11月 招待有り
書籍等出版物
13-
羊土社 2023年9月 (ISBN: 9784758122672)
-
培風館 2022年10月 (ISBN: 9784563078324)
-
丸善出版 2022年1月 (ISBN: 9784621306604)
-
羊土社 2019年
-
講談社サイエンティフィク 2018年11月
-
共立出版 2014年4月 (ISBN: 9784320123700)
-
シーエムシー出版 2013年9月
-
NTS 2010年4月 (ISBN: 9784860432706)
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羊土社 2008年4月 (ISBN: 9784758101738)
-
オーム社 2004年
-
メディカル・サイエンス・インターナショナル 2002年
-
共立出版 2001年
-
中経出版 2001年
講演・口頭発表等
64-
バイオインフォマティクス人材育成講座 中級コース 2023年9月9日 招待有り
-
計算生命科学の基礎9 2022年10月5日 招待有り
-
日本農芸化学会 中部支部 第190回例会 2021年9月18日 招待有り
-
データサイエンス講習会~データ解析環境Rの基礎と応用~ 2021年3月9日
-
数理生物学セミナー2020@TMDU 2020年11月14日 招待有り
-
データサイエンス講習会 2020年2月17日
-
データサイエンス講習会 2020年2月7日
-
データサイエンス講習会 2020年2月6日
-
バイオインフォマティクス解析集中トレーニングコース 2019年8月28日 招待有り
-
バイオインフォマティクス・フォーラム2019 2019年8月24日 招待有り
-
バイオインフォマティクス講習会 2019年2月19日
-
JSBi九州地域部会セミナー鹿児島2018 2018年5月25日 招待有り
-
平成29年度NGSハンズオン講習会 2017年8月30日
-
平成29年度NGSハンズオン講習会 2017年8月29日
-
平成28年度NGSハンズオン講習会 2016年8月4日
-
平成28年度NGSハンズオン講習会 2016年8月3日
-
平成28年度NGSハンズオン講習会 2016年8月2日
-
平成28年度NGSハンズオン講習会 2016年8月1日
-
平成28年度NGSハンズオン講習会 2016年7月22日
-
平成28年度NGSハンズオン講習会 2016年7月21日
担当経験のある科目(授業)
16共同研究・競争的資金等の研究課題
13-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C) 基盤研究(C) 2021年4月 - 2025年3月
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C) 基盤研究(C) 2018年4月 - 2022年3月
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C) 基盤研究(C) 2015年10月 - 2019年3月
-
JST-NBDC 共同研究 2017年4月 - 2018年3月
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B) 基盤研究(B) 2013年4月 - 2017年3月
-
JST-NBDC 共同研究 2016年4月 - 2017年3月
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2010年4月 - 2016年3月
-
JST-NBDC 共同研究 2015年4月 - 2016年3月
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C) 基盤研究(C) 2012年4月 - 2015年3月
-
JST-NBDC 共同研究 2014年4月 - 2015年3月
-
科学研究費補助金・新学術領域研究(研究領域提案型) 2010年6月 - 2015年3月
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日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究(B) 若手研究(B) 2009年 - 2011年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究(B) 若手研究(B) 2007年 - 2008年
社会貢献活動
10