2005年 - 2009年
共生、相互作用など複雑なゲノム構成系を解析するための情報基盤研究
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特定領域研究 特定領域研究
生物の特徴である普遍性と多様性のメカニズムを解明するために、配列データを整備し、ゲノム比較を行うシステムを開発した。メタゲノム情報から属分類解析を行うツールを開発し、腸内細菌叢を解析し、離乳後で細菌叢が劇的に変化することを明らかにした。また、細菌叢解析用の16SrDNA情報を用いたマイクロアレイを開発した。最後に、遺伝子発現データに基づく疾患等の責任遺伝子群の識別能力の高いカーネル部分空間法を開発した。
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- 課題番号 : 17018026
- 体系的課題番号 : JP17018026