山口知宏 (Tomohiro Yamaguchi) - マイポータル

基本情報

所属: Veneno Technologies株式会社研究開発部上級研究員

学位: 理学博士(京都大学)

J-GLOBAL ID: 200901095069462617
researchmap会員ID: 1000312240

研究キーワード

研究分野

経歴

2022年7月 - 現在

Veneno Technologies株式会社, 研究開発部, 上級研究員
2019年4月 - 2022年1月

株式会社FuturedMe, 研究開発部ケミカルバイオロジーチーム, 主任研究員
2008年9月 - 2019年3月

国立大学法人京都大学大学院薬学研究科, 助教
2007年3月 - 2008年8月

独立行政法人理化学研究所播磨研究所, 研究員
2006年3月 - 2007年2月

社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム, 特別研究員
2002年6月 - 2006年2月

国立大学法人九州大学付属病院, 検査部, 助手

学歴

論文

Structure‐based alteration of tryptophan residues of the multidrug transporter CmABCB1 to assess substrate binding using fluorescence spectroscopy

Yoshiki Inoue, Tomohiro Yamaguchi, Tetsuo Otsuka, Yuto Utsunomiya, Dongqing Pan, Haruo Ogawa, Hiroaki Kato

Protein Science 31(6) 2022年6月
Inward- and outward-facing X-ray crystal structures of homodimeric P-glycoprotein CmABCB1

A. Kodan, T. Yamaguchi, T. Nakatsu, K. Matsuoka, Y. Kimura, K. Ueda, H. Kato

Nature Communications 10(1) Article number: 88-88 2019年1月査読有り
Experimental phase determination with selenome¬thionine or mercury-derivatization in serial femtosecond crystallography

IUCrJ 4 639-647 2017年9月査読有り
ホタルの発光色と酵素-基質間相互作用との立体構造に基づいた関係

飯尾一輝, 山口知宏, 村井智洋, 宇都宮裕人, 大西弘晃, 中津亨, 加藤博章

ELCAS Journal 2 53-57 2017年3月査読有り
シゾン由来P糖タンパク質ホモログの結晶構造

山口知宏, 加藤博章

生物物理 56(6) 315-318 2016年11月査読有り招待有り
ABC 多剤排出トランスポーターの構造と機能からADME を探る

山口知宏

薬学雑誌 136(2) 197-202 2016年2月査読有り招待有り
実験とシミュレーションを用いたABCトランスポーターによる物質輸送の機構解明

古田忠臣, 山口知宏, 加藤博章, 櫻井実

生物物理 56(1) 5-8 2016年1月査読有り招待有り
An isomorphous replacement method for efficient de novo phasing for serial femtosecond crystallography

Keitaro Yamashita, Dongqing Pan, Tomohiko Okuda, Michihiro Sugahara, Atsushi Kodan, Tomohiro Yamaguchi, Tomohiro Murai, Keiko Gomi, Naoki Kajiyama, Eiichi Mizohata …

SCIENTIFIC REPORTS 5(14017) 2015年9月査読有り
ヒト赤血球膜タンパク質バンド3の構造―膜貫通ドメインの二次元結晶構造解析―

平井照久, 山口知宏

臨床血液 56(7) 831-836 2015年8月査読有り招待有り
Luciferin-regenerating enzyme solved by SIRAS using XFEL (refined against Hg derivative data)

Yamashita K, Pan D, Okuda T, Sugahara M, Kodan A, Yamaguchi T, Murai T, Gomi K, Kajiyama N, Mizohata E …

Worldwide Protein Data Bank 2015年査読有り
Luciferin-regenerating enzyme solved by SAD using synchrotron radiation at room temperature

Yamashita K, Pan D, Okuda T, Sugahara M, Kodan A, Yamaguchi T, Murai T, Gomi K, Kajiyama N, Mizohata E …

Worldwide Protein Data Bank 2015年査読有り
Analysis of the Structural and Functional Roles of Coupling Helices in the ATP-Binding Cassette Transporter MsbA through Enzyme Assays and Molecular Dynamics Simulations

Tadaomi Furuta, Tomohiro Yamaguchi, Hiroaki Kato, Minoru Sakurai

BIOCHEMISTRY 53(26) 4261-4272 2014年7月査読有り
Structural basis for gating mechanisms of a eukaryotic P-glycoprotein homolog

Atsushi Kodan, Tomohiro Yamaguchi, Toru Nakatsu, Keita Sakiyama, Christopher J. Hipolito, Akane Fujioka, Ryo Hirokane, Keiji Ikeguchi, Bunta Watanabe, Jun Hiratake …

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 111(11) 4049-4054 2014年3月査読有り
真核生物由来ABC多剤排出トランスポーターの構造と分子メカニズム

小段篤史, 山口知宏, 中津亨, 加藤博章

日本結晶学会誌 56(4) 224-229 2014年査読有り招待有り
Arg 901 in the AE1 C-terminal tail is involved in conformational change but not in substrate binding

Shinya Takazaki, Yoshito Abe, Tomohiro Yamaguchi, Mikako Yagi, Tadashi Ueda, Dongchon Kang, Naotaka Hamasaki

BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOMEMBRANES 1818(3) 658-665 2012年3月査読有り
ナノバイオ技術と最新創薬応用研究第1章ナノバイオ創薬に向けたターゲットの探索と構造解析 3.トランスポーターの構造生物学的研究とナノバイオ創薬

加藤博章, 中津亨, 山口知宏

遺伝子医学MOOK (20) 40-46,4-5 2012年1月31日
Topology models of anion exchanger 1 that incorporate the anti-parallel V-shaped motifs found in the EM structure

Teruhisa Hirai, Naotaka Hamasaki, Tomohiro Yamaguchi, Yohei Ikeda

BIOCHEMISTRY AND CELL BIOLOGY-BIOCHIMIE ET BIOLOGIE CELLULAIRE 89(2) 148-156 2011年4月査読有り
Mutation of His 834 in human anion exchanger 1 affects substrate binding

Shinya Takazaki, Yoshito Abe, Tomohiro Yamaguchi, Mikako Yagi, Tadashi Ueda, Dongchon Kang, Naotaka Hamasaki

BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOMEMBRANES 1798(5) 903-908 2010年5月査読有り
Structure of the Membrane Domain of Human Erythrocyte Anion Exchanger 1 Revealed by Electron Crystallography

Tomohiro Yamaguchi, Yohei Ikeda, Yoshito Abe, Hiroyuki Kuma, Dongchon Kang, Naotaka Hamasaki, Teruhisa Hirai

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 397(1) 179-189 2010年3月査読有り
Helical image reconstruction of the outward-open human erythrocyte band 3 membrane domain in tubular crystals

Tomohiro Yamaguchi, Takashi Fujii, Yoshito Abe, Teruhisa Hirai, Dongchon Kang, Keiichi Namba, Naotaka Hamasaki, Kaoru Mitsuoka

JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY 169(3) 406-412 2010年3月査読有り

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MISC

P糖タンパク質CmABCB1の輸送基質としてのローダミン誘導体の構造活性相関研究

瀧川紘, 三和空知, 山岡庸介, 山口知宏, 中津亨, 加藤博章, 高須清誠

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 140th 2020年
Trp経口を利用したP糖タンパク質分子内の基質結合部位の解析

井上善貴, 山口知宏, 大城悠暉, 松岡敬太, 加藤博章

日本薬学会第139年会・講演要旨集 2019年3月
ATP binding cassette transporter,CmABCB1を含有したナノディスクの調製

陳月, 山口知宏, 中津亨, 加藤博章

日本細胞生物学会大会(Web) 71st 2019年
トリプトファンの蛍光を利用したABC多剤排出トランスポーターとリガンドとの相互作用解析

大城悠暉, 山口知宏, 松岡敬太, 宇都宮裕人, 中津亨, 加藤博章

第67回日本薬学会近畿支部総会・大会 2017年10月
P糖タンパク質の基質排出ゲート開閉の構造基盤

松岡敬太, 山口知宏, 中津亨, 加藤博章

第17回日本蛋白質科学会年会 2017年6月
X線自由電子レーザーを用いたP糖タンパク質ホモログの連続フェムト秒X線結晶構造解析

大山諒, 潘東青, 中津亨, 佐藤友美, 山口知宏, 小段篤史, 植田和光, 岩田想, 加藤博章

第14回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム（PPF2016） 2016年8月
[epsilon-13C]メチオニン標識したABCトランスポーターMsbAの調製とNMR 解析

小田健人, 山口知宏, 宮ノ入洋平, 宇都宮裕人, 中津亨, 甲斐荘正恒, 加藤博章

第16回日本蛋白質科学会年会 2016年6月
Serial Femtosecond Crystallography of ABC Transporter

Oyama, R, Pan, D, Nakatsu, T, Sato, T, Yamaguchi, T, Kodan, A, Ueda, K, Iwata. S, Kato, H

6th Special Meeting, ATP-Binding Cassette (ABC) Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Diseases (ABC2016) 2016年3月
Crystallographic study of the ABC transporter CmABCB1 covalently bound to substrate derivatives

Matsuoka, K, Hirokane, R, Kodan, A, Yamaguchi, T, Nakatsu, T, Ueda, K, Kato, H

6th Special Meeting, ATP-Binding Cassette (ABC) Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Diseases (ABC2016) 2016年3月
X線自由電子レーザーを用いた新規タンパク質の立体構造決定

山下恵太郎, 潘東青, 奥田智彦, 菅原道泰, 小段篤史, 山口知宏, 村井智洋, 溝端栄一, 鈴木守, 南後恵理子 …

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 136th ROMBUNNO.27M-PM20 2016年
Altering stability of a transmembrane protein, MsbA by structural comparison with its thermophilic homolog

K. Lu, T. Yamaguchi, T. Nakatsu, H. Kato

The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2015 (Pacifichem2015) 2015年12月
NMR解析を目指したABCトランスポーターの大腸菌高密度培養による安定同位体標識系の確立

小田健人, 山口知宏, 宮ノ入洋平, 中津亨, 甲斐荘正恒, 加藤博章

日本薬学会近畿支部総会・大会 2015年10月
メタノール資化性酵母発現系を用いて15N 安定同位体標識したABC トランスポーターのNMR 解析

宇都宮裕人, 山口知宏, 宮ノ入洋平, 小田健人, 中津亨, 甲斐荘正恒, 加藤博章

第16回日本蛋白質科学会年会 2015年6月
Trp変異導入によるABC多剤排出トランスポーターと基質の相互作用解析

大塚哲央, 山口知宏, 中津亨, 加藤博章

日本薬学会第135年会 2015年3月
X線自由電子レーザーを用いたタンパク質Ｘ線結晶構造解析

潘東青, 中津亨, 山口知宏, 小段篤史, 小川和浩, 松嶌一樹, 山下恵太郎, 城地保昌, 登野健介, 矢橋牧名 …

日本薬学会第135年会 2015年3月
ABC多剤排出トランスポーターの立体構造の特徴

山口知宏, 小段篤史, 中津亨, 植田和光, 加藤博章

第87回日本生化学会大会 2014年10月15日
Lysの13C-ジメチル化によるABC多剤排出トランスポーターのNMR解析

宇都宮裕人, 山口知宏, 宮ノ入洋平, 武田光広, 中津亨, 甲斐荘正恒, 加藤博章

第64回日本薬学会近畿支部総会・大会 2014年10月
SACLAによるABCトランスポーターおよびホタル・ルシフェラーゼのＸ線結晶構造解析

潘東青, 中津亨, 山口知宏, 小段篤史, 小川和浩, 松嶌一樹, 城地保昌, 登野健介, 矢橋牧名, 鈴木守 …

第14回日本蛋白質科学会年会 14th 2014年6月
ABC多剤排出トランスポーターにおける基質取込の立体構造基盤

山口知宏, 小段篤史, 中津亨, 植田和光, 加藤博章

日本薬学会第134回年会 2014年3月
Structure-based functional aspects of the ABC multidrug transporter, CmABCB1 from a thermophilic eukaryote

Tomohiro Yamaguchi, Atsushi Kodan, Toru Nakatsu, Keita Sakiyama, Christopher J. Hipolito, Akane Fujioka, Ryo Hirokane, Yasuhisa Kimura, Hiroaki Suga, Kazumitsu Ueda …

ABC2014, 5th FEBS Special Meeting, ATP-Binding Cassette (ABC) Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Diseases 2014年3月

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書籍等出版物

トランスポーターの構造生物学研究とナノバイオ創薬

加藤博章, 中津亨, 山口知宏 (担当:共著)

遺伝子医学MOOK: ナノバイオ技術と最新創薬応用研究 (橋田充, 佐治英郎編) 2012年

講演・口頭発表等

P糖タンパク質の多剤能動輸送メカニズムから考える創薬・薬理学

山口知宏

日本薬学会第137年会 2017年3月26日招待有り
ABC多剤排出トランスポーターの構造と機能からADMEを探る

山口知宏

日本薬学会第135年会 2015年3月招待有り
ABC多剤排出トランスポーターの立体構造の特徴

山口知宏, 小段篤史, 中津亨, 植田和光, 加藤博章

第87回日本生化学会大会 2014年10月招待有り
Helical image reconstruction of the membrane domain of human AE1 in tubular crystals

Tomohiro Yamaguchi

53rd Annual Meeting of the Canadian Society for Biochemistry, Molecular and Cellular Biology Satellite Meeting 2011年6月

担当経験のある科目(授業)

Works(作品等)

Ligand-sensitive interaction of endothelin B receptor with caveolin-1

1998年 - 2002年

共同研究・競争的資金等の研究課題

「排出過程におけるABC輸送体―基質相互作用を捉える

科研費補助金基盤研究(C) 2016年 - 2018年

山口知宏
ABC輸送体のATP加水分解と基質輸送共役効率化のカギとなる残基の同定

科研費補助金若手研究(B) 2014年 - 2015年

山口知宏
真核生物由来ABCトランスポーターの多剤排出機構に関する研究

財団法人上尾竹圓会 2012年

山口知宏
好熱性紅藻由来P糖タンパク質ホモログにおける多剤排出機構に関する研究

京都大学大学院薬学研究科革新的ナノバイオ創薬研究拠点 2011年

山口知宏
Functional analysis of an ABC protein based on the crystal structure

物質―細胞統合システム拠点（iCeMS）学際融合研究推進プロジェクト 2011年

山口知宏
好熱性紅藻由来P糖タンパク質ホモログのX線結晶構造解析

財団法人上尾竹圓会 2010年

山口知宏
好熱性紅藻由来P糖タンパク質ホモログC16を用いた新規抗癌剤候補化合物の探索研究

京都大学大学院薬学研究科革新的ナノバイオ創薬研究拠点 2009年

山口知宏
ヒト赤血球膜蛋白質Band3膜貫通ドメインの電子線結晶構造解析

科学研究費補助金特定領域研究 2005年 - 2006年

山口知宏
Establishment of expression and purification systems, and three-dimensional structure analysis of an erythrocyte membrane protein, Band3.

2002年 - 2004年

産業財産権

特願2010-262291 多環芳香族化合物

平竹潤, 渡辺文太, 山口知宏, 崎山慶太, 中津亨, 加藤博章

山口知宏

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

Works(作品等)

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

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