山田 篤志

J-GLOBALへ         更新日: 19/05/14 10:17
 
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研究者氏名
山田 篤志
 
ヤマダ アツシ
URL
http://salmon.ccs.tsukuba.ac.jp/members/ayamada.html
所属
筑波大学
部署
計算科学研究センター
職名
主任研究員
学位
博士(理学)(名古屋大学)

研究分野

 
 

経歴

 
2017年7月
 - 
現在
筑波大学 計算科学研究センター 量子物性研究部門 主任研究員
 
2015年7月
 - 
2017年6月
米国 ケント州立大学 化学科 Research Associate
 
2014年7月
 - 
2015年6月
フランス ボルドー大学/CRPP-CNRS Postdoctoral Fellow
 
2008年4月
 - 
2014年6月
名古屋大学 工学部 化学・生物工学科(応用化学分野) 助教
 
2010年5月
 - 
2011年5月
米国 テキサス大学オースチン校 化学科 客員研究員
 
2007年7月
 - 
2008年3月
分子科学研究所 / 計算科学研究センター 助教
 
2003年9月
 - 
2007年6月
分子科学研究所 / 計算科学研究センター 博士研究員
 

学歴

 
1998年4月
 - 
2003年9月
名古屋大学 大学院理学研究科 物質理学専攻(物理系)
 
1994年4月
 - 
1998年3月
名古屋大学 理学部 物理学科
 

論文

 
Masashi Noda,Array,Yuta Hirokawa,Mitsuharu Uemoto,Takashi Takeuchi,Shunsuke Yamada,Atsushi Yamada,Yasushi Shinohara,Maiku Yamaguchi,Kenji Iida,Isabella Floss,Array,Kyung-Min Lee,Kazuya Ishimura,Taisuke Boku,George F. Bertsch,Katsuyuki Nobusada,Kazuhiro Yabana
Computer Physics Communications   235 356-365   2019年   [査読有り]
Atsushi Yamada, Kazuhiro Yabana
arXiv      2018年7月
Energy transfer processes from a high-intensity ultrashort laser pulse to
electrons in simple dielectrics, silicon, diamond, and Tex-quartz are
theoretically investigated by first-principles calculations based on
time-dependent density functi...
Petra Ivaskovic, Atsushi Yamada, Juan Elezgaray, David Talaga,Sébastien Bonhommeau,Mireille Blanchard-Desce,Renaud A. L. Vallée, and Serge Ravaine
Nanoscale   10 16568-16573   2018年   [査読有り]
First-Principles Electron Dynamics Simulation Study of High Intensity Laser Irradiation on Crystal Systems: Photon Energy Dependent Energy Transfer
Atsushi Yamada and Kazuhiro Yabana
Proceedings of XXI International Conference on Ultrafast Phenomena      2018年   [査読有り]
Yamada Atsushi, Feng Qingguo, Zhou Qi, Hoskins Austin, Lewis Kim M., Dunietz Barry D.
JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY C   121(19) 10298-10304   2017年5月   [査読有り]
Zhou Qi, Yamada Atsushi, Feng Qingguo, Hoskins Austin, Dunietz Barry D., Lewis Kim M.
ACS APPLIED MATERIALS & INTERFACES   9(19) 15901-15906   2017年5月   [査読有り]
Andoh Yoshimichi, Yoshii Noriyuki, Yamada Atsushi, Okazaki Susumu
JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY   38(10) 704-713   2017年4月   [査読有り]
Zhong Kuo, Liu Liwang, Xu Xiaodong, Hillen Michael, Yamada Atsushi, Zhou Xingping, Verellen Niels, Song Kai, Van Cleuvenbergen Stijn, Vallee Renaud, Clays Koen
ACS PHOTONICS   3(12) 2330-2337   2016年12月   [査読有り]
Yamada Atsushi, Feng Qingguo, Hoskins Austin, Fenk Kevin D., Dunietz Barry D.
NANO LETTERS   16(10) 6092-6098   2016年10月   [査読有り]
Feng Qingguo, Yamada Atsushi, Baer Roi, Dunietz Barry D.
JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION   12(8) 3431-3435   2016年8月   [査読有り]
Ichikawa Osamu, Fujimoto Kazushi, Yamada Atsushi, Okazaki Susumu, Yamazaki Kazuto
PLOS ONE   11(5)    2016年5月   [査読有り]
Yamada Atsushi, Neuhauser Daniel, Vallee Renaud
NANOSCALE   8(43) 18476-18482   2016年   [査読有り]
Kojima Hidekazu, Yamada Atsushi, Okazaki Susumu
MOLECULAR SIMULATION   41(10-12) 850-856   2015年8月   [査読有り]
Yoshii Noriyuki, Andoh Yoshimichi, Fujimoto Kazushi, Kojima Hidekazu, Yamada Atsushi, Okazaki Susumu
INTERNATIONAL JOURNAL OF QUANTUM CHEMISTRY   115(5) 342-348   2015年3月   [査読有り]
Andoh Y., Yoshii N., Yamada A., Fujimoto K., Kojima H., Mizutani K., Nakagawa A., Nomoto A., Okazaki S.
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS   141(16)    2014年10月   [査読有り]
Yamada Atsushi, Kojima Hidekazu, Okazaki Susumu
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS   141(8)    2014年8月   [査読有り]
Andoh Yoshimichi, Yoshii Noriyuki, Fujimoto Kazushi, Mizutani Keisuke, Kojima Hidekazu, Yamada Atsushi, Okazaki Susumu, Kawaguchi Kazutomo, Nagao Hidemi, Iwahashi Kensuke, Mizutani Fumiyasu, Minami Kazuo, Ichikawa Shin-ichi, Komatsu Hidemi, Ishizuki Shigeru, Takeda Yasuhiro, Fukushima Masao
JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION   9(7) 3201-3209   2013年7月   [査読有り]
Kurokawa Yoshihiko, Kojima Hidekazu, Yamada Atsushi, Okazaki Susumu
MOLECULAR SIMULATION   38(5) 442-447   2012年   [査読有り]
Yamada A, Ishikura T, Yamato T
PROTEINS: Stru. Func. Bio.   55(4) 1063-1069   2004年6月   [査読有り]
Yamada A, Ishikura T, Yamato T
PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS   55(4) 1070-1077   2004年6月   [査読有り]
Yamada A, Yamato T, Kakitani T, Yamamoto S
Photochem. Photobio.   79(5) 476-486   2004年5月   [査読有り]
タンパク質中で起こる発色団の光異性化反応メカニズムの解析
山田 篤志
名古屋大学      2003年   [査読有り]
Yamada A, Kakitani T, Yamamoto S, Yamato T
CHEMICAL PHYSICS LETTERS   366(5-6) 670-675   2002年12月   [査読有り]
Analysis of Cis-Trans Photoisomerization Mechanism of Rhodopsin Based on the Tertiary Structure of Rhodopsin
J. Photoscience   9(2) 51-54   2002年   [査読有り]
Kakitani T, Kawatsu T, Kimura A, Yamada A, Yamato T, Yamamoto S
Journal of Biological Physics   28(3) 367-381   2002年   [査読有り]
Yamada A, Yamamoto S, Yamato T, Kakitani T
J. Mol. Stru.(Theochem)   536(2-3) 195-201   2001年2月   [査読有り]
KAKITANI T, BEPPU Y, YAMADA A
Photochem. Photobio.   70(4) 686-693   1999年

Misc

 
The Molecular Simulation Society of Japan[分子シミュレーション研究会会誌] アンサンブル   1(9) 26-31   2007年
計算機を用いた光受容タンパク質の研究
The Molecular Simulation Society of Japan[分子シミュレーション研究会] News Letter アンサンブル   25(6) 25-28   2004年

担当経験のある科目

 
 

Works

 
コンピュータソフト   
光-物質/分子相互作用を含む第一原理電子動力学シミュレーションソフトウェア
コンピュータソフト   
ab initio 量子化学計算ソフトウェア
コンピュータソフト   
超高並列汎用分子動力学計算用ソフトウェア
コンピュータソフト   
分子・結晶の科学技術計算ソフトウェアのための入力支援ソフトウェア

競争的資金等の研究課題

 
分光測定を再現するMaxwell方程式と融合した分子動力学マルチスケール法の開発
日本学術振興会: 科学研究費助成事業 基盤研究 C
研究期間: 2019年4月 - 2023年3月    代表者: 山田 篤志
溶媒環境依存性に注目したプロトン移動反応の量子ダイナミクスと分子機構の理論的研究
日本学術振興会: 科学研究費助成事業 若手研究(B)
研究期間: 2013年4月 - 2015年3月    代表者: 山田 篤志
分子集団系の自由エネルギー理論計算
文部科学省: 特定領域研究
研究期間: 2007年 - 2009年3月    代表者: 岡崎 進