山中秀介 (Shusuke Yamanaka) - マイポータル

基本情報

所属: 大阪大学理学研究科准教授

学位: 博士(理学)(大阪大学)
修士(理学)(北海道大学)

J-GLOBAL ID: 200901076522507479
researchmap会員ID: 1000317652

研究キーワード

研究分野

経歴

2019年4月 - 現在

大阪大学先導的学祭研究機構量子情報・量子生命研究部門(兼任)
2014年10月 - 現在

大阪大学理学研究科化学専攻, 准教授
2010年4月 - 2014年9月

大阪大学理学研究科化学専攻, 助教
2008年4月 - 2010年3月

大阪大学蛋白質研究所, 特任研究員・客員准教授
2006年4月 - 2008年3月

大阪大学極限量子科学研究センター, 特任研究員
2005年4月 - 2006年3月

大阪大学理学研究科, NAREGI研究員
2002年11月 - 2005年3月

大阪大学理学研究科, 連携研究員
1999年 - 2002年

大阪大学理学研究科助手
1999年 - 2002年

Research Associate,Gradnate School of Science,
1999年

日本学術振興会特別研究員
1999年

独立行政法人日本学術振興会
University of Osaka
Postdoctoral Fellowship

学歴

委員歴

2015年4月 - 2017年3月

日本化学会近畿支部, 幹事

受賞

2003年

日本化学会進歩賞, 日本化学会

山中秀介

論文

221

Extension of the Linear Response Function of Electron Density to a Plane-wave Basis and the First Application to Periodic Surface Systems

Tomohiro Maruyama, Jinta Ohnari, Kohei Tada, Yoyo Hinuma, Takashi Kawakami, Shusuke Yamanaka, Mitsutaka Okumura

Chemistry Letters 50(10) 1801-1805 2021年10月5日査読有り
Mechanism of Water Oxidation in Photosynthesis Elucidated by Interplay Between Experiment and Theory

K. Yamaguchi, S. Yamanaka, H. Isobe, M. Shoji, T. Kawakami, K. Miyagawa

Advances in Photosynthesis and Respiration 47 39-80 2021年9月10日査読有り
Gibbs energy of hydrogen adsorption on Pt surface by machine learning potential and metadynamics

Akihide Hayashi, Yoshinori Ato, Akira Yamamoto, Hisao Yoshida, Shusuke Yamanaka, Takashi Kawakami, Mitsutaka Okumura

Chemistry Letters 2021年4月15日査読有り
Isolobal and isospin analogy between organic and inorganic open-shell molecules Application to oxygenation reactions by active oxygen and oxy-radicals and water oxidation in the native and artificial photosynthesis

K. Yamaguchi, K. Miyagawa, H. Isobe, M. Shoji, T. Kawakami, S. Yamanaka

Advances in Quantum Chemistry 84 425-564 2021年4月1日査読有り
Estimation of spin contamination errors in DFT/plane-wave calculations of solid materials using approximate spin projection scheme

Kohei Tada, Shusuke Yamanaka, Takashi Kawakami, Yasutaka Kitagawa, Mitsutaka Okumura, Kizashi Yamaguchi, Shingo Tanaka

Chemical Physics Letters 765 138291-138291 2021年2月査読有り
Relative stability among intermediate structures in S-2 state of CaMn4O5 cluster in PSII by using hybrid-DFT and DLPNO-CC methods and evaluation of magnetic interactions between Mn ions

Miyagawa, K., Kawakami, T., Suzuki, Y., Isobe, H., Shoji, M., Yamanaka, S., Okumura, M., Nakajima, T., Yamaguchi, K.

Journal of Photochemistry and Photobiology A: Chemistry 2021年
A three states model for hydrogen abstraction reactions with the cytochrome P450 compound I is revisited. Isolobal and isospin analogy among Fe(IV)=O, O=O and O

K. Miyagawa, H. Isobe, M. Shoji, T. Kawakami, S. Yamanaka, K. Yamaguchi

J. Photochem. Photobiol. A: Chem. 405 112902-1-112902-14 2020年9月11日査読有り
Theoretical Investigation of the Heterojunction Effect on the Catalytic Activity and Selectivity of an Au@NiO Core–Shell Catalyst in Aerobic Oxidation

Akihide Hayashi, Yoshinori Ato, Kohei Tada, Hiroaki Koga, Takashi Kawakami, Shusuke Yamanaka, Mitsutaka Okumura

The Journal of Physical Chemistry C 124(31) 17039-17047 2020年8月6日査読有り
Development of broken-symmetry (BS) methods in chemical reactions A theoretical view of water oxidation in photosystem II and related systems

K. Yamaguchi, H. Isobe, M. Shoji, K. Miyagawa, S. Yamanaka, T. Kawakami, T. Nakajima

J. Photochem. Photobiol. A: Chem. 402 112791-1-112791-22 2020年8月1日査読有り
Effect of surface interactions on spin contamination errors of homogeneous spin dimers, chains, and films: model calculations of Au/MgO and Au/BaO systems

Kohei Tada, Akihide Hayashi, Tomohiro Maruyama, Hiroaki Koga, Shusuke Yamanaka, Mitsutaka Okumura, Shingo Tanaka

Molecular Physics 119(13) 1-25 2020年7月13日査読有り
UNO(ULO) active space for multireference calculations on classical and quantum computers. Revisit to the iron-sulfur complexes

Koichi Miyagawa, Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Shusuke Yamanaka, Takashi Kawakami, Mitsutaka Okumura, Kizashi Yamaguchi

Chemical Physics Letters 746 2020年5月査読有り
Theory of chemical bonds in metalloenzymes XXIII Fundamental principles for the photo-induced water oxidation in oxygen evolving complex of photosystem II

K. Yamaguchi, S. Yamanaka, H. Isobe, M. Shoji, K. Miyagawa, T. Kawakami

Mol. Phys. - e1725168-1-e1725168-30 2020年2月19日査読有り
Electronic and spin structures of CaMn4Ox clusters in the S-0 state of the oxygen evolving complex of photosystem II. Domain-based local pair natural orbital (DLPNO) coupled-cluster (CC) calculations using optimized geometries and natural orbitals (UNO) by hybrid density functional theory (HDFT) calculations

Miyagawa, K., Yamanaka, S., Isobe, H., Shoji, M., Kawakami, T., Taniguchi, M., Okumura, M., Yamaguchi, K.

Physical Chemistry Chemical Physics 2020年
Theory of chemical bonds in metalloenzymes XXIV electronic and spin structures of FeMoco and Fe-S clusters by classical and quantum computing

Miyagawa, Koichi, Shoji, Mitsuo, Isobe, Hiroshi, Yamanaka, Shusuke, Kawakami, Takashi, Okumura, Mitsutaka, Yamaguchi, Kizashi

Molecular Physics 2020年
Domain-based local pair natural orbital CCSD(T) calculations of fourteen different S<inf>2</inf> intermediates for water oxidation in the Kok cycle of OEC of PSII. Re-visit to one LS-two HS model for the S<inf>2</inf> state

K. Miyagawa, H. Isobe, T. Kawakami, M. Shoji, S. Yamanaka, M. Okumura, T. Nakajima, K. Yamaguchi

Chemical Physics Letters 734 2019年11月査読有り
Domain-based local pair natural orbital CCSD(T) calculations of strongly correlated electron systems. Examination of dynamic equilibrium models based on multiple intermediates in the S1 state of photosystem II

K. Miyagawa, T. Kawakami, Y. Suzuki, H. Isobe, M. Shoji, S. Yamanaka, M. Okumura, T. Nakajima, K. Yamaguchi

Mol. Phys. - e1666171-1-e1666171-19 2019年9月25日査読有り
Domain-based local pair natural orbital CCSD(T) calculations of six different S1 structures of oxygen evolving complex of photosystem II. Proposal of multi-intermediate models for the S1 state

K. Miyagawa, T. Kawakami, H. Isobe, M. Shoji, S. Yamanaka, K. Nakatani, M. Okumura, T. Nakajima, K. Yamaguchi

Chem. Phys. Lett. 732 136660-1-136660-8 2019年8月6日査読有り
Theoretical study of aerobic oxidation of alcohols over Au-38 nanocluster by a two-step-modeling approach

Ato Yoshinori, Hayashi Akihide, Koga Hiroaki, Kawakami Takashi, Yamanaka Shusuke, Okumura Mitsutaka

CHEMICAL PHYSICS LETTERS 724 115-121 2019年6月査読有り
Hydrogen bond donors and acceptors are generally depolarized in α‐helices as revealed by a molecular tailoring approach

Hiroko X. Kondo, Ayumi Kusaka, Colin K. Kitakawa, Jinta Onari, Shusuke Yamanaka, Haruki Nakamura, Yu Takano

Journal of Computational Chemistry 2019年5月17日査読有り
Theoretical and computational investigations of geometrical, electronic and spin structures of the CaMn4OX (X=5, 6) cluster in the Kok cycle S-i (i=0-3) of oxygen evolving complex of photosystem II

Yamaguchi Kizashi, Yamanaka Shusuke, Isobe Hiroshi, Shoji Mitsuo, Miyagawa Kouichi, Nakajima Takahito, Kawakami Takashi, Okumura Mitsutaka

PHYSIOLOGIA PLANTARUM 166(1) 44-59 2019年5月査読有り

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MISC

Theoretical Elucidation of Geometrical Structures of the CaMn4O5 Cluster in Oxygen Evolving Complex of Photosystem II Scope and Applicability of Estimation Formulae of Structural Deformations via the Mixed-Valence and Jahn-Teller Effects

Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Shusuke Yamanaka, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Nobuo Kamiya, Kizashi Yamaguchi

QUANTUM SYSTEMS IN PHYSICS, CHEMISTRY AND BIOLOGY - THEORY, INTERPRETATION, AND RESULTS 78 307-451 2019年
Au‐Ni触媒のヘテロ接合効果に関する理論的研究

安渡佳典, 林亮秀, 川上貴資, 山中秀介, 石田玉青, 徳永信, 奥村光隆

触媒討論会討論会A予稿集 122nd 68 2018年9月19日
Free energy reaction root mapping of alanine tripeptide in water

Yuki Mitsuta, Johannes Kästner, Shusuke Yamanaka, Takashi Kawakami, Mitsutaka Okumura

Molecular Physics 117(17) 2284-2292 2018年1月1日
On the guiding principles for understanding of geometrical structures of the CaMn4O5 cluster in oxygen-evolving complex of photosystem II. Proposal of estimation formula of structural deformations via the Jahn-Teller effects

K. Yamaguchi, M. Shoji, H. Isobe, S. Yamanaka, Y. Umena, K. Kawakami, N. Kamiya

MOLECULAR PHYSICS 115(5) 636-666 2017年
On the guiding principles for lucid understanding of the damage-free S-1 structure of the CaMn4O5 cluster in the oxygen evolving complex of photosystem II

Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Shusuke Yamanaka, Michihiro Suga, Fusamichi Akita, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

CHEMICAL PHYSICS LETTERS 627 44-52 2015年5月
Large-scale QM/MM calculations of hydrogen bonding networks for proton transfer and water inlet channels for water oxidation—Theoretical system models of the oxygen-evolving complex of Photosystem II

Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Shusuke Yamanaka, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen, Takahito Nakajima, Kizashi Yamaguchi

Advances in Quantum Chemistry 70 325-413 2015年
金錯体の光スペクトルの理論的研究

小國敦, 山中秀介, 林祥生, 北河康隆, 川上貴資, 今野巧, 奥村光隆

分子科学討論会講演プログラム&要旨(Web) 8th 2014年
特異なイオン集合体を含む金錯体結晶の安定性に関する理論計算による解析

近藤雄大, 山中秀介, 林祥生, 北河康隆, 川上貴資, 井頭麻子, 今野巧, 奥村光隆

分子科学討論会講演プログラム&要旨(Web) 8th 2014年
Linear response function approach for the boundary problem of QM/MM methods

Koki Ueda, Shusuke Yamanaka, Kazuto Nakata, Masahiro Ehara, Mitsutaka Okumura, Kizashi Yamaguchi, Haruki Nakamura

International Journal of Quantum Chemistry 113(3) 336-341 2013年2月5日
How to determine boundaries for QM/MM calculations: A guideline based on linear response function for glutathione

Shusuke Yamanaka, Koki Ueda, Kazuto Nakata, Mitsutaka Okumura, Kizashi Yamaguchi, Haruki Nakamura

24TH IUPAP CONFERENCE ON COMPUTATIONAL PHYSICS (IUPAP-CCP 2012) 454 2013年
Ab initio DFT study of magneto-structural correlation of dinuclear mixed-valence Mn complexes

Shusuke Yamanaka, Kyohei Komi, Koki Ueda, Yasutaka Kitagawa, Takashi Kawakami, Mitsutaka Okumura, Haruki Nakamura, Kizashi Yamaguchi

Journal of Physics: Conference Series 428 2013年1月1日
Theory of chemical bonds in metalloenzymes - Manganese oxides clusters in the oxygen evolution center - Manganese o

K. Yamaguchi, K. Yamaguchi, K. Yamaguchi, M. Shoji, T. Saito, H. Isobe, S. Yamada, S. Nishihara, T. Kawakami, Y. Kitagawa, S. Yamanaka, M. Okumura

AIP Conference Proceedings 1504 63-79 2012年12月1日
25pGP-7 光化学系IIマンガンクラスターの電子構造の密度汎関数理論による研究(25pGP 領域12シンポジウム:光化学系IIにおける酸素発生中心,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

山中秀介, 神田慧太, 梅名泰史, 川上恵典, 沈建仁, 神谷信夫, 奥村光隆, 中村春木, 山口兆

日本物理学会講演概要集 66(1) 378-378 2011年3月3日
化学反応における対称性の破れの理論(1)酸素分子のエチレンへの付加反応再訪

山口兆, 磯部寛, 山中秀介

豊田研究報告 (62) 105-111 2009年5月
Theoretical considerations on the roles of hydrogen bonding in thermal decomposition of peroxides

H. Isobe, S. Yamanaka, M. Okumura, K. Yamaguchi

LUMINESCENCE 23(2) 74-74 2008年3月
Regulation mechanism of spin-orbit coupling in charge-transfer-induced luminescence of imidazopyrazinone derivatives

Hiroshi Isobe, Syusuke Yamanaka, Seiki Kuramitsu, Kizashi Yamaguchi

JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 130(1) 132-149 2008年1月
21pWA-6 揺らぎ参照多配置参照密度汎関数計算による自己無撞着電子状態計算(電子系,領域11,統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理)

草部浩一, 鈴木直, 山中秀介, 山口兆

日本物理学会講演概要集 62(2) 272-272 2007年8月21日
Approximately spin projected (AP) geometry optimization method and its application to di-chromium systems

Yasutaka Kitagawa, Toru Saito, Masahide Ito, Mitsuo Shoji, Kenichi Koizumi, Shusuke Yamanaka, Takashi Kawakami, Mitsutaka Okumura, Kizashi Yamaguchi

Chem. Phys. Lett. 442, 445-450 445-450 2007年7月17日
Theory of chemical bonds in metalloenzymes IV: Hybrid-DFT study of Rieske-type [2Fe-2S] clusters

Mitsuo Shoji, Kenichi Koizumi, Yasutaka Kitagawa, Shusuke Yamanaka, Mitsutaka Okumura, Kizashi Yamaguchi

Int. J. Quant. Chem. 107, 609-627 609-627 2007年3月5日
20pWB-9 揺らぎ参照多配置参照密度汎関数計算による自己無撞着電子状態計算(電子系(密度汎関数法),領域11,統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理)

草部浩一, 鈴木直, 山中秀介, 山口兆

日本物理学会講演概要集 62(1) 290-290 2007年2月28日

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書籍等出版物

金属錯体の量子計算化学

山中秀介, 奥村光隆

三共出版 2014年
Quantum Systems in Chemistry and Physics: Progress in Methods and Applications

S. Yamanaka, K. Kanda, T. Saito, Y. Kitagawa, T. Kawakami, M. Ehara, M. Okumura, H. Nakamura, K. Yamaguchi (担当:共著, 範囲:Chapter 26, Density functional study of manganese complexes: Protonation effects on geometries and magnetism.)

Springer 2012年
Quantum Systems in Chemistry and Physics: Progress in Methods and Applications

K. Kanda, S. Yamanaka, T. Saito, Y. Kitagawa, T. Kawakami, M. Okumura, K. Yamaguchi

Springer 2012年
Recent Progress in Coupled Cluster Methods

INSTABILITY IN, CHEMICAL BONDS, UNO CASCC, RESONATING UCC AND, APPROXIMATELY, PROJECTED, UCC METHODS TO, QUASI-DEGENERATE ELECTRONIC SYSTEMS (担当:共著, 範囲:Chapter 22)

Springer 2010年
Carbon-Based Magnetism

K. Yamaguchi, S. Yamanaka, Y. Kitagawa

Elsevier 2006年
物性量子化学入門

山中秀介, 北河康隆, 高橋英明

講談社 2004年
集積型金属錯体の科学

山中秀介, 山口兆

化学同人 2003年
Molecule-Based Magnetic Materials: Theory, Techniques, and Applications

T. Kawakami, D. Yamaki, S. Yamanaka, K. Yamaguchi (担当:共著, 範囲:Chapter 3, Theoretical Approaches to Molecular Magnetism, p.30-43)

American Chemical Society 1999年

担当経験のある科目(授業)

2011年4月 - 現在

共通教育基礎化学実験
2010年4月 - 現在

化学実験1
2010年4月 - 現在

化学プログラミング演習
2010年4月 - 現在

量子力学演習
2014年4月 - 2018年3月

現代化学の基礎
2011年4月 - 2018年3月

化学発展セミナー

所属学協会

Works(作品等)

共同研究・競争的資金等の研究課題

線形応答関数に基づく反応場計算スキームの開発と酵素の高効率化への応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2015年4月 - 2018年3月

山中秀介
少数原子クラスター内包系のスピン・構造状態制御による物性発現機構の理論的解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2011年11月 - 2014年3月

奥村光隆, 川上貴資, 北河康隆, 山中秀介, 長尾秀実
強相関系の為の量子古典ハイブリッド法の開発と生体酵素活性中心への応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2011年 - 2013年

山中秀介
第一原理計算と統計理論による分子性磁性体の巨視的磁性発現機構の理論的解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2007年 - 2010年

奥村光隆, 川上貴資, 北河康隆, 長尾秀実, 山中秀介
一般化されたスピン密度汎関数理論によるノンコリニア分子磁性の研究
Study on Noncollinear Molecular Magnetism by Generalized Spin Density Functional Theory

産業財産権

特許6406958 基質分子計算による触媒作用誘起有効場の設計法

山中秀介, 奥村光隆
特許4646064 分子軌道法計算方法及び計算装置

高田俊和, 山口兆, 山中秀介, 中田一人

山中秀介

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研究分野

経歴

学歴

委員歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

Works(作品等)

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

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