角田大 (Masaru Tsunoda) - マイポータル

基本情報

所属: 医療創生大学薬学部, 大学院生命理工学研究科構造生物化学研究室教授

学位: 修士(理学)(2001年3月東京工業大学)
博士(理学)(1998年3月東京工業大学)

ORCID ID: https://orcid.org/0000-0002-3128-7695
J-GLOBAL ID: 200901037273558550
researchmap会員ID: 1000321962

外部リンク: https://www.isu.ac.jp/department/staff/detail.html?tsunoda_masaru

研究キーワード

研究分野

経歴

2021年 - 現在

医療創生大学薬学部教授
2020年4月 - 現在

医療創生大学大学院生命理工学研究科
2015年4月 - 現在

医療創生大学大学院理工学研究科
2013年4月 - 2021年3月

医療創生大学（いわき明星大学）薬学部准教授
2007年4月 - 2013年3月

いわき明星大学薬学部講師
2002年10月 - 2007年3月

昭和大学薬学部薬品物理化学教室助手
2001年4月 - 2002年9月

いわき明星大学理工学部博士研究員

学歴

1996年4月 - 2001年3月

東京工業大学大学院生命理工学研究科バイオサイエンス専攻
1991年4月 - 1996年3月

東京工業大学生命理工学部生命理学科

受賞

1996年

日本生化学会論文賞

論文

Roles of the hydroxy group of tyrosine in crystal structures of Sulfurisphaera tokodaiiO6-methylguanine-DNA methyltransferase.

Makiko Kikuchi, Takahiro Yamauchi, Yasuhito Iizuka, Masaru Tsunoda

Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications 77(Pt 12) 444-451 2021年12月1日
Structural insights into the catalytic reaction trigger and inhibition of D-3-hydroxybutyrate dehydrogenase

Hiroki Kanazawa, Md. Mominul Hoque, Masaru Tsunoda, Kaoru Suzuki, Tamotsu Yamamoto, Gota Kawai, Jiro Kondo, Akio Takenaka

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS 72 507-515 2016年7月査読有り
Crystal structure of family 4 uracil-DNA glycosylase from Sulfolobus tokodaii and a function of tyrosine 170 in DNA binding

Akito Kawai, Shigesada Higuchi, Masaru Tsunoda, Kazuo T. Nakamura, Yuriko Yamagata, Shuichi Miyamoto

FEBS LETTERS 589(19) 2675-2682 2015年9月査読有り
The Characteristic Structure of Anti-HIV Actinohivin in Complex with Three HMTG D1 Chains of HIV-gp120

Fang Zhang, Mominul M. Hoque, Jiandong Jiang, Kaoru Suzuki, Masaru Tsunoda, Yoichi Takeda, Yukishige Ito, Gota Kawai, Haruo Tanaka, Akio Takenaka

CHEMBIOCHEM 15(18) 2766-2773 2014年12月査読有り
O-6-Carboxymethylguanine in DNA forms a sequence context-dependent wobble base-pair structure with thymine

Fang Zhang, Masaru Tsunoda, Yuji Kikuchi, Oliver Wilkinson, Christopher L. Millington, Geoffrey P. Margison, David M. Williams, Akio Takenaka

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 70 1669-1679 2014年6月査読有り
Peculiarity in crystal packing of anti-HIV lectin actinohivin in complex with α(1-2)mannobiose

Kaoru Suzuki, Masaru Tsunoda, Md. Mominul Hoque, Fang Zhang, Jiandong Jiang, Xiaoxue Zhang, Naomi Ohbayashi, Haruo Tanaka, Akio Takénaka

Acta Cryst. 69 1818-1825 2013年9月査読有り
Structures of DNA duplexes containing O-6-carboxymethylguanine, a lesion associated with gastrointestinal cancer, reveal a mechanism for inducing pyrimidine transition mutations

Fang Zhang, Masaru Tsunoda, Kaoru Suzuki, Yuji Kikuchi, Oliver Wilkinson, Christopher L. Millington, Geoffrey P. Margison, David M. Williams, Ella Czarina Morishita, Akio Takenaka

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 41(10) 5524-5532 2013年5月査読有り
Purification, Crystallization and Preliminary X-Ray Diffraction Analysis of Exodeoxyribonuclease III from Crenarchaeon Sulfolobus tokodaii Strain 7

Shuichi Miyamoto, Chieko Naoe, Masaru Tsunoda, Kazuo T. Nakamura

Cryst. Struct. Theor. Appl 2 155-158 2013年査読有り
Structural insights into the specific anti-HIV property of actinohivin : structure of its complex with the α(1-2)mannobiose moiety of gp120

Md. Mominul Hoque, Kaoru Suzuki, Masaru Tsunoda, Jiandong Jiang, Fang Zhang, Atsushi Takahashi, Naomi Ohbayashi, Xiaoxue Zhang, Haruo Tanaka, Satoshi Omura, Akio Takénaka

Acta Cryst. 68 1671-1679 2012年12月査読有り
Purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of uracil-DNA glycosylase from Sulfolobus tokodaii strain 7

Akito Kawai, Shigesada Higuchi, Masaru Tsunoda, Kazuo T. Nakamura, Shuichi Miyamoto

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS 68 1102-1105 2012年9月査読有り
Crystallographic study of the interaction of the anti-HIV lectin actinohivin with the α(1-2)mannobiose moiety of gp120 HMTG

Kaoru Suzuki, Naomi Ohbayashi, Jiandong Jiang, Xiaoxue Zhang, M. Mominul Hoque, Masaru Tsunoda, Kazataka Murayama, Haruo Tanaka, Akio Takénaka

Acta Cryst. 68 1060-1063 2012年9月査読有り
The unique structure of carbonic anhydrase αCA1 from Chlamydomonas reinhardtii

Kaoru Suzuki, Shi-Yuan Yang, Satoru Shimizu, Ella Czarina, Magat Juan, Jian Jiandong, Fang Zhang, M. M. Hoque, Yoshiteru Sato, Masaru Tsunoda, Takeshi Sekiguchi, Akio Takénaka

Acta Cryst. 67 894-901 2011年10月査読有り
A novel heterotetrameric structure of the crenarchaeal PCNA2-PCNA3 complex.

Kawai A, Hashimoto H, Higuchi S, Tsunoda M, Sato M, Nakamura KT, Miyamoto S

Journal of structural biology 174(3) 443-450 2011年6月査読有り
Actinohivin : specific amino acid residues essential for anti-HIV activity”, The Journal of Antibiotics

Atsushi Takahashi, Junnichi Inokoshi, Masaru Tsunoda, Kaoru Suzuki, Akio Takénaka, Takeshi Sekiguchi, Satoshi Omura, Haruo Tanaka

The Journal of Antibiotics 63(11) 661-665 2010年11月査読有り
Insights into the DNA stabilizing contributions of a bicyclic cytosine analogue: crystal structures of DNA duplexes containing 7,8-dihydropyrido [2,3-d]pyrimidin-2-one

Ella Czarina Magat Juan, Satoru Shimizu, Xiao Ma, Taizo Kurose, Tsuyoshi Haraguchi, Fang Zhang, Masaru Tsunoda, Akihiro Ohkubo, Mitsuo Sekine, Takayuki Shibata, Christopher L. Millington, David M. Williams, Akio Takenaka

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 38(19) 6737-6745 2010年10月査読有り
Crystallographic study of wild-type carbonic anhydrase αCA1 from Chlamydomonas reinhardtii

Kaoru Suzuki, Satoru Shimizu, Ella Czarina, Magat Juan, Takahiro Miyamoto, Zhang Fang, Md Mominul Hoque, Yoshiteru Sato, Masaru Tsunoda, Takeshi Sekiguchi, Akio Takénaka, Shi-Yuan Yang

Acta Cryst. 66 1082-1085 2010年9月査読有り
A Structural Model for the Single-Stranded DNA Genome of Filamentous Bacteriophage Pf1

Masamichi Tsuboi, Masaru Tsunoda, Stacy A. Overman, James M. Benevides, George J. Thomas

BIOCHEMISTRY 49(8) 1737-1743 2010年3月査読有り
Insights into the structures of DNA damaged by hydroxyl radical: Crystal structures of DNA duplexes containing 5-formyluracil

Masaru Tsunoda, Takeshi Sakaue, Satoko Naito, Tomoko Sunami, Naoko Abe, Yoshihito Ueno, Akira Matsuda, Akio Takénaka

Journal of Nucleic Acids 2010 107289 2010年査読有り
Purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of the PCNA2-PCNA3 complex from Sulfolobus tokodaii strain 7.

Kawai A, Higuchi S, Tsunoda M, Nakamura KT, Miyamoto S

Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications 65(Pt 12) 1282-1284 2009年12月査読有り
Two Complementary Enzymes for Threonylation of tRNA in Crenarchaeota: Crystal Structure of Aeropyrum pernix Threonyl-tRNA Synthetase Lacking a cis-Editing Domain

Satoru Shimizu, Ella Czarina Magat Juan, Yoshiteru Sato, Yu-ichiro Miyashita, Md. Mominul Hoque, Kaoru Suzuki, Tsubasa Sagara, Masaru Tsunoda, Takeshi Sekiguchi, Anne-Catherine Dock-Bregeon, Dino Moras, Akio Takenaka

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 394(2) 286-296 2009年11月査読有り

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MISC

HIV予防薬開発を目指したアクチノヒビンと糖鎖との構造解析

角田大, 鈴木薫, 武田陽一, 伊藤幸成, 伊藤幸成, 田中晴雄

KEK Progress Report (Web) (2016-8) 2017年
The unique structure of carbonic anhydrase alpha CA1 from Chlamydomonas reinhardtii (vol D67, pg 894, 2011)

Kaoru Suzuki, Shi-Yuan Yang, Satoru Shimizu, Ella Czarina Morishita, Jiandong Jiang, Fang Zhang, Md Mominul Hoque, Yoshiteru Sato, Masaru Tsunoda, Takeshi Sekiguchi, Akio Takenaka

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 67 1077-1077 2011年12月
酵母TyrRS・Tyr‐AMPアナログ・tRNA^Tyr複合体の結晶構造解析とTyrRS改変体の「タンパク質の部位特異的修飾」への利用

横川隆志, 大野敏, 田中信忠, 角田大, 日下部吉男, 中村和郎, 西川一八

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 7th 25 2007年5月7日
三生物界間のチロシンtRNA合成酵素によるtRNAの認識の構造比較

角田大, 日下部吉男, 田中信忠, 大野敏, 中村政志, 千田俊哉, 森口朋尚, 朝井範夫, 関根光雄, 横川隆志, 西川一八, 中村和郎

日本結晶学会年会講演要旨集 2007 98 2007年
ヒト・リボヌクレアーゼLのアンキリン反復ドメインの結晶構造

TANAKA Nobutada, KUSAKABE Yoshio, SAKAMOTO Yasumitsu, AOKI Ken-ichi, TSUNODA Masaru, KITAGAWA Yasuyuki, NAKAMURA Kazuo T.

KEK Progress Report (2005-5 CD-ROM) 2005年
超分子2-オキソグルタル酸脱水素酵素複合体を構成する成分タンパク質の構造研究

角田大, 鈴木薫, 関口武司, 竹中章郎

いわき明星大学ハイテクリサーチセンター平成10～平成14年度研究成果報告書 15 26-32 2003年
X-ray Analysis of Full Size Pig E2 of 2-Oxo glutarate Dehydrogenase Complex

20th European Crystallographic Meeting Abstracts 216 2001年
Oxidized thymidine induces mutagenesis through reversed wobble pairing with guanosine

20th European Crystallographic Meeting Abstracts 42 2001年
X-ray Analysis of Full Size Pig E2 of 2-oxo glutarate Dehydrogenase Complex

143 2001年
Crystallization and preliminary X-ray analysis of a DNA dodecamer containing 2′-deoxy-5-formyluridine; what is the role of magnesium cation in crystallization of Dickerson-type DNA dodecamers?

M. Tsunoda, N. Karino, Y. Ueno, A. Matsuda, A. Takenaka

Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography 57(2) 345-348 2001年
X-ray analysis of a DNA dodecamer containing 5-fromyluracil

19th European Crystallographic Meeting Abstracts 273 2000年
Crystallization of Nucleic Acid Enzyme : Leadzyme

2nd RNA Meeting Abstracts 68 2000年
Crystallization of DIS from HIV-1 part (]G0002[)

2nd RNA Meeting Abstracts 52 2000年
X-ray analyses of two DNA dodecamers containing N⁴-methoxycytosine paired with adenine or guanine

Nucleic Acids Symposium Series 44 239-240 2000年
Crystallization of DIS from HIV-1

1st RNA Meeting Abstracts 79 1999年
Potential analysis of aminoacylation of ATP in aminoacyl-tRNA Synthetase

Nucleic Acids Symposium Series 39 247-248 1998年
Packing change of DNA dodecamer containing 2'-Deoxy-N⁶-methoxyadenosine

160 1997年
X-ray Analysis of Eulcaryotic Yeast Lipoamide Dehydrogenase

Photon Factory Activity Report 14 119 1997年
X-ray Analysis of DNA Dodecamer Containing 2'-Deoxy-N⁶-methoxyadenosine

Photon Factory Activity Report 14 395 1997年
Electrostatic Potentials for Anticodon Identity

17th International tRNA Workshop Abstracts 4-33 1997年

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書籍等出版物

わかりやすい物理化学第２版

中村和郎, 北川康行, 甲谷繁, 高橋哲郎, 田中信忠, 谷本能文, 角田大, 戸原明, 豊田栄子, 仲西功, 藤田幸久, 森本正太郎 (担当:共著, 範囲:12章結晶とX線回折法)

廣川書店 2010年9月 (ISBN: 9784567223126)
構造生物学-ポストゲノム時代の蛋白質研究-

共立出版 2007年 (ISBN: 9784320056497)

講演・口頭発表等

新規抗HIV蛋白質アクチノヒビンならびにそのマンノビオースとの複合体の結晶構造

角田大, 鈴木薫, 相良翼, 高橋淳, 関口武司, 田中晴雄, 竹中章郎

日本薬学会第130年会 2010年3月
放線菌より単離した新規anti-HIV蛋白質アクチノヒビンならびにそのマンノビオースとの複合体のX線構造

角田大, 鈴木薫, 相良翼, 高橋淳, 猪腰淳嗣, 大村智, 関口武司, 田中晴雄, 竹中章郎

第82回日本生化学会大会 2009年10月
抗HIVタンパク質アクチノヒビンの結晶構造解析

角田大, 鈴木薫, 相良翼, 高橋淳, 竹中章郎, 田中晴雄

PFシンポジウム26 2008年3月
三生物界間のチロシンｔRNA合成酵素によるｔRNAの認識の構造比較

角田大, 日下部吉男, 田中信忠, 大野敏, 中村政志, 千田俊哉, 森口朋尚, 朝井範夫, 関根光雄, 横川隆志, 西川一八, 中村和郎

日本結晶学会 2007年12月
O6-メチル化DNA修復酵素の反応メカニズムの解析

日本薬学会 2007年
Crystal structure of O6-methylguanine-DNA methyltransferase

AsCa'06/CrSJ 2006年
O6メチル化DNA修復酵素の結晶構造

ＰＦシンポジウム２３ 2006年
好熱性古細菌由来のRNAヘリカーゼの精製と結晶化

日本薬学会 2005年
好熱性古細菌由来PCNAの精製・結晶化

日本薬学会 2005年
超好熱古細菌由来ＭＴＡホスホリラーゼの結晶構造における構造変化

日本薬学会 2005年
Crystallographic Study of the Archaeal DNA Repair Enzymes:EXOIII and APE

IUCr 2005年
X-Ray Analyses of DNA Dodecamers Containing 2'-Deoxy-5-formyluridine

IUCr 2005年
コエンザイムＡ生合成フラビンタンパク質の結晶化

日本結晶学会 2005年
古細菌Sulfolobus tokodaii由来メチル化ＤＮＡ修復酵素の結晶構造

日本薬学会 2004年
シュードウリジンΨと５－メチルウリジンｍ５ＵがｔＲＮＡの構造に及ぼす影響：ｄΨとＵを含むＤＮＡ１２量体のＸ線解析

第31回核酸化学シンポジウム 2004年
酵母由来チロシルｔＲＮＡ合成酵素3成分複合体の立体構造

第31回核酸化学シンポジウム 2004年
古細菌の相同的組み換えタンパク質のＤＮＡ複合体の構造的研究

第31回核酸化学シンポジウム 2004年
ｄΨとＵを含むＤＮＡ１２量体のＸ線解析：シュードウリジンΨと５－メチルウリジンｍ５ＵがｔＲＮＡの構造に及ぼす影響

日本結晶学会 2004年
酵母由来チロシルｔＲＮＡ合成酵素３成分複合体の結晶構造

日本結晶学会 2004年
古細菌由来5'-deoxy-5'-methylthioadenosine phosphorylaseの結晶構造解析

日本結晶学会 2004年

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担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

疑似科学的主張への薬剤師の関わりの検証～ｗｉｔｈコロナにおける薬学教育の在り方～

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2022年6月 - 2024年3月

角田大
構造化学的アプローチによる抗多剤耐性HIV薬の開発

科学研究費補助金基盤（Ｃ） 2015年 - 2017年

角田大
２－オキソ酸関連酸化還元酵素群の立体構造

科学研究費補助金若手研究（B） 2003年 - 2005年

角田大
ロイシンtRNA合成酵素の結晶構造解析

2001年 - 2002年
2-オキソグルタル酸脱水素酵素複合体の結晶構造解析

2001年 - 2002年
Crystal structural analysis of the complex of 2-oxo glutarate dehydrogenate
Crystal structural analysis of Leucyl-tRNA synthetase
HIV/AIDS予防・治療薬の開発－アクチノヒビンの特異な抗HIV活性の改良－

日本私立大学振興・共済事業団学術研究振興資金

社会貢献活動

タンパク質を見てみよう～自宅でできる結晶化とコンピューターによる分子の観察～

講師, 企画

医療創生大学 2022年度ひらめき☆ときめきサイエンス～ようこそ大学の研究室へ～KAKENHI 2022年9月17日 - 2022年9月18日

角田大

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研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

社会貢献活動

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