本田信治 (Shinji HONDA) - マイポータル

基本情報

所属: 福井大学学術研究院医学系部門看護学領域准教授

研究者番号: 90632167
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-1584-4156
J-GLOBAL ID: 200901037722072331
researchmap会員ID: 1000325711

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 遺伝学 /

経歴

2023年4月 - 現在

福井大学, 学術研究院医学系部門基盤看護学分野生命基礎科学領域, 准教授（主任教員）
2016年4月 - 2023年3月

福井大学, 生命情報医科学講座染色体機能学, 助教（主任教員）
2012年6月 - 2016年3月

福井大学, テニュアトラック推進本部, 助教（テニュアトラック教員）
2012年4月 - 2012年5月

福井大学, テニュアトラック推進本部, 特命助教（テニュアトラック教員）
2011年 - 2012年

オレゴン大学, 分子生物学研究所, Research Associate
2011年 - 2012年

Department of Biology and Institute of Molecular Biology, University of Oregon, Research Associate
2005年 - 2011年

オレゴン大学, 分子生物学研究所, Postdoctoral fellow
2005年 - 2011年

Department of Biology and Institute of Molecular Biology, University of Oregon, Postdoctoral fellow
2006年

財団法人上原記念生命科学財団
2003年 - 2005年

日本学術振興会, 特別研究員
2001年 - 2003年

東京工業大学, 生命理工学研究科, Research Assistant
1999年 - 2001年

東京工業大学, 生命理工学研究科, Teaching Assistant

学歴

2001年4月 - 2004年3月

東京工業大学, 生命理工学研究科, 生体システム専攻
1999年4月 - 2001年3月

東京工業大学, 生命理工学研究科, バイオサイエンス専攻
1995年4月 - 1999年3月

東京工業大学, 生命理工学部, 生体機構学科

受賞

2014年

文部科学大臣表彰若手科学者賞

本田信治
2010年

Perkins fund award

本田信治

論文

RNA editing of genomic neighbors controls antiviral response in fungi

Shinji Honda, Ayumi Yokoyama, Nobuhiro Suzuki

Cell Host & Microbe 33(9) 545-559 2025年3月査読有り筆頭著者責任著者
24

RNA Editing of Genomic Neighbors Controls Antiviral Response in Fungi

Shinji Honda, Ayumi Yokoyama, Nobuhiro Suzuki

Sneak Peek (Preprint) 2023年4月筆頭著者責任著者
288

Establishment of Neurospora crassa as a model organism for fungal virology.

Shinji Honda, Ana Eusebio-Cope, Shuhei Miyashita, Ayumi Yokoyama, Annisa Aulia, Sabitree Shahi, Hideki Kondo, Nobuhiro Suzuki

Nature communications 11(1) 5627-5627 2020年11月6日査読有り筆頭著者
6

LSD1 prevents aberrant heterochromatin formation in Neurospora crassa.

William K Storck, Vincent T Bicocca, Michael R Rountree, Shinji Honda, Tereza Ormsby, Eric U Selker

Nucleic acids research 48(18) 10199-10210 2020年10月9日査読有り
5

Normal Patterns of Histone H3K27 Methylation Require the Histone Variant H2A.Z in Neurospora crassa.

Abigail J Courtney, Masayuki Kamei, Aileen R Ferraro, Kexin Gai, Qun He, Shinji Honda, Zachary A Lewis

Genetics 216(1) 51-66 2020年9月査読有り
151

Nucleosome Positioning by an Evolutionarily Conserved Chromatin Remodeler Prevents Aberrant DNA Methylation in Neurospora.

Andrew D Klocko, Miki Uesaka, Tereza Ormsby, Michael R Rountree, Elizabeth T Wiles, Keyur K Adhvaryu, Shinji Honda, Eric U Selker

Genetics 211(2) 563-578 2018年12月15日査読有り
229

ASH1-catalyzed H3K36 methylation drives gene repression and marks H3K27me2/3-competent chromatin.

Vincent T Bicocca, Tereza Ormsby, Keyur K Adhvaryu, Shinji Honda, Eric U Selker

eLife 7 e41497 2018年11月23日査読有り
10

Telomere repeats induce domains of H3K27 methylation in Neurospora

Kirsty Jamieson, Kevin J. McNaught, Tereza Ormsby, Neena A. Leggett, Shinji Honda, Eric U. Selker

eLife 7 e31216 2018年1月3日査読有り
6

Normal chromosome conformation depends on subtelomeric facultative heterochromatin in Neurospora crassa

Andrew D. Klocko, Tereza Ormsby, Jonathan M. Galazka, Neena A. Leggett, Miki Uesaka, Shinji Honda, Michael Freitag, Eric U. Selker

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 113(52) 15048-15053 2016年12月査読有り
4

Dual chromatin recognition by the histone deacetylase complex HCHC is required for proper DNA methylation in Neurospora crassa

Shinji Honda, Vincent T. Bicocca, Jordan D. Gessaman, Michael R. Rountree, Ayumi Yokoyama, Eun Y. Yu, Jeanne M. L. Selker, Eric U. Selker

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 113(41) E6135-E6144 2016年10月査読有り
5

Neurospora chromosomes are organized by blocks of importin alpha-dependent heterochromatin that are largely independent of H3K9me3

Jonathan M. Galazka, Andrew D. Klocko, Miki Uesaka, Shinji Honda, Eric U. Selker, Michael Freitag

GENOME RESEARCH 26(8) 1069-1080 2016年8月査読有り
4

The Cullin-4 Complex DCDC Does Not Require E3 Ubiquitin Ligase Elements To Control Heterochromatin in Neurospora crassa

Keyur K. Adhvaryu, Jordan D. Gessaman, Shinji Honda, Zachary A. Lewis, Paula L. Grisafi, Eric U. Selker

EUKARYOTIC CELL 14(1) 25-28 2015年1月査読有り
6

The common ancestral core of vertebrate and fungal telomerase RNAs

Xiaodong Qi, Yang Li, Shinji Honda, Steve Hoffmann, Manja Marz, Axel Mosig, Joshua D. Podlevsky, Peter F. Stadler, Eric U. Selker, Julian J. -L. Chen

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 41(1) 450-462 2013年1月
Heterochromatin protein 1 forms distinct complexes to direct histone deacetylation and DNA methylation

Shinji Honda, Zachary A. Lewis, Kenji Shimada, Wolfgang Fischle, Ragna Sack, Eric U. Selker

NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY 19(5) 471-U24 2012年5月
4

DNA Methylation and Normal Chromosome Behavior in Neurospora Depend on Five Components of a Histone Methyltransferase Complex, DCDC

Zachary A. Lewis, Keyur K. Adhvaryu, Shinji Honda, Anthony L. Shiver, Marijn Knip, Ragna Sack, Eric U. Selker

PLOS GENETICS 6(11) e1001196 2010年11月
6

Identification of DIM-7, a protein required to target the DIM-5 H3 methyltransferase to chromatin

Zachary A. Lewis, Keyur K. Adhvaryu, Shinji Honda, Anthony L. Shiver, Eric U. Selker

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 107(18) 8310-8315 2010年5月
5

The DMM complex prevents spreading of DNA methylation from transposons to nearby genes in Neurospora crassa

Shinji Honda, Zachary A. Lewis, Maite Huarte, Lucy Y. Cho, Larry L. David, Yang Shi, Eric U. Selker

GENES & DEVELOPMENT 24(5) 443-454 2010年3月
6

Tools for Fungal Proteomics: Multifunctional Neurospora Vectors for Gene Replacement, Protein Expression and Protein Purification

Shinji Honda, Eric U. Selker

GENETICS 182(1) 11-23 2009年5月
A Novel Potential Role for Gametogenetin-Binding Protein 1 (GGNBP1) in Mitochondrial Morphogenesis During Spermatogenesis in Mice

Takeshi Aihara, Nobuhiro Nakamura, Shinji Honda, Shigehisa Hirose

BIOLOGY OF REPRODUCTION 80(4) 762-770 2009年4月
6

Relics of repeat-induced point mutation direct heterochromatin formation in Neurospora crassa

Zachary A. Lewis, Shinji Honda, Tamir K. Khlafallah, Jennifer K. Jeffress, Michael Freitag, Fabio Mohn, Dirk Schuebeler, Eric U. Selker

GENOME RESEARCH 19(3) 427-437 2009年3月

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講演・口頭発表等

RNA Editing of Genomic Neighbors Controls Antiviral Response in Neurospora crassa

Honda S, Yokoyama A, Suzuki N

32nd Fungal Genetics Conference 2024年3月16日招待有り
モデル生物アカパンカビを利用したウイルス・宿主の相利共生とエピジェティクス制御

本田信治

第6回北陸エピジェネティック研究会 2019年10月30日招待有り
山火事の熱と煙で目覚めるアカパンカビ子嚢胞子のシグナル伝達経路網

上坂美紀, 横山歩, 本田信治

第91回日本遺伝学会 2019年9月11日招待有り
山火事の熱と煙で目覚めるアカパンカビ子嚢胞子のシグナル伝達経路網

本田信治

第45回岡山大学植物病理セミナー 2019年5月18日招待有り
Ascospore sleepless-1 and -2 are required for ascospore dormancy in Neurospora crassa

Uesaka M, Yokoyama A, Honda S

Neurospore meeting 2018 2018年10月招待有り
Shelterin is required for telomeric integrity in Neurospora crassa

Uesaka M, Yokoyama A, Lewis ZA, Honda S

The EMBO conference on Telomeres, telomerase and disease 2016年4月
Shelterin is required for telomeric integrity in Neurospora crassa

Uesaka M, Yokoyama A, Lewis ZA, Honda S

Neurospore meeting 2016 2016年3月
Identification and characterization of Neurospora Shelterin

Uesaka M, Yokoyama A, Lewis ZA, Honda S

The 9th Cold Spring Harbor meeting on Telomeres & Telomerase, Cold Spring Harbor 2015年4月
Four color imagining by fluorescent protein tagging system in Neurospora crassa

Yokoyama A, Uesaka M, Honda S

The 28th Fungal Genetics Conference 2015年3月
Identification of Neurospora Shelterin

Uesaka M, Yokoyama A, Honda S

The 28th Fungal Genetics Conference 2015年3月
DNA methylation-dependent and independent silencing through HP1 in Neurospora crassa

Honda S

Temasek Life Laboratory 2015年1月29日招待有り
Heat break of ascospore dormancy in Neurospora crassa

Uesaka M, Honda S

Neurospore meeting 2014 2014年3月
Opposing activities of the HCHC and DMM complexes maintain proper DNA methylation in Neurospora crassa

Honda S

The 27th Fungal Genetics Conference at Asilomar 2013年3月
アカパンカビの重複配列に対するエピジェネティクス制御

第７回エピジェネティクス研究会年会 2013年
Neurospora crassa is a Better Fungal Model System for the Study of Telomerase Regulation and Telomere Biology

Fungal Genetics Conference 2011年
Control and distribution of chromatin domains in Neurospora crassa

Fungal Genetics Conference 2011年
The chromodomain protein CDP-2 modulates DNA methylation in Neurospora crassa

Fungal Genetics Conference 2011年
Neurospora crassa is a Better Fungal Model System for the Study of Telomerase Regulation and Telomere Biology

Fungal Genetics Conference 2011年
Control and distribution of chromatin domains in Neurospora crassa

Fungal Genetics Conference 2011年
The chromodomain protein CDP-2 modulates DNA methylation in Neurospora crassa

Fungal Genetics Conference 2011年

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所属学協会

Genetics Society of America

共同研究・競争的資金等の研究課題

子嚢菌門の糸状菌に保存された生殖期特異的ウイルス除去機構を担う因子群の同定

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究（萌芽） 2022年6月 - 2025年3月
非ドメイン型バイオポリマーを介した菌類ウイルス・宿主間の特殊な共生関係

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2022年6月 - 2024年3月
宿主アカパンカビの抗ウイルス免疫暴走化機序の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2024年3月

本田信治, 鈴木信弘
モデル糸状菌アカパンカビを用いたウイルス研究フロンティア

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2021年7月 - 2023年3月

近藤秀樹, 鈴木信弘, 本田信治
モデル生物アカパンカビを利用したウイルス・宿主の相利共生と環境適応の関係解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2019年4月 - 2021年3月

本田信治
山火事の熱と煙で目覚めるアカパンカビ子嚢胞子のシグナル伝達経路網

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2017年4月 - 2019年3月

本田信治
アカパンカビ子嚢胞子が山火事で目覚める分子機構の解明とその応用

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 若手研究(A) 2014年4月 - 2019年3月

本田信治
アカパンカビゲノム防御機構RIP可視化システムの構築

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2015年4月 - 2017年3月

本田信治
アカパンカビの特殊能力を利用した染色体適応機構の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2013年4月 - 2015年3月

本田信治
エピジェネティクス修飾を暗号解読する蛋白質複合体の網羅的解析

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2013年4月 - 2015年3月

本田信治
ヘテロクロマチンの境界を制御する新規蛋白質の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援研究活動スタート支援 2012年8月 - 2014年3月

本田信治
精子形成時の強発現するミトコンドリア融合・分裂因子の作用機構と生理的役割の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2003年 - 2004年

本田信治

本田信治

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講演・口頭発表等

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