吉田天士 (Takashi Yoshida) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学大学院農学研究科応用生物科学専攻教授

学位: 博士(農学)(京都大学)
修士(農学)(京都大学)

J-GLOBAL ID: 200901041434036280
researchmap会員ID: 1000360363

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 水圏生産科学 /

学歴

委員歴

受賞

2015年3月

水産学進歩賞, 日本水産学会

論文

107

Phylogenetic diversity of putative nickel-containing carbon monoxide dehydrogenase-encoding prokaryotes in the human gut microbiome

Yuka Adachi Katayama, Ryoma Kamikawa, Takashi Yoshida

Microbial Genomics 2024年8月21日
Taxonomic difference in marine bloom-forming phytoplanktonic species affects the dynamics of both bloom-responding prokaryotes and prokaryotic viruses

Hiroaki Takebe, Kento Tominaga, Tatsuhiro Isozaki, Tetsuhiro Watanabe, Keigo Yamamoto, Ryoma Kamikawa, Takashi Yoshida

mSystems 2024年4月16日
Draft genome of Parageobacillus thermoglucosidasius, a member of hydrogenogenic carbon monoxide utilizers, isolated from a freshwater lake sediment

Shiho Nishida, Jota Suzuki, Masao Inoue, Ryoma Kamikawa, Takashi Yoshida

Microbiology Resource Announcements 13(2) 2024年2月15日
A rumen virosphere with implications of contribution to fermentation and methane production, and endemism in cattle breeds and individuals

Yoshiaki Sato, Hiroaki Takebe, Kento Tominaga, Jumpei Yasuda, Hajime Kumagai, Hiroyuki Hirooka, Takashi Yoshida

Applied and Environmental Microbiology 2024年1月24日
Population‐level prokaryotic community structures associated with ferromanganese nodules in the Clarion‐Clipperton Zone (Pacific Ocean) revealed by 16S rRNA gene amplicon sequencing

Kento Tominaga, Hiroaki Takebe, Chisato Murakami, Akira Tsune, Takahiko Okamura, Takuji Ikegami, Yosuke Onishi, Ryoma Kamikawa, Takashi Yoshida

Environmental Microbiology Reports 2023年12月26日
Phylogenetic diversity of the carbon monoxide-utilizing prokaryotes and their divergent carbon monoxide metabolisms in the human gut microbiome

Yuka Adachi Katayama, Ryoma Kamikawa, Takashi Yoshida

2023年10月23日
Construction of multiple metagenome assembled genomes containing carbon monoxide dehydrogenases from anaerobic carbon monoxide enrichment cultures

Shiho Nishida, Kimiho Omae, Masao Inoue, Yoshihiko Sako, Ryoma Kamikawa, Takashi Yoshida

Archives of Microbiology 205(8) 2023年7月20日
Draft Genome Sequence of Thermolongibacillus altinsuensis Strain B1-1, a Novel Hydrogenogenic CO Oxidizer Isolated from Sediment from Lake Biwa in Japan.

Jota Suzuki, Yoshinari Imaura, Shiho Nishida, Ryoma Kamikawa, Takashi Yoshida

Microbiology resource announcements 12(7) e0033423 2023年7月18日
Isolation, Genomic Sequence and Physiological Characterization of Parageobacillus sp. G301, an Isolate Capable of Both Hydrogenogenic and Aerobic Carbon Monoxide Oxidation.

Yoshinari Imaura, Shunsuke Okamoto, Taiki Hino, Yusuke Ogami, Yuka Adachi Katayama, Ayumi Tanimura, Masao Inoue, Ryoma Kamikawa, Takashi Yoshida, Yoshihiko Sako

Applied and environmental microbiology 89(6) e0018523 2023年6月28日
Characteristics of the rumen virome in Japanese cattle

Yoshiaki Sato, Hiroaki Takebe, Kento Tominaga, Jumpei Yasuda, Hajime Kumagai, Hiroyuki Hirooka, Takashi Yoshida

2023年3月20日
Prevalence of Viral Frequency-Dependent Infection in Coastal Marine Prokaryotes Revealed Using Monthly Time Series Virome Analysis.

Kento Tominaga, Nana Ogawa-Haruki, Yosuke Nishimura, Hiroyasu Watai, Keigo Yamamoto, Hiroyuki Ogata, Takashi Yoshida

mSystems 8(1) e0093122 2023年2月23日
Identification of key virus–prokaryote infection pairs that contribute to viral shunt in a freshwater lake

Shang Shen, Kento Tominaga, Kenji Tsuchiya, Tomonari Matsuda, Takashi Yoshida, Yoshihisa Shimizu

2023年2月5日
Ecological Dynamics of Broad- and Narrow-Host-Range Viruses Infecting the Bloom-Forming Toxic Cyanobacterium Microcystis aeruginosa

Daichi Morimoto, Naohiro Yoshida, Aya Sasaki, Satoshi Nakagawa, Yoshihiko Sako, Takashi Yoshida

Applied and Environmental Microbiology 89(2) e0211122 2023年1月23日
Tight association between microbial eukaryote and giant virus communities in the Arctic Ocean

Jun Xia, Sohiko Kameyama, Florian Prodinger, Takashi Yoshida, Kyoung‐Ho Cho, Jinyoung Jung, Sung‐Ho Kang, Eun‐Jin Yang, Hiroyuki Ogata, Hisashi Endo

Limnology and Oceanography 67(6) 1343-1356 2022年6月
Biome-specific distribution of Ni-containing carbon monoxide dehydrogenases

Masao Inoue, Kimiho Omae, Issei Nakamoto, Ryoma Kamikawa, Takashi Yoshida, Yoshihiko Sako

Extremophiles 26(1) 2022年4月
Year-round dynamics of amplicon sequence variant communities differ among eukaryotes, Imitervirales and prokaryotes in a coastal ecosystem.

Florian Prodinger, Hisashi Endo, Yoshihito Takano, Yanze Li, Kento Tominaga, Tatsuhiro Isozaki, Romain Blanc-Mathieu, Yasuhiro Gotoh, Tetsuya Hayashi, Etsunori Taniguchi …

FEMS microbiology ecology 97(12) 2022年1月8日
Identification of 146 Metagenome-assembled Genomes from the Rumen Microbiome of Cattle in Japan

Yoshiaki Sato, Hiroaki Takebe, Kazato Oishi, Jumpei Yasuda, Hajime Kumagai, Hiroyuki Hirooka, Takashi Yoshida

Microbes and Environments 37(4) n/a-n/a 2022年
Viral Nature of the Aquatic Ecosystems

Daichi Morimoto, Kento Tominaga, Hiroaki Takebe, Sigitas Šulčius, Takashi Yoshida

The Biological Role of a Virus 3-25 2022年
Taxonomic and functional characterization of the rumen microbiome of Japanese Black cattle revealed by 16S rRNA gene amplicon and metagenome shotgun sequencing.

Yoshiaki Sato, Hiroaki Takebe, Kento Tominaga, Kazato Oishi, Hajime Kumagai, Takashi Yoshida, Hiroyuki Hirooka

FEMS microbiology ecology 97(12) 2021年12月4日
Diversity analysis of thermophilic hydrogenogenic carboxydotrophs by carbon monoxide dehydrogenase amplicon sequencing using new primers.

Kimiho Omae, Tatsuki Oguro, Masao Inoue, Yuto Fukuyama, Takashi Yoshida, Yoshihiko Sako

Extremophiles : life under extreme conditions 25(1) 61-76 2021年1月査読有り

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MISC

257

メタゲノム解析を用いたアクティブな細菌-ウイルス感染関係の推定

SHEN Shang, SHEN Shang, 富永賢人, 土屋健司, 松田知成, 吉田天士, 清水芳久

日本水環境学会年会講演集 56th 2022年
水生新ウイルス学【JST・京大機械翻訳】|||

NAGASAKI Keizo, OGATA Hiroyuki, YOSHIDA Takashi, TOMARU Yuji, KIMURA Kei, NUNOURA Takuro, TAKAKI Yoshihiro, URAYAMA Shun-ichi

日本ウイルス学会学術集会プログラム・予稿集(Web) 68th 2021年
微細藻類ブルームを起点とした原核生物群集構造の遷移機構に関する研究

武部紘明, 富永賢人, 山本圭吾, 渡邉哲弘, 吉田天士

日本水産学会大会講演要旨集 2020 2020年
好気・嫌気型の両一酸化炭素脱水素酵素を唯一保有する好熱菌の発見と諸性状

井上真男, 日野太貴, 岡元俊輔, 吉田天士, 左子芳彦

日本水産学会大会講演要旨集 2020 2020年
メタゲノム解析で明らかにする琵琶湖ウイルスの多様性

SHEN Shang, 富永賢人, 松田知成, 吉田天士, 清水芳久

日本水環境学会年会講演集 54th 2020年
網羅的転写解析による大阪湾の海洋原核生物とウイルスの日周期の解明

富永賢人, 西門航平, 武部紘明, 吉田天士

日本ゲノム微生物学会年会要旨集 14th 2020年
アスタキサンチン生産緑藻Haematococcus lacustrisのゲノム解析

森本大地, 吉田天士, 澤山茂樹

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2020 2020年
琵琶湖ウイルスの多様性と季節変動

SHEN S., 富永賢人, 土屋健司, 松田知成, 吉田天士, 清水芳久

日本地球化学会年会要旨集(Web) 67th 2020年
海洋原核生物も”密集”すればウイルスによる感染を受けるのか?

富永賢人, 山本圭吾, 神川龍馬, 緒方博之, 吉田天士

日本地球化学会年会要旨集(Web) 67th 2020年
ミクロコズム培養系を用いた海洋性優占原核生物遷移過程におけるウイルス動態解析

武部紘明, 富永賢人, 神川龍馬, 山本圭吾, 渡邉哲弘, 吉田天士

日本地球化学会年会要旨集(Web) 67th 2020年
大阪湾における海洋微生物・ウイルスの群集ダイナミクスと生態学的相互作用解析

富永賢人, 晴気七菜, 藤原健太郎, 西村陽介, 西村陽介, 山本圭吾, 綿井博康, 左子芳彦, 緒方博之, 吉田天士

日本ゲノム微生物学会年会要旨集 13th 2019年
アオコ原因ラン藻Microcystis aeruginosaと相互作用する新規ウイルスの定量的検出法の確立と環境動態解析

森本大地, 吉田尚寛, 左子芳彦, 吉田天士

日本水産学会大会講演要旨集 2019 2019年
大阪湾の海洋微生物・ウイルスの生態学的相互作用解析

富永賢人, 西村陽介, 山本圭吾, 緒方博之, 左子芳彦, 吉田天士

日本水産学会大会講演要旨集 2019 2019年
火山帯水圏環境由来Parageobacillus属水素生成型一酸化炭素(CO)資化菌のゲノム解析

井上真男, 谷村あゆみ, 大神優祐, 日野太貴, 吉田天士, 左子芳彦

日本水産学会大会講演要旨集 2019 2019年
セルソーターによる高純度細胞分取法を利用した海洋ラン藻の細胞内ウイルス定量法の確立の試み(短縮題目:海洋ラン藻の細胞内ウイルス定量法)

礒崎達大, 富永賢人, 山本圭吾, 左子芳彦, 吉田天士

日本水産学会大会講演要旨集 2019 2019年
全原核生物の16S rRNA系統における一酸化炭素(CO)デヒドロゲナーゼの分布パターンを利用した水素生成型CO資化菌の分子生態

大前公保, 福山宥斗, 大黒達希, 大神優祐, 安田尚登, 吉田天士, 左子芳彦

日本水産学会大会講演要旨集 2019 2019年
琵琶湖堆積物からの過去100年のウイルス叢復元の試み

本庄三恵, 槻木玲美, 加三千宣, 岡崎友輔, 木村成子, 吉田天士, 左子芳彦, 工藤洋

日本生態学会大会講演要旨(Web) 66th 2019年
海洋性真核微細藻類が原核生物群集構造に与える影響に関する研究

武部紘明, 富永賢人, 礒崎達大, 山本圭吾, 渡邉哲弘, 吉田天士

日本微生物生態学会大会(Web) 33rd 2019年
メタゲノム解析でひも解く淡水湖のファージの多様性と生態

岡崎友輔, 西村陽介, 吉田天士, 緒方博之, 中野伸一

日本微生物生態学会大会(Web) 33rd 2019年
未分離の海洋性Bacteroidetes門細菌感染ウイルスの生物情報学的探索

富永賢人, 緒方博之, 吉田天士

日本微生物生態学会大会(Web) 33rd 2019年

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書籍等出版物

環境と微生物の事典

吉田天士

朝倉書店 2014年
食品微生物学の基礎 = Fundamentals of food microbiology

藤井, 建夫, 石田, 真巳, 久田, 孝, 小長谷, 幸史, 小栁, 喬, 左子, 芳彦, 里見, 正隆, 土戸, 哲明, 中野, 宏幸, 藤川, 浩, 宮本, 敬久, 森田, 幸雄, 吉田, 天士

講談社 2013年9月 (ISBN: 9784061398382)
Temporal changes in microcystin-producing Microcystis populations of a Japanese lake.

Yoshida, M, Yoshida, T, Takashima, Y, Hosoda, N, Hiroishi, S

Moesturup, �et al. (eds) Proceedings of the 12th international conference on harmful algae. Inernational society for the study of harmful algae and intergovemmental oceanographic commission of UNERSCO. 2008, Copenhagen p.144-146. 2008年
Survival of Heterocapsa circularisquama (Dinophyceae) as a pellicle cyst induced by low temperature in the laboratory.

Yoshida, T, Takahashi, Y, Ishikawa, K, Wang, M-K, Hiroishi, S

Moesturup, �et al. (eds) Proceedings of the 12th international conference on harmful algae. Inernational society for the study of harmful algae and intergovemmental oceanographic commission of UNERSCO. 2008, Copenhagen p.47-49. 2008年

講演・口頭発表等

有害・有毒プランクトンに関する分子生理生態学的研究

吉田天士

平成26年度春季日本水産学大会 2015年3月31日招待有り
環境における微生物とウイルスのせめぎ合い

吉田天士

JT 生命誌研究館セミナー 2015年3月18日招待有り
ファージゲノムに学ぶラン藻の分子生物学

吉田天士

ラン藻の分子生物学 201 2011年12月3日招待有り
アオコとファージのせめぎ合い～CRISPRの解析から見えたもの～

吉田天士

藻類談話会 2011年11月9日招待有り
アオコとウィルスのせめぎ合い

吉田天士

日本陸水学会第76回大会「公開シンポジウムⅡ アオコ研究最前線の多様性」 2011年9月24日招待有り
水圏環境のウイルス・ファージ研究の現状と将来展望

大阪大学蛋白質研究所セミナー合同シンポジウム・第3回ファージ研究会「バクテリオファージ研究の課題と展望」 2010年
ファージゲノム情報のアオコ防除への活用

平成22年度日本水産学会秋季大会シンポジウム「微生物ゲノムが拓く水産の新たな潮流」 2010年
藻類とウイルスの関係－ゲノミクスの視点から. ナショナルバイオリソースプロジェクト藻類シンポジウム「未来を支える藻類、その多様性 ―ゲノミクス・ポストゲノミクスの視点から―」東京、2011.1.29パンコムギに導入されたライムギB染色体の染色体不分離

ナショナルバイオリソースプロジェクト藻類シンポジウム「未来を支える藻類、その多様性 ―ゲノミクス・ポストゲノミクスの視点から―」 2010年
シアノファージ―Microcystis aeruginosa間の生物学・生態学的相互作用

京都大学生態研究センター・共同利用事業セミナー「アオコの生態・生理・分子系統地理学的研究の現状」 2009年

所属学協会

Works(作品等)

環境における有毒ラン藻Microcystis属の高感度モニタリングシステムの開発

1999年 - 2000年
Deveropment of monitoring system for toxic cyanobacteria Microcystis

1999年 - 2000年

主要な共同研究・競争的資金等の研究課題

ウイルス駆動の海洋低次生態系の時計仕掛けと海洋への影響解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 基盤研究(S) 2021年7月 - 2026年3月

吉田天士, 長崎慶三, 緒方博之, 神川龍馬, 山本圭吾, 大美博昭

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吉田天士

基本情報

研究キーワード

研究分野

学歴

委員歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

所属学協会

Works(作品等)

主要な共同研究・競争的資金等の研究課題

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