城所俊一 (Shun-ichi Kidokoro) - マイポータル

基本情報

所属: 蛋白質物性学研究所所長 (理学博士)
: 長岡技術科学大学名誉教授

学位: 理学博士(1988年7月東京大学)
理学修士(1984年3月東京大学)
理学士(1982年3月東京大学)

連絡先: kidokoroproteinphys.org
研究者番号: 80195320
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-3714-867X
J-GLOBAL ID: 200901048304709511
researchmap会員ID: 1000364608

外部リンク: https://www.proteinphys.org

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 生物物理学 /

経歴

2024年5月 - 現在

蛋白質物性学研究所, 所長
2024年4月 - 現在

長岡技術科学大学, 名誉教授
2011年12月 - 2024年3月

長岡技術科学大学, 物質生物系, 教授
2007年4月 - 2011年11月

長岡技術科学大学, 准教授
1999年1月 - 2007年3月

長岡技術科学大学, 助教授
1990年4月 - 1998年12月

財団法人相模中央化学研究所, 研究員
1986年11月 - 1990年3月

東京大学理学部物理学教室, 助手

学歴

1984年4月 - 1986年11月

東京大学, 理学系研究科, 物理学専門課程第１種博士課程
1982年4月 - 1984年3月

東京大学, 理学系研究科, 物理学専門課程修士課程
1979年4月 - 1982年3月

東京大学, 理学部, 物理学科
1977年4月 - 1979年3月

東京大学, 教養学部, 理科一類

委員歴

2015年10月 - 2017年9月

日本熱測定学会, 会長

受賞

2013年10月

学会賞, 日本熱測定学会

城所俊一
2007年8月

日本工学教育協会賞業績賞, 日本工学教育協会

論文

等温滴定型カロリメーターによる酵素活性阻害剤の探索

加藤悦子, 瀬尾和聖, 城所俊一

熱測定 51(1) 11-16 2025年1月査読有り
Anion effects on the structure and stability of 3D domain-swapped cytochrome c dimer

Kodai Fujiwara, Michiko Ryuzaki, Masaru Yamanaka, Tsuyoshi Mashima, Tomonori Saotome, Shun-ichi Kidokoro, Shun Hirota

Chemistry Letters 2024年8月2日
Design and Escherichia coli Expression of a Natively Folded Multi-Disulfide Bonded Influenza H1N1-PR8 Receptor-Binding Domain (RBD)

Thao Tu, Tharangani Rathnayaka, Toshiyo Kato, Kenji Mizutani, Tomonori Saotome, Keiichi Noguchi, Shun-ichi Kidokoro, Yutaka Kuroda

International Journal of Molecular Sciences 25(7) 3943-3943 2024年4月1日
Reverse Engineering Analysis of the High-Temperature Reversible Oligomerization and Amyloidogenicity of PSD95-PDZ3.

Sawaros Onchaiya, Tomonori Saotome, Kenji Mizutani, Jose C Martinez, Jeremy R H Tame, Shun-Ichi Kidokoro, Yutaka Kuroda

Molecules (Basel, Switzerland) 27(9) 2022年4月28日
Blocking PSD95-PDZ3's amyloidogenesis through point mutations that inhibit high-temperature reversible oligomerization (RO).

Tomonori Saotome, Sawaros Onchaiya, Subbaian Brindha, Taichi Mezaki, Satoru Unzai, Keiichi Noguchi, Jose C Martinez, Shun-Ichi Kidokoro, Yutaka Kuroda

The FEBS journal 2021年12月30日
DSC Analysis of Reversible Oligomers of Denatured Protein Molecules

Shun-ichi KIDOKORO

Seibutsu Butsuri 61(6) 370-373 2021年
Reversible Oligomerization and Reverse Hydrophobic Effect Induced by Isoleucine Tags Attached at the C-Terminus of a Simplified BPTI Variant

Shigeyoshi Nakamura, Md. Golam Kibria, Satoru Unzai, Yutaka Kuroda, Shun-ichi Kidokoro

Biochemistry 59(39) 3660-3668 2020年10月6日
Thermodynamic Analysis of Point Mutations Inhibiting High-Temperature Reversible Oligomerization of PDZ3

Tomonori Saotome, Taichi Mezaki, Subbaian Brindha, Satoru Unzai, Jose C. Martinez, Shun-ichi Kidokoro, Yutaka Kuroda

Biophysical Journal 119(7) 1391-1401 2020年10月
Hydrophobic surface residues can stabilize a protein through improved water-protein interactions.

Mohammad, M Islam, Kei Kobayashi, Shun Ichi Kidokoro, Yutaka Kuroda

FEBS J. 2019年1月7日査読有り
Protocols of IATC, DSC, and PPC: The Multistate Structural Transition of Cytochrome c

Shigeyoshi Nakamura, Shun-ichi Kidokoro

Methods in Molecular Biology 1964 17-32 2019年
DSCにより明らかになった蛋白質の高温での可逆的オリゴマー形成

城所俊一

熱測定 46(1) 2019年
Significance of H461 at subsite +1 in substrate binding and transglucosylation activity of amylomaltase from Corynebacterium glutamicum

Suthipapun Tumhom, Kuakarun Krusong, Shun-ichi Kidokoro, Etsuko Katoh, Piamsook Pongsawasdi

Archives of Biochemistry and Biophysics 652 3-8 2018年8月15日査読有り
Role of metal ion binding and protonation in ATP hydrolysis energetics

Shun-Ichi Kidokoro

The Role of Water in ATP Hydrolysis Energy Transduction by Protein Machinery 25-32 2018年5月7日
蛋白質に物理を学ぶ

Shun-ichi KIDOKORO

Seibutsu Butsuri 58(2) 067-067 2018年
Thermodynamics of the Thermal Denaturation of Acid Molten Globule State of Cytochrome c Indicate a Reversible High-Temperature Oligomerization Process

Shigeyoshi Nakamura, Tomonori Saotome, Akiko Nakazawa, Masao Fukuda, Yutaka Kuroda, Shun-ichi Kidokoro

BIOCHEMISTRY 56(18) 2372-2378 2017年5月査読有り
Crystal structures of highly simplified BPTIs provide insights into hydration-driven increase of unfolding enthalpy

Mohammad Monirul Islam, Masafumi Yohda, Shun-ichi Kidokoro, Yutaka Kuroda

SCIENTIFIC REPORTS 7(41205) 1-10 2017年3月査読有り
Conserved and unique thermodynamic properties of lactate dehydrogenases in an ectothermic organism, the teleost Microstomus achne, and an endothermic organism, bovine

Mika Yonezawa, Mizuki Nakagawa, Shigeyoshi Nakamura, Tatsufumi Goto, Kotomi Sugawara, Shun-Ichi Kidokoro, Hideki Wakui, Wataru Nunomura

JOURNAL OF BIOCHEMISTRY 160(5) 299-308 2016年11月査読有り
Enzymatic and thermodynamic profiles of a heterotetramer lactate dehydrogenase isozyme in swine

Tatsufumi Goto, Kotomi Sugawara, Shigeyoshi Nakamura, Shun-Ichi Kidokoro, Hideki Wakui, Wataru Nunomura

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 479(4) 860-867 2016年10月査読有り
Roles of N287 in catalysis and product formation of amylomaltase from Corynebacterium glutamicum

Pitchanan Nimpiboon, Kuakarun Krusong, Jarunee Kaulpiboon, Shun-ichi Kidokoro, Piamsook Pongsawasdi

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 478(2) 759-764 2016年9月査読有り
Unusual Reversible Oligomerization of Unfolded Dengue Envelope Protein Domain 3 at High Temperatures and Its Abolition by a Point Mutation

Tomonori Saotome, Shigeyoshi Nakamura, Mohammad M. Islam, Akiko Nakazawa, Mariano Dellarole, Fumio Arisaka, Shun-ichi Kidokoro, Yutaka Kuroda

BIOCHEMISTRY 55(32) 4469-4475 2016年8月査読有り

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MISC

1PT179 多様な分子コンホメーションを取り得る溶質の小角X線散乱プロフィルの近似計算法(日本生物物理学会第50回年会(2012年度))

Seki Yasutaka, Nakamura Shigeyoshi, Kidokoro Shun-ichi, Nonaka Takamasa, Soda Kunitsugu

生物物理 52 S99 2012年
Synthesis of D-trigalacturonic acid methylglycoside

Yamamoto, K, Sato, Y, Ishimori, A, Miyairi, K, Okuno, T, Nemoto, N, Shimizu, H, Kidokoro, S, Hashimoto, M

Biosci. Biotech. Biochem 71 1230-1235 2008年
2P086 シトクロムcのモルテングロビュール状態の熱力学的研究(蛋白質(物性(安定性、折れ畳みなど)),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)

中村成芳, 関安孝, 城所俊一

生物物理 47(1) 2007年11月20日
好酸性好熱古細菌由来StHsp14.0の多量体形成へのC末端IXIモチーフの役割と機能解析

阿部哲也, 佐治仁, 飯塚怜, 吉田尊雄, 城所俊一, 石井則行, 養王田正文

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 7th 96 2007年5月7日
1P121 Studies of Molten-Globule Structure of Cytochrome c by Detailed Analysis of Solution X-ray Scattering Profiles(3. Protein folding and misfolding (1),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Seki Yasutaka, Nakamura Shigeyoshi, Inoue Katsuaki, Kidokoro Shun-ichi, Soda Kunitsugu

生物物理 46(2) S177 2006年
1P036 The Structural Characterization of the Molten Globule States of Cytochrome c Evaluated by Solution X-ray Scattering(1. Protein structure and dynamics (I),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Nakamura Shigeyoshi, Seki Yasutaka, Soda Kunitugu, Kidokoro Shun-ichi

生物物理 46(2) S155 2006年
1P090 シトクロムcのモルテングロビュール状態の多状態熱転移に伴う構造・体積変化(蛋白質 C) 物生(安定性、折れたたみなど)))

中村成芳, 馬場隆之, 関安孝, 城所俊一

生物物理 45(1) 2005年10月19日
3P055 シトクロムcの低塩濃度の熱転移で検出された安定な中間状態(蛋白質 C) 物性(安定性、折れたたみなど)))

城所俊一, 中村成芳, 馬場隆之, 関安孝

生物物理 45(1) 2005年10月19日
1G0945 蛋白質の水和状態のコンホメーション依存性

安藤健一, 関安孝, 城所俊一, 曽田邦嗣

生物物理 40(1) S50 2000年8月5日
1G0930 蛋白質の部分分子容と水和効果の解析

曽田邦嗣, 関安孝, 城所俊一

生物物理 40(1) S50 2000年8月5日
2A1345 シャペロニンGroESの溶液X線散乱プロフィルの解析

関安孝, 日暮卓志, 市村薫, 柊弓絃, 河田康志, 城所俊一, 曽田邦嗣

生物物理 40(1) S115 2000年8月5日
3PA061 ミオグロビンの酸変性状態における3次的残存構造

関安孝, 城所俊一, 曽田邦嗣

生物物理 39(1) S164 1999年9月2日
3PA025 低水和状態における蛋白質の水和構造・動力学 II

安藤健一, 関安孝, 城所俊一, 曽田邦嗣

生物物理 39(1) S155 1999年9月2日
3PA054 蛋白質表面近傍の水和水分子の占有体積

曽田邦嗣, 関安孝, Rozi Ismail E, 城所俊一

生物物理 39(1) S162 1999年9月2日

書籍等出版物

熱量測定・熱分析ハンドブック

日本熱測定学会

丸善出版 2020年8月 (ISBN: 9784621305072)
タンパク質のアモルファス凝集と溶解性 : 基礎研究からバイオ産業・創薬研究への応用まで

黒田, 裕, 有坂, 文雄

シーエムシー出版 2019年2月 (ISBN: 9784781313979)
Microcalorimetry of biological molecules : methods and protocols

2019年 (ISBN: 9781493991785)
The Role of Water in ATP Hydrolysis Energy Transduction by Protein Machinery

2018年 (ISBN: 9789811084584)
熱分析第4版

吉田, 博久, 古賀, 信吉 (担当:共著, 範囲:タンパク質・核酸・脂質)

講談社 2017年2月 (ISBN: 9784061543966)
Methods in Enzymology, Vol.567

Kidokoro S, Nakamura S (担当:共著, 範囲:pp. 391-412)

ScienceDirect 2016年1月30日
Comprehensive Nanoscience and Technology

Academic Press 2010年12月10日 (ISBN: 0470843128, 9780123743909, 0123743907)
熱量測定・熱分析ハンドブック

日本熱測定学会

丸善 2010年1月 (ISBN: 9784621081921)
分子間相互作用解析ハンドブック

磯部俊明ほか多数

羊土社 2007年10月1日
生物物理学ハンドブック

石渡信一ほか多数

朝倉書店 2007年4月25日
タンパク質科学 : 構造・物性・機能

後藤, 祐児, 桑島, 邦博, 谷澤, 克行

化学同人 2005年10月 (ISBN: 4759810471)
第５版実験化学講座 6 温度・熱,圧力

日本化学会

丸善 2005年7月 (ISBN: 4621073052)
最新熱分析

小沢, 丈夫, 吉田, 博久

講談社 2005年4月 (ISBN: 4061543172)
The nature of biological systems as revealed by thermal methods

2004年 (ISBN: 1402022182)
ポストシークエンスタンパク質実験法 3

大島, 泰郎

東京化学同人 2002年10月1日 (ISBN: 4807911368)
生体ナノマシンの分子設計

城所, 俊一

共立出版 2001年9月 (ISBN: 4320055489)
Encyclopedia of bioprocess technology : fermentation, biocatalysis, and bioseparation

1999年 (ISBN: 0471138223)
熱量測定・熱分析ハンドブック

日本熱測定学会

丸善出版 1998年8月1日 (ISBN: 4621044869, 9784621044865)
ナノバイオロジー入門: 時間と空間の生物学

嶋本, 伸雄

講談社 1994年8月1日 (ISBN: 4061535358)
熱分析の基礎と応用 : 超伝導からバイオまで,その多彩な展開

日本熱測定学会

リアライズ社 1994年7月 (ISBN: 4947655690)

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講演・口頭発表等

High-temperature reversible oligomerization of cytochrome c observed by DSC and PPC

Kidokoro S, Nakamura S

Calorimetry Conference 2016年7月30日 Office of Calorimetry Conference 招待有り
圧力摂動熱量測定によるシトクロムｃのモルテングロビュール状態の安定性・体積変化の評価

中村成芳, 城所俊一

第１５回日本蛋白質科学会年会 2015年6月26日日本蛋白質科学会招待有り
蛋白質の熱転移における可逆的なオリゴマー形成過程の熱力学的解析

中村成芳, Mohammad M Islam, 和智友香, 清水凌, 黒田裕, 城所俊一

第５０回記念熱測定討論会 2014年9月24日日本熱測定学会
蛋白質の熱転移におけるオリゴマー形成過程の熱力学的解析

中村成芳, Mohammad M Islam, 和智友香, 清水凌, 黒田裕, 城所俊一

第５５回新潟生化学懇話会 2014年6月28日日本生化学会新潟支部
ATP加水分解反応エンタルピーにMgイオンが与える影響

古賀俊太郎, 中村成芳, 城所俊一

第４９回熱測定討論会 2013年10月30日日本熱測定学会
ATPやADPとMgイオンとの相互作用の熱力学的解析

中村成芳, 古賀俊太郎, 城所俊一

第４９回熱測定討論会 2013年10月30日日本熱測定学会
タンパク質の熱力学的安定性と分子機能の精密熱量測定

城所俊一

第４９回熱測定討論会 2013年10月29日日本熱測定学会招待有り
Thermodynamic characterization of a reversible high temperature oligomerization process in the thermal transition of a BPTI variant tagged with isoleucines

Shigeyoshi Nakamura, Tomoka Wachi, Ryo Shimizu, Mohammad M Islam, Yutaka Kuroda, Shun-ichi Kidokoro

第５１回日本生物物理学会年会 2013年10月24日日本生物物理学会
Unique structural change in calcium-boundcalmodulin upon interaction with a peptide of protein 4.1R

Wataru Nunomura, Noriyoshi Isozumi, Shigeyoshi Nakamura, Shinya Ohki, Shun-ichi Kidokoro, Yuichi Takakuwa

第50回日本生物物理学会年会 2012年9月23日日本生物物理学会
A combination analysis of PPC and DSC revealed novel multi-state thermal transitions of cytochrome c

Shigeyoshi Nakamura, Shun-ichi Kidokoro

第50回日本生物物理学会年会 2012年9月23日日本生物物理学会
A new approximation method for estimating SAXS profiles of solutes with multiple molecular conformations

Yasutaka Seki, Shigeyoshi Nakamura, Shun-^ichi Kidokoro, Takamasa Nonaka, Kunitsugu Soda

第50回日本生物物理学会年会 2012年9月23日日本生物物理学会
各種熱量測定によるATP加水分解エンタルピーの詳細解析

中村成芳, 古賀峻太朗, 城所俊一

合同公開シンポジウム～ゆらぎと水 2012年9月14日新学術領域
Thermal transition of the molten globule state of cytochrome c including reversible oligomerization process analyzed by differential scanning calorimetry and pressure perturbation calorimetry

Shigeyoshi Nakamura, Shun-ichi Kidokoro

International Congress on Thermal analysis and Calorimetry 2012 2012年8月23日 International Confederation for Thermal Analysis and Calorimetry
「熱」でわかる分子間相互作用

城所俊一

BIA symposimu 2012 2012年7月20日 GEヘルスケア招待有り
各種熱測定法による蛋白質物性評価

城所俊一

第12回日本蛋白質科学会年会 2012年6月20日日本蛋白質科学会招待有り
圧力摂動熱量測定によるシトクロムｃのモルテングロビュール状態の安定性・体積変化の評価

中村成芳, 城所俊一

第12回日本蛋白質科学会年会 2012年6月20日日本蛋白質科学会
低温ショック蛋白質と一本鎖核酸との相互作用の熱力学

第４８回熱測定討論会 2011年9月28日日本熱測定学会
A general analysis method for normal and reverse titration of multi-site binding system by isothermal titration calorimetry

日本生物物理学会第４９回年会 2011年9月16日日本生物物理学会
タンパク質の熱分析

第２２回食品ハイドロコロイドシンポジウム 2011年5月18日食品ハイドロコロイド研究会
低温ショック蛋白質と一本鎖核酸との結合の熱力学

第４６回熱測定討論会 2010年9月28日日本熱測定学会

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所属学協会

1982年9月

日本生物物理学会
日本熱測定学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

蛋白質の変性可逆的会合体から不可逆的会合核形成過程の熱測定を活用した解析と応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

城所俊一
細菌における多様なリグニン由来芳香族化合物の外膜・内膜輸送システムの全容解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2019年4月 - 2023年3月

政井英司, 菱山正二郎, 桑原敬司, 城所俊一
高安定かつ高結合性を持つ低温ショック蛋白質変異体の開発とPCR法への応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2017年4月 - 2020年3月

城所俊一
糸状菌のセルラーゼ誘導生産に与えるβ－グルコシダーゼ変異のインパクト

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2016年4月 - 2019年3月

志田洋介, 矢追克郎, 城所俊一, 奥直也
多様なレセプターが関与する芳香族化合物の新規外膜輸送システム

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2015年4月 - 2019年3月

政井英司, 城所俊一, 笠井大輔
プロテアーゼの耐熱性に影響を与える自己分解反応の速度論的解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2013年4月 - 2016年3月

城所俊一
各種熱量測定によるＡＴＰ加水分解エンタルピーの詳細解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2011年4月 - 2013年3月

城所俊一
中性子回折法による創薬標的タンパク質のリガンド認識機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2010年 - 2012年

黒木良太, 城所俊一, 玉田太郎, 安達基泰, 大原高志, 栗原和男, 城所俊一, 玉田太郎, 安達基泰, 栗原和男
等温滴定熱量測定法によるATP/ADP変換反応の熱力学的解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2009年 - 2010年

城所俊一
蛋白質の中性子構造解析を推進するための技術的基盤の確立

日本学術振興会科研費基盤（Ｂ）基盤研究(B) 2007年 - 2009年

黒木良太, 玉田太郎, 安達基泰, 城所俊一, 斎藤稔, 海野久雄, 大原高志, 岡崎伸生, 栗原和男
多糖-endo型グリコシダーゼ複合体解析に基づく反応機構解明研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2007年 - 2008年

橋本勝, 宮入一夫, 斎藤稔, 城所俊一, 清水弘樹, 清水哲哉
蛋白質・リガンド相互作用の等温酸滴定熱量測定法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業萌芽研究 2005年 - 2006年

城所俊一
生体高分子の機能発現における水素・水和水の静的・動的な役割の実証

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2005年 - 2005年

黒木良太, 斎藤稔, 城所俊一, 森元聡, 米本照代, 玉田太郎
蛋白質の非天然状態における疎水効果の役割と分子機構の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2004年 - 2005年

曽田邦嗣, 城所俊一
蛋白質基本フォールドの熱力学的安定化機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究(C) 2000年 - 2000年

城所俊一
ヒト・カルシトニンの立体構造転移と線維化の分子機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 1999年 - 2000年

曽田邦嗣, 城所俊一
タンパク質立体構造の安定性・ダイナミックス・折れたたみ機構

日本学術振興会科学研究費助成事業重点領域研究 1995年 - 1998年

油谷克英, 片岡幹雄, 櫛田孝司, 山縣ゆり子, 木寺詔紀, 城所俊一, 熊谷泉, 伊倉貞吉, 北尾彰朗, 後藤祐児
球状蛋白質の熱力学的安定性に対する超多次元精密測定法・解析法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業奨励研究(A) 1988年 - 1988年

城所俊一
低温ショック蛋白質の分子機能と水素・水和水の役割

黎明研究
各種熱量測定によるATP加水分解エンタルピーの詳細解析

科学研究費補助金

城所俊一

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研究分野

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学歴

委員歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

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