矢田哲士 (Tetsushi Yada) - マイポータル

基本情報

所属: 九州工業大学大学院情報工学研究院生命化学情報工学研究系教授

学位: 博士（理学）(東京大学)

J-GLOBAL ID: 200901012601418939
researchmap会員ID: 1000367812

研究キーワード

研究分野

情報通信 / 生命、健康、医療情報学 /

経歴

2017年 - 2018年

九州工業大学大学院情報工学研究院情報工学研究院生命情報工学研究系長
2017年 - 2018年

九州工業大学大学院情報工学府情報工学府情報工学専攻長
2017年 - 2018年

九州工業大学大学院情報工学府情報工学府学際情報工学専攻長・情報システム専攻長
2017年 - 2018年

九州工業大学情報工学部情報工学部生命情報工学科長
2007年 - 2013年

京都大学大学院情報学研究科准教授
2007年 - 2013年

Associate Professor
2013年

九州工業大学大学院情報工学研究院生命情報工学研究系教授
2013年

Professor,Department of Bioscience and Bioinformatics,Faculty of Computer Science and Systems Engineering,Kyushu Institute of Technology
2003年 - 2007年

京都大学大学院情報学研究科助教授
2003年 - 2007年

Associate Professor
2001年 - 2003年

東京大学医科学研究所助教授
2001年 - 2003年

Associate Professor
1999年 - 2001年

理化学研究所ゲノム科学総合研究センター研究員
1999年 - 2001年

Researcher
1988年 - 1999年

株式会社三菱総合研究所研究員
1988年 - 1999年

Researcher

学歴

- 1988年

九州大学, 理学部, 生物学科
- 1988年

九州大学

論文

Dynamical Robustness and Its Structural Dependence in Biological Networks

Natsuhiro Ichinose, Takeshi Kawashima, Tetsushi Yada, Hiroshi Wada

Journal of Theoretical Biology 110808-110808 2021年6月査読有り
Asymmetry in indegree and outdegree distributions of gene regulatory networks arising from dynamical robustness

Natsuhiro Ichinose, Tetsushi Yada, Hiroshi Wada

Physical Review E 97(6) 2018年6月28日
Micropeptides Encoded in Transcripts Previously Identified as Long Noncoding RNAs: A New Chapter in Transcriptomics and Proteomics.

Yeasmin F, Yada T, Akimitsu N

Frontiers in genetics 9 144-144 2018年査読有り
Identification of Minimal p53 Promoter Region Regulated by MALAT1 in Human Lung Adenocarcinoma Cells.

Tano K, Onoguchi-Mizutani R, Yeasmin F, Uchiumi F, Suzuki Y, Yada T, Akimitsu N

Frontiers in genetics 8 208 2017年査読有り
Analysis of RNA decay factor mediated RNA stability contributions on RNA abundance.

Maekawa S, Imamachi N, Irie T, Tani H, Matsumoto K, Mizutani R, Imamura K, Kakeda M, Yada T, Sugano S …

BMC genomics 16(1) 154-154 2015年3月査読有り
Long Noncoding RNA NEAT1-Dependent SFPQ Relocation from Promoter Region to Paraspeckle Mediates IL8 Expression upon Immune Stimuli.

Katsutoshi I, Imamachi N, Akizuki G, Kumakura M, Kawaguchi A, Nagata K, Kato A, Kawaguchi Y, Sato H, Yoneda M …

Molecular Cell 53(3) 393-406 2014年2月査読有り
Tetrahedral Gray Code for Visualization of Genome Information

Natsuhiro Ichinose, Tetsushi Yada, Osamu Gotoh

PLOS ONE 9(1) e86133 2014年1月査読有り

MISC

Oncofetal geneの体系的な探索

原惇史, 水谷玲菜, 秋光信佳, 矢田哲士

生命科学系学会合同年次大会 2017年度 [1P-0751] 2017年12月
A new computational method to predict transcriptional activity of a DNA sequence from diverse datasets of massively parallel reporter assays

Ying Liu, Takuma Irie, Tetsushi Yada, Yutaka Suzuki

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 45(13) 2017年7月
Estimating optimal sparseness of developmental gene networks using a semi-quantitative model

Natsuhiro Ichinose, Tetsushi Yada, Hiroshi Wada

PLOS ONE 12(4) 2017年4月
次世代型シークエンサーを用いた変異プロモーターの網羅的解析

入江拓磨, 劉瑩, 榊原雄太, 門城拓, 関真秀, 菅野純夫, 矢田哲士, 鈴木穣

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 39th ROMBUNNO.1P‐0875 (WEB ONLY) 2016年
変異導入プロモーターの転写活性データを用いて転写制御コードを解読する

劉瑩, 入江拓磨, 門城拓, 矢田哲士, 鈴木穣

日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集 88回・38回 [4T14L-04(3P0704)] 2015年12月
次世代型シークエンサーを用いた変異プロモーターの網羅的解析

入江拓磨, 劉瑩, 門城拓, 関真秀, 榊原雄太, 菅野純夫, 矢田哲士, 鈴木穣

日本生化学会大会(Web) 88th 3P0842 (WEB ONLY) 2015年
Long Noncoding RNA NEAT1-Dependent SFPQ Relocation from Promoter Region to Paraspeckle Mediates IL8 Expression upon Immune Stimuli (vol 53, pg 393, 2014)

Katsutoshi Imamura, Naoto Imamachi, Gen Akizuki, Michiko Kumakura, Atsushi Kawaguchi, Kyosuke Nagata, Akihisa Kato, Yasushi Kawaguchi, Hiroki Sato, Misako Yoneda …

MOLECULAR CELL 54(6) 1055-1055 2014年6月
次世代シークエンサーによる変異プロモーターの網羅的解析

入江拓磨, 門城拓, 劉エイ, 関真秀, 菅野純夫, 矢田哲士, 鈴木穣

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 37th 2P-0985 (WEB ONLY) 2014年
miRNA-target prediction based on transcriptional regulation

Toyofumi Fujiwara, Tetsushi Yada

BMC GENOMICS 14 2013年2月
Identification of hundreds of novel UPF1 target transcripts by direct determination of whole transcriptome stability

Hidenori Tani, Naoto Imamachi, Kazi Abdus Salam, Rena Mizutani, Kenichi Ijiri, Takuma Irie, Tetsushi Yada, Yutaka Suzuki, Nobuyoshi Akimitsu

RNA BIOLOGY 9(11) 1370-1379 2012年11月
超並列シークエンサーを用いたヒト変異プロモーターのハイスループット解析

入江拓磨, 関真秀, 菅野純夫, 矢田哲士

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 35th 3P-0753 (WEB ONLY) 2012年
Large-scale motif discovery using DNA Gray code and equiprobable oligomers

Natsuhiro Ichinose, Tetsushi Yada, Osamu Gotoh

BIOINFORMATICS 28(1) 25-31 2012年1月
Predicting promoter activities of primary human DNA sequences

Takuma Irie, Sung-Joon Park, Riu Yamashita, Masahide Seki, Tetsushi Yada, Sumio Sugano, Kenta Nakai, Yutaka Suzuki

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 39(11) 2011年6月
Linear regression models predicting strength of transcriptional activity of promoters.

Yada T, Yoshida K, Morita M, Taniguchi T, Irie T, Suzuki Y

Genome informatics. International Conference on Genome Informatics 25(1) 53-60 2011年
Linear regression models predicting strength of transcriptional activity of promoters.

25(1) 53-60 2011年

Works(作品等)

次世代シークエンサー解析と情報科学解析で迫る転写調節コードの普遍性と多様性

2015年 - 2017年
プロモーター配列の情報科学的解体と再構成による遺伝子回路の設計

2014年 - 2016年
遺伝子のde novo誕生の機序に迫るバイオインフォマティクス研究

2013年 - 2016年

共同研究・競争的資金等の研究課題

複雑ネットワークの視点からの新規細胞タイプの進化

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2018年4月 - 2023年3月

和田洋, 矢田哲士, 川島武士, 市瀬夏洋
生物のde novo遺伝子探索アルゴリズムの探究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2018年4月 - 2023年3月

矢田哲士
ゲノムアノテーションで見過された短鎖ペプチドコードORFの発見と疾患マーカー開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2017年6月 - 2019年3月

矢田哲士, 秋光信佳
転写制御ネットワークの頑健性と柔軟性、相転移の実験的検証

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2015年7月 - 2019年3月

和田洋, 矢田哲士, 市瀬夏洋
次世代シークエンサー解析と情報科学解析で迫る転写調節コードの普遍性と多様性

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2015年4月 - 2017年3月

矢田哲士
プロモーター配列の情報科学的解体と再構成による遺伝子回路の設計

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2014年4月 - 2016年3月

矢田哲士
遺伝子のde novo誕生の機序に迫るバイオインフォマティクス研究

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2013年4月 - 2016年3月

矢田哲士
ゲノム科学の総合的推進に向けた大規模ゲノム情報生産・高度情報解析支援

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2010年4月 - 2016年3月

小原雄治, 加藤和人, 豊田敦, 黒木陽子, 菅野純夫, 鈴木穣, 林哲也, 山本健, 辻省次, 井ノ上逸朗, 黒川顕, 森下真一, 中村保一, 田畑哲之, 久原哲, 岩崎渉, 瀬々潤, 高橋弘喜, 浅井潔, 笠原雅弘, 榊原康文, 矢田哲士, 山縣然太朗, 武藤香織, 位田隆一, 増井徹, 栗山真理子, 高木利久, 藤山秋佐夫, 服部正平, 小椋義俊, 徳永勝士, 桑野良三, 大橋順, 伊藤武彦, 平川英樹, 野口英樹, 松岡聡, 小笠原直毅, 中村建介, 浜田道昭, 金谷重彦, 安西祐一郎, 岡田清孝, 榊佳之, 高久史麿, 豊島久真男, 中村桂子, 堀田凱樹, 米澤明憲, 吉川寛, 吉田光昭, 猪子英俊, 戸田達史, 稲澤譲治, 五條掘孝, 漆原秀子, 武田洋幸, 城石俊彦, 伊藤隆司, 佐藤矩行, 松田秀雄, 五斗進, 津田雅孝, 桑野良三, 徳永勝士, 小笠原直毅
プロモーター配列の設計

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2010年 - 2012年

矢田哲士, 鈴木穰
大規模ゲノム情報の比較技術と知識発見

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2005年 - 2009年

矢田哲士, 野口秀樹
比較ゲノム解析による進化・多様性のゲノム基盤の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2004年 - 2009年

藤山秋佐夫, 佐藤矩行, 堀寛, 田畑哲之, 矢田哲士, 小原雄治
網羅的DNA-蛋白相互作用データに基づく染色体のモデル表現

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2003年 - 2005年

白髭克彦, 坂東優篤, 矢田哲士, 市瀬夏洋, 野口英樹
情報表現モデルによるゲノム配列情報のモデル化と予測

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2000年 - 2004年

矢田哲士, 浅井潔
-
-

矢田哲士

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

論文

MISC

Works(作品等)

共同研究・競争的資金等の研究課題

メニュー

共著者の一覧