Shun-ichi SEKINE

J-GLOBAL         Last updated: Feb 20, 2019 at 13:50
 
Avatar
Name
Shun-ichi SEKINE
Affiliation
RIKEN
Section
RIKEN Center for Life Science Technologies
Job title
Associate Professor
Degree
Ph D.
Research funding number
50321774

Research Areas

 
 

Education

 
 
   
 
University of Tokyo
 
 
   
 
Tohoku University
 

Published Papers

 
Ehara H, Kujirai T, Fujino Y, Shirouzu M, Kurumizaka H, Sekine SI
Science (New York, N.Y.)      Feb 2019   [Refereed]
Kujirai T, Ehara H, Fujino Y, Shirouzu M, Sekine SI, Kurumizaka H
Science (New York, N.Y.)      Oct 2018   [Refereed]
Chong YE, Guo M, Yang XL, Kuhle B, Naganuma M, Sekine SI, Yokoyama S, Schimmel P
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America      Jul 2018   [Refereed]
Inouye S, Tomabechi Y, Hosoya T, Sekine SI, Shirouzu M
Journal of biochemistry      May 2018   [Refereed]
Ehara H, Sekine SI
Transcription      May 2018   [Refereed]
Ooi WY, Murayama Y, Mekler V, Minakhin L, Severinov K, Yokoyama S, Sekine SI
Nucleic acids research      Nov 2017   [Refereed]
Ehara H, Yokoyama T, Shigematsu H, Yokoyama S, Shirouzu M, Sekine SI
Science (New York, N.Y.)      Aug 2017   [Refereed]
Ehara H, Umehara T, Sekine SI, Yokoyama S
Biochemical and biophysical research communications      May 2017   [Refereed]
Shimizu H, Tosaki A, Ohsawa N, Ishizuka-Katsura Y, Shoji S, Miyazaki H, Oyama F, Terada T, Shirouzu M, Sekine SI, Nukina N, Yokoyama S
The Journal of biological chemistry      Jun 2017   [Refereed]
Shimizu H, Miyazaki H, Ohsawa N, Shoji S, Ishizuka-Katsura Y, Tosaki A, Oyama F, Terada T, Sakamoto K, Shirouzu M, Sekine S, Nukina N, Yokoyama S
Scientific reports      May 2016   [Refereed]
Antonopoulos I. H, Murayama Y, Warner B. A, Sekine S, Yokoyama S, Carey P. R.
Biochemistry   54(3) 652-65   2015   [Refereed]
Sekine S, Murayama Y, Svetlov V, Nudler E, Yokoyama S.
Mol Cell   57(3) 408-21   2015   [Refereed]
Ito T, Masuda I, Yoshida K, Goto-Ito S, Sekine S, Suh S. W, Hou Y. M, Yokoyama S.
Proc Natl Acad Sci U S A   112(31) E4197-205   2015   [Refereed]
Sekine S, Murayama Y, Svetlov V, Nudler E, Yokoyama S.
Transcription   6(3) 56-60   2015   [Refereed]
Itoh Y, Sekine S, Yokoyama S.
Nucleic Acids Res   43(18) 9028-38   2015   [Refereed]
Tomabechi Y, Hosoya T, Ehara H, Sekine S. I, Shirouzu M, Inouye S.
Biochem Biophys Res Commun      2015   [Refereed]
Ehara H, Makino M, Kodama K, Konoki K, Ito T, Sekine S, Fukuzawa S, Yokoyama S, Tachibana K.
Chembiochem   16(10) 1435-9   2015   [Refereed]
Yanagisawa T, Ishii R, Hikida Y, Fukunaga R, Sengoku T, Sekine S, Yokoyama S.
J Struct Funct Genomics   16(1) 25-41   2015   [Refereed]
Naganuma M, Sekine S, Chong Y. E, Guo M, Yang X. L, Gamper H, Hou Y. M, Schimmel P, Yokoyama S.
Nature   510(7506) 507-11   2014   [Refereed]
Tagami S, Sekine S, Minakhin L, Esyunina D, Akasaka R, Shirouzu M, Kulbachinskiy A, Severinov K, Yokoyama S.
Genes Dev   28(5) 521-31   2014   [Refereed]
Severinov K, Minakhin L, Sekine S. I, Lopatina A, Yokoyama S.
Bacteriophage   4 e29399   2014   [Refereed]
Itoh Y, Bröcker M. J, Sekine S, Söll D, Yokoyama S.
J Mol Biol   426(8) 1723-35   2014   [Refereed]
Higo T, Suka N, Ehara H, Wakamori M, Sato S, Maeda H, Sekine S, Umehara T, Yokoyama S.
J Struct Funct Genomics   15(4) 191-9   2014   [Refereed]
Itoh Y, Sekine S, Suetsugu S, Yokoyama S.
Nucleic Acids Res   41(13) 6729-38   2013   [Refereed]
Itoh Y, Bröcker M. J, Sekine S, Hammond G, Suetsugu S, Söll D, Yokoyama S.
Science   340(6128) 75-8   2013   [Refereed]
Nakagawa H, Kuratani M, Goto-Ito S, Ito T, Katsura K, Terada T, Shirouzu M, Sekine S, Shigi N, Yokoyama S.
Proteins   81(7) 1232-44   2013   [Refereed]
Murayama Y, Sekine S, Yokoyama S.
Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun   69(Pt 2) 174-7   2013   [Refereed]
Sekine S, Tagami S, Yokoyama S.
Curr Opin Struct Biol   22(1) 110-8   2012   [Refereed]
Hanawa-Suetsugu K, Kukimoto-Niino M, Mishima-Tsumagari C, Akasaka R, Ohsawa N, Sekine S, Ito T, Tochio N, Koshiba S, Kigawa T, Terada T, Shirouzu M, Nishikimi A, Uruno T, Katakai T, Kinashi T, Kohda D, Fukui Y, Yokoyama S.
Proc Natl Acad Sci U S A   109(9) 3305-10   2012   [Refereed]
Itoh Y, Sekine S. I, Yokoyama S.
Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun   68(Pt 6) 678-82   2012   [Refereed]
Itoh Y, Sekine S, Yokoyama S.
Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun   68(Pt 9) 1128-33   2012   [Refereed]
Ehara H, Sekine S, Yokoyama S.
Protein Sci   20(9) 1558-65   2011   [Refereed]
Tagami S, Sekine S. I, Yokoyama S.
Transcription   2(4) 162-167   2011   [Refereed]
Hikida Y, Kuratani M, Bessho Y, Sekine S. I, Yokoyama S.
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr   66(Pt 12) 1301-7   2010   [Refereed]
Chiba S, Itoh Y, Sekine S, Yokoyama S.
Mol Cell   39(3) 410-20   2010   [Refereed]
Tagami S, Sekine S, Kumarevel T, Yamamoto M, Yokoyama S.
Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun   66(Pt 1) 64-8   2010   [Refereed]
Kuratani M, Hirano M, Goto-Ito S, Itoh Y, Hikida Y, Nishimoto M, Sekine S, Bessho Y, Ito T, Grosjean H, Yokoyama S.
J Mol Biol   401(3) 323-33   2010   [Refereed]
Tagami S, Sekine S, Kumarevel T, Hino N, Murayama Y, Kamegamori S, Yamamoto M, Sakamoto K, Yokoyama S.
Nature   468(7326) 978-82   2010   [Refereed]
Naganuma M, Sekine S, Fukunaga R, Yokoyama S.
Proc Natl Acad Sci U S A   106(21) 8489-94   2009   [Refereed]
Itoh Y, Sekine S, Matsumoto E, Akasaka R, Takemoto C, Shirouzu M, Yokoyama S.
J Mol Biol   385(5) 1456-69   2009   [Refereed]
Konno M, Sumida T, Uchikawa E, Mori Y, Yanagisawa T, Sekine S, Yokoyama S.
FEBS J   276(17) 4763-79   2009   [Refereed]
Itoh Y, Chiba S, Sekine S, Yokoyama S.
Nucleic Acids Res   37(18) 6259-68   2009   [Refereed]
Goto-Ito S, Ishii R, Ito T, Shibata R, Fusatomi E, Sekine S. I, Bessho Y, Yokoyama S.
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr   63(Pt 10) 1059-68   2007   [Refereed]
Bessho Y, Shibata R, Sekine S, Murayama K, Higashijima K, Hori-Takemoto C, Shirouzu M, Kuramitsu S, Yokoyama S.
Proc Natl Acad Sci U S A   104(20) 8293-8   2007   [Refereed]
Iwasaki W, Sekine S, Kuroishi C, Kuramitsu S, Shirouzu M, Yokoyama S.
J Mol Biol   360(2) 329-42   2006   [Refereed]
Hiyama T. B, Zhao M, Kitago Y, Yao M, Sekine S, Terada T, Kuroishi C, Liu Z. J, Rose J. P, Kuramitsu S, Shirouzu M, Watanabe N, Yokoyama S, Tanaka I, Wang B. C.
J Struct Funct Genomics   7(3-4) 119-29   2006   [Refereed]
Sasaki H. M, Sekine S, Sengoku T, Fukunaga R, Hattori M, Utsunomiya Y, Kuroishi C, Kuramitsu S, Shirouzu M, Yokoyama S.
Proc Natl Acad Sci U S A   103(40) 14744-9   2006   [Refereed]
Kuratani M, Sakai H, Takahashi M, Yanagisawa T, Kobayashi T, Murayama K, Chen L, Liu Z. J, Wang B. C, Kuroishi C, Kuramitsu S, Terada T, Bessho Y, Shirouzu M, Sekine S, Yokoyama S.
J Mol Biol   355(3) 395-408   2006   [Refereed]
Kuratani M, Ishii R, Bessho Y, Fukunaga R, Sengoku T, Shirouzu M, Sekine S, Yokoyama S.
J Biol Chem   280(16) 16002-8   2005   [Refereed]
Artsimovitch I, Patlan V, Sekine S, Vassylyeva M. N, Hosaka T, Ochi K, Yokoyama S, Vassylyev D. G.
Cell   117(3) 299-310   2004   [Refereed]
Randau L, Schauer S, Ambrogelly A, Salazar J. C, Moser J, Sekine S, Yokoyama S, Söll D, Jahn D.
J Biol Chem   279(33) 34931-7   2004   [Refereed]
Hanawa-Suetsugu K, Sekine S, Sakai H, Hori-Takemoto C, Terada T, Unzai S, Tame J. R, Kuramitsu S, Shirouzu M, Yokoyama S.
Proc Natl Acad Sci U S A   101(26) 9595-600   2004   [Refereed]
Fukai S, Nureki O, Sekine S, Shimada A, Vassylyev D. G, Yokoyama S.
RNA   9(1) 100-11   2003   [Refereed]
Sakai H, Vassylyeva M. N, Matsuura T, Sekine S, Gotoh K, Nishiyama M, Terada T, Shirouzu M, Kuramitsu S, Vassylyev D. G, Yokoyama S.
J Mol Biol   332(3) 729-40   2003   [Refereed]
Vassylyeva M. N, Sakai H, Matsuura T, Sekine S, Nishiyama M, Terada T, Shirouzu M, Kuramitsu S, Vassylyev D. G, Yokoyama S.
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr   59(Pt 9) 1651-2   2003   [Refereed]
Fukai S, Nureki O, Sekine S, Shimada A, Vassylyev D. G, Yokoyama S.
RNA   9(1) 100-11   2003   [Refereed]
Sakai H, Vassylyeva M. N, Matsuura T, Sekine S, Gotoh K, Nishiyama M, Terada T, Shirouzu M, Kuramitsu S, Vassylyev D. G, Yokoyama S.
J Mol Biol   332(3) 729-40   2003   [Refereed]
Vassylyeva M. N, Sakai H, Matsuura T, Sekine S, Nishiyama M, Terada T, Shirouzu M, Kuramitsu S, Vassylyev D. G, Yokoyama S.
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr   59(Pt 9) 1651-2   2003   [Refereed]
Sekine S, Nureki O, Dubois D. Y, Bernier S, Chênevert R, Lapointe J, Vassylyev D. G, Yokoyama S.
EMBO J   22(3) 676-88   2003   [Refereed]
Vassylyeva M. N, Lee J, Sekine S. I, Laptenko O, Kuramitsu S, Shibata T, Inoue Y, Borukhov S, Vassylyev D. G, Yokoyama S.
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr   58(Pt 9) 1497-500   2002   [Refereed]
Vassylyev D. G, Sekine S, Laptenko O, Lee J, Vassylyeva M. N, Borukhov S, Yokoyama S.
Nature   417(6890) 712-9   2002   [Refereed]
Nureki O, Fukai S, Sekine S, Shimada A, Terada T, Nakama T, Shirouzu M, Vassylyev D. G, Yokoyama S.
Cold Spring Harb Symp Quant Biol   66 167-73   2001   [Refereed]
Fukai S, Nureki O, Sekine S, Shimada A, Tao J, Vassylyev D. G, Yokoyama S.
Cell   103(5) 793-803   2000   [Refereed]
Sekine S, Nureki O, Tateno M, Yokoyama S.
Eur J Biochem   261(2) 354-60   1999   [Refereed]
Sekine S, Nureki O, Sakamoto K, Niimi T, Tateno M, Go M, Kohno T, Brisson A, Lapointe J, Yokoyama S.
J Mol Biol   256(4) 685-700   1996   [Refereed]
Nureki O, Vassylyev D. G, Katayanagi K, Shimizu T, Sekine S, Kigawa T, Miyazawa T, Yokoyama S, Morikawa K.
Science   267(5206) 1958-65   1995   [Refereed]
Tateno M, Nureki O, Sekine S, Kaneda K, Go M, Yokoyama S.
FEBS Lett   377(1) 77-81   1995   [Refereed]

Misc

 
Matsumoto, E., Sekine, S. et al.
Acta Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun.   64(6) 453-458   2008
Crystallographic and mutational studies of seryl-tRNA synthetase from the archaeon Pyrococcus horikoshii.
Itoh, Y., Sekine, S. et al.
RNA Biol.   5(3) 169-177   2008
Structure of the bacterial RNA polymerase holoenzyme.
Sekine, S. et al.
Tanpakushitsu Kakusan Koso.   48(1) 1-8   2003

Research Grants & Projects

 
Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology: Grants-in-Aid for Scientific Research(基盤研究(C))
Project Year: 2008 - 2011    Investigator(s): Shun-ichi SEKINE
Selenium is an essential micronutrient for many organisms, including humans. It is present in proteins as a selenocysteine(Sec) residue(s), which is known as the 21^(st) amino acid that is translationally incorporated into proteins. To elucidate s...
-