山下敦子 (Atsuko Yamashita) - マイポータル

基本情報

所属: 大阪大学蛋白質研究所教授

学位: 博士（農学）(京都大学)

連絡先: a_yamaprotein.osaka-u.ac.jp
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-8001-4642
J-GLOBAL ID: 200901091779028430
researchmap会員ID: 5000003594

外部リンク: http://www.protein.osaka-u.ac.jp/labs/molrecbiol/molrecbiol/

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 /

受賞

論文

Insights into the taste of organic acids via TAS1Rs

Yuko Yamase, Katsuki Takebe, Kengo Horie, Yoshihiro Mitoh, Atsuko Yamashita, Ryusuke Yoshida

Journal of Oral Biosciences 2026年2月
Receptor mechanism producing a sweet taste from plant aroma compounds

Fuyumi Horie, Keisuke Sanematsu, Keiko Yasumatsu, Takatsugu Hirokawa, Noriatsu Shigemura, Atsuko Yamashita, Yuko Kusakabe

Scientific Reports 15(1) 2025年3月12日査読有り
Unravelling nicotinic receptor and ligand features underlying neonicotinoid knockdown actions on the malaria vector mosquito Anopheles gambiae

Ryo Ito, Masaki Kamiya, Koichi Takayama, Sumito Mori, Rei Matsumoto, Mayuka Takebayashi, Hisanori Ojima, Shota Fujimura, Haruki Yamamoto, Masayuki Ohno …

Open Biology 14(7) 2024年7月24日査読有り
Chemical range recognized by the ligand-binding domain in a representative amino acid-sensing taste receptor, T1r2a/T1r3, from medaka fish

Hikaru Ishida, Norihisa Yasui, Atsuko Yamashita

PLOS ONE 19(3) e0300981-e0300981 2024年3月22日査読有り責任著者
Accelerated Molecular Dynamics and AlphaFold Uncover a Missing Conformational State of Transporter Protein OxlT

Jun Ohnuki, Titouan Jaunet-Lahary, Atsuko Yamashita, Kei-ichi Okazaki

The Journal of Physical Chemistry Letters 15(3) 725-732 2024年1月12日査読有り
Overexpression of the flagellar motor protein MotB sensitizes Bacillus subtilis to aminoglycosides in a motility-independent manner.

Mio Uneme, Kazuya Ishikawa, Kazuyuki Furuta, Atsuko Yamashita, Chikara Kaito

PloS one 19(4) e0300634 2024年査読有り
Investigating the Effect of Substituting a Single Cysteine Residue on the Thermal Stability of an Engineered Sweet Protein, Single-Chain Monellin

Kyosuke Ohnuma, Atsuko Yamashita, Norihisa Yasui

The Protein Journal 2023年9月22日査読有り
Direct binding of calmodulin to the cytosolic C-terminal regions of sweet/umami taste receptors

Atsuki Yoshida, Ayumi Ito, Norihisa Yasui, Atsuko Yamashita

The Journal of Biochemistry 174(5) 451-459 2023年8月1日査読有り責任著者
Structure and mechanism of oxalate transporter OxlT in an oxalate-degrading bacterium in the gut microbiota

Titouan Jaunet-Lahary, Tatsuro Shimamura, Masahiro Hayashi, Norimichi Nomura, Kouta Hirasawa, Tetsuya Shimizu, Masao Yamashita, Naotaka Tsutsumi, Yuta Suehiro, Keiichi Kojima …

Nature Communications 14(1) 2023年4月3日査読有り責任著者
Chloride ions evoke taste sensations by binding to the extracellular ligand-binding domain of sweet/umami taste receptors

Nanako Atsumi, Keiko Yasumatsu, Yuriko Takashina, Chiaki Ito, Norihisa Yasui, Robert F Margolskee, Atsuko Yamashita

eLife 12 2023年2月28日査読有り責任著者
Pivotal role for S-nitrosylation of DNA methyltransferase 3B in epigenetic regulation of tumorigenesis.

Kosaku Okuda, Kengo Nakahara, Akihiro Ito, Yuta Iijima, Ryosuke Nomura, Ashutosh Kumar, Kana Fujikawa, Kazuya Adachi, Yuki Shimada, Satoshi Fujio …

Nature communications 14(1) 621-621 2023年2月4日査読有り
Development of hidden Markov modeling method for molecular orientations and structure estimation from high-speed atomic force microscopy time-series images.

Tomonori Ogane, Daisuke Noshiro, Toshio Ando, Atsuko Yamashita, Yuji Sugita, Yasuhiro Matsunaga

PLoS computational biology 18(12) e1010384 2022年12月査読有り
T1R2-mediated sweet sensing in a lizard.

Liang Q, Ko MC, Ng NSR, Borja Reh, Lee JGH, Yamashita A, Nishihara H, Toda Y, Baldwin MW

Current biology : CB 32(23) R1302-R1303 2022年12月1日査読有り
An optogenetic assay method for electrogenic transporters using Escherichia coli co‐expressing light‐driven proton pump

Masahiro Hayashi, Keiichi Kojima, Yuki Sudo, Atsuko Yamashita

Protein Science 30(10) 2161-2169 2021年7月10日査読有り最終著者責任著者
A sweet protein monellin as a non-antibody scaffold for synthetic binding proteins

Norihisa Yasui, Kazuaki Nakamura, Atsuko Yamashita

The Journal of Biochemistry 169(5) 585-599 2021年7月3日査読有り
Current pivotal strategies leading a difficult target protein to a sample suitable for crystallographic analysis

Atsuko Yamashita

Biochemical Society Transactions 48(4) 1661-1673 2020年8月28日査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Differential scanning fluorimetric analysis of the amino-acid binding to taste receptor using a model receptor protein, the ligand-binding domain of fish T1r2a/T1r3

Takashi Yoshida, Norihisa Yasui, Yuko Kusakabe, Chiaki Ito, Miki Akamatsu, Atsuko Yamashita

Plos One 14 e0218909 2019年6月13日査読有り責任著者
Specific modification at the C-terminal lysine residue of the green fluorescent protein variant, GFPuv, expressed in Escherichia coli

Takahiro Nakatani, Norihisa Yasui, Issei Tamura, Atsuko Yamashita

Scientific Reports 9 4722 2019年3月18日査読有り責任著者
うま味受容体細胞外リガンド結合ドメインのX線結晶構造解析

細谷麻以子, 山下敦子

SPring-8/SACLA利用研究成果集 7 2019年1月査読有り責任著者
Structure-function relationships of olfactory and taste receptors

Maik Behrens, Loïc Briand, Claire A. de March, Hiroaki Matsunami, Atsuko Yamashita, Wolfgang Meyerhof, Simone Weyand

Chemical Senses 43(2) 81-87 2018年2月2日査読有り

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MISC

構造生物学・生物物理学で探るタイプ1 型味覚受容体リガンド結合ドメインの多彩な化学物質認識

山下敦子, 石田光

日本味と匂学会誌 31(1) 15-21 2024年5月査読有り招待有り筆頭著者責任著者
腸内細菌叢と尿路結石の関係は？−尿路結石形成に影響する腸内シュウ酸分解菌と同菌が有するシュウ酸輸送体の構造と機能

山下敦子

臨床泌尿器科 78(3) 224-230 2024年3月招待有り筆頭著者
腸内シュウ酸分解菌で働くシュウ酸輸送体の分子メカニズム

山下敦子, 岡崎圭一

生物物理 64(1) 25-27 2024年2月招待有り筆頭著者
放射光で視た甘味・うま味受容～味覚受容体T1rの構造解析～

山下敦子

SPring-8/SACLA 利用者情報 28(4) 344-348 2023年11月査読有り招待有り筆頭著者
甘味受容体・うま味受容体を介した塩化物イオンの感知

山下敦子

バイオサイエンスとインダストリー 81(5) 406-407 2023年9月招待有り筆頭著者
食塩は甘味やうま味の受容体でも感知されている

山下敦子

明日の食品産業 (539) 28-31 2023年9月招待有り筆頭著者
味覚受容体の構造と働き

山下敦子

milsil 14(6) 6-8 2021年11月招待有り筆頭著者
受容体タンパク質を用いた味覚感知初反応の解析と応用

山下敦子, 芦川雄二, 南後恵理子, 安井典久

バイオサイエンスとインダストリー 79(2) 86-89 2021年3月招待有り筆頭著者
微生物TRPチャネルの機能と役割

魚住信之, 山下敦子

医学のあゆみ 270 970-976 2019年9月
食行動と栄養摂取をむすぶ味覚受容体による味分子認識

山下敦子

実験医学 37 531-535 2019年3月招待有り筆頭著者責任著者
味覚受容体細胞外領域ヘテロ二量体の発現・精製および性状解析(Expression, purification, and characterization of the entire heterodimeric extracellular regions of fish taste receptor)

Maruhashi Hiroki, Noshiro Daisuke, Yasui Norihisa, Ando Toshio, Yamashita Atsuko

生物物理 57(Suppl.1-2) S313-S313 2017年8月
X 線小角散乱法による味覚受容体リガンド結合ドメインの味物質結合に伴う構造変化の解析

山下敦子

分子研レターズ 75 28-29 2017年3月招待有り筆頭著者責任著者
GPCRの機能構造とその形成

山下敦子

医学のあゆみ 256 365-371 2016年1月招待有り筆頭著者責任著者
Role of the C-terminal region of T1r3 in the membrane trafficking of taste receptor T1r2/T1r3

Atsuko Yamashita

Chemical Senses 2016年
Taste substance binding to the ligand-binding domains of T1r taste receptor heterodimer

Yamashita Atsuko, Nango Eriko, Akiyama Shuji, Maki-Yonekura Saori, Ashikawa Yuji, Kusakabe Yuko, Krayukhina Elena, Maruno Takahiro, Uchiyama Susumu, Nuemket Nipawan …

Chemical Senses 41(9) E176-E177 2016年
TRPチャネルの構造から考える多様な刺激応答

山下敦子

生化学 86(4) 513-517 2014年4月招待有り筆頭著者責任著者
TRPチャネルがさまざまな刺激に応答できる仕組み

伊原誠, 山下敦子

化学と生物 52(1) 48-53 2014年
膜タンパク質構造解析の新展開

山下敦子

ファルマシア 49(8) 753-757 2013年
結晶構造解析における「静止画」から「動画」への試み

山下敦子

日本薬理学雑誌 141(5) 235-239 2013年
味覚受容体T1r3の膜移行機序に関する解析

日下部裕子, 進藤由美子, 河合崇行, 山下敦子

日本味と匂学会誌 = The Japanese journal of taste and smell research 19(3) 297-298 2012年12月1日

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書籍等出版物

おいしさの科学とフードテック最前線

都甲, 潔 (担当:分担執筆, 範囲:第２章「味覚受容体の構造と働き」)

シーエムシー出版 2022年8月 (ISBN: 9784781316758)
膜タンパク質工学ハンドブック

津本, 浩平, 浜窪, 隆雄 (担当:分担執筆, 範囲:第１編第2章第9節「ポリアクリルアミドゲル電気泳動法を利用した膜タンパク質の性状解析」, 第３編第10章「味覚受容体タンパク質を利用した味物質評価法開発の可能性」)

エヌ・ティー・エス 2020年4月 (ISBN: 9784860435370)
口・鼻・耳の感覚メカニズムと応用技術

(担当:分担執筆, 範囲:第１章・第２節「味覚」)

S&T出版 2018年 (ISBN: 9784907002701)
膜タンパク質構造研究

(担当:分担執筆, 範囲:「神経伝達物質トランスポーターホモログ」)

化学同人 2013年 (ISBN: 9784759815610)
化学受容の科学: 匂い・味・フェロモン分子から行動まで

(担当:分担執筆, 範囲:12章「化学感覚受容体の構造生物学」)

化学同人 2012年 (ISBN: 4759815015)

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