千田 俊哉

J-GLOBALへ         更新日: 19/06/14 16:03
 
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研究者氏名
千田 俊哉
 
センダ トシヤ
URL
http://pfweis.kek.jp/index.html
所属
高エネルギー加速器研究機構
部署
物質構造科学研究所
職名
教授
学位
博士(工学)(長岡技術科学大学)

研究分野

 
 

経歴

 
2013年1月
 - 
現在
高エネルギー加速器研究機構 物質構造科学研究所 教授
 
2008年4月
 - 
2012年3月
産業技術総合研究所 バイオメディシナル情報研究センター 主任研究員
 
2001年4月
 - 
2007年3月
産業技術総合研究所 生物情報解析研究センター 主任研究員
 
1995年4月
 - 
2001年3月
長岡技術科学大学 工学部生物系 助手
 
1990年4月
 - 
1992年3月
(株)日立製作所 基礎研究所
 

学歴

 
1992年4月
 - 
1995年3月
長岡技術科学大学 工学部生物系 
 
1988年4月
 - 
1990年3月
東京大学大学院 薬学系研究科 
 
1984年4月
 - 
1988年3月
東京大学 薬学部 
 

受賞

 
1997年
日本結晶学会 日本結晶学会進歩賞 I型インターフェロン類の基本立体構造とその機能および進化
 
 
日本結晶学会 日本結晶学会学術賞 エピジェネティックおよび疾病関連タンパク質の構造生物学研究
 

論文

 
I Ciftci H, G Sierra R, Yoon CH, Su Z, Tateishi H, Koga R, Kotaro K, Yumoto F, Senda T, Liang M, Wakatsuki S, Otsuka M, Fujita M, DeMirci H
International journal of molecular sciences   20(7)    2019年4月   [査読有り]
RFID tag system for sample tracking at structural biology beamlines.
千田 俊哉
AIP Conference Proceedings.   2054 060074-1-060074-4   2019年1月   [査読有り]
Nakashima Y, Mitsuhashi T, Matsuda Y, Senda M, Sato H, Yamazaki M, Uchiyama M, Senda T, Abe I
Journal of the American Chemical Society   140(30) 9743-9750   2018年8月   [査読有り]
LysRタイプ転写調節因子CbnRのDNA結合ドメインとDNAとの複合体構造.
千田美紀, 安達成彦, Maharani Pertiwi Koentjoro, 小川直人, 千田俊哉.
日本結晶学会誌   60 135-141   2018年   [査読有り]
Sato M, Liebschner D, Yamada Y, Matsugaki N, Arakawa T, Wills SS, Hattie M, Stubbs KA, Ito T, Senda T, Ashida H, Fushinobu S
The Journal of biological chemistry   292(29) 12126-12138   2017年7月   [査読有り]
Ray-Gallet D, Ricketts MD, Sato Y, Gupta K, Boyarchuk E, Senda T, Marmorstein R, Almouzni G
Nature communications   9(1) 3103   2018年8月   [査読有り]
Harada A, Kamimura N, Takeuchi K, Yu HY, Masai E, Senda T
The FEBS journal   284(12) 1855-1867   2017年6月   [査読有り]
Senda M, Senda T
Biophysical reviews   10(2) 183-189   2018年4月   [査読有り]
Adachi N, Aizawa K, Kratzer Y, Saijo S, Shimizu N, Senda T
Protein expression and purification   133 50-56   2017年5月   [査読有り]
Katsuyama Y, Sato Y, Sugai Y, Higashiyama Y, Senda M, Senda T, Ohnishi Y
The FEBS journal   285(8) 1540-1555   2018年4月   [査読有り]
Nagae M, Mishra SK, Neyazaki M, Oi R, Ikeda A, Matsugaki N, Akashi S, Manya H, Mizuno M, Yagi H, Kato K, Senda T, Endo T, Nogi T, Yamaguchi Y
Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms   22(4) 348-359   2017年4月   [査読有り]
Koentjoro MP, Adachi N, Senda M, Ogawa N, Senda T
The FEBS journal   285(5) 977-989   2018年3月   [査読有り]
Nakashima Y, Mori T, Nakamura H, Awakawa T, Hoshino S, Senda M, Senda T, Abe I
Nature communications   9(1) 104   2018年1月   [査読有り]
Kawakami E, Adachi N, Senda T, Horikoshi M
Cell reports   21(13) 3941-3956   2017年12月   [査読有り]
Moriuchi R, Takada K, Takabayashi M, Yamamoto Y, Shimodaira J, Kuroda N, Akiyama E, Udagawa M, Minai R, Fukuda M, Senda T, Ogawa N
Bioscience, biotechnology, and biochemistry   81(11) 2119-2129   2017年11月   [査読有り]
Hayashi T, Senda M, Suzuki N, Nishikawa H, Ben C, Tang C, Nagase L, Inoue K, Senda T, Hatakeyama M
Cell reports   20(12) 2876-2890   2017年9月   [査読有り]
Yamashita K, Kuwabara N, Nakane T, Murai T, Mizohata E, Sugahara M, Pan D, Masuda T, Suzuki M, Sato T, Kodan A, Yamaguchi T, Nango E, Tanaka T, Tono K, Joti Y, Kameshima T, Hatsui T, Yabashi M, Manya H, Endo T, Kato R, Senda T, Kato H, Iwata S, Ago H, Yamamoto M, Yumoto F, Nakatsu T
IUCrJ   4(Pt 5) 639-647   2017年9月   [査読有り]
Nagae M, Liebschner D, Yamada Y, Morita-Matsumoto K, Matsugaki N, Senda T, Fujita M, Kinoshita T, Yamaguchi Y
Proteins   85(4) 764-770   2017年1月   [査読有り]
Kanai Y, Harada A, Shibata T, Nishimura R, Namiki K, Watanabe M, Nakamura S, Yumoto F, Senda T, Suzuki A, Neya S, Yamamoto Y
Biochemistry   56(34) 4500-4508   2017年8月   [査読有り]
Harada A, Sato Y, Kamimura N, Venugopalan N, Masai E, Senda T
Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications   72(Pt 12) 897-902   2016年12月   [査読有り]
Takeuchi K, Senda M, Lo YH, Kofuji S, Ikeda Y, Sasaki AT, Senda T
The FEBS journal   283(19) 3556-3562   2016年10月   [査読有り]
Katayama Y, Suzuki T, Ebisawa T, Ohtsuka J, Wang S, Natsume R, Lo YH, Senda T, Nagamine T, Hull JJ, Matsumoto S, Nagasawa H, Nagata K, Tanokura M
Biochimica et biophysica acta   1858(9) 2145-2151   2016年9月   [査読有り]
Kuwabara N, Manya H, Yamada T, Tateno H, Kanagawa M, Kobayashi K, Akasaka-Manya K, Hirose Y, Mizuno M, Ikeguchi M, Toda T, Hirabayashi J, Senda T, Endo T, Kato R
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   113(33) 9280-9285   2016年8月   [査読有り]
Nishikawa H, Hayashi T, Arisaka F, Senda T, Hatakeyama M
Scientific reports   6 30031   2016年7月   [査読有り]
Liebschner D, Yamada Y, Matsugaki N, Senda M, Senda T
Acta crystallographica. Section D, Structural biology   72(Pt 6) 728-741   2016年6月   [査読有り]
Adachi N, Senda T, Horikoshi M
Scientific reports   6 27922   2016年6月   [査読有り]
Sumita K, Lo YH, Takeuchi K, Senda M, Kofuji S, Ikeda Y, Terakawa J, Sasaki M, Yoshino H, Majd N, Zheng Y, Kahoud ER, Yokota T, Emerling BM, Asara JM, Ishida T, Locasale JW, Daikoku T, Anastasiou D, Senda T, Sasaki AT
Molecular cell   61(2) 187-198   2016年1月   [査読有り]
Kuwabara N, Minami R, Yokota N, Matsumoto H, Senda T, Kawahara H, Kato R
The Journal of biological chemistry   290(15) 9387-9398   2015年4月   [査読有り]
Sugiyama Y, Senda M, Senda T, Matsuda T
Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications   71(Pt 3) 320-323   2015年3月   [査読有り]
Nishizawa A, Harada A, Senda M, Tachihara Y, Muramatsu D, Kishigami S, Mori S, Sugiyama K, Senda T, Kimura S
The Biochemical journal   462(2) 257-265   2014年9月   [査読有り]
[Immuno-EM in solution using atmospheric scanning electron microscope (ASEM) applicable to various antibodies].
Ebihara T, Nishiyama H, Sato M, Senda T, Suga M, Sato C
Seikagaku. The Journal of Japanese Biochemical Society   86(1) 103-110   2014年2月   [査読有り]
Sugimoto K, Senda M, Kasai D, Fukuda M, Masai E, Senda T
PloS one   9(3) e92249   2014年   [査読有り]
Aizawa S, Senda M, Harada A, Maruyama N, Ishida T, Aigaki T, Ishigami A, Senda T
PloS one   8(1) e53706   2013年   [査読有り]
Senda T
Yakugaku zasshi : Journal of the Pharmaceutical Society of Japan   136(3) 449-458   2016年   [査読有り]
Hayashi T, Senda M, Morohashi H, Higashi H, Horio M, Kashiba Y, Nagase L, Sasaya D, Shimizu T, Venugopalan N, Kumeta H, Noda NN, Inagaki F, Senda T, Hatakeyama M
Cell host & microbe   12(1) 20-33   2012年7月   [査読有り]
Kim SB, Naganawa R, Murata S, Nakayama T, Miller S, Senda T
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)   1461 279-287   2016年   [査読有り]
Senda M, Yamamoto A, Tanaka H, Ishida T, Horiike K, Senda T
Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications   68(Pt 6) 644-646   2012年6月   [査読有り]
Nagase L, Hayashi T, Senda T, Hatakeyama M
Scientific reports   5 15749   2015年10月   [査読有り]
Maruyama Y, Ebihara T, Nishiyama H, Konyuba Y, Senda M, Numaga-Tomita T, Senda T, Suga M, Sato C
International journal of molecular sciences   13(8) 10553-10567   2012年   [査読有り]
Ishikawa K, Ohsumi T, Tada S, Natsume R, Kundu LR, Nozaki N, Senda T, Enomoto T, Horikoshi M, Seki M
Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms   16(10) 1050-1062   2011年10月   [査読有り]
Tanaka H, Senda M, Venugopalan N, Yamamoto A, Senda T, Ishida T, Horiike K
The Journal of biological chemistry   286(31) 27548-27558   2011年8月   [査読有り]
Kim SB, Miller S, Suzuki N, Senda T, Nishihara R, Suzuki K
Analytical sciences : the international journal of the Japan Society for Analytical Chemistry   31(10) 955-960   2015年   [査読有り]
Senda M, Tanaka H, Ishida T, Horiike K, Senda T
Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications   67(Pt 1) 147-149   2011年1月   [査読有り]
Prokop Z, Sato Y, Brezovsky J, Mozga T, Chaloupkova R, Koudelakova T, Jerabek P, Stepankova V, Natsume R, van Leeuwen JG, Janssen DB, Florian J, Nagata Y, Senda T, Damborsky J
Angewandte Chemie (International ed. in English)   49(35) 6111-6115   2010年8月   [査読有り]
Kamimura N, Takamura K, Hara H, Kasai D, Natsume R, Senda T, Katayama Y, Fukuda M, Masai E
Journal of bacteriology   192(13) 3394-3405   2010年7月   [査読有り]
Akai Y, Adachi N, Hayashi Y, Eitoku M, Sano N, Natsume R, Kudo N, Tanokura M, Senda T, Horikoshi M
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   107(18) 8153-8158   2010年5月   [査読有り]
Senda M, Kishigami S, Kimura S, Senda T
Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications   63(Pt 6) 520-523   2007年6月   [査読有り]
Sato Y, Natsume R, Tsuda M, Damborsky J, Nagata Y, Senda T
Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications   63(Pt 4) 294-296   2007年4月   [査読有り]
Senda M, Kishigami S, Kimura S, Senda T
Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications   63(Pt 4) 311-314   2007年4月   [査読有り]
Natsume R, Eitoku M, Akai Y, Sano N, Horikoshi M, Senda T
Nature   446(7133) 338-341   2007年3月   [査読有り]
Muto S, Senda M, Akai Y, Sato L, Suzuki T, Nagai R, Senda T, Horikoshi M
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   104(11) 4285-4290   2007年3月   [査読有り]
Yamada M, Natsume R, Nakamatsu T, Horinouchi S, Kawasaki H, Senda T
Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications   63(Pt 2) 120-122   2007年2月   [査読有り]
Senda M, Kimura S, Kishigami S, Senda T
Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications   62(Pt 6) 590-592   2006年6月   [査読有り]
Sugimoto K, Matsufuzi K, Ohnuma H, Senda M, Fukuda M, Senda T
Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications   62(Pt 2) 125-127   2006年2月   [査読有り]
Ishida T, Senda T, Tanaka H, Yamamoto A, Horiike K
Biochemical and biophysical research communications   338(1) 223-229   2005年12月   [査読有り]
[Structure function relationship of the LysR type transcriptional regulator].
Senda T, Ogawa N
Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme   50(12) 1535-1540   2005年10月   [査読有り]
Senda M, Hatta T, Kimbara K, Senda T
Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications   66(Pt 3) 282-285   2010年3月   [査読有り]
Liu S, Ogawa N, Senda T, Hasebe A, Miyashita K
Journal of bacteriology   187(15) 5427-5436   2005年8月   [査読有り]
Sugimoto K, Yamamoto Y, Antoni S, Senda M, Kasai D, Masai E, Fukuda M, Senda T
Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications   65(Pt 11) 1171-1174   2009年11月   [査読有り]
Kimura S, Kikuchi A, Senda T, Shiro Y, Fukuda M
The Biochemical journal   388(3) 869-878   2005年6月   [査読有り]
Senda T, Senda M, Kimura S, Ishida T
Antioxidants & redox signaling   11(7) 1741-1766   2009年7月   [査読有り]
Adachi N, Natsume R, Senda M, Muto S, Senda T, Horikoshi M
Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography   60(Pt 12 Pt 2) 2328-2331   2004年12月   [査読有り]
Hayashi Y, Senda T, Sano N, Horikoshi M
Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms   14(7) 789-806   2009年7月   [査読有り]
Furusawa Y, Nagarajan V, Tanokura M, Masai E, Fukuda M, Senda T
Journal of molecular biology   342(3) 1041-1052   2004年9月   [査読有り]
Adachi N, Senda M, Natsume R, Senda T, Horikoshi M
Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms   13(11) 1127-1140   2008年11月   [査読有り]
Muto S, Senda M, Adachi N, Suzuki T, Nagai R, Senda T, Horikoshi M
Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography   60(Pt 4) 712-714   2004年4月   [査読有り]
Senda M, Muto S, Horikoshi M, Senda T
Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications   64(Pt 10) 960-965   2008年10月   [査読有り]
Natsume R, Ohnishi Y, Senda T, Horinouchi S
Journal of molecular biology   336(2) 409-419   2004年2月   [査読有り]
[Mechanism of nucleosome assembly/disassembly mediated by histone chaperone CIA; implications for nucleosome semi-conservative replication].
Natsume R, Eitoku M, Horikoshi M, Senda T
Seikagaku. The Journal of Japanese Biochemical Society   79(11) 1068-1072   2007年11月   [査読有り]
Tsunoda M, Kusakabe Y, Tanaka N, Ohno S, Nakamura M, Senda T, Sekine M, Yokogawa T, Nishikawa K, Nakamura KT
Nucleic acids symposium series (2004)   (48) 155-156   2004年   [査読有り]
Suzuki Y, Noma A, Suzuki T, Senda M, Senda T, Ishitani R, Nureki O
Journal of molecular biology   372(5) 1204-1214   2007年10月   [査読有り]
Natsume R, Takeshita R, Sugiyama M, Ohnishi Y, Senda T, Horinouchi S
Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography   59(Pt 12) 2313-2315   2003年12月   [査読有り]
Senda M, Kishigami S, Kimura S, Fukuda M, Ishida T, Senda T
Journal of molecular biology   373(2) 382-400   2007年10月   [査読有り]
Nagarajan V, Sakurai N, Kubota M, Nonaka T, Nagumo H, Takeda H, Nishizaki T, Masai E, Fukuda M, Mitsui Y, Senda T
Protein and peptide letters   10(4) 412-417   2003年8月   [査読有り]
Tsunoda M, Kusakabe Y, Tanaka N, Ohno S, Nakamura M, Senda T, Moriguchi T, Asai N, Sekine M, Yokogawa T, Nishikawa K, Nakamura KT
Nucleic acids research   35(13) 4289-4300   2007年   [査読有り]

競争的資金等の研究課題

 
ピロリ菌の感染と発がん機構の構造学的解明
科学技術振興機構: CREST
研究期間: 2012年10月 - 2018年3月    代表者: 千田 俊哉
文部科学省: 科学研究費補助金(基盤研究(B), 基盤研究(B))
研究期間: 2012年 - 2014年    代表者: 千田 俊哉
文部科学省: 科学研究費補助金(新学術領域研究(研究領域提案型), 新学術領域研究(研究領域提案型))
研究期間: 2010年 - 2014年    代表者: 千田 俊哉
今年度は、HIRAの発規に力を注いだ。大腸菌で発現させたHIRAは、生化学的にはヒストンH3-H4結合活性やCIA/ASF1結合活性を持つものであったが、ゲル濾過による分析の結果、溶液中で大きな会合体を形成していることが明らかになった。その原因をさらに追求するために、電子顕微鏡を用いて不染色像を観察したところ、DNAを巻き込んだ複合体を形成していることが明らかになり、単独での精製を断念した。そこで、HIRAをN末端部、C末端部の2つに分割し、発現精製を行った。そのうちC末端部分に関しては、...
文部科学省: 科学研究費補助金(挑戦的萌芽研究)
研究期間: 2012年 - 2013年    代表者: 千田 俊哉
文部科学省: 科学研究費補助金(挑戦的萌芽研究)
研究期間: 2009年 - 2010年    代表者: 千田 俊哉
今年度は、大腸菌由来のTacプロモータとコリネ型細菌由来のCspBプロモータを利用して異種タンパク質(ヒストンシャペロンCIAおよびTAF-Iβ)の発現を試みた。CIAおよびTAF-Iβには、精製用にHis-タグを付与した。発現したタンパク質をアフィニティ精製したところ、CIAはTacプロモータで、TAF-IβはCspBプロモータで発現可能であることがわかった。プロモータと発現タンパク質の組み合わせに相性が認められたが、両プロモータはコリネ型細菌を用いた異種タンパク質発現に有効であることが...