阿部陽 (Akira Abe) - マイポータル

基本情報

所属: 公益財団法人岩手生物工学研究センターゲノム育種研究部研究部長

学位: 博士（農学）(岩手大学大学院)

J-GLOBAL ID: 200901002657196119
researchmap会員ID: 5000012015

外部リンク: https://genome.ibrc.or.jp

研究キーワード

研究分野

環境・農学 / 遺伝育種科学 /

受賞

2019年3月

日本育種学会賞, 全ゲノム情報をもちいた突然変異遺伝子およびQTL同定法の開発とその活用, 日本育種学会

岩手生物工学研究センターゲノム育種研究グループ, 寺内良平, 阿部陽, 高木宏樹
2016年8月

学術賞, 日本作物学会東北支部会

阿部陽

論文

Mutagenesis and production of double-flowered gentians via regeneration from ion beam-irradiated leaves

Masahiro Nishihara, Akiko Hirabuchi, Akira Abe, Motoki Shimizu, Fumina Goto, Chiharu Yoshida, Takashi Shimokawa, Suguru Ozawa, Zenbi Naito, Keiichiro Nemoto

Plant Biotechnology 42(4) 423-429 2025年12月25日
STT3A Is Required for Recognition of Pathogen-Derived Sphingolipids in Arabidopsis.

Seowon Choi, Motoki Shimizu, Akira Abe, Nobuaki Ishihama, Yuko Ishikawa, Daigo Takemoto, Ken Shirasu, Yoshitaka Takano, Ryohei Terauchi, Hiroaki Kato

Molecular plant-microbe interactions : MPMI 2025年10月14日
Impact of rice GENERAL REGULATORY FACTOR14h (GF14h) on low-temperature seed germination and its application to breeding

Yusaku Sugimura, Kaori Oikawa, Yu Sugihara, Hiroe Utsushi, Eiko Kanzaki, Kazue Ito, Yumiko Ogasawara, Tomoaki Fujioka, Hiroki Takagi, Motoki Shimizu …

PLOS Genetics 20(8) e1011369-e1011369 2024年8月7日査読有り責任著者
Whole-genome analysis of recombinant inbred rice lines reveals a quantitative trait locus on chromosome 3 with genotype-by-environment interaction effects.

Toshiyuki Sakai, Tomoaki Fujioka, Toyokazu Uemura, Shinichi Saito, Ryohei Terauchi, Akira Abe

G3 (Bethesda, Md.) 13(6) 2023年6月1日査読有り責任著者
Isolation of Pikps, an allele of Pik, from the aus rice cultivar Shoni.

Basavaraj Kovi, Toshiyuki Sakai, Akira Abe, Eiko Kanzaki, Ryohei Terauchi, Motoki Shimizu

Genes & genetic systems 2023年1月7日査読有り
V-primer: software for the efficient design of genome-wide InDel and SNP markers from multi-sample variant call format (VCF) genotyping data

Satoshi Natsume, Kaori Oikawa, Chihiro Nomura, Kazue Ito, Hiroe Utsushi, Motoki Shimizu, Ryohei Terauchi, Akira Abe

Breeding Science 73(4) 415-420 2023年査読有り責任著者
Disentangling the complex gene interaction networks between rice and the blast fungus identifies a new pathogen effector.

Yu Sugihara, Yoshiko Abe, Hiroki Takagi, Akira Abe, Motoki Shimizu, Kazue Ito, Eiko Kanzaki, Kaori Oikawa, Jiorgos Kourelis, Thorsten Langner …

PLoS biology 21(1) e3001945 2023年1月査読有り
Genome Analysis Revives a Forgotten Hybrid Crop Edo-dokoro in the Genus Dioscorea.

Satoshi Natsume, Yu Sugihara, Aoi Kudoh, Kaori Oikawa, Motoki Shimizu, Yuko Ishikawa, Masahiro Nishihara, Akira Abe, Hideki Innan, Ryohei Terauchi

Plant & cell physiology 2022年7月25日査読有り
A genetically linked pair of NLR immune receptors shows contrasting patterns of evolution.

Motoki Shimizu, Akiko Hirabuchi, Yu Sugihara, Akira Abe, Takumi Takeda, Michie Kobayashi, Yukie Hiraka, Eiko Kanzaki, Kaori Oikawa, Hiromasa Saitoh …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 119(27) e2116896119 2022年7月5日査読有り
Recognition of pathogen-derived sphingolipids in Arabidopsis

H. Kato, K. Nemoto, M. Shimizu, A. Abe, S. Asai, N. Ishihama, S. Matsuoka, T. Daimon, M. Ojika, K. Kawakita …

Science 376(6595) 857-860 2022年5月20日査読有り
High-performance pipeline for MutMap and QTL-seq

Yu Sugihara, Lester Young, Hiroki Yaegashi, Satoshi Natsume, Daniel J. Shea, Hiroki Takagi, Helen Booker, Hideki Innan, Ryohei Terauchi, Akira Abe

PeerJ 10 e13170-e13170 2022年3月18日査読有り責任著者
Recombinant inbred lines and next-generation sequencing enable rapid identification of candidate genes involved in morphological and agronomic traits in foxtail millet

Kenji Fukunaga, Akira Abe, Yohei Mukainari, Kaho Komori, Keisuke Tanaka, Akari Fujihara, Hiroki Yaegashi, Michie Kobayashi, Kazue Ito, Takanori Ohsako …

Scientific Reports 12(1) 2022年1月7日査読有り筆頭著者責任著者
Insertion of a transposable element in Less Shattering1 (SvLes1) gene is not always involved in foxtail millet (Setaria italica) domestication

Kenji Fukunaga, Sarasa Matsuyama, Akira Abe, Michie Kobayashi, Kazue Ito

Genetic Resources and Crop Evolution 2021年3月15日査読有り
Genotypic variation in cold tolerance of 18 Ethiopian rice cultivars in relation to their reproductive morphology

Habtamu Assega Alemayehu, Gibrilla Dumbuya, Mehedi Hasan, Tilahun Tadesse, Shinsuke Nakajyo, Tomoaki Fujioka, Akira Abe, Maya Matsunami, Hiroyuki Shimono

Field Crops Research 262 108042-108042 2021年3月
Genome analyses reveal the hybrid origin of the staple crop white Guinea yam (Dioscorea rotundata).

Yu Sugihara, Kwabena Darkwa, Hiroki Yaegashi, Satoshi Natsume, Motoki Shimizu, Akira Abe, Akiko Hirabuchi, Kazue Ito, Kaori Oikawa, Muluneh Tamiru-Oli …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 117(50) 31987-31992 2020年12月15日査読有り
Lumi-Map, a Real-Time Luciferase Bioluminescence Screen of Mutants Combined with MutMap, Reveals Arabidopsis Genes Involved in PAMP-Triggered Immunity.

Hiroaki Kato, Kiyoshi Onai, Akira Abe, Motoki Shimizu, Hiroki Takagi, Chika Tateda, Hiroe Utsushi, Suthitar Singkarabanit-Ogawa, Saeko Kitakura, Erika Ono …

Molecular plant-microbe interactions : MPMI 33(12) 1366-1380 2020年12月査読有り
RIL-StEp: epistasis analysis of recombinant inbred lines (RILs) reveals candidate interacting genes that control rice seed hull color

Toshiyuki Sakai, Akira Abe, Motoki Shimizu, Ryohei Terauchi

2020年6月10日査読有り
Next generation long-culm rice with superior lodging resistance and high grain yield, Monster Rice 1

Tomohiro Nomura, Naoya Arakawa, Toshio Yamamoto, Tadamasa Ueda, Shunsuke Adachi, Jun ichi Yonemaru, Akira Abe, Hiroki Takagi, Tadashi Yokoyama, Taiichiro Ookawa

PLoS ONE 14(8) e0221424 2019年8月1日査読有り
Genome analysis of the foxtail millet pathogen Sclerospora graminicola reveals the complex effector repertoire of graminicolous downy mildews

Michie Kobayashi, Yukie Hiraka, Akira Abe, Hiroki Yaegashi, Satoshi Natsume, Hideko Kikuchi, Hiroki Takagi, Hiromasa Saitoh, Joe Win, Sophien Kamoun …

BMC GENOMICS 18(1) 897 2017年11月査読有り
Genome sequencing of the staple food crop white Guinea yam enables the development of a molecular marker for sex determination

Muluneh Tamiru, Satoshi Natsume, Hiroki Takagi, Benjamen White, Hiroki Yaegashi, Motoki Shimizu, Kentaro Yoshida, Aiko Uemura, Kaori Oikawa, Akira Abe …

BMC BIOLOGY 15(1) 86 2017年9月査読有り

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主要なMISC

全ゲノム情報を用いた突然変異遺伝子およびQTL同定法の開発とその活用

寺内良平, 寺内良平, 阿部陽, 高木宏樹, 高木宏樹

育種学研究 21(2) 2019年招待有り

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書籍等出版物

Rice Genomics, Genetics and Breeding

Akira Abe, Hiroki Takagi, Hiroki Yaegashi, Satoshi Natsume, Hiroe Utsushi, Muluneh Tamiru, Ryohei Terauchi (担当:分担執筆, 範囲:Next-Generation Breeding of Rice by Whole-Genome Approaches)

Springer 2018年
次世代シークエンス解析スタンダード

阿部陽, 高木宏樹, 小杉俊一, 夏目聡, 八重樫弘樹, 吉田健太郎, 寺内良平 (担当:分担執筆, 範囲:育種に応用するMutMap)

羊土社 2014年
The handbook of plant mutation screening : mining of natural and induced alleles

(担当:分担執筆, 範囲:Use of TILLING for Reverse and Forward Genetics of Rice)

Wiley-Blackwell 2010年3月22日 (ISBN: 3527326049)

講演・口頭発表等

慣行栽培における耐塩性水稲品種「Kaijin」の収量性および食味関連理化学特性

阿部陽, 高木宏樹, 仲條眞介, 寺内良平, 黒田栄喜

日本作物学会東北支部会報 2016年日本作物学会東北支部
イネNested association mapping集団による穂の着粒構造に関するQTL同定

太田裕貴, 阿部陽, 仲條眞介, 藤岡智明, 植村亜衣子, 及川香梨, 宇津志博恵, 寺内良平

日本作物学会講演会要旨集 2016年日本作物学会
イネNested Association Mapping集団による農業形質の遺伝解析

阿部陽, 高木宏樹, 八重樫弘樹, 植村亜衣子, 及川香梨, 宇津志博恵, 菊池秀子, 小笠原由美子, 清水元樹, 寺内良平

育種学研究 2016年
ギニアヤムのゲノム解析

TAMIRU Muluneh, 夏目俊, 高木宏樹, WHITE Benjamin, 清水元樹, 吉田健太郎, 八重樫弘樹, 植村亜衣子, 及川香梨, 阿部陽, 浦崎直也, 松村英生, BABIL Pachakkil, 山中慎介, 松本亮, 村中聡, GIRMA Gezahegn, LOPEZ-MONTES Antonio, GEDIL Melaku, BHATTACHARJEE Rnjana, ABBERTON Michael, KUMAR P. Lava, RABBI Ismail, 辻村真衣, 寺地徹, HAERTY Wilfried, CORPAS Manuel, KAMOUN Sophien, KAHL Guenter, 高木洋子, ASIEDU Robert, 寺内良平, 寺内良平

日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム講演要旨集 2016年
イネ初期伸長性QTL"qPHS3-2"が湛水直播の初期生育に与える効果

阿部陽, 野々上慈徳, 寺内良平, 菅原浩視

日本作物学会東北支部会報 2015年日本作物学会東北支部
バーコードシステムを用いたイネ大規模実験系統群の効率的な形質調査

阿部陽, 宇津志博恵, 高木宏樹, 寺内良平

日本作物學會紀事 2013年9月9日
Identification of genomic regions linked to phenotype by whole genome sequencing of bulked DNA in rice

Akira Abe, Shunichi Kosugi, Kentaro Yoshida, Tamiru Muluneh, Hiroki Takagi, Satoshi Natsume, Tsutomu Sasaki, Ryohei Terauchi

GENES & GENETIC SYSTEMS 2011年12月 GENETICS SOC JAPAN
イネにおけるゴールドハル形質が倒伏抵抗性関連形質に与える影響

落合祐介, 阿部陽, 菅原浩視, 黒田榮喜, 寺内良平

日本作物學會紀事 2011年3月30日
ヒエの冬期世代促進における出穂特性と適性播種密度の品種間差異

高草木雅人, 阿部陽, 田村和彦, 仲條眞介, 木内豊

日本作物学会講演会要旨集 2006年日本作物学会
寒冷地における直播向け水稲選抜のための押し倒し抵抗値指標品種の選定

阿部陽, 田村和彦, 木内豊

日作紀 2004年日本作物学会
寒冷地における遺伝子型の異なる水稲品種・系統の乾物生産および分配特性

阿部陽, 田村和彦, 高橋真博, 神山芳典, 黒田栄喜

日本作物學會紀事 2003年4月4日日本作物学会
水稲の耐倒伏性に関与する桿の性質の基肥無窒素栽培条件による変化

Duy Pham Quang, 阿部陽, 平野貢, 黒田栄喜

日本作物學會紀事 2002年4月2日日本作物学会
110 FACE(Free-air CO_2 Enrichment)が水稲の乾物分配および炭水化物代謝に及ぼす影響

黒田栄喜, 阿部陽, 平野貢, 金漢龍, 岡田益己, 小林和彦

日本作物學會紀事 2001年3月30日日本作物学会
22 寒冷地における水稲品種の収量性および乾物生産とその分配特性

黒田栄喜, 小舘琢磨, 阿部陽, 平野貢

日本作物學會紀事 2001年3月30日日本作物学会
83 FACE(Free-air CO_2 Enrichment)が水稲品種「ふくひびき」の生育と収量に及ぼす影響

黒田栄喜, 阿部陽, 田中大介, 宋鳳斌, 平野貢, 金漢龍, 岡田益己, 小林和彦

日本作物學會紀事 2000年10月4日日本作物学会
1 寒冷地水稲における収量性の品種間差異とその年次変動に及ぼす要因

黒田栄喜, 阿部陽, 東直邦, 小舘琢磨, 平野貢

日本作物學會紀事 1999年日本作物学会

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

イネNLRome-病原菌エフェクター相互作用の全貌解明と育種利用

日本学術振興会科学研究費助成事業特別推進研究 2024年4月 - 2029年3月

寺内良平, 藤崎恒喜, 堺俊之, 根本圭一郎, 安達広明, 竹田匠, 阿部陽, 清水元樹
3次元回帰モデリングによるイネのゲノムワイド多環境出穂期予測システムの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2028年3月

齊藤大樹, 堺俊之, 土井一行, 阿部陽
大気CO2濃度上昇への適応を支配するイネの代謝-遺伝子ネットワークの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2027年3月

下野裕之, 若山正隆, 小倉立己, 野口航, 阿部陽
イネNAM集団を用いた高精度ゲノミックデザインモデルの構築と有用ハプロタイプの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2026年3月

阿部陽, 堺俊之
NGSを用いた，新規モデル植物Setariaの量的形質候補遺伝子同定と遺伝資源多様性評価

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2023年4月 - 2026年3月

福永健二, 門田有希, 大迫敬義, 阿部陽
イネNAM集団を用いた高精度ゲノミックデザインモデルの構築と有用ハプロタイプの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2026年3月

阿部陽, 堺俊之
イネNLR抵抗性遺伝子の機能と進化の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2020年8月 - 2025年3月

寺内良平, 藤崎恒喜, 阿部陽, 清水元樹
Dual-NAM集団を用いた出穂期メタQTLの環境応答性を評価する数理モデリング

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

齊藤大樹, 小川諭志, 土井一行, 阿部陽
遺伝資源保全のための,ゲノム情報を用いたアワ在来品種・実験系統の多様性解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

福永健二, 阿部陽
イネNAM集団を用いた新規ゲノム予測手法による遺伝子同定とネットワーク解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2020年4月 - 2023年3月

阿部陽, 石川和也
イネの野外ビッグデータを用いた「人工知能」による育種プラットフォームの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2019年4月 - 2022年3月

下野裕之, 岩田洋佳, 阿部陽, 金天海
イネNLR抵抗性遺伝子の機能と進化の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2020年4月 - 2021年3月

寺内良平, 藤崎恒喜, 阿部陽, 清水元樹
イネNAM集団を利用した群落ソース能関連遺伝子の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2017年4月 - 2020年3月

阿部陽
Nested Association Mappingによるイネ多収遺伝子の単離

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 2014年4月 - 2017年3月

阿部陽, 高木宏樹, 宇津志博恵, 八重樫弘樹

阿部陽

基本情報

研究キーワード

研究分野

受賞

論文

主要なMISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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