楳原琢哉 (Takuya Umehara) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学生物生産工学研究センター特任助教

J-GLOBAL ID: 200901040177299030
researchmap会員ID: 5000013538

経歴

2018年4月 - 現在

東京大学, 生物生産工学研究センター, 特任助教
2013年4月 - 2018年3月

東京理科大学, 基礎工学部生物工学科, 嘱託助教
2011年1月 - 2013年3月

東京理科大学, RNA科学総合研究センター, ポストドクトラル研究員
2006年9月 - 2010年12月

Yale University, Molecular Biophysics and Biochemistry, Postdoctoral associate
2006年6月 - 2006年8月

（独）産業技術総合研究所, 年齢軸生命工学研究センター, 特別研究員
2005年3月 - 2006年5月

（財）東京都臨床医学総合研究所, 感染症プロジェクト, 特別研究員

論文

Lysine Acetylation Regulates Alanyl-tRNA Synthetase Activity in Escherichia coli.

Umehara T, Kosono S, Söll D, Tamura K

Genes 9(10) 473-473 2018年9月査読有り
The kiss switch brings inactive R3C ligase ribozyme back to life

Kana Tanizawa, Sayuri Uchida, Eri Kurihara, Takuya Umehara, Koji Tamura

Biology 7(1) 2018年3月1日査読有り
A step into the RNA world: Conditional analysis of hydrogel formation of adenosine 5 '-monophosphate induced by cyanuric acid

Takumi Yokosawa, Ryota Enomoto, Sho Uchino, Ito Hirasawa, Takuya Umehara, Koji Tamura

BIOSYSTEMS 162 53-58 2017年12月査読有り
A genomically modified Escherichia coli strain carrying an orthogonal E. coli histidyl-tRNA synthetase•tRNA^His pair.

Englert M, Vargas-Rodriguez O, Reynolds NM, Wang YS, Söll D, Umehara T

Biochimica et biophysica acta 1861(11 Pt B) 3009-3015 2017年11月査読有り
Binding Properties of Split tRNA to the C-terminal Domain of Methionyl-tRNA Synthetase of Nanoarchaeum equitans

Hidemichi Suzuki, Akihiro Kaneko, Taro Yamamoto, Mahoko Nambo, Ito Hirasawa, Takuya Umehara, Hisashi Yoshida, Sam-Yong Park, Koji Tamura

JOURNAL OF MOLECULAR EVOLUTION 84(5-6) 267-278 2017年6月査読有り
RNA-Dependent Cysteine Biosynthesis in Bacteria and Archaea

Takahito Mukai, Ana Crnkovic, Takuya Umehara, Natalia N. Ivanova, Nikos C. Kyrpides, Dieter Soll

MBIO 8(3) 2017年5月査読有り
Development of a functionally minimized mutant of the R3C ligase ribozyme offers insight into the plausibility of the RNA world hypothesis

Eri Kurihara, Sayuri Uchida, Takuya Umehara, Koji Tamura

Biology 3(3) 452-465 2014年7月29日査読有り
Proline Might Have Been the First Amino Acid in the Primitive Genetic Code

Reina Komatsu, Risa Sawada, Takuya Umehara, Koji Tamura

JOURNAL OF MOLECULAR EVOLUTION 78(6) 310-312 2014年6月査読有り
Pyrrolysyl-tRNA synthetase variants reveal ancestral aminoacylation function

Jae-hyeong Ko, Yane-Shih Wang, Akiyoshi Nakamura, Li-Tao Guo, Dieter Soell, Takuya Umehara

FEBS LETTERS 587(19) 3243-3248 2013年10月査読有り
Glycols modulate terminator stem stability and ligand-dependency of a glycine riboswitch

Kokoro Hamachi, Hikari Hayashi, Miyuki Shimamura, Yuiha Yamaji, Ai Kaneko, Aruma Fujisawa, Takuya Umehara, Koji Tamura

BIOSYSTEMS 113(2) 59-65 2013年8月査読有り
RNA tetraplex as a primordial peptide synthesis scaffold

Takuya Umehara, Takahiro Kitagawa, Yu Nakazawa, Hinako Yoshino, Ryohei Nemoto, Koji Tamura

BIOSYSTEMS 109(2) 145-150 2012年8月査読有り
Self-Enhancement of Hepatitis C Virus Replication by Promotion of Specific Sphingolipid Biosynthesis

Yuichi Hirata, Kazutaka Ikeda, Masayuki Sudoh, Yuko Tokunaga, Akemi Suzuki, Leiyun Weng, Masatoshi Ohta, Yoshimi Tobita, Ken Okano, Kazuhisa Ozeki …

PLoS Pathogens 8(8) e1002860 2012年8月査読有り
N-Acetyl lysyl-tRNA synthetases evolved by a CcdB-based selection possess N-acetyl lysine specificity in vitro and in vivo

Takuya Umehara, Jihyo Kim, Sangsik Lee, Li-Tao Guo, Dieter Soell, Hee-Sung Park

FEBS LETTERS 586(6) 729-733 2012年3月査読有り
Expanding the Genetic Code of Escherichia coli with Phosphoserine

Hee-Sung Park, Michael J. Hohn, Takuya Umehara, Li-Tao Guo, Edith M. Osborne, Jack Benner, Christopher J. Noren, Jesse Rinehart, Dieter Soell

SCIENCE 333(6046) 1151-1154 2011年8月査読有り
Increased inhibitory ability of conjugated RNA aptamers against the HCV IRES

Kunio Kikuchi, Takuya Umehara, Fumiko Nishikawa, Kotaro Fukuda, Tsunemi Hasegawa, Satoshi Nishikawa

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 386(1) 118-123 2009年8月査読有り
Pyrrolysyl-tRNA synthetase-tRNA(Pyl) structure reveals the molecular basis of orthogonality

Kayo Nozawa, Patrick O'Donoghue, Sarath Gundllapalli, Yuhei Araiso, Ryuichiro Ishitani, Takuya Umehara, Dieter Soell, Osamu Nureki

NATURE 457(7233) 1163-U127 2009年2月査読有り
Misacylation of pyrrolysine tRNA in vitro and in vivo

Sarath Gundllapalli, Alexandre Ambrogelly, Takuya Umehara, Darrick Li, Carla Polycarpo, Dieter Soell

FEBS LETTERS 582(23-24) 3353-3358 2008年10月査読有り
Liver target delivery of small interfering RNA to the HCV gene by lactosylated cationic liposome

Tsunamasa Watanabe, Takuya Umehara, Fumihiko Yasui, Shin-ichiro Nakagawa, Junichi Yano, Tadaaki ohgi, Satoru Sonoke, Kenichi Satoh, Kazuaki Inoue, Makoto Yoshiba …

JOURNAL OF HEPATOLOGY 47(6) 744-750 2007年12月査読有り
Therapeutic application of RNA interference for hepatitis C virus

Tsunamasa Watanabe, Takuya Umehara, Michinori Kohara

ADVANCED DRUG DELIVERY REVIEWS 59(12) 1263-1276 2007年10月査読有り
Evaluation of a cyclophilin inhibitor in hepatitis C virus-infected chimeric mice in vivo

Kazuaki Inoue, Takuya Umehara, Urs T. Ruegg, Fumihiko Yasui, Tsunamasa Watanabe, Hiroshi Yasuda, Jean-Maurice Dumont, Pietro Scalfaro, Makoto Yoshiba, Michinori Kohara

HEPATOLOGY 45(4) 921-928 2007年4月査読有り

もっとみる