藤原進 (Susumu Fujiwara) - マイポータル

基本情報

所属: 京都工芸繊維大学材料化学系教授

学位: 博士（理学）(慶應義塾大学)

J-GLOBAL ID: 200901061950071106
researchmap会員ID: 5000026633

外部リンク: http://www.cis.kit.ac.jp/~fujiwara/index.shtml

研究キーワード

研究分野

経歴

2015年4月 - 現在

京都工芸繊維大学, 材料化学系, 教授
2014年1月 - 2015年3月

京都工芸繊維大学, 大学院工芸科学研究科, 教授
2013年10月 - 2014年3月

横浜国立大学, 大学院工学府, 非常勤講師
2007年4月 - 2013年12月

京都工芸繊維大学, 大学院工芸科学研究科, 准教授
2012年10月 - 2013年3月

横浜国立大学, 大学院工学府, 非常勤講師
2010年4月 - 2011年9月

愛知工業大学, 非常勤講師
2006年4月 - 2007年3月

京都工芸繊維大学, 大学院工芸科学研究科, 助教授
2002年4月 - 2006年3月

京都工芸繊維大学, 繊維学部, 助教授
2003年5月 - 2004年3月

核融合科学研究所, 共同研究員（併任）
2001年6月 - 2003年3月

慶應義塾大学, 大学院政策・メディア研究科, 特別研究講師（非常勤）
2001年8月 - 2002年3月

総合研究大学院大学, 数物科学研究科核融合科学専攻科, 助手（併任）
1995年4月 - 2002年3月

核融合科学研究所, 理論･シミュレーション研究センター, 助手

学歴

1992年4月 - 1995年3月

Keio University (Ph. D in physics), Faculty of Science and Technology, Department of Physics
1992年4月 - 1995年3月

慶應義塾大学, 理工学研究科, 物理学専攻後期博士課程
1990年4月 - 1992年3月

慶應義塾大学, 理工学研究科, 物理学専攻前期博士課程
1990年4月 - 1992年3月

Keio University (M. Sc. in physics), Graduate School, Faculty of Science and Technology, Department of Physics
1986年4月 - 1990年3月

慶應義塾大学, 理工学部, 物理学科
1986年4月 - 1990年3月

Keio University (B. Sc. in physics), Faculty of Science and Technology, Department of Physics

委員歴

2020年9月 - 現在

日本シミュレーション学会, 理事
2004年4月 - 現在

Steering committee member of the Research Group on Computational Polymer Science in the Society of Polymer Science, Japan
2004年 - 現在

- 高分子学会高分子計算機科学研究会運営委員会委員
2022年7月 - 2024年7月

日本シミュレーション学会, 会長
2012年4月 - 2014年3月

高分子学会, 高分子計算機科学研究会運営委員会副委員長
2012年4月 - 2014年3月

Vice-chairperson of the steering committee of the Research Group on Computational Polymer Science in the Society of Polymer Science, Japan
2009年4月 - 2010年3月

分子シミュレーション研究会, 学術賞調査委員会委員
2004年 - 2006年

「高分子」海外ニュース担当委員
2001年 - 2002年

日本物理学会領域１２化学物理分科会世話人
2001年 - 2002年

Coordinator of the field 12 of condensed matter physics division in thePhysical Society of Japan
1998年 - 2001年

高機能材料設計プラットフォームの研究開発(通称、土井プロジェクト)総合調査研究委員会委員

受賞

2024年10月

Award_of_ASIASIM_Fellowship, Great contribution to development of modeling and simulation and the ASIASIM, Federation of Asia Simulation Societies (ASIASIM)

Susumu Fujiwara
2021年11月

JSST2021 Outstanding Presentation Award
2017年10月

日本シミュレーション学会研究賞
2001年

Best Poster Award in "Conference on Computational Physics 2001"
1990年

慶応工学会賞

論文

153

Molecular dynamics study on clustered DNA damage: AP sites on the same strand

Kazushi Terakawa, Susumu Fujiwara, Tomoko Mizuguchi, Hiroaki Nakamura, Ken Akamatsu, Naoya Shikazono, Yoshiteru Yonetani

Biophysical Chemistry 107394-107394 2025年1月
Reactive molecular dynamics simulation on DNA double strand breaks induced by hydrogen elimination

Hiroaki Nakamura, Kento Ishiguro, Ayako Nakata, Shunsuke Usami, Seiki Saito, Susumu Fujiwara

Japanese Journal of Applied Physics 2024年10月25日
Analyzing hydroxyl radical accessibility related to hydrogen abstraction in a DNA sugar moiety using molecular dynamics simulations

Ryuta Kawanami, Susumu Fujiwara, Yoshiteru Yonetani, Tsukasa Aso

AIP Advances 14(10) 105318-1-105318-7 2024年10月14日査読有り責任著者
Molecular Dynamics Study on Structure Formation in Soft Matter and Biomolecules

Susumu Fujiwara

Conference Proceedings of the 43rd JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST2024) xiii-xiii 2024年9月招待有り筆頭著者責任著者
Orientation factor analysis of gapped DNA labeled with fluorescent dye molecules

Takumi Timothy Hashi, Susumu Fujiwara, Tomoko Mizuguchi, Yoshiteru Yonetani, Naoya Shikazono, Ken Akamatu, Hiroaki Nakamura

Student Session Proceedings of the 43rd JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST2024) 30(33) 2024年9月査読有り責任著者
Molecular dynamics simulation on hydration structure of zwitterionic molecules

Takuya Harada, Susumu Fujiwara, Takashi Aoki

Student Session Proceedings of the 43rd JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST2024) 50(53) 2024年9月査読有り
Molecular orbital calculation of hydrogen abstraction reaction from DNA by OH radicals

Takumi Iida, Susumu Fujiwara, Yoshiteru Yonetani, Tsukasa Aso, Nakamura Hiroaki, Yoshiyuki Hirano, Takao Otsuka, Masanori Hara

Student Session Proceedings of the 43rd JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST2024) 54-57 2024年9月査読有り責任著者
Molecular dynamics simulation of fluorescent dye-labeled DNA with apurinic/apyrimidinic sites

Kotaro Masumoto, Susumu Fujiwara, Tomoko Mizuguchi, Yoshiteru Yonetani, Naoya Shikazono, Ken Akamatu, Hiroaki Nakamura

Student Session Proceedings of the 43rd JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST2024) 58-61 2024年9月査読有り責任著者
Molecular dynamics simulation of OH-radical scavenging mechanism by tea catechins

Reon Kuriyama, Susumu Fujiwara, Yoshiteru Yonetani, Hiroaki Nakamura, Tsukasa Aso, Yoshiyuki Hirano, Takao Otsuka, Yasuhisa Oya

Student Session Proceedings of the 43rd JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST2024) 62-65 2024年9月査読有り責任著者
Molecular dynamics study of perturbation on protocell membrane induced by magnesium ion

Ryuta Kawanami, Susumu Fujiwara

Journal of Advanced Simulation in Science and Engineering 11(1) 179-187 2024年5月27日査読有り招待有り責任著者
Molecular dynamics simulation of fluorescent dye-labeled DNA with apurinic/apyrimidinic sites

K. Masumoto, S. Fujiwara, T. Mizuguchi, Y. Yonetani, N. Shikazono, K. Akamatu, H. Nakamura

Student Session Proceedings of the 42nd JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST2023) 42-45 2023年8月査読有り責任著者
Molecular dynamics simulation of gapped DNA labeled with fluorescent probes

T. T. Hashi, S. Fujiwara, T. Mizuguchi, Y. Yonetani, N. Shikazono, K. Akamatu, H. Nakamura

Student Session Proceedings of the 42nd JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST2023) 5-8 2023年8月査読有り責任著者
Study on effect of oxygen concentration in water radiolysis using Geant4-DNA

T. Aso, S. Fukagawa, Y. Hirano, M. Hara, S. Fujiwara

Conference Proceedings of the 42nd JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST2023) 292-294 2023年8月査読有り
Molecular dynamics study of defects on fatty acid vesicle induced by magnesium ion

R. Kawanami, S. Fujiwara

Conference Proceedings of the 42nd JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST2023) 337-339 2023年8月査読有り責任著者
Molecular dynamics study of OH radical-mediated DNA damage production

S. Fujiwara, R. Kawanami, T. Mizuguchi, Y. Yonetani, T. Aso, H. Nakamura

Conference Proceedings of the 42nd JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST2023) 340-342 2023年8月査読有り筆頭著者
Molecular Dynamics of Topological Barriers on the Crystallization Behavior of Ring Polyethylene Melts with Trefoil Knots

Katsumi Hagita, Takahiro Murashima, Naoki Sakata, Koya Shimokawa, Tetsuo Deguchi, Erica Uehara, Susumu Fujiwara

Macromolecules 56(1) 15-27 2023年1月10日査読有り
Molecular Dynamics Study on Cluster Damaged DNA Containing Apurinic/Apyrimidinic Sites on the Same Strand

Kazushi Terakawa, Susumu Fujiwara, Tomoko Mizuguchi, Yoshiteru Yonetani, Naoya Shikazono, Ken Akamatsu, Hiroaki Nakamura

Proceedings of the AROB-ISBC-SWARM 2023 1341-1342 2023年1月
Linear response theory-based theoretical approach to structural changes in a polymer induced by β-decay of substituted tritium

Ryuta Kawanami, Susumu Fujiwara, Hiroaki Nakamura, Kazumi Omata

Japanese Journal of Applied Physics 62(SA) SA1001-SA1001 2023年1月査読有り責任著者
Molecular dynamics simulation of water dynamics in zwitterionic polymer brush-water interface

S. Fujiwara, Y. Fujinaga, T. Mizuguchi

Conference Proceedings of the 41st JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST 2022) 82-84 2022年9月査読有り筆頭著者
Atomistic analysis of strand breaks of DNA in tritiated water using Geant4-DNA simulation

Tsukasa Aso, Masahara Hara, Yoshiyuki Hirano, Yoshiteru Yonetani, Susumu Fujiwara

Conference Proceedings of the 41st JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST 2022) 131-134 2022年9月査読有り

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MISC

137

トリチウムβ崩壊を模擬したDNAテロメア構造の二重鎖切断の分子動力学シミュレーション

中村浩章, 中村浩章, 石黒健人, 藤原進, 中田彩子, 波多野雄治, 齋藤誠紀, 安永卓生, 米谷佳晃

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 78(1) 2023年
シミュレーションと共同研究

藤原進

日本シミュレーション学会誌「シミュレーション」 41(4) 193-194 2022年12月
Damages of DNA in tritiated water

Yuji Hatano, Hiroaki Nakamura, Susumu Fujiwara, Seiki Saito, Takahiro Kenmotsu

The Enzymes 51 131-152 2022年10月招待有り
Special Section on Recent Advances in Simulation in Science and Engineering - Post-conference proceedings for JSST2021 -

Susumu Fujiwara

Journal of Advanced Simulation in Science and Engineering 10(1) I-II 2022年5月
トリチウム崩壊がDNA構造の耐性に与える影響のMDシミュレーションによる評価

中村浩章, 中村浩章, 石黒健人, 宇佐見俊介, 斎藤誠紀, 藤原進, 波多野雄治

プラズマ・核融合学会年会(Web) 39th 2022年
トリチウムによるDNA損傷のメカニズム--二本鎖切断の蛍光顕微鏡観察およびシミュレーション

藤原進, 波多野雄治, 中村浩章

日本物理学会誌 77(1) 2022年
カーボンナノチューブ複合体中のポリプロピレンの配向や結晶化の分析手法の検討

川崎史也, 藤原進, 村島隆浩, 萩田克美

分子シミュレーション討論会講演要旨集 35th (CD-ROM) 2021年
分子動力学法を用いた生体高分子のトリチウム誘起壊変シミュレーションと精度評価のための実験系の構築

中村浩章, 中村浩章, 藤原進, 波多野雄治

プラズマ・核融合学会誌 97(10) 2021年
置換トリチウムのβ崩壊に伴う高分子・DNA構造変化の分子シミュレーション

藤原進, 斉藤真司, 阿蘇司, 中村浩章, 安永卓生, 波多野雄治, 剣持貴弘, 斎藤誠紀, 大矢恭久, 坂井亙 …

分子研レターズ 84 2021年
分子動力学法を用いたDNAテロメア構造中バックボーン水素の溶媒接触表面積の評価

土田陽平, 齋藤誠紀, 中村浩章, 米谷佳晃, 藤原進

日本シミュレーション学会論文誌(Web) 13(1) 2021年
周辺プラズマの輸送とプラズマ・壁相互作用 (プロジェクトレビュー核融合科学研究所における数値実験炉研究プロジェクト) -- (核融合プラズマシミュレーション研究の進展)

鈴木康浩, 河村学思, 中村浩章, 伊藤篤史, 高山有道, 藤原進

プラズマ・核融合学会誌 = Journal of plasma and fusion research 96(10) 603-609 2020年10月
置換トリチウムの壊変に伴う高分子の構造緩和-MDシミュレーションへの線形応答理論の利用

尾又一実, 川波竜太, 中村浩章, 中村浩章, 藤原進

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 75(1) 2020年
DNAテロメア構造のトリチウムのβ崩壊による構造崩壊

中村浩章, 中村浩章, 宮西寿典, 藤原進, 水口朋子, 安永卓生, 中田彩子, 宮崎剛, 大塚教雄, 剣持貴弘 …

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 75(1) 2020年
置換トリチウムのベータ崩壊によるポリエチレンの構造変化に関する分子動力学シミュレーション

藤原進, LI Haolun, 中村浩章, 中村浩章, 水口朋子, 安永卓生, 中田彩子, 宮崎剛, 大塚教雄, 剣持貴弘 …

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 75(1) 2020年
2.核融合プラズマシミュレーション研究の進展 2.4 周辺プラズマの輸送とプラズマ・壁相互作用

鈴木康浩, 鈴木康浩, 河村学思, 河村学思, 中村浩章, 中村浩章, 伊藤篤史, 高山有道, 藤原進, 藤原進

プラズマ・核融合学会誌 96(10) 2020年
DNAテロメア中デオキシDリボースのトリチウムβ崩壊による構造変化のMD解析

中村浩章, 中村浩章, 石黒健人, 藤原進, 水口朋子, 米谷佳晃, 安永卓生, 中田彩子, 宮崎剛, 大塚教雄 …

プラズマ・核融合学会年会(Web) 37th 2020年
DNA-ラジカル相互作用の分子動力学シミュレーション解析

米谷佳晃, 藤原進, 中村浩章, 阿蘇司

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 75(2) 2020年
置換トリチウムのベータ崩壊による高分子の構造変化に関する理論・シミュレーション

川波竜太, LI Haolun, 藤原進, 中村浩章, 中村浩章, 尾又一実

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 75(2) 2020年
蛍光顕微鏡によるDNA画像のための画像処理技術の開発

大谷寛明, 大谷寛明, 松元朗, 生野壮一郎, 剣持貴弘, 中村浩章, 中村浩章, 波多野雄治, 藤原進

日本応用数理学会年会講演予稿集(CD-ROM) 2019 2019年
置換トリチウムのベータ崩壊によるポリエチレンの構造変化の粗視化分子動力学シミュレーション

LI Haolun, 藤原進, 中村浩章, 中村浩章, 水口朋子

日本応用数理学会年会講演予稿集(CD-ROM) 2019 2019年

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書籍等出版物

エマルションの安定化のための新しい調製技術と評価

技術情報協会 (担当:分担執筆, 範囲:pp.552-561)

技術情報協会 2022年10月 (ISBN: 9784861049002)
Damages of DNA in tritiated water

Y.Hatano, H. Nakamura, S. Fujiwara, S. Saito, T. Kenmotsu (担当:共著)

Academic Press 2022年
人物でよむ物理法則の事典

米沢, 富美子, 辻, 和彦, 小野, 嘉之, 西尾, 成子, 坂東, 昌子, 兵頭, 俊夫, 米谷, 民明, 笠, 耐 (担当:分担執筆)

朝倉書店 2015年11月 (ISBN: 9784254131161)
エマルションの特性評価と新製品開発、品質管理への活用

田崎, 裕人 (担当:分担執筆, 範囲:pp.93-103)

技術情報協会 2014年10月 (ISBN: 9784861045462)
自己組織化と進化の論理（共訳）

筑摩書房 2008年
生化学の物理的基礎（共訳）

シュプリンガー・フェアラーク東京 2004年
自己組織化と進化の論理（共訳）

日本経済新聞社 1999年
Computational Physics as a New Frontier in Condensed Matter Research（共著）

The Physical Society of Japan 1995年
Elementary Processes in Dense Plasmas（共著）

Addison-Wesley Pub. Co. 1994年

講演・口頭発表等

294

Orientation factor analysis of gapped DNA labeled with fluorescent dye molecules

Takumi Timothy Hashi, Susumu Fujiwara, Tomoko Mizuguchi, Yoshiteru Yonetani, Naoya Shikazono, Ken Akamatu, Hiroaki Nakamura

The 43rd JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST2023) and The 23rd Asia Simulation onference (AsiaSim2024) 2024年9月19日
Molecular dynamics simulation on hydration structure of zwitterionic molecules

Takuya Harada, Susumu Fujiwara, Takashi Aoki

The 43rd JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST2023) and The 23rd Asia Simulation onference (AsiaSim2024) 2024年9月19日
Molecular dynamics simulation of fluorescent dye-labeled DNA with apurinic/apyrimidinic sites

Kotaro Masumoto, Susumu Fujiwara, Tomoko Mizuguchi, Yoshiteru Yonetani, Naoya Shikazono, Ken Akamatu, Hiroaki Nakamura

The 43rd JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST2023) and The 23rd Asia Simulation onference (AsiaSim2024) 2024年9月19日
Molecular dynamics simulation of OH-radical scavenging mechanism by tea catechins

Reon Kuriyama, Susumu Fujiwara, Yoshiteru Yonetani, Hiroaki Nakamura, Tsukasa Aso, Yoshiyuki Hirano, Takao Otsuka, Yasuhisa Oya

The 43rd JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST2023) and The 23rd Asia Simulation onference (AsiaSim2024) 2024年9月19日
Molecular Dynamics Study on Structure Formation in Soft Matter and Biomolecules

Susumu Fujiwara

The 43rd JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST2023) and The 23rd Asia Simulation onference (AsiaSim2024) 2024年9月18日招待有り
Geant4-DNAシミュレーションへの水素引抜き反応によるDNA損傷過程の導入

深川舜, 阿蘇司, 平野祥之, 藤原進, 原正憲

第61回アイソトープ・放射線研究発表会 2024年7月3日
シーディング操作によるアイソタクチックポリスチレン球晶の一次核形成

篠田幸音, 橋本雅人, 水口朋子, 藤原進

第73回高分子学会年次大会 2024年6月6日
高分子球晶の融解・再結晶化過程に生成するモルフォロジー

大津理桜, 新村優太, 橋本雅人, 水口朋子, 藤原進

第73回高分子学会年次大会 2024年6月6日
脱塩基部位を有する損傷DNAの分子動力学シミュレーション

藤原進, 寺川和志, 水口朋子, 中村浩章, 米谷佳晃, 赤松憲, 鹿園直哉

第73回高分子学会年次大会 2024年6月5日
茶カテキンによるOHラジカル捕捉機構の分子動力学シミュレーション

栗山玲温, 藤原進, 米谷佳晃, 中村浩章, 阿蘇司, 平野祥之, 大塚教雄, 大矢恭久

光・量子ビーム科学合同シンポジウム2024（OPTO2024） 2024年6月5日
OHラジカルによるDNAからの水素引抜き反応の量子化学計算

飯田匠, 藤原進, 米谷佳晃, 阿蘇司, 中村浩章, 平野祥之, 大塚教雄

光・量子ビーム科学合同シンポジウム2024（OPTO2024） 2024年6月5日
蛍光色素分子で標識したギャップ損傷DNAの配向因子解析

橋拓実ティモシー, 藤原進, 水口朋子, 米谷佳晃, 鹿園直哉, 赤松憲, 中村浩章

光・量子ビーム科学合同シンポジウム2024（OPTO2024） 2024年6月5日
蛍光色素分子で標識した脱塩基損傷DNAの分子動力学シミュレーション

増本晃太朗, 藤原進, 水口朋子, 米谷佳晃, 鹿園直哉, 赤松憲, 中村浩章

光・量子ビーム科学合同シンポジウム2024（OPTO2024） 2024年6月5日
分子シミュレーションの基礎と高分子材料の研究・開発の効率化への展開～高分子のモデリング手法、計算方法、分子構造形成のシミュレーション技術～

藤原進

サイエンス＆テクノロジーセミナー 2024年5月28日招待有り
Reactive Molecular Dynamics Simulation on DNA Double Strand Breaks Induced by Hydrogen Elimination

Hiroaki Nakamura, Kento Ishiguro, Ayako Nakata, Shunsuke Usami, Seiki Saito, Susumu Fujiwara

16th International Symposium on Advanced Plasma Science and its Applications for Nitrides and Nanomaterials (ISPlasma2024)/17th International Conference on Plasma-Nano Technology & Science (IC-PLANTS2024)/13th Asia-Pacific International Symposium on the Basics and Applications of Plasma Technology (APSPT-13) 2024年3月5日
Molecular Dynamics Simulation Study of Protocell Membrane

Ryuta Kawanami, Susumu Fujiwara

AROB-ISBC-SWARM 2024 2024年1月25日
Analysis of orientation factors of gapped DNA labeled with fluorescent probes by molecular dynamics simulation

Takumi Timothy Hashi, Susumu Fujiwara, Tomoko Mizuguchi, Yoshiteru Yonetani, Naoya Shikazono, Ken Akamatu, Hiroaki Nakamura

AROB-ISBC-SWARM 2024 2024年1月25日
Molecular dynamics simulation of fluorescent dye-labeled DNA with apurinic/apyrimidinic sites

Kotaro Masumoto, Susumu Fujiwara, Tomoko Mizuguchi, Yoshiteru Yonetani, Naoya Shikazono, Ken Akamatu, Hiroaki Nakamura

AROB-ISBC-SWARM 2024 2024年1月25日
Molecular dynamics study of tacticity effect of polymer brushes on alanine dipeptide adsorption

Haolun Li, Tomoko Mizuguch, Susumu Fujiwara

AROB-ISBC-SWARM 2024 2024年1月25日
OHラジカルによるDNAからの水素引抜き反応の量子化学計算

飯田匠, 藤原進, 中村浩章, 阿蘇司, 米谷佳晃, 平野祥之, 大塚教雄

2023年度核融合科学研究所一般共同研究(研究会)「医工連携を目指した生体分子・医療データの数値解析に関する研究会」 2024年1月16日