河合洋介 (Yosuke Kawai) - マイポータル

基本情報

所属: 国立健康危機管理研究機構国立国際医療研究所ゲノム医科学プロジェクト副プロジェクト長
: 情報・システム研究機構国立遺伝学研究所生命情報・DDBJ研究センター外来研究員 (特命教授)

学位: 博士（理学）(東京理科大学)

J-GLOBAL ID: 200901099931313511
researchmap会員ID: 5000056532

研究キーワード

研究分野

主要な経歴

2015年4月 - 現在

国立健康危機管理研究機構国立国際医療研究所, ゲノム医科学プロジェクト, 副プロジェクト長

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学歴

論文

146

HLA-DQB1*03:01 and HLA-DQA1*05:05 as key genetic determinants of infliximab response and immunogenicity in Japanese patients with inflammatory bowel disease.

Ryuya Osaka, Takeo Naito, Seik-Soon Khor, Yoichi Kakuta, Yosuke Kawai, Masao Nagasaki, Hiroshi Meguro, Hideya Iwaki, Daisuke Okamoto, Hiroshi Nagai …

Journal of gastroenterology 2026年2月6日
Functional impact of a deep intronic variant in the RPS19 gene detected in a case of Diamond-Blackfan anemia syndrome.

Rika Kanezaki, Tsutomu Toki, Ryo Okuse, Akie Kobayashi, Moeka Sato, Sayaka Kimura, Ko Kudo, Tomohiko Sato, Tatsuhiko Tanaka, Kenichi Yoshida …

Haematologica 2026年1月22日
Orofacial granulomatosis in pediatric Crohn's disease: clinical outcomes and genetic background in the era of biologics: a retrospective study in Japan.

Ryusuke Nambu, Takeo Naito, Mei Haruyama, Junichi Hosokawa, Hirotaka Shimizu, Ichiro Takeuchi, Shin-Ichiro Hagiwara, Tatsuki Mizuochi, Yugo Takaki, Takashi Ishige …

Intestinal research 2026年1月2日
A de novo splice-site variant in the retinitis pigmentosa 2 (RP2) gene identified in a symptomatic carrier woman.

Aya Domoto, Kazuki Kuniyoshi, Akiko Suga, Kei Mizobuchi, Kazutoshi Yoshitake, Yosuke Kawai, Yosuke Omae, Katsushi Tokunaga, Miki Sawa, Takaaki Hayashi …

Ophthalmic genetics 1-5 2025年12月16日
JoGo 1.0: the ACTG hierarchical nomenclature and database covering 4.7 million haplotypes across 19,194 human genes.

Masao Nagasaki, Toshiaki Katayama, Yuki Moriya, Yayoi Sekiya, Shuichi Kawashima, Ryo Teraoka, Shuto Machida, Taichi Matsubara, Hiroki Hashimoto, Akihiro Asakura …

Nucleic acids research 2025年11月29日
Germline variants of the POLH and RAD51 genes are candidate variants associated with risk of hormone receptor-negative young-onset breast cancer.

Shu Yazaki, Rui Kitadai, Yukihide Momozawa, Teruhiko Yoshida, Takashi Yamanaka, Sho Shiino, Chisako Yamauchi, Kenichi Harano, Motonobu Saito, Yosuke Hirotsu …

NPJ breast cancer 11(1) 133-133 2025年11月28日
Two Japanese families with adult-onset leukoencephalopathy caused by pathogenic variants in CST3.

Kenta Orimo, Takashi Matsukawa, Kazutaka Shiomi, Ryoji Goto, Akihiko Mitsutake, Yumiko Kuromi, Nozomu Matsuda, Kazuaki Kanai, Ryo Kurokawa, Hiroyuki Ishiura …

Journal of the neurological sciences 478 123708-123708 2025年9月26日
Novel Genetic Loci for Nontuberculous Mycobacterial Pulmonary Disease and Potential Protective Effect of Body Mass Index.

Kyungtaek Park, Hyejin Kim, Hee Jae Huh, Ho Namkoong, Naoki Hasegawa, Tomoyasu Nishimura, Takanori Asakura, Kozo Morimoto, Atsuyuki Kurashima, Yosuke Omae …

American journal of respiratory and critical care medicine 2025年9月12日
Genome sequencing provides high diagnostic yield and new etiological insights for intellectual disability and developmental delay

Kohei Hamanaka, Atsushi Fujita, Satoko Miyatake, Kazuharu Misawa, Eriko Koshimizu, Yuri Uchiyama, Naomi Tsuchida, Rie Seyama, Masamune Sakamoto, Kazuhiro Iwama …

NPJ GENOMIC MEDICINE 10(1) 2025年8月26日
Phased genome assemblies and pangenome graphs of human populations of Japan and Saudi Arabia.

Maxat Kulmanov, Saeideh Ashouri, Yang Liu, Marwa Abdelhakim, Ebtehal Alsolme, Masao Nagasaki, Yasuyuki Ohkawa, Yutaka Suzuki, Rund Tawfiq, Katsushi Tokunaga …

Scientific data 12(1) 1316-1316 2025年8月12日
Genomic Profiles of Pathogenic and Moderate-Penetrance Germline Variants Associated With Risk of Early-Onset Lung Adenocarcinoma.

Hourin Cho, Kouya Shiraishi, Kuniko Sunami, Yukihide Momozawa, Tatsuya Yoshida, Shingo Matsumoto, Koichi Matsuda, Motonobu Saito, Akiteru Goto, Takayuki Honda …

Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer 2025年6月15日
Impact of germline variants on breast and ovarian cancer risk in Japanese women: an original cohort study and meta-analysis.

Shu Yazaki, Megumi Hori, Hisaki Aiba, Yukihide Momozawa, Masayuki Yoshida, Sho Shiino, Kenichi Harano, Chisako Yamauchi, Takashi Yamanaka, Maiko Miwa …

EBioMedicine 116 105758-105758 2025年6月
Clinical, neuroimaging and genetic findings in the Japanese case series of CLCN2-related leukoencephalopathy.

Kenta Orimo, Takashi Matsukawa, Akihiko Mitsutake, Takusei Cho, Hiroya Naruse, Yoshio Sakiyama, Kensho Sumi, Naohiro Uchio, Akane Satake, Yoshihisa Takiyama …

Journal of the neurological sciences 472 123486-123486 2025年5月15日
Genome-wide association study of common side effects following COVID-19 booster vaccination in a cohort of corporate employees in Japan.

Yosuke Omae, Seik-Soon Khor, Mihoko Shimada, Yosuke Kawai, Taihei Yamaguchi, Maiko Yagi, Masashi Ebisawa, Junko S Takeuchi, Tetsuya Mizoue, Wataru Sugiura …

Scientific reports 15(1) 12728-12728 2025年4月13日
JoGo-LILR caller: Unveiling and navigating the complex diversity of LILRB3-LILRA6 copy number haplotype structures with whole-genome sequencing.

Masao Nagasaki, Kouyuki Hirayasu, Seik-Soon Khor, Ryoko Otokozawa, Yayoi Sekiya, Yosuke Kawai, Katsushi Tokunaga

Human immunology 86(3) 111272-111272 2025年3月6日
LILR genotype imputation with attribute bagging (LIBAG): leukocyte immunoglobulin-like receptor copy number imputation system.

Seik-Soon Khor, Kouyuki Hirayasu, Yosuke Kawai, Hie Lim Kim, Masao Nagasaki, Katsushi Tokunaga

Frontiers in immunology 16 1559301-1559301 2025年
WDR45 variants as a major cause for a clinically variable intellectual disability syndrome from early infancy in females.

Chihiro Abe-Hatano, Ken Inoue, Eri Takeshita, Yosuke Kawai, Katsushi Tokunaga, Yu-Ichi Goto

Journal of medical genetics 61(12) 1119-1122 2024年11月25日
Wilson disease (novel ATP7B variants) with concomitant FLNC-related cardiomyopathy.

Takeshi Imai, Satomi Mitsuhashi, Kenji Isahaya, Soichiro Shibata, Yosuke Kawai, Yosuke Omae, Katsushi Tokunaga, Yoshihisa Yamano

Human genome variation 11(1) 34-34 2024年8月29日
Association study of GBA1 variants with MSA based on comprehensive sequence analysis -Pitfalls in short-read sequence analysis depending on the human reference genome-

Kenta Orimo, Jun Mitsui, Takashi Matsukawa, Masaki Tanaka, Junko Nomoto, Hiroyuki Ishiura, Yosuke Omae, Yosuke Kawai, Katsushi Tokunaga, Hatsue Ishibashi-Ueda …

Journal of Human Genetics 2024年7月18日査読有り
Genetically Predicted Higher Levels of Caffeic Acid Are Protective Against Ulcerative Colitis: A Comprehensive Metabolome Analysis

Takeo Naito, Ryuya Osaka, Yoichi Kakuta, Yosuke Kawai, Seik-Soon Khor, Junji Umeno, Katsushi Tokunaga, NCBN Controls WGS Consortium, Hantsue Ishibashi-Ueda, Tsutomu Tomita …

Inflammatory Bowel Diseases 30(12) 2440-2448 2024年6月29日

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MISC

マルチオミクス解析の基盤と技術バイオバンクのゲノムデータを上手に活用するためには

河合洋介

医学のあゆみ 293(9) 2025年
“即時オープンアクセス義務化”に備えようヒトゲノムのデータ共有とオープンサイエンス

河合洋介

実験医学 43(18) 2025年
琉球諸島集団の地域性とその成立過程に関するヒトゲノム解析

小金渕佳江, 小金渕佳江, 松波雅俊, 今村美菜子, 今村美菜子, 河合洋介, 徳永勝士, 前田士郎, 前田士郎, 石田肇 …

日本人類学会大会プログラム・抄録集(Web) 78th 2024年
琉球列島・貝塚時代に由来する古代ゲノム解析

松波雅俊, 小金渕佳江, 瀧上舞, 河合洋介, 角田恒雄, 安達登, 片桐千亜紀, 新里貴之, 竹中正巳, 米田穣 …

日本人類学会大会プログラム・抄録集(Web) 78th 2024年
難病の全ゲノム解析プロジェクトにおけるゲノム基盤—Establishment of the platform in the project for genome analysis of rare diseases—特集全ゲノム解析に基づく難病のゲノム医学

河合洋介, 大前陽輔

医学のあゆみ 285(1) 29-33 2023年4月1日
遺伝の基礎 11.ゲノムデータベース大規模ゲノムデータセット

鎌谷洋一郎, 河合洋介, 木下賢吾, 木下賢吾

日本医師会雑誌 152 2023年
Common disease解析の最前線 9.ポリジェニックモデルによるゲノム情報解析の最前線

OLIVIER Gervais, 河合洋介, 長崎正朗, 長崎正朗

遺伝子医学 11(2) 2021年
小児ネフローゼの大規模ゲノムワイド関連解析と集団間メタ解析による新規遺伝要因の同定

賈暁媛, 山村智彦, 長野智那, 人見祐基, KHOR Seik-Soon, 植野和子, 河合洋介, 長崎正朗, 野入英世, 堀之内智子 …

日本人類遺伝学会大会(CD-ROM) 65th 2020年
原発性胆汁性胆管炎(PBC)感受性遺伝子領域を対象とした機能的遺伝子多型(causal variant)の同定

人見祐基, 河合洋介, 植野和子, 西田奈央, 川嶋実苗, 相葉佳洋, 築地信, 長崎正朗, 中村稔, 徳永勝士

MHC: Major Histocompatibility Complex 26(2Suppl.) 104-104 2019年9月
原発性胆汁性胆管炎(PBC)感受性遺伝子領域を対象とした機能的遺伝子多型(causal variant)の同定

人見祐基, 人見祐基, 河合洋介, 河合洋介, 植野和子, 植野和子, 西田奈央, 川嶋実苗, 相葉佳洋, 築地信 …

MHC (Web) 26(2 Suppl) 2019年
Estimating frequency of pathogenic variants in a Japanese population by using the whole-genome reference panel of ToMMo

Yumi Yamaguchi-Kabata, Jun Yasuda, Osamu Tanabe, Yoichi Suzuki, Hiroshi Kawame, Nobuo Fuse, Masao Nagasaki, Yosuke Kawai, Kaname Kojima, Fumiki Katsuoka …

HUMAN GENOMICS 12 2018年3月
全ゲノムシークエンス解析を用いた感冒薬関連重症薬疹(CM-SJS/TEN)発症に関わる遺伝要因の網羅的探索

人見祐基, KHOR Seik-Soon, 上田真由美, 河合洋介, 外園千恵, 木下茂, 長崎正朗, 徳永勝士

MHC (Web) 25(2 Suppl) 2018年
日本人の5塩基短鎖重複反復配列のプロファイルと高解像度の反復配列タイピングの検証

齊藤真梨恵, 平田智士, 小島要, 三澤計治, 三森隆広, GERVAIS Olivier, 河合洋介, 人見祐基, 徳永勝士, 中村稔 …

日本人類遺伝学会大会プログラム・抄録集 63rd 2018年
疾患データベースとバイオバンク【プロジェクトの最前線と利用の実践ガイド】15.集団特異的なカスタムアレイの設計と高精度なジェノタイピング―カスタムアレイが拓く未来

河合洋介, 檀上稲穂

実験医学 35(17) 2951‐2957 2017年11月1日
Genome-wide association study identifies novel susceptibility loci for tanning ability in Japanese population

K. Shido, K. Kojima, A. Hozawa, S. Ogishima, N. Minegishi, Y. Kawai, G. Tamiya, K. Tanno, K. Yamasaki, S. Aiba …

JOURNAL OF INVESTIGATIVE DERMATOLOGY 137(5) S86-S86 2017年5月
DICHOTOMOUS EFFECTS OF ATG16L1 AND LRRK2 IN MODULATING PANETH CELL DEFECT IN JAPANESE AND NORTH AMERICAN CROHN'S DISEASE PATIENTS

Ta-Chiang Liu, Takeo Naito, Zhenqiu Liu, Kelli VanDussen, Talin Haritunians, Dalin Li, Katsuya Endo, Yosuke Kawai, Masao Nagasaki, Yoshitaka Kinouchi …

GASTROENTEROLOGY 152(5) S982-S982 2017年4月
POPULATION-OPTIMIZED SNP ARRAY REVEALS RAP1A AS A NOVEL CANDIDATE SUSCEPTIBILITY GENE FOR CROHN'S DISEASE IN JAPANESE INDIVIDUALS

Yoichi Kakuta, Yosuke Kawai, Takeo Naito, Atsushi Hirano, Junji Umeno, Keiichiro Hiramoto, Masatake Kuroha, Yoshitake Kanazawa, Tomoya Kimura, Katsuya Endo …

GASTROENTEROLOGY 152(5) S78-S78 2017年4月
早発型発達緑内障における原因遺伝子の探索

布施昇男, 木村雅恵, 清水愛, 河合洋介, 小島要, 長崎正朗, 濱中輝彦, 石田誠夫, 中村誠, 酒井寛 …

日本眼科学会雑誌 121(臨増) 227-227 2017年3月
マルチオミクスが解き明かす疾患生物学日本人多層オミックス参照パネルの拡張

小柴生造, 三枝大輔, 元池育子, 小島要, 城田松之, 齋藤智, 勝岡史城, 河合洋介, 山口由美, 田邉修 …

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 89回 [1S05-5] 2016年9月
Estimation of allele frequency of pathological variants based on whole-genome sequencing of 1070 Japanese individuals

Yumi Yamaguchi-Kabata, Yosuke Kawai, Kaname Kojima, Naoki Nariai, Takahiro Mimori, Yukuto Sato, Fumiki Katsuoka, Jun Yasuda, Masayuki Yamamoto, Masao Nagasaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 90(6) 379-379 2015年12月

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書籍等出版物

ゲノム多様性解析 = Genome diversity analysis

長田, 直樹, 藤本, 明洋, 河合, 洋介, 五條堀, 淳, 東野, 俊英, 木村, 亮介, 松波, 雅俊

森北出版 2025年3月 (ISBN: 9784627261716)
最新DNA研究が解き明かす。日本人の誕生

斎藤成也, 木村亮介, 鈴木留美子, 河合洋介, 松波雅俊 (担当:共著)

秀和システム 2020年8月 (ISBN: 9784798060224)

講演・口頭発表等

ハプロタイプ共有長の分布から推定する東アジア人の集団史

河合洋介

日本進化学会第21回大会 2019年8月9日
日本人の大規模ゲノムワイド多型解析

河合洋介

第２６回日本DNA多型学会 2018年招待有り
Genome-wide genetic variation of people in Japan and its implication of demographic history

河合洋介

The 2018 SMBE conference 2018年
Genome-wide genotype imputation of Japanese population-specific SNP array.

河合洋介

The 2017 Japan-NIH Joint Symposium 2017年
Genome-wide analysis of common and rare genetic variation in Japanese population

河合洋介

2nd International Conference on Founder Populations 2017年招待有り
ゲノム医科学のための全ゲノム情報解析基盤

河合洋介, 長崎正朗

日本生化学会大会(Web) 2017年招待有り
日本人ゲノムの多様性解析

河合洋介, 三澤計治, 三森隆広, 小島要, 山口由美, 柴田朋子, 勝岡史城, 山本雅之, 長崎正朗

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 2016年8月25日招待有り
集団遺伝解析の方法:実演と実習

河合洋介

第3回ゲノム多様性解析ワークショップ 2016年招待有り
Improved imputation accuracy using population-specific SNP array and haplotype reference panel

河合洋介

International Congress of Human Genetics 2016年
Improved imputation accuracy with population-specific SNP array and reference panel in Japanese population

河合洋介

European Society of Human Genetics 2016年
Fine-scale genetic diversity of Japanese population

河合洋介

American Society of Human Genetics 2016年
日本人の集団ゲノミクス

河合洋介

国立遺伝学研究所研究集会「分子進化学の現状と今後の展望」 2016年招待有り
日本人1070人の全ゲノム配列から推定したヒトゲノムの負の自然淘汰

河合洋介, 成相直樹, 小島要, 山口由美, 佐藤行人, 三森隆広, 長崎正朗

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 2015年9月10日
日本人１０７０人の集団ゲノム解析

河合洋介

第2回ゲノム多様性解析ワークショップ 2015年招待有り
An approach combining the construction of haplotype collection and the design of population-optimized SNP array on the largescale whole genome-sequencing project in Japan

河合洋介

American Society of Human Genetics 2015年
High precession whole genome sequences of 1,070 Japanese individuals

河合洋介

日本進化学会第１７回大会 2015年招待有り
SNPアレイデータの全ゲノムインピュテーション

河合洋介

日本人類遺伝学会大会 2015年招待有り
集団サイズ動態のノンパラメトリック回帰を使った推定

河合洋介, 佐藤行人, 山口由美, 成相直樹, 杉本幸代, 三森隆広, 小島要, 長崎正朗

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 2014年8月31日
二次代謝多重遺伝子ファミリーの分子進化

河合洋介

第三回植物二次代謝フロンティア研究会 2014年招待有り
ジャポニカアレイと日本人高精度全ゲノム配列を使ったジェノタイプインピュテーション

河合洋介

日本人類遺伝学会大会 2014年招待有り

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担当経験のある科目(授業)

所属学協会

Works(作品等)

霊長類ゲノム比較による塩基組成進化の解析

2008年9月 - 2009年3月
霊長類ゲノム比較による塩基組成進化の解析

2008年9月 - 2009年3月

共同研究・競争的資金等の研究課題

先史人類の人口動態に関する研究

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2023年4月 - 2028年3月

中村大, 河合洋介, 高瀬克範, 山口雄治, NOXON Corey・Tyler
ヒトゲノム構造多型データ類似性検索のための基盤技術開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2023年4月 - 2026年3月

鎌田真由美, 河合洋介, 片山俊明
ヒトゲノム中に多型的に存在するウイルス様配列の大規模探索と集団ゲノム解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2026年3月

長田直樹, 河合洋介
ヒトゲノム中に多型的に存在するウイルス様配列の大規模探索と集団ゲノム解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2026年3月

長田直樹, 河合洋介
日本人集団ゲノムワイドクロマチン相互作用情報と構造多型との関連解析と疾患要因探索

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2024年3月

長崎正朗, 河合洋介, 大川恭行
ヤポネシア人の人口推定を中心とした巨大データ解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2018年6月 - 2023年3月

長田直樹, 五條堀淳, 河合洋介, 藤本明洋
(1)Analysis of base substitution pattern by comparing closely related species.

河合洋介

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研究分野

主要な経歴

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論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

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