河合洋介 (Yosuke Kawai) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人国立国際医療研究センターゲノム医科学プロジェクト副プロジェクト長
: 情報・システム研究機構国立遺伝学研究所生命情報・DDBJ研究センター外来研究員 (特命教授)

学位: 博士（理学）(東京理科大学)

J-GLOBAL ID: 200901099931313511
researchmap会員ID: 5000056532

研究キーワード

研究分野

経歴

2024年4月 - 現在

情報・システム研究機構国立遺伝学研究所, 生命情報・DDBJ研究センター, 外来研究員 (特命教授)
2020年11月 - 現在

独立行政法人国立国際医療研究センター, ゲノム医科学プロジェクト, 副プロジェクト長
2019年4月 - 2020年10月

国立国際医療研究センター, ゲノム医科学プロジェクト, 上級研究員
2017年 - 2019年

東京大学, 大学院医学系研究科, 特任助教
2014年 - 2017年

東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 講師
2013年 - 2014年

東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 助教
2013年 - 2013年

前橋工科大学, 工学部, 研究員
2008年 - 2013年

立命館大学, 生命科学部, 助教
2011年 - 2011年

University of Wasington, Department of Genome Sciences, Visiting scholar
2006年 - 2008年

国立遺伝学研究所, 集団遺伝研究部門, 特任研究員

学歴

論文

134

WDR45 variants as a major cause for a clinically variable intellectual disability syndrome from early infancy in females.

Chihiro Abe-Hatano, Ken Inoue, Eri Takeshita, Yosuke Kawai, Katsushi Tokunaga, Yu-Ichi Goto

Journal of medical genetics 61(12) 1119-1122 2024年11月25日
ゲノムワイド関連解析(GWAS)を用いた日本人原発性胆汁性胆管炎(PBC)感受性遺伝子の同定

人見祐基, 植野和子, 相葉佳洋, 西田奈央, 河野通大, 杉原実樹, 河合洋介, 川嶋実苗, Khor Seik-Soon, 石垣和慶 …

MHC: Major Histocompatibility Complex 31(2Suppl.) 89-89 2024年9月
Wilson disease (novel ATP7B variants) with concomitant FLNC-related cardiomyopathy.

Takeshi Imai, Satomi Mitsuhashi, Kenji Isahaya, Soichiro Shibata, Yosuke Kawai, Yosuke Omae, Katsushi Tokunaga, Yoshihisa Yamano

Human genome variation 11(1) 34-34 2024年8月29日
Association study of GBA1 variants with MSA based on comprehensive sequence analysis -Pitfalls in short-read sequence analysis depending on the human reference genome-

Kenta Orimo, Jun Mitsui, Takashi Matsukawa, Masaki Tanaka, Junko Nomoto, Hiroyuki Ishiura, Yosuke Omae, Yosuke Kawai, Katsushi Tokunaga, Hatsue Ishibashi-Ueda …

Journal of Human Genetics 2024年7月18日査読有り
Genetically Predicted Higher Levels of Caffeic Acid Are Protective Against Ulcerative Colitis: A Comprehensive Metabolome Analysis

Takeo Naito, Ryuya Osaka, Yoichi Kakuta, Yosuke Kawai, Seik-Soon Khor, Junji Umeno, Katsushi Tokunaga, NCBN Controls WGS Consortium, Hantsue Ishibashi-Ueda, Tsutomu Tomita …

Inflammatory Bowel Diseases 2024年6月29日
A genome-wide association study identified PTPN2 as a population-specific susceptibility gene locus for primary biliary cholangitis.

Yuki Hitomi, Kazuko Ueno, Yoshihiro Aiba, Nao Nishida, Michihiro Kono, Mitsuki Sugihara, Yosuke Kawai, Minae Kawashima, Seik-Soon Khor, Kazuhiro Sugi …

Hepatology (Baltimore, Md.) 2024年4月23日
A novel NODAL variant in a young embolic stroke patient with visceral heterotaxy.

Kei Kaburagi, Yuta Hagiwara, Keiji Tachikawa, Noriko Miyake, Hisanao Akiyama, Yosuke Kawai, Yosuke Omae, Katsushi Tokunaga, Yoshihisa Yamano, Takahiro Shimizu …

BMC neurology 24(1) 119-119 2024年4月11日
Assessing the efficacy of target adaptive sampling long-read sequencing through hereditary cancer patient genomes.

Wataru Nakamura, Makoto Hirata, Satoyo Oda, Kenichi Chiba, Ai Okada, Raúl Nicolás Mateos, Masahiro Sugawa, Naoko Iida, Mineko Ushiama, Noriko Tanabe …

NPJ genomic medicine 9(1) 11-11 2024年2月17日
Exploring the genetic diversity of the Japanese population: Insights from a large-scale whole genome sequencing analysis.

Yosuke Kawai, Yusuke Watanabe, Yosuke Omae, Reiko Miyahara, Seik-Soon Khor, Eisei Noiri, Koji Kitajima, Hideyuki Shimanuki, Hiroyuki Gatanaga, Kenichiro Hata …

PLoS genetics 19(12) e1010625 2023年12月
Cost-Effective Cas9-Mediated Targeted Sequencing of Spinocerebellar Ataxia Repeat Expansions.

Keiji Tachikawa, Takahiro Shimizu, Takeshi Imai, Riyoko Ko, Yosuke Kawai, Yosuke Omae, Katsushi Tokunaga, Martin C Frith, Yoshihisa Yamano, Satomi Mitsuhashi

The Journal of molecular diagnostics : JMD 2023年11月24日
rs10924104 in the expression enhancer motif of CD58 confers susceptibility to human autoimmune diseases.

Yuki Hitomi, Kazuko Ueno, Yoshihiro Aiba, Nao Nishida, Yosuke Kawai, Minae Kawashima, Seik-Soon Khor, Sanami Takada, Chisato Iwabuchi, Masao Nagasaki …

Human genetics 2023年11月23日
抗原提示補助シグナル分子の遺伝的バリアントに起因する自己免疫疾患感受性の分子機序の解明

人見祐基, 植野和子, 相葉佳洋, 西田奈央, 河合洋介, 川嶋実苗, Khor Seik-Soon, 長崎正朗, 徳永勝士, 中村稔

MHC: Major Histocompatibility Complex 30(2Suppl.) 83-83 2023年9月
Demographic history of Ryukyu islanders at the southern part of the Japanese Archipelago inferred from whole-genome resequencing data.

Kae Koganebuchi, Masatoshi Matsunami, Minako Imamura, Yosuke Kawai, Yuki Hitomi, Katsushi Tokunaga, Shiro Maeda, Hajime Ishida, Ryosuke Kimura

Journal of human genetics 2023年7月20日
HLA-DQA1*05 and upstream variants of PPARGC1B are associated with infliximab persistence in Japanese Crohn's disease patients.

Fumiko Shimoda, Takeo Naito, Yoichi Kakuta, Yosuke Kawai, Katsushi Tokunaga, Yusuke Shimoyama, Rintaro Moroi, Hisashi Shiga, Masao Nagasaki, Yoshitaka Kinouchi …

The pharmacogenomics journal 2023年7月17日
重症薬疹の全ゲノムDNA解析情報を活用した発症機序の解明

人見祐基, 河合洋介, 上田真由美, 徳永勝士

臨床薬理の進歩 (44) 36-44 2023年6月
Genetic architecture of the inflammatory bowel diseases across East Asian and European ancestries.

Zhanju Liu, Ruize Liu, Han Gao, Seulgi Jung, Xiang Gao, Ruicong Sun, Xiaoming Liu, Yongjae Kim, Ho-Su Lee, Yosuke Kawai …

Nature genetics 55(5) 796-806 2023年5月8日
【全ゲノム解析に基づく難病のゲノム医学】難病の全ゲノム解析プロジェクトにおけるゲノム基盤

河合洋介, 大前陽輔

医学のあゆみ 285(1) 29-33 2023年4月
Genome-Wide Association Study and Transcriptome of Japanese Patients with Developmental Dysplasia of the Hip Demonstrates an Association with the Ferroptosis Signaling Pathway

Yu Mori, Kazuko Ueno, Daisuke Chiba, Ko Hashimoto, Yosuke Kawai, Kazuyoshi Baba, Hidetatsu Tanaka, Takashi Aki, Masanori Ogasawara, Naoto Shibasaki …

International Journal of Molecular Sciences 24(5) 5019-5019 2023年3月6日
Prediction Model with HLA-A*33:03 Reveals Number of Days to Develop Liver Cancer from Blood Test.

Nao Nishida, Jun Ohashi, Goki Suda, Takehiro Chiyoda, Nobuharu Tamaki, Takahiro Tomiyama, Sachiko Ogasawara, Masaya Sugiyama, Yosuke Kawai, Seik-Soon Khor …

International journal of molecular sciences 24(5) 2023年3月1日
Novel HLA allele associations with susceptibility, staging, symptomatic state, autoimmune hepatitis and hepatocellular carcinoma events for primary biliary cholangitis in the Japanese population.

Seik-Soon Khor, Kazuko Ueno, Nao Nishida, Minae Kawashima, Yosuke Kawai, Yoshihiro Aiba, Yuki Hitomi, Masao Nagasaki, Minoru Nakamura, Katsushi Tokunaga

Frontiers in immunology 14 1151502-1151502 2023年

もっとみる

MISC

難病の全ゲノム解析プロジェクトにおけるゲノム基盤—Establishment of the platform in the project for genome analysis of rare diseases—特集全ゲノム解析に基づく難病のゲノム医学

河合洋介, 大前陽輔

医学のあゆみ 285(1) 29-33 2023年4月1日
遺伝の基礎 11.ゲノムデータベース大規模ゲノムデータセット

鎌谷洋一郎, 河合洋介, 木下賢吾, 木下賢吾

日本医師会雑誌 152 2023年
様々な免疫形質と関連するCD28領域におけるスプライシング制御バリアントの同定

人見祐基, 相葉佳洋, 植野和子, 西田奈央, 河合洋介, 川嶋実苗, 築地信, 岩渕千里, 高田紗奈美, 三宅紀子 …

日本人類遺伝学会大会プログラム・抄録集 67th (CD-ROM) 2022年
原発性胆汁性胆管炎(PBC)感受性遺伝子CCR6/FGFR1OPにおけるprimary functional variantsの同定

人見祐基, 相葉佳洋, 植野和子, 西田奈央, 河合洋介, 川嶋実苗, 安波道朗, GERVAIS Olivier, 長崎正朗, 徳永勝士 …

日本人類遺伝学会大会プログラム・抄録集 66th (CD-ROM) 2021年
クラウドサーバとオンプレミスサーバを組み合わせたハイブリッドシステムの構築と活用

山口泉, 川口喬久, 寺岡亮, 稲富雄一, 深沢圭一郎, 関谷勇司, 塙敏博, 大川恭行, 王妍雁, GREVAIS Oliver …

日本人類遺伝学会大会プログラム・抄録集 66th (CD-ROM) 2021年
Common disease解析の最前線 9.ポリジェニックモデルによるゲノム情報解析の最前線

OLIVIER Gervais, 河合洋介, 長崎正朗, 長崎正朗

遺伝子医学 11(2) 2021年
原発性胆汁性胆管炎(PBC)感受性遺伝子領域を対象とした機能的遺伝子多型(causal variant)の同定

人見祐基, 河合洋介, 植野和子, 西田奈央, 川嶋実苗, 相葉佳洋, 築地信, 長崎正朗, 中村稔, 徳永勝士

MHC: Major Histocompatibility Complex 26(2Suppl.) 104-104 2019年9月
原発性胆汁性胆管炎(PBC)感受性遺伝子領域を対象とした機能的遺伝子多型(causal variant)の同定

人見祐基, 人見祐基, 河合洋介, 河合洋介, 植野和子, 植野和子, 西田奈央, 川嶋実苗, 相葉佳洋, 築地信 …

MHC (Web) 26(2 Suppl) 2019年
Estimating frequency of pathogenic variants in a Japanese population by using the whole-genome reference panel of ToMMo

Yumi Yamaguchi-Kabata, Jun Yasuda, Osamu Tanabe, Yoichi Suzuki, Hiroshi Kawame, Nobuo Fuse, Masao Nagasaki, Yosuke Kawai, Kaname Kojima, Fumiki Katsuoka …

HUMAN GENOMICS 12 2018年3月
レアバリアントが尿酸値の失われた遺伝率のかなりの割合を説明する

三澤計治, 三澤計治, 三島英換, 大内基司, 長谷川嵩矩, 小島要, 小島要, 河合洋介, 長崎正朗, 長崎正朗 …

日本人類遺伝学会大会プログラム・抄録集 63rd 2018年
全ゲノムシークエンス解析を用いた感冒薬関連重症薬疹(CM-SJS/TEN)発症に関わる遺伝要因の網羅的探索

人見祐基, KHOR Seik-Soon, 上田真由美, 河合洋介, 外園千恵, 木下茂, 長崎正朗, 徳永勝士

MHC (Web) 25(2 Suppl) 2018年
日本人の5塩基短鎖重複反復配列のプロファイルと高解像度の反復配列タイピングの検証

齊藤真梨恵, 平田智士, 小島要, 三澤計治, 三森隆広, GERVAIS Olivier, 河合洋介, 人見祐基, 徳永勝士, 中村稔 …

日本人類遺伝学会大会プログラム・抄録集 63rd 2018年
疾患データベースとバイオバンク【プロジェクトの最前線と利用の実践ガイド】15.集団特異的なカスタムアレイの設計と高精度なジェノタイピング―カスタムアレイが拓く未来

河合洋介, 檀上稲穂

実験医学 35(17) 2951‐2957 2017年11月1日
Genome-wide association study identifies novel susceptibility loci for tanning ability in Japanese population

K. Shido, K. Kojima, A. Hozawa, S. Ogishima, N. Minegishi, Y. Kawai, G. Tamiya, K. Tanno, K. Yamasaki, S. Aiba …

JOURNAL OF INVESTIGATIVE DERMATOLOGY 137(5) S86-S86 2017年5月
DICHOTOMOUS EFFECTS OF ATG16L1 AND LRRK2 IN MODULATING PANETH CELL DEFECT IN JAPANESE AND NORTH AMERICAN CROHN'S DISEASE PATIENTS

Ta-Chiang Liu, Takeo Naito, Zhenqiu Liu, Kelli VanDussen, Talin Haritunians, Dalin Li, Katsuya Endo, Yosuke Kawai, Masao Nagasaki, Yoshitaka Kinouchi …

GASTROENTEROLOGY 152(5) S982-S982 2017年4月
POPULATION-OPTIMIZED SNP ARRAY REVEALS RAP1A AS A NOVEL CANDIDATE SUSCEPTIBILITY GENE FOR CROHN'S DISEASE IN JAPANESE INDIVIDUALS

Yoichi Kakuta, Yosuke Kawai, Takeo Naito, Atsushi Hirano, Junji Umeno, Keiichiro Hiramoto, Masatake Kuroha, Yoshitake Kanazawa, Tomoya Kimura, Katsuya Endo …

GASTROENTEROLOGY 152(5) S78-S78 2017年4月
早発型発達緑内障における原因遺伝子の探索

布施昇男, 木村雅恵, 清水愛, 河合洋介, 小島要, 長崎正朗, 濱中輝彦, 石田誠夫, 中村誠, 酒井寛 …

日本眼科学会雑誌 121(臨増) 227-227 2017年3月
マルチオミクスが解き明かす疾患生物学日本人多層オミックス参照パネルの拡張

小柴生造, 三枝大輔, 元池育子, 小島要, 城田松之, 齋藤智, 勝岡史城, 河合洋介, 山口由美, 田邉修 …

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 89回 [1S05-5] 2016年9月
Estimation of allele frequency of pathological variants based on whole-genome sequencing of 1070 Japanese individuals

Yumi Yamaguchi-Kabata, Yosuke Kawai, Kaname Kojima, Naoki Nariai, Takahiro Mimori, Yukuto Sato, Fumiki Katsuoka, Jun Yasuda, Masayuki Yamamoto, Masao Nagasaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 90(6) 379-379 2015年12月
Inference of negative selection on human genome from whole genome sequences of 1070 individuals

Yosuke Kawai, Naoki Nariai, Kaname Kojima, Yumi Yamaguchi-Kabata, Yukuto Sato, Takahiro Mimori, Masaco Nagasaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 90(6) 379-379 2015年12月

もっとみる

書籍等出版物

最新DNA研究が解き明かす。日本人の誕生

斎藤成也, 木村亮介, 鈴木留美子, 河合洋介, 松波雅俊 (担当:共著)

秀和システム 2020年8月 (ISBN: 9784798060224)

講演・口頭発表等

ハプロタイプ共有長の分布から推定する東アジア人の集団史

河合洋介

日本進化学会第21回大会 2019年8月9日
日本人の大規模ゲノムワイド多型解析

河合洋介

第２６回日本DNA多型学会 2018年招待有り
Genome-wide genetic variation of people in Japan and its implication of demographic history

河合洋介

The 2018 SMBE conference 2018年
Genome-wide genotype imputation of Japanese population-specific SNP array.

河合洋介

The 2017 Japan-NIH Joint Symposium 2017年
Genome-wide analysis of common and rare genetic variation in Japanese population

河合洋介

2nd International Conference on Founder Populations 2017年招待有り
ゲノム医科学のための全ゲノム情報解析基盤

河合洋介, 長崎正朗

日本生化学会大会(Web) 2017年招待有り
日本人ゲノムの多様性解析

河合洋介, 三澤計治, 三森隆広, 小島要, 山口由美, 柴田朋子, 勝岡史城, 山本雅之, 長崎正朗

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 2016年8月25日招待有り
集団遺伝解析の方法:実演と実習

河合洋介

第3回ゲノム多様性解析ワークショップ 2016年招待有り
Improved imputation accuracy using population-specific SNP array and haplotype reference panel

河合洋介

International Congress of Human Genetics 2016年
Improved imputation accuracy with population-specific SNP array and reference panel in Japanese population

河合洋介

European Society of Human Genetics 2016年
Fine-scale genetic diversity of Japanese population

河合洋介

American Society of Human Genetics 2016年
日本人の集団ゲノミクス

河合洋介

国立遺伝学研究所研究集会「分子進化学の現状と今後の展望」 2016年招待有り
日本人1070人の全ゲノム配列から推定したヒトゲノムの負の自然淘汰

河合洋介, 成相直樹, 小島要, 山口由美, 佐藤行人, 三森隆広, 長崎正朗

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 2015年9月10日
日本人１０７０人の集団ゲノム解析

河合洋介

第2回ゲノム多様性解析ワークショップ 2015年招待有り
An approach combining the construction of haplotype collection and the design of population-optimized SNP array on the largescale whole genome-sequencing project in Japan

河合洋介

American Society of Human Genetics 2015年
High precession whole genome sequences of 1,070 Japanese individuals

河合洋介

日本進化学会第１７回大会 2015年招待有り
SNPアレイデータの全ゲノムインピュテーション

河合洋介

日本人類遺伝学会大会 2015年招待有り
集団サイズ動態のノンパラメトリック回帰を使った推定

河合洋介, 佐藤行人, 山口由美, 成相直樹, 杉本幸代, 三森隆広, 小島要, 長崎正朗

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 2014年8月31日
二次代謝多重遺伝子ファミリーの分子進化

河合洋介

第三回植物二次代謝フロンティア研究会 2014年招待有り
ジャポニカアレイと日本人高精度全ゲノム配列を使ったジェノタイプインピュテーション

河合洋介

日本人類遺伝学会大会 2014年招待有り

もっとみる

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

Works(作品等)

霊長類ゲノム比較による塩基組成進化の解析

2008年9月 - 2009年3月
霊長類ゲノム比較による塩基組成進化の解析

2008年9月 - 2009年3月

共同研究・競争的資金等の研究課題

先史人類の人口動態に関する研究

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2023年4月 - 2028年3月

中村大, 河合洋介, 高瀬克範, 山口雄治, NOXON Corey・Tyler
ヒトゲノム中に多型的に存在するウイルス様配列の大規模探索と集団ゲノム解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2026年3月

長田直樹, 河合洋介
日本人集団ゲノムワイドクロマチン相互作用情報と構造多型との関連解析と疾患要因探索

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2024年3月

長崎正朗, 河合洋介, 大川恭行
ヤポネシア人の人口推定を中心とした巨大データ解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2018年6月 - 2023年3月

長田直樹, 五條堀淳, 河合洋介, 藤本明洋
(1)Analysis of base substitution pattern by comparing closely related species.

河合洋介

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

Works(作品等)

共同研究・競争的資金等の研究課題

メニュー

共著者の一覧