市原寿子 (Hisako Ichihara) - マイポータル

基本情報

所属: 公益財団法人かずさDNA研究所特任研究員

学位: 博士（システム生命科学）(九州大学)

J-GLOBAL ID: 200901085983169450
researchmap会員ID: 5000059143

外部リンク

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / ゲノム生物学 / データベース

経歴

2024年4月 - 現在

公益財団法人かずさDNA研究所, 先端研究開発部植物ゲノム・遺伝学研究室, 特任研究員
2023年4月 - 2024年3月

公益財団法人かずさDNA研究所, シーズ開拓研究室生物情報解析システム開発チーム, 特任研究員
2020年4月 - 2023年3月

公益財団法人かずさDNA研究所, 植物ゲノム・遺伝学研究室, 特任研究員
2017年4月 - 2020年3月

大阪大学, 医学系研究科ゲノム情報学共同研究講座, 特任助教（常勤）
2012年4月 - 2017年3月

公益財団法人かずさDNA研究所, 技術開発研究部ゲノム情報解析グループ, JST統合化推進プログラムプロジェクト研究員
2011年4月 - 2012年3月

立教大学, 理学部生命理学科, 兼任講師
2010年4月 - 2012年3月

独立行政法人産業技術総合研究所生命情報工学研究センター, 産総研特別研究員
2008年4月 - 2010年3月

九州大学, 生体防御医学研究所微生物ゲノム情報学分野, 特任助教
2007年4月 - 2008年3月

福岡歯科大学, 学術フロンティア研究センター, 助教
2002年10月 - 2007年3月

京都大学, 化学研究所附属バイオインフォマティクスセンター, 特任助手
2002年1月 - 2002年9月

技術研究組合生物分子工学研究所, 生命情報研究部, 研究員
2000年4月 - 2001年12月

株式会社生物分子工学研究所, 情報解析研究部門, 研究員

学歴

論文

Plant GARDEN: a portal website for cross-searching between different types of genomic and genetic resources in a wide variety of plant species.

Hisako Ichihara, Manabu Yamada, Mitsuyo Kohara, Hideki Hirakawa, Andrea Ghelfi, Takuro Tamura, Akihiro Nakaya, Yasukazu Nakamura, Sachiko Shirasawa, Samatchaya Yamashita …

BMC plant biology 23(1) 391-391 2023年8月12日
Plant GARDEN: a portal website for accessing plant genome, DNA marker, and SNP information

H. Ichihara, H. Hirakawa, A. Ghelfi, M. Kohara, M. Yamada, T. Tamura, A. Nakaya, Y. Nakamura, S. Shirasawa, E. Sugihara …

Acta Horticulturae (1339) 415-418 2022年4月
植物ゲノム統合データベースPGDBjの構築

平川英樹, 中谷明弘, 市原寿子, 柴谷多恵子, 浅水恵理香, 白澤沙知子, 中村保一, 磯部祥子, 田畑哲之

トーゴーの日2017 1 2017年10月5日
Plant Genome DataBase Japan (PGDBj).

Akihiro Nakaya, Hisako Ichihara, Erika Asamizu, Sachiko Shirasawa, Yasukazu Nakamura, Satoshi Tabata, Hideki Hirakawa

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 1533 45-77 2017年査読有り招待有り
Plant Genome DataBase Japan (PGDBj): a portal website for the integration of plant genome-related databases.

Erika Asamizu, Hisako Ichihara, Akihiro Nakaya, Yasukazu Nakamura, Hideki Hirakawa, Takahiro Ishii, Takuro Tamura, Kaoru Fukami-Kobayashi, Yukari Nakajima, Satoshi Tabata

Plant & cell physiology 55(1) e8-e8(7) 2014年1月査読有り
Preparation and preliminary X-ray diffraction analysis of crystals of bacterial flagellar sigma factor sigma(28) in complex with the sigma(28)-binding region of its antisigma factor, FlgM

Kengo Okada, Hisako Ichihara, Hiroyuki Takahashi, Nobuyuki Fujita, Akira Ishihama, Toshio Hakoshima

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS 63 196-199 2007年3月査読有り
Structure of SixA, a histidine protein phosphatase of the ArcB histidine-containing phosphotransfer domain in Escherichia coli

Toshio Hakoshima, Hisako Ichihara

TWO-COMPONENT SIGNALING SYSTEMS, PT A 422 288-+ 2007年査読有り招待有り
Positive selection in the ComC-ComD system of streptococcal species

Hisako Ichihara, Kei-ichi Kuma, Hiroyuki Toh

JOURNAL OF BACTERIOLOGY 188(17) 6429-6434 2006年9月査読有り
How does a topological inversion change the evolutionary constraints on membrane proteins?

H Ichihara, H Daiyasu, H Toh

PROTEIN ENGINEERING DESIGN & SELECTION 17(3) 235-244 2004年3月
バイオインフォマティクス入門 -要素と相互作用、個別と網羅の観点から-

市原寿子, 藤博幸

BIO・IT World 2 49-63 2003年
Evolutionary Traceを利用して蛋白質の相互作用情報を読みとる

市原寿子, 藤博幸

蛋白質核酸酵素 47(13) 1863-1869 2002年
Three novel repetitive units of reelin

H Ichihara, H Jingami, H Toh

MOLECULAR BRAIN RESEARCH 97(2) 190-193 2001年12月

MISC

植物ゲノム情報ポータルサイト「Plant GARDEN」の改訂(2023年度・第4四半期版)-進化情報を活用するためのツールの開発-

市原寿子, 山田学, 戸田陽介, 中谷明弘, 山下サマッチャヤー, 清水武彦, 白澤沙知子, 小原光代, 平川英樹, 中村保一 …

育種学研究 26 2024年
植物ゲノム情報ポータルサイト「Plant GARDEN」の改訂(2023年度・第2四半期版)

市原寿子, 小原光代, 山下サマッチャヤー, 山田学, 清水武彦, 白澤沙知子, 戸田陽介, 平川英樹, 中村保一, 中村保一 …

育種学研究 25 2023年
植物ゲノム情報ポータルサイト「Plant GARDEN」の改訂(2022年度・第4四半期版)

市原寿子, 平川英樹, 山田学, 小原光代, 山下サマッチャヤー, 白澤沙知子, 戸田陽介, 清水武彦, 中村保一, 中村保一 …

育種学研究 25 2023年
植物ゲノム統合データベースPlant GARDEN、微生物、メタボローム統合データベース間の連携検索システムの開発

平川英樹, 藤澤貴智, 守屋勇樹, 信定知江, 長崎英樹, 森宙史, 福島敦史, Ghelfi Andrea, 市原寿子, 中村保一 …

トーゴーの日2022 1 2022年10月5日
植物ゲノム情報ポータルサイト「Plant GARDEN」の改訂（2022年度・第２四半期版）

市原寿子, 平川英樹, 山田学, 小原光代, 山下サマッチャヤー, 白澤沙知子, 戸田陽介, 中村保一, 七夕高也, 田畑哲之 …

トーゴーの日2022 1 2022年10月5日
Plant GARDENからMi-GARDENへ~公開ゲノム情報とユーザーデータをつなぐ~

磯部祥子, 市原寿子, 山田学, 中村保一, 中村保一, 戸田陽介, 小原光代, 山下サマッチャヤー, 七夕高也, 平川英樹 …

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 86th 2022年
ゲノム・遺伝子・NGSデータを調べるゲノム 4.Plant GARDEN-さまざまな植物のゲノムやマーカー情報を集めたポータルサイト

磯部祥子, 市原寿子, 平川英樹

実験医学 40(17) 2022年
植物の多様性の理解のためにゲノム解析が明らかにできていること

磯部祥子, 白澤健太, 佐藤光彦, 市原寿子, 田島直之, 平川英樹

育種学研究 24 2022年
植物の参照ゲノム配列とユーザーのゲノム配列データを比較するプラットホーム「Mi-GARDEN」の開発

磯部祥子, 堀口晃一郎, 山田学, 三澤拓真, 中村保一, 市原寿子, 小原光代, 平川英樹

育種学研究 24 2022年
植物ゲノム情報ポータルサイト「Plant GARDEN」の改訂(2021年度・第4四半期版)

市原寿子, 平川英樹, GHELFI A., 小原光代, 山田学, 田村卓郎, 中谷明弘, 中村保一, 白澤沙知子, 杉原英志 …

育種学研究 24 2022年
大規模データ時代のDBの役割は?~Plant GARDENの開発現場から~

磯部祥子, 市原寿子, 七夕高也, ジェルフィアンドレア, 兒玉晋洋, 小原光代, 山田学, 白澤沙知子, 田村卓郎, 杉原英志 …

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 85th 2021年
植物ゲノムポータルサイト「Plant GARDEN」の使い方

市原寿子, 平川英樹, GHELFI Andrea, 小原光代, 山田学, 田村卓郎, 中谷明弘, 中村保一, 白澤沙智子, 杉原英志 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 44th 2021年
植物ゲノム情報ポータルサイト「Plant GARDEN」の改訂(2020年度・第4四半期版)

市原寿子, 小原光代, 山田学, GHELFI A., 平川英樹, 白澤沙知子, 田村卓郎, 杉原英志, 中村保一, 中谷明弘 …

育種学研究 23 2021年
植物ゲノム情報ポータルサイトPlant GARDENの正規版公開

市原寿子, 原田大士朗, ゲルフィアンドレア, 小原光代, 山田学, 白澤沙知子, フォーセットジェフリー, 田村卓郎, 杉原英志, 中谷明弘 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
植物ゲノム情報ポータルサイトPlantGARDENの正規版公開

市原寿子, 原田大士朗, GHELFI A., 小原光代, 山田学, 白澤沙知子, FAWCETT J., 田村卓郎, 杉原英志, 中谷明弘 …

育種学研究 22 2020年
植物ゲノム情報ポータルサイトPlantGARDENの開発

原田大士朗, 市原寿子, 中谷明弘, GHELFI A., 藤代継一, 小原光代, 平川英樹, 田畑哲之, 磯部祥子

育種学研究 21 2019年
植物ゲノム情報ポータルサイトPlantGARDENの拡張

原田大士朗, 市原寿子, 中谷明弘, GHELFI A., 山田学, 小原光代, 平川英樹, 田畑哲之, 磯部祥子

育種学研究 21 2019年
作物品種の形質情報に対するセマンティックウェブ技術の適用

市原寿子, 藤井浩, 磯部祥子, 櫛田達矢, 田畑哲之, 中谷明弘

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年
植物ゲノム統合ポータルサイトPlantGARDENの開発と公開

原田大士朗, 市原寿子, 中谷明弘, ジェルフィアンドレア, 山田学, 小原光代, 平川英樹, 田畑哲之, 磯部祥子

日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム講演要旨集 37th 2019年
世界における植物ゲノム解析の現状と課題

原田大士朗, 市原寿子, 中谷明弘, GHELFI Andrea, 藤代継一, 小原光代, 平川英樹, 田畑哲之, 磯部祥子

トーゴーの日2018 1 2018年10月5日

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書籍等出版物

実験医学増刊今日から使える！データベース・ウェブツール達人になるための実践ガイド100 内藤雄樹／編

平川英樹, 市原寿子, 浅水恵理香, 中谷明弘, 中村保一, 田畑哲之 (担当:分担執筆, 範囲:PGDBj 植物ゲノム関連データベースの統合)

羊土社 2014年12月 (ISBN: 9784758103435)
Prostaglandin D Synthase - A Multitude of Biological Functions. Ragolia L(ed)

Ichihara H, Kuma K, Urade Y, Toh H (担当:分担執筆, 範囲:Evolutionary analysis of lipocalin-type prostaglandin D2 synthase.)

Research Signpost 2007年
バイオインフォマティクス事典日本バイオインフォマティクス学会／編

市原寿子 (担当:分担執筆, 範囲:“原核生物の遺伝子構造（生物科学・分子生物学基礎）”, “真核生物の遺伝子構造（生物科学・分子生物学基礎）”, “遺伝子重複（ゲノム遺伝解析・進化学）”, “シンテニー（ゲノム遺伝解析・ゲノムの進化）”)

共立出版 2006年7月
実験医学別冊注目のプロテオミクスの全貌を知る -最新手法とその応用成果- 磯辺俊明・高橋信弘／編

藤博幸, 市原寿子 (担当:分担執筆, 範囲:ゲノム情報を利用した蛋白質ネットワークの再構築)

羊土社 2002年12月

講演・口頭発表等

「系統―生育環境―表現型」データベースの開発

市原寿子

日本育種学会第146回講演会 (令和6年秋季大会) 2024年9月20日
「系統―⽣育環境―表現型」データベースの構築

市原寿子

日本生物環境工学会2024年大阪大会 2024年9月18日
植物研究データベースの開発 ~「系統―生育環境―表現型」データベースと植物ゲノムポータルサイトPlant GARDENのデータ活用~

市原寿子

日本植物バイオテクノロジー学会（仙台）大会シンポジウム 2024年9月1日招待有り
植物ゲノムポータルサイトPlant GARDENの紹介

市原寿子

SIPスマートバイオ1B・D 精密ゲノム編集・国民理解サブコンソーシアム情報交換会 2021年12月14日招待有り
植物統合データベースPGDBJ(Plant Genome DataBase Japan)の構築

平川英樹, 市原寿子

園芸学会平成28年度春季大会小集会 2016年3月25日招待有り
Plant Genome DataBase Japan（PGDBj）-植物統合DB 2013年度版の紹介-

市原寿子

第５５回日本植物生理学会大会シンポジウム「データベース講習会」 2014年3月18日招待有り
ゲノム情報に基づく植物データベースの統合

市原寿子

第３１回日本植物細胞分子生物学会（札幌）大会シンポジウム「バイオインフォマティクス講習会」 2013年9月12日招待有り
統合化推進プログラム−ゲノム情報に基づく植物データベースの統合−

市原寿子

第５４回日本植物生理学会大会シンポジウム「データベース講習会」 2013年3月22日招待有り
ゲノムを護るタンパク質のバイオインフォマティクス

市原寿子

福岡歯科大学学術フロンティア研究シンポジウム 2007年7月招待有り
ストレプトコッカス属の自然形質転換を制御するCSP-ComD系における正の選択圧

市原寿子

日本分子生物学会2006フォーラム 2006年12月

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

セマンティックウェブ技術を用いた植物の系統・生育環境・表現型のデータベース

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

市原寿子
セマンティックウェブ技術を用いた遺伝素材の交配・解析系統の選定を支援するシステム

2019年4月 - 2022年3月

市原寿子
ヒト赤血球microRNAによるマラリア感染機構の調節

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2009年4月 - 2011年3月

梅村創
情報科学的アプローチによるタンパク質間のソフトな相互作用の解析法及び予測法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2007年4月 - 2009年3月

藤博幸
情報科学的アプローチによるタンパク質間のソフトな相互作用の解析法及び予測法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2005年4月 - 2007年3月

藤博幸
Extraction of the Information about Biological function by the analysis of the protein interactions.
Evolution of Protein functions and Structure
Extraction of Information about Protein function and Structure by compareing homologous amino acid sequences

市原寿子

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研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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