荒 武

J-GLOBALへ         更新日: 18/12/17 16:13
 
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研究者氏名
荒 武
 
アラ タケシ
URL
http://www.foodfunc.kais.kyoto-u.ac.jp/
所属
京都大学
学位
農学(京都大学)
科研費研究者番号
80338194
ORCID ID
0000-0003-1754-2837

プロフィール

植物細胞内を流れる葉緑体の美しさにひかれて農学部へ。植物の代謝と酵素学を少し学んだ後でオミックスとバイオインフォの海へ入り、アノテーションと計算解析の道に。

◆研究テーマ
生物学におけるビッグデータ(Genome, Transcriptome, Proteome, Metabolome)を世界中で活用するために、データベースの構築(主にデータを地道に公開する作業)とデータの注釈付け(地道なアノテーション、キュレーション作業)に携わり、20年がたちました。生物の多様性の大きさに比べればわずかな水滴のようなこれらのデータを、いかに育てていくかを日々考えています。生物の生き様としての代謝、というものの理解は、まだまだ果てしない道のりのようです。

研究分野

 
 

経歴

 
2017年4月
 - 
現在
京都大学大学院 農学研究科  食品生物科学専攻 食品分子機能学分野 特定准教授
 
2014年4月
 - 
2017年3月
京都大学 大学院農学研究科「カゴメ」トマト・ディスカバリーズ講座 特定准教授
 
2006年7月
 - 
2014年3月
かずさDNA研究所 研究員
 
2004年4月
 - 
2006年6月
INSERM 研究員
 
2001年4月
 - 
2004年3月
慶應義塾大学 先端生命科学研究所 助手
 

学歴

 
1995年4月
 - 
1998年3月
京都大学 農学研究科博士後期課程 農芸化学専攻
 
1993年4月
 - 
1995年3月
京都大学 農学研究科修士課程 農芸化学専攻
 
1989年4月
 - 
1993年3月
京都大学 農学部 農芸化学科
 

論文

 
Takahashi S., Waki N, Mohri S, Takahashi H, Ara T, Aizawa K, Suganuma H, Kawada T, Goto T
Journal of Agricultural and Food Chemistry      2018年   [査読有り]
Lactobacillus amylovorus CP1563株由来10-Hydroxyoctadecanoic Acidが脂質代謝および脂肪蓄積に及ぼす影響
青木ゆめこ、菅原智詞、柳原沙恵、高橋春弥、野村 直、Jheng Huei-Fen、荒 武、後藤 剛、河田照雄、澤田大輔
応用薬理   95 73-82   2018年   [査読有り]
Yeh YS, Kim M, Jheng HF, Takahashi H, Iwase M, Mohri S, Li Y, Ara T, Nomura W, and Kawada T, Goto T
iScience   9 175-191   2018年   [査読有り]
Takeda K, Sawazaki H, Takahashi H, Yeh YS, Jheng HF, Nomura W, Ara T, Takahashi N, Seno S, Osato N, Matsuda H, Kawada T, Goto T.
FEBS Open Bio   8 1782-1793   2018年   [査読有り]
Yuliana A, Jheng HF, Nomura W, Takahashi H, Ara T, Kawada T, and Goto T.
International Journal of Molecular Sciences   19(8) 2436   2018年   [査読有り]
Kera K, Fine D, Wherritt D, Nagashima Y, Shimada N, Ara T, Ogata Y, Sumner LW and Suzuki H
Metabolomics   14(5) 71   2018年   [査読有り]
Mohri S, Takahashi H, Sakai M, Takahashi S, Waki N, Aizawa K, Suganuma H, Ara T, Shibata D, Goto T and Kawada T
PLoS One   13(1) e0191203   2018年   [査読有り]
新世代の栄養学研究メタボローム
荒 武、青江誠一郎、渡邊 昌
医と食   9(1) 9-16   2017年2月   [招待有り]
Takahashi H, Sanada K, Nagai H, Li Y, Aoki Y, Ara T, Seno S, Matsuda H, Yu R, Kawada T and Goto T
Biochemical and Biophysical Research Communications   493(1) 108-114   2017年   [査読有り]
Akimoto N, Ara T, Nakajima D, Suda K, Ikeda C, Takahashi S, Muneto R, Yamada M, Suzuki H, Shibata D, Sakurai N
Scientific Reports   7 1243   2017年   [査読有り]
メタボロームはじめの一歩 - 食品の新しい姿を求めて
荒 武
工業材料   64(9)    2016年8月   [招待有り]
Yamamoto N, Ara T, Sakurai N, Tsugane T, Suzuki H and Shibata D
Journal of Life Sciences and Technologies   4(2) 75-78   2016年   [査読有り]
A new approach to construct a synthetic mixture of saccharifying enzymes
Fukuura M, Ara T, Takeda M, Shibata D, Mitsuzawa S
Lignocellulose degradation and biorefinery   262-264   2015年   [査読有り]
Ara T, Enomoto M, Arita M, Ikeda C, Kera K, Yamada M, Nishioka T, Ikeda T, Nihei Y, Shibata D, Kanaya S, Sakurai N
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology   3 38   2015年   [査読有り]
Kota Kera, Yoshiyuki Ogata, Takeshi Ara, Yoshiki Nagashima, Norimoto Shimada, Nozomu Sakurai, Daisuke Shibata, Hideyuki Suzuki
Plant Biotechnology   31(3) 269-274   2014年   [査読有り]
Sakurai N, Ara T, Enomoto M, Motegi T, Morishita Y, Kurabayashi A, Iijima Y, Ogata Y, Nakajima D, Suzuki H and Shibata D
BioMed Research International   2014 1-11   2014年   [査読有り]
Sakurai N, Ara T, Kanaya S, Nakamura Y, Iijima Y, Enomoto M, Motegi T, Aoki K, Suzuki H and Shibata D
Bioinformatics   29(2) 290-291   2013年   [査読有り]
Sakurai N, Ogata Y, Ara T, Sano R, Akimoto N, Suzuki H, Kajikawa M, Widyastuti U, Suharsono S, Yokota A, Akashi K, Kikuchi J and Shibata D
Plant Biotechnology   29(2) 131-135   2012年   [査読有り]
Sano R, Ara T, Akimoto N, Sakurai N, Suzuki H, Fukuzawa Y, Kawamitsu Y, Ueno M and Shibata D
Plant Biotechnology   29(2) 175-178   2012年   [査読有り]
Yamamoto N, Suzuki T, Ara T, Sakurai N, Shinpo S, Morishita Y, Sasaki R, Tsugane T, Suzuki H and Shibata D
Plant Biotechnology   29(1) 109-113   2012年   [査読有り]
Sakurai N, Ara T, Ogata Y, Sano R, Ohno T, Sugiyama K, Hiruta A, Yamazaki K, Yano K, Aoki K, Aharoni A, Hamada K, Yokoyama, Kawamura S, Otsuka H, Tokimatsu T, Kanehisa M, Suzuki H, Saito K and Shibata G
Nucleic Acids Research   29(1) D677-D684   2011年   [査読有り]
Horai H, Arita M, Kanaya S, Nihei Y, Ikeda T, Suwa K, Ojima Y, Tanaka K, Tanaka S, Aoshima K, Oda Y, Kakazu Y, Kusano M, Tohge T, Matsuda F, Sawada Y, Hirai MY, Nakanishi H, Ikeda K, Akimoto N, Maoka T, Takahashi H, Ara T, Sakurai N, Suzuki H, Shibata D, Neumann S, Iida T, Tanaka K, Funatsu K, Matsuura F, Soga T, Taguchi R, Saito K, Nishioka T
Journal of Mass Spectrometry   45(7) 703-714   2010年   [査読有り]
Aono E, Baba T, Ara T, Nishi T, Nakamichi T, Inamoto E, Toyonaga H, Hasegawa M, Takai Y, Okumura Y, Baba M, Tomita M, Kato C, Oshima T, Nakasone K and Mori H
Molecular BioSystems   6(7) 1216-1226   2010年   [査読有り]
Ogawa T, Ara T, Aoki K, Suzuki H and Shibata D
Plant Biotechnology   27(2) 205-209   2010年   [査読有り]
Ara T, Sakurai N, Tange Y, Morishita Y, Suzuki H, Aoki K, Saito K and Shibata D
Plant Biotechnology   26(5) 445-449   2009年   [査読有り]
Koscielny G, Le Texier V, Gopalakrishnan C, Kumanduri V, Riethoven JJ, Nardone F, Stanley E, Fallsehr C, Hofmann O, Kull M, Harrington E, Boue S, Eyras E, Plass M, Lopez F, Ritchie W, Moucadel V, Ara T, Pospisil H, Herrmann A, G Reich J, Guigo R, Bork P, Doeberitz MK, Vilo J, Hide W, Apweiler R, Thanaraj TA, Gautheret D
Genomics   93(3) 213-220   2009年   [査読有り]
Chen C, Ara T and Gautheret D.
Molecular Biology and Evolution   Epub ahead of print   2008年   [査読有り]
Moucadel V, Lopez F, Ara T, Philippe Benech and Gautheret D
Nucleic Acids Research   35(6) 1947-1957   2007年   [査読有り]
Lopez F, Granjeaud S, Ara T, Ghattas B and Gautheret D
RNA   12(10) 1794-1801   2006年   [査読有り]
Ara T, Lopez F, Ritchie W, Benech P and Gautheret D
BMC Genomics   7 189   2006年   [査読有り]
Baba T, Ara T, Hasegawa M, Takai Y, Okumura Y, Baba M, Datsenko KA, Tomita M, Wanner BL and Mori H
Mol. Sys. Biol.   2 2006.0008   2006年   [査読有り]
Arifuzzaman M, Maeda M, Itoh A, Nishikata K, Takita C, Saito R, Ara T, Nakahigashi K, Huang HC, Hirai A, Tsuzuki K, Nakamura S, Altaf-Ul-Amin M, Oshima T, Baba T, Yamamoto N, Kawamura T, Ioka-Nakamichi T, Kitagawa M, Tomita M, Kanaya S, Wada C and Mori H
Genome Research   16 686-691   2006年   [査読有り]
Kitagawa M., Ara T., Arifuzzaman M., Ioka-Nakamichi T., Inamoto E., Toyonaga H., and Mori H
DNA Research   12(5) 291-299   2005年   [査読有り]
深海微生物の比較ゲノム生物学
荒 武、青野英司
月刊海洋   411 655-672   2004年
Oshima T., Wada C., Kawagoe Y., Ara T., Maeda M., Masuda Y., Hiraga S., and Mori H
Mol. Microbiol.   45(3) 673-695   2002年   [査読有り]
Murata T., Ohnishi M., Ara T., Kaneko J., Han C. G., Li Y. F., Takashima K., Nojima H., Nakayama K., Kaji A., Kamio Y., Miki T., Mori H., Ohtsubo E., Terawaki Y. and Hayashi T.
J. Bacteriol.   184(12) 3194-3202   2002年   [査読有り]
Kawano M., Kanaya S., Oshima T., Masuda Y., Ara T. and Mori H
DNA Research   9(1) 1-10   2002年   [査読有り]
大腸菌ゲノムデータベースの構築
荒 武、旭 浩子、森 浩禎
Computer Today   101 19-25   2001年
大腸菌のポストシーケンスゲノム解析
森 浩禎、堀内 嵩、磯野 克己、和田 千恵子、金谷 重彦、北川 正成、荒  武、大島 拓
蛋白質核酸酵素   46 1977-1985   2001年
Ara T. and Sekiya J.
Biosci Biotechnol Biochem.   61(4) 621-624   1997年   [査読有り]
Purification and characterization of APS sulfotransferase from spinach leaves
Ara T. and Sekiya J
Sulphur Metabolism in Higher Plants   177-179   1997年   [査読有り]
Comparative metabolomic analysis of two tomato cultivars during fruit maturation
Ara T, Takahashi S, Waki N, Sakurai N, Aizawa K, Suganuma H, Matsumura Y, Kawada T and Shibata D
Acta Horticulturae   1159 101-106   2017年   [査読有り]

書籍等出版物

 
The Jatropha Genome (分担執筆)
Springer   2017年   ISBN:9783319496511
バイオデータベースとウェブツールの手とり足とり活用法(分担執筆)
羊土社   2002年   ISBN:4897063574
ゲノミクス・プロテオミクスの新展開(分担執筆)
羊土社   2004年   ISBN:4860430492
バイオデータベースとウェブツールの手とり足とり活用法 第2版(分担執筆)
羊土社   2007年   ISBN:4758108110

Works

 
荒 武   データベース   2015年 - 現在
荒 武   データベース   2011年 - 現在
荒 武   データベース   2010年 - 現在
荒 武   データベース   2009年 - 現在
荒 武   データベース   2012年 - 現在

競争的資金等の研究課題

 
高等植物のAPSスルホトランスフェラーゼの生化学的および分子生物学的研究
文部科学省: 科学研究費補助金(特別研究員奨励費)
研究期間: 1998年   

社会貢献活動

 
【企画, 運営参加・支援】  2017年11月23日
【企画, 実演】  京都大学アカデミックデイ2014  2014年9月28日