坂井直樹 (Sakai Naoki) - マイポータル

基本情報

所属: 公益財団法人高輝度光科学研究センター回折・散乱推進室主幹研究員

学位: 博士（理学）(北海道大学)

ORCID iD: https://orcid.org/0000-0001-8544-1187
J-GLOBAL ID: 200901076557878917
Researcher ID: E-1120-2017
researchmap会員ID: 5000070945

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 /

経歴

2025年4月 - 現在

公益財団法人高輝度光科学研究センター, 回折・散乱推進室, 主幹研究員
2023年4月 - 2025年3月

公益財団法人高輝度光科学研究センター, 構造生物学推進室, 主幹研究員
2022年4月 - 2023年3月

公益財団法人高輝度光科学研究センター, 構造生物学推進室, 研究員
2018年10月 - 2022年3月

理化学研究所, 放射光科学研究センター, 研究員
2018年4月 - 2018年9月

理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 研究員
2015年4月 - 2018年3月

理化学研究所, ライフサイエンス技術基盤研究センター, 研究員
2011年1月 - 2014年12月

University of Luebeck, Institute of Biochemistry, Senior scientist
2006年8月 - 2010年12月

北海道大学, 大学院先端生命科学研究院, 助教
2006年6月 - 2006年7月

北海道大学, 大学院先端生命科学研究院, 特任助手
2006年4月 - 2006年5月

北海道大学, 大学院先端生命科学研究院, 研究員
2003年4月 - 2006年3月

北海道大学, 大学院理学研究科, 研究員

学歴

1998年4月 - 2003年3月

北海道大学, 大学院理学研究科, 生物科学専攻（高分子機能学）
1994年4月 - 1998年3月

北海道大学, 理学部, 生物科学科（高分子機能学）

論文

Enhanced axonal transport in large vertebrates: KIF5A adaptations in giraffes and pythons

Taketoshi Kambara, Lu Rao, Yosuke Yamagishi, Kazuho Ikeda, Daisuke Taniguchi, Tsuyoshi Imasaki, Hideki Shigematsu, Naoki Sakai, Arne Gennerich, Ryo Nitta …

2025年5月5日
Where and how to house big data on small fragments

Daniel A. Erlanson, Stephen K. Burley, Daren Fearon, James S. Fraser, Dale Kreitler, Maria Cristina Nonato, Naoki Sakai, Jan Wollenhaupt, Manfred S. Weiss

Nature Communications 2025年5月5日
Identification of benzimidazole-6-carboxamide based inhibitors of secretory glutaminyl cyclase for the treatment of Alzheimer's disease

K.V. Dileep, Naoki Sakai, Kentaro Ihara, Akiko Nakata, Akihiro Ito, Divya M. Sivaraman, Chi Wai Yip, Jay W. Shin, Minoru Yoshida, Mikako Shirouzu …

International Journal of Biological Macromolecules 2025年3月
Engineering of acyl ligase domain in non-ribosomal peptide synthetases to change fatty acid moieties of lipopeptides

Rina Aoki, Eri Kumagawa, Kazuaki Kamata, Hideo Ago, Naoki Sakai, Tomohisa Hasunuma, Naoaki Taoka, Yukari Ohta, Shingo Kobayashi

Communications Chemistry 2025年1月21日
A new BMP type 1 receptor kinase inhibitor for safe and efficient oral treatment to prevent genetically induced heterotopic ossification in mice

Naoki Sakai

Bone 2025年
Application of multiple small-wedge synchrotron crystallography for post-reaction structural characterization of a stimuli-responsive small-molecule crystal

Naoki Sakai

Bulletin of the Chemical Society of Japan 2025年
A large pocket structure surrounding the catalytic center in the BCG protein fromMycobacterium tuberculosis

Kohei Takeshita, Naoki Sakai, Go Ueno, Midori Horie, Hirofumi Tsujino, Mitsuhiro Arisawa, Masaki Yamamoto, Masayoshi Arai, Taku Yamashita

2024年5月14日
Structural insights into catalytic promiscuity of chalcone synthase from Glycine max (L.) Merr.: Coenzyme A-induced alteration of product specificity

Toshiyuki Waki, Riki Imaizumi, Kaichi Uno, Yamato Doi, Misato Tsunashima, Sayumi Yamada, Ryo Mameda, Shun Nakata, Taro Yanai, Kohei Takeshita …

Biochemical and Biophysical Research Communications 150080-150080 2024年5月
Structural‐Functional Correlations between Unique N‐terminal Region and C‐terminal Conserved Motif in Short‐chain cis‐Prenyltransferase from Tomato

Riki Imaizumi, Hiroaki Matsuura, Taro Yanai, Kohei Takeshita, Shuto Misawa, Haruhiko Yamaguchi, Naoki Sakai, Yukino Miyagi‐Inoue, Miki Suenaga‐Hiromori, Toshiyuki Waki …

ChemBioChem 2024年4月2日
Elucidating polymorphs of crystal structures by intensity-based hierarchical clustering analysis of multiple diffraction data sets

Hiroaki Matsuura, Naoki Sakai, Sachiko Toma-Fukai, Norifumi Muraki, Koki Hayama, Hironari Kamikubo, Shigetoshi Aono, Yoshiaki Kawano, Masaki Yamamoto, Kunio Hirata

Acta Crystallographica Section D Structural Biology 2023年10月1日
Structural insights into a bacterial β-glucosidase capable of degrading sesaminol triglucoside to produce sesaminol: toward the understanding of the aglycone recognition mechanism by the C-terminal lid domain

Taro Yanai, Yukino Takahashi, Eri Katsumura, Naoki Sakai, Kohei Takeshita, Riki Imaizumi, Hiroaki Matsuura, Shuntaro Hongo, Toshiyuki Waki, Seiji Takahashi …

The Journal of Biochemistry 174(4) 335-344 2023年9月29日
Arginine cluster introduction on framework region in anti‐lysozyme antibody improved association rate constant by changing conformational diversity of <scp>CDR</scp> loops

Shingo Maeta, Makoto Nakakido, Hiroaki Matsuura, Naoki Sakai, Kunio Hirata, Daisuke Kuroda, Atsushi Fukunaga, Kouhei Tsumoto

Protein Science 32(9) 2023年9月26日
Current Status of Serial Crystallography at Spring-8 MX Beamlines

Naoki Sakai

Acta Crystallographica Section A: Foundations and Advances 2023年
Development of a drug screening pipeline at SPring-8 macromolecular crystallography beamlines

Naoki Sakai

Acta Crystallographica Section A: Foundations and Advances 2023年
Structural model of microtubule dynamics inhibition by kinesin-4 from the crystal structure of KLP-12 –tubulin complex

Shinya Taguchi, Juri Nakano, Tsuyoshi Imasaki, Tomoki Kita, Yumiko Saijo-Hamano, Naoki Sakai, Hideki Shigematsu, Hiromichi Okuma, Takahiro Shimizu, Eriko Nitta …

eLife 11 2022年9月6日
CAMSAP2 organizes a γ-tubulin-independent microtubule nucleation centre through phase separation

Tsuyoshi Imasaki, Satoshi Kikkawa, Shinsuke Niwa, Yumiko Saijo-Hamano, Hideki Shigematsu, Kazuhiro Aoyama, Kaoru Mitsuoka, Takahiro Shimizu, Mari Aoki, Ayako Sakamoto …

eLife 11 2022年6月28日
In situ crystal data-collection and ligand-screening system at SPring-8

Hideo Okumura, Naoki Sakai, Hironori Murakami, Nobuhiro Mizuno, Yuki Nakamura, Go Ueno, Takuya Masunaga, Takashi Kawamura, Seiki Baba, Kazuya Hasegawa …

Acta Crystallographica Section F Structural Biology Communications 78(6) 241-251 2022年6月1日
Structure‐based engineering of a short‐chain cis ‐prenyltransferase to biosynthesize nonnatural all‐ cis ‐polyisoprenoids: molecular mechanisms for primer substrate recognition and ultimate product chain‐length determination

Ryo Kutsukawa, Riki Imaizumi, Miki Suenaga‐Hiromori, Kohei Takeshita, Naoki Sakai, Shuto Misawa, Masaki Yamamoto, Haruhiko Yamaguchi, Yukino Miyagi‐Inoue, Toshiyuki Waki …

The FEBS Journal 2022年2月22日
Lewis fucose is a key moiety for the recognition of histo‐blood group antigens by GI.9 norovirus, as revealed by structural analysis

Tomomi Kimura‐Someya, Miyuki Kato‐Murayama, Kazushige Katsura, Naoki Sakai, Kazutaka Murayama, Kazuharu Hanada, Mikako Shirouzu, Yuichi Someya

FEBS Open Bio 12(3) 560-570 2022年1月30日
Structural basis of membrane recognition of Toxoplasma gondii vacuole by Irgb6

Yumiko Saijo-Hamano, Aalaa Alrahman Sherif, Ariel Pradipta, Miwa Sasai, Naoki Sakai, Yoshiaki Sakihama, Masahiro Yamamoto, Daron M Standley, Ryo Nitta

Life Science Alliance 5(1) e202101149-e202101149 2022年1月

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SPring-8タンパク質結晶解析ビームラインにおける高効率データ収集システムの利用技術の開発

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現代化学 522 54-55 2014年9月
特集タンパク 3000 プロジェクトの産んだもの第 I 部成果とインパクト:個別的解析拠点の研究成果転写・翻訳翻訳系蛋白質を中心に

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構造生物学を支えるハイスループット蛋白質生産

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ハイスループット蛋白質立体構造解析システムの開発

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日本バイオイメージング学会誌 12(2) 152-155 2003年

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