有機性廃棄物を原料としてコンポスト化する主役を担うには微生物であるが,その実態についてはいまだ不明な点が多い。ここでは有機物分解を担う微生物メカニズムを解明するための技術について紹介した。メカニズムの解明は困難であるが,研究対象はコンポスト中の微生物生態系の特徴の解明,遺伝子技術を用いた微生物相の解析方法が含まれる。研究事例として,バッチ式堆積発酵型のコンポスト化システムの微生物相解析として,分子生物学的手法や培養法による好熱性細菌群集の分離同定および機能解析の概要について解説した。