吾郷日出夫 (Ago Hideo) - マイポータル

基本情報

所属: 特定国立研究開発法人理化学研究所放射光科学研究センター専任研究員

学位: 博士（理学）

J-GLOBAL ID: 200901019496929226
researchmap会員ID: 5000072181

研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 /

経歴

2018年4月 - 現在

理化学研究所, 生命系放射光利用システム開発チーム
2013年4月 - 2018年3月

理化学研究所, 生命系放射光利用システム開発ユニット
2001年7月 - 2013年3月

理化学研究所, 構造生物物理研究室
1995年4月 - 2001年6月

日本たばこ産業株式会社, 医薬総合研究所
1991年4月 - 1995年3月

日本たばこ産業株式会社, 生命科学研究所

学歴

大阪大学, 理学研究科

委員歴

2020年4月 - 現在

日本結晶学会, 編集委員
2018年4月 - 2020年3月

SPring-8 ユーザー協同体, 編集幹事
2015年10月 - 2017年9月

日本放射光学会, 編集幹事
2013年10月 - 2015年9月

日本放射光学会, 編集委員

受賞

2015年

日本結晶学会賞学術賞, X線自由電子レーザーを使った無損傷高分解能タンパク質構造解析法の開発, 日本結晶学会

吾郷日出夫

論文

XFEL crystallography reveals catalytic cycle dynamics during non-native substrate oxidation by cytochrome P450BM3

Satoshi Nagao, Wako Kuwano, Takehiko Tosha, Keitaro Yamashita, Joshua Kyle Stanfield, Chie Kasai, Shinya Ariyasu, Kunio Hirata, Go Ueno, Hironori Murakami …

Communications Chemistry 2025年3月12日査読有り
A high-resolution structural characterization and physicochemical study of how a peptoid binds to an oncoprotein MDM2

Marin Yokomine, Jumpei Morimoto, Yasuhiro Fukuda, Takumi Ueda, Koh Takeuchi, Koji Umezawa, Hideo Ago, Hiroaki Matsuura, Go Ueno, Akinobu Senoo …

Chemical Science 15(19) 7051-7060 2024年
StayGold variants for molecular fusion and membrane-targeting applications

Ryoko Ando, Satoshi Shimozono, Hideo Ago, Masatoshi Takagi, Mayu Sugiyama, Hiroshi Kurokawa, Masahiko Hirano, Yusuke Niino, Go Ueno, Fumiyoshi Ishidate …

Nature Methods 2023年11月30日
XFEL Crystal Structures of Peroxidase Compound II

Hanna Kwon, Jaswir Basran, Chinar Pathak, Mahdi Hussain, Samuel L Freeman, Alistair J Fielding, Anna J Bailey, Natalia Stefanou, Hazel A Sparkes, Takehiko Tosha …

Angewandte Chemie International Edition 2021年4月7日
An unprecedented insight into the catalytic mechanism of copper nitrite reductase from atomic-resolution and damage-free structures.

Samuel L Rose, Svetlana V Antonyuk, Daisuke Sasaki, Keitaro Yamashita, Kunio Hirata, Go Ueno, Hideo Ago, Robert R Eady, Takehiko Tosha, Masaki Yamamoto …

Science advances 7(1) 2021年1月
An oxyl/oxo mechanism for oxygen-oxygen coupling in PSII revealed by an x-ray free-electron laser.

Suga M, Akita F, Yamashita K, Nakajima Y, Ueno G, Li H, Yamane T, Hirata K, Umena Y, Yonekura S …

Science (New York, N.Y.) 366(6463) 334-338 2019年10月査読有り
A temperature-controlled cold-gas humidifier and its application to protein crystals with the humid-air and glue-coating method

Seiki Baba, Atsuhiro Shimada, Nobuhiro Mizuno, Junpei Baba, Hideo Ago, Masaki Yamamoto, Takashi Kumasaka

Journal of Applied Crystallography 52(4) 2019年8月査読有り
Catalytically important damage-free structures of a copper nitrite reductase obtained by femtosecond X-ray laser and room-temperature neutron crystallography

Thomas P. Halsted, Keitaro Yamashita, Chai C. Gopalasingam, Rajesh T. Shenoy, Kunio Hirata, Hideo Ago, Go Ueno, Matthew P. Blakeley, Robert R. Eady, Svetlana V. Antonyuk …

IUCrJ 6(4) 761-772 2019年7月査読有り
An oxyl/oxo mechanism for dioxygen bond formation in PSII revealed by X-ray free electron lasers

Suga, M, Akita, F, Yamashita, K, Nakajima, Y, Ueno, G, Li, H, Yamane, T, Hirata, K, Umena, Y, Yonekura, S …

Science in press 2019年査読有り
An unprecedented dioxygen species revealed by serial femtosecond rotation crystallography in copper nitrite reductase

Thomas P. Halsted, Keitaro Yamashita, Kunio Hirata, Hideo Ago, Go Ueno, Takehiko Tosha, Robert R. Eady, Svetlana V. Antonyuk, Masaki Yamamoto, S. Samar Hasnain

IUCrJ 5(1) 22-31 2018年査読有り
Capturing an initial intermediate during the P450nor enzymatic reaction using time-resolved XFEL crystallography and caged-substrate

Takehiko Tosha, Takashi Nomura, Takuma Nishida, Naoya Saeki, Kouta Okubayashi, Raika Yamagiwa, Michihiro Sugahara, Takanori Nakane, Keitaro Yamashita, Kunio Hirata …

NATURE COMMUNICATIONS 8(1) 1585 2017年11月査読有り
Experimental phase determination with selenomethionine or mercury-derivatization in serial femtosecond crystallography

Keitaro Yamashita, Naoyuki Kuwabara, Takanori Nakane, Tomohiro Murai, Eiichi Mizohata, Michihiro Sugahara, Dongqing Pan, Tetsuya Masuda, Mamoru Suzuki, Tomomi Sato …

IUCRJ 4(5) 639-647 2017年9月査読有り
Protein microcrystallography using synchrotron radiation

Masaki Yamamoto, Kunio Hirata, Keitaro Yamashita, Kazuya Hasegawa, Go Ueno, Hideo Ago, Takashi Kumasaka

IUCRJ 4(5) 529-539 2017年9月査読有り
A nanosecond time-resolved XFEL analysis of structural changes associated with CO release from cytochrome c oxidase

Atsuhiro Shimada, Minoru Kubo, Seiki Baba, Keitaro Yamashita, Kunio Hirata, Go Ueno, Takashi Nomura, Tetsunari Kimura, Kyoko Shinzawa-Itoh, Junpei Baba …

SCIENCE ADVANCES 3(7) e1603042 2017年7月査読有り
Observation of water-channel opening of cytochrome c oxidase by time-resolved XFEL crystallography

M. Kubo, A. Shimada, S. Baba, K. Yamashita, K. Hirata, M. Yamamoto, K. Shinzawa-Itoh, H. Ago, S. Yoshikawa, T. Tsukihara

EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS 46 S56-S56 2017年7月査読有り
Development of a dose-limiting data collection strategy for serial synchrotron rotation crystallography

Kazuya Hasegawa, Keitaro Yamashita, Tomohiro Murai, Nipawan Nuemket, Kunio Hirata, Go Ueno, Hideo Ago, Toru Nakatsu, Takashi Kumasaka, Masaki Yamamoto

JOURNAL OF SYNCHROTRON RADIATION 24(1) 29-41 2017年1月査読有り
Novel Features of Eukaryotic Photosystem II Revealed by Its Crystal Structure Analysis from a Red Alga

Hideo Ago, Hideyuki Adachi, Yasufumi Umena, Takayoshi Tashiro, Keisuke Kawakami, Nobuo Kamiya, Lirong Tian, Guangye Han, Tingyun Kuang, Zheyi Liu …

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 291(11) 5676-5687 2016年3月査読有り
A nearly on-axis spectroscopic system for simultaneously measuring UV-visible absorption and X-ray diffraction in the SPring-8 structural genomics beamline

Miyuki Sakaguchi, Tetsunari Kimura, Takuma Nishida, Takehiko Tosha, Hiroshi Sugimoto, Yoshihiro Yamaguchi, Sachiko Yanagisawa, Go Ueno, Hironori Murakami, Hideo Ago …

JOURNAL OF SYNCHROTRON RADIATION 23(1) 334-338 2016年1月査読有り
An isomorphous replacement method for efficient de novo phasing for serial femtosecond crystallography

Keitaro Yamashita, Dongqing Pan, Tomohiko Okuda, Michihiro Sugahara, Atsushi Kodan, Tomohiro Yamaguchi, Tomohiro Murai, Keiko Gomi, Naoki Kajiyama, Eiichi Mizohata …

SCIENTIFIC REPORTS 5 14017 2015年9月査読有り
High-resolution native structure analyses of supramacromolecular complexes susceptible to radiation damage

Hideo Ago, Kunio Hirata, Go Ueno, Masaki Yamamoto, Kyoko Shinzawa-Itoh, Tomitake Tsukihara, Shinya Yoshikawa, Michihiro Suga, Fusamichi Akita, Jian-Ren Shen

Acta Crystallographica Section A Foundations and Advances 71(a1) s15-s15 2015年8月査読有り

もっとみる

MISC

超高分解能X線結晶解析により解明された[2Fe-2S]型フェレドキシンの酸化還元に伴う構造変化

OHNISHI Yusuke, TANAKA Hideaki, OKUMURA Hideo, BABA Kiyoki, KAWANO Yoshiaki, KUMASAKA Takashi, TESHIMA Kezo, IKEGAMI Takahisa, IKEGAMI Takahisa, AGO Hideo …

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 100th 2020年
Crystallographic study on estimation of the valence of each of the four Mn atoms in Photosystem II using anomalous diffraction techniques

Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Nobuo Kamiya, Yoshiaki Kawano, Keitaro Yamashita, Hideo Ago, Masaki Yamamoto, Jian-Ren Shen

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES 75 A363-A363 2019年
Observation of water-channel opening of cytochrome c oxidase by time-resolved XFEL crystallography

M. Kubo, A. Shimada, S. Baba, K. Yamashita, K. Hirata, M. Yamamoto, K. Shinzawa-Itoh, H. Ago, S. Yoshikawa, T. Tsukihara

EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS 46 S149-S149 2017年7月
酵素反応機構解明のためのX線自由電子レーザーを利用した時間分解結晶構造解析

當舎武彦, 西田拓真, 西田拓真, 野村高志, 佐伯直哉, 佐伯直哉, 杉本宏, 山下恵太郎, 平田邦生, 吾郷日出夫 …

酸化反応討論会講演要旨集 50th 2017年
X線自由電子レーザーを利用した時間分解X線結晶構造解析による酵素反応の観測

當舎武彦, 西田拓真, 西田拓真, 野村高志, 佐伯直哉, 佐伯直哉, 杉本宏, 山下恵太郎, 平田邦生, 吾郷日出夫 …

生体分子科学討論会講演要旨集 44th 2017年
Fixed target serial crystallography at SACLA

Masaki Yamamoto, Hideo Ago, Kunio Hirata, Keitaro Yamashita, Go Ueno, Minoru Kubo, Seiki Baba, Kazuya Hasegawa, Takashi Kumasaka, Atsuhiro Shimada …

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES 73 A341-A341 2017年
生体高分子の微結晶構造解析における技術革新シリアルフェムト秒結晶学における異常分散を用いた位相決定

山下恵太郎, 岩田想, 吾郷日出夫, 山本雅貴, 中津亨

放射光 29(4) 204‐212-212 2016年7月
深紫外レーザータンパク質結晶加工機の性能評価

松本直記, 松本直記, 河野能顕, 吾郷日出夫, 吾郷日出夫, 馬場清喜, 上野剛, 平田邦生, 山下恵太郎, 熊坂崇 …

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 16th 126 2016年5月19日
X線自由電子レーザーを用いた,ポンプ・プローブ法によるチトクロム酸化酵素の時分割結晶構造解析

波多野啓太, 島田敦広, 宮本朱梨, 馬場清喜, 山下恵太郎, 久保稔, 吾郷日出夫, 平田邦生, 上野剛, 村上博則 …

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 16th 84 2016年5月19日
X線自由電子レーザーを用いた新規タンパク質の立体構造決定

山下恵太郎, 潘東青, 奥田智彦, 菅原道泰, 小段篤史, 山口知宏, 村井智洋, 溝端栄一, 鈴木守, 南後恵理子 …

日本薬学会年会要旨集 136年会(2) 249-249 2016年3月
フェムト秒Ｘ線レーザーを用いて決定した光化学系II複合体の無損傷構造

菅倫寛, 秋田総理, 沈建仁, 山本雅貴, 吾郷日出夫

日本結晶学会誌 58(3) 126-132 2016年
X線自由電子レーザーを用いたチトクロム酸化酵素の時分割構造解析から明らかとなった,銅イオンへの配位子結合によって制御されるプロトンポンプ経路の閉鎖メカニズム

島田敦広, 波多野啓太, 宮本朱梨, 伊藤(新澤, 恭子, 久保稔, 馬場清喜, 熊坂崇, 山本雅貴, 吾郷日出夫 …

日本生化学会大会(Web) 89th ROMBUNNO.3P‐143 (WEB ONLY) 2016年
SPring‐8タンパク質結晶解析ビームラインBL41XUの現状

長谷川和也, 奥村英夫, 馬場清喜, 水野伸宏, 村上博則, 平田邦生, 山下恵太郎, 上野剛, 吾郷日出夫, 中津亨 …

日本結晶学会年会講演要旨集 2015 93 2015年10月17日
シリアル結晶学における重原子誘導体を用いた位相決定

山下恵太郎, 潘東青, 長谷川和也, 菅原道泰, 村井智洋, 小段篤史, 溝端栄一, 鈴木守, 鈴木守, 桝田哲哉 …

日本結晶学会年会講演要旨集 2015 89 2015年10月
De novo structure determination for serial femtosecond crystallography using heavy atom derivatives

YAMASHITA Keitaro, PAN Dongqing, SUGAHARA Michihiro, AGO Hideo, YAMAMOTO Masaki, NAKATSU Toru, NAKATSU Toru

生物物理(Web) 55(Supplement 1-2) 1SGP-04 (WEB ONLY) 2015年8月18日
SACLAによるウシ心筋チトクロム酸化酵素の無損傷高分解能結晶構造解析

吾郷日出夫, 平田邦生, 上野剛, 村上博則, 山本雅貴, 山下栄樹, 伊藤(新澤)恭子, 加藤公児, 畑中美樹, 武村修平 …

日本結晶学会年会講演要旨集 2013 32 2013年10月12日
X線自由電子レーザーを用いたタンパク質の結晶構造解析 (特集 X線自由電子レーザーと注目の応用)

平田邦生, 吾郷日出夫, 月原冨武

オプトロニクス 31(8) 107-112 2012年8月
Internally bridging water molecule in transmembrane alpha-helical kink

Masashi Miyano, Hideo Ago, Hiromichi Saino, Tetsuya Hori, Koh Ida

CURRENT OPINION IN STRUCTURAL BIOLOGY 20(4) 456-463 2010年8月
HCV 由来ゲノム複製酵素の立体構造とその複製機構

宮野雅司, 吾郷日出夫

ウイルス 51(1) 73-79 2001年6月1日
Cloning and crystal structure of hematopoietic prostaglandin D synthase (vol 90, pg 1085, 1997)

Y Kanaoka, H Ago, E Inagaki, T Nanayama, M Miyano, R Kikuno, Y Fujii, N Eguchi, H Toh, Y Urade …

CELL 96(3) U25-U25 1999年2月

講演・口頭発表等

X線自由電子レーザーを光源とするフェムト秒X線結晶構造解析

吾郷日出夫

2017年度生命科学系学会合同年次大会 2017年12月9日招待有り
Native structure analysis of large metalloproteins using femtosecond crystallography.

Ago, H

Science@FEL 2016年9月5日招待有り
Development of a method of femtosecond crystallography enabling determination of high-resolution native structure of huge proteins.

吾郷日出夫

第53回日本生物物理学会年会 2015年9月13日招待有り
High-resolution native structure analyses of supramacromolecular complexes susceptible to radiation damage.

Ago, H, Hirata, K, Ueno, G, Yamamoto, M, Shinzawa-Itoh, K, Tsukihara, T, Yoshikawa, S, Suga, M, Akita, F, Shen, J-.R

29th European Crystallographic Meeting 2015年8月26日招待有り
High-Resolution Native Structure Determination of Photosystem II by Serial Femtosecond Rotation Crystallography at SACLA.

Ago, H, Hirata, K, Ueno, G, Yamamoto, M, Shinzawa-Itoh, K, Tsukihara, T, Yoshimawa, S, Suga, M, Akita, F, Shen, J.-R

Gordon Research Conference: X-ray Science 2015年7月29日招待有り
Radiation damage free protein crystallography.

Ago, H

Micro-Beam Workshop 2015年5月19日招待有り
Intact structure determination of highly radiation sensitive protein at SACLA.

Ago, H

The 2nd Ringberg Workshop on Structural Biology with FELs from first results to future perspectives 2015年2月25日招待有り
3. タンパク質の構造解析におけるXFELの可能性 −無損傷Ｘ線結晶構造解析から高速時分割解析への展望−

吾郷日出夫

第28回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム 2015年1月11日
4. フェムト秒観察でみたＸ線損傷のないタンパク質の構造 −タンパク質機能構造解析におけるSACLAの可能性 −

吾郷日出夫

第三回 SACLA利用に関するワークショップ 2014年10月4日招待有り
Intact structure determination of a highly radiation sensitive protein at SACLA.

Ago, H, Hirata, K, Shinzawa-Itoh, K, Yano, N, Tsukihara, T, Yamashita, E, Ueno, G, Murakami, H, Yoshikawa, S, Yamamoto, M

The 23rd Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography 2014年8月8日
Determination of damage-free crystal structure of an X-ray sensitive protein using SACLA

Ago, H, Hirata, K, Shinzawa-Itoh, K, Yano, N, Tsukihara, T, Yamashita, E, Ueno, G, Murakami, H, Yoshikawa, S, Yamamoto, M

RD8 2014 workshop, X-ray Radiation Damage to Biological Crystalline Samples. 2014年4月11日招待有り
Femtosecond crystallography at SACLA for the molecular functional analysis based on natural structure free of radiation damage

Ago, H, Hirata, K, Shinzawa-Itoh, K, Yano, N, Takemura, S, Kato, K, Hatanaka, M, Muramoto, K, Kawahara, T, Kubo, M, Tsukihara, T, Yamashita, E, Ueno, G, Hikima, T, Murakami, H, Ogura, T, Yoshikawa, S, Yamamoto, M

1st International Picobiology Institute Symposium 2014年1月8日招待有り
5. 新たな超高輝度光源が拓く膜タンパク質結晶構造解析のフロンティア

吾郷日出夫

タンパク質研究所セミナー、量子ビームの連携利用に向けた新しいタンパク質結晶学 2013年12月18日招待有り
Femtosecond crystallography at SACLA targeting high-resolution crystal structure determination of large biological macromolecules free of radiation damage.

Ago, H, Hirata, K, Ueno, G, Murakami, H, Yamamoto, M, Shinzawa-Ito, K, Kato, K, Hatanaka, M, Takemura, S, Yano, N, Yamashita, E, Sugimoto, H, Shen, J.-R, Ogura, T, Tsukihara, T, Yoshikawa, S

The 12th conference of the Asian crystallographic association 2013年12月9日招待有り
High-resolution femtosecond crystallography at SACLA, a challenge of reducing the X-ray radiation damage on super molecular assemblies.

Ago, H, Hirata, K, Ueno, G, Murakami, H, Tosha, T, Hisano, T, Kubo, M, Sugimoto, H, Shiro, Y, Yamamoto, M, Yamashita, E, Shen, J.-R, Shinzawa-Ito, K, Kato, K, Hatanaka, M, Takemura, S, Yano, N, Ogura, T, Yoshikawa, S, Tsukihara, T

11th international conference biology and synchrotron radiation 2013年9月11日
6. Protein crystallography free from radiation damage at SACLA.

吾郷日出夫

The 2nd annual meeting for whole-organism science society / The 11th annual meeting of structural-biological whole cell project 2012年9月28日招待有り
X-ray Protein Crystallography Free from Radiation Damage at SACLA

Ago, H, Shen, J.-R, Ueno, G, Hirata, K, Hikima, T, Murakami, H, Koua, F, Yamashita, E, Yamamoto, M

he 17th Sagamore Conference on charge, Spin and Momentum Densities 2012年7月19日招待有り
The catalytic architecture of Leukotriene C4 Synthase with two arginine residues.

Saino, H, Ukita, Y, Ago, H, Miyano, M

XXII congress and general assembly of the international union of crystallography 2011年8月
7. Synchrotron radiation structural biology of proteins functioning at biological membrane

吾郷日出夫

第27回内藤コンファレンス 2010年6月30日招待有り
The distinct role of two arginine residues in the leukotriene A4 specific glutathione S-transferase activity of LTC4 synthase.

Saino, H, Ukita, Y, Ago, H, Irikura, D, Kanaoka, Y, Lam, B.K, Austen, K. F, Miyano, M

Keystone Symposia Conference: Bioactive Lipids: Biochemistry and Diseases 2010年6月7日

もっとみる

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

脂質性情報伝達物質を産生する膜タンパク質の脂溶性分子認識機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2015年4月 - 2018年3月

吾郷日出夫
αへリックスの構造変化が不可欠な活性型プロスタグランジンＥ２合成酵素１の構造研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2011年 - 2013年

吾郷日出夫, 齊野廣道
膜貫通型蛋白質マイクロゾーマルプロスタグランジンE2合成酵素1のX線結晶構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2008年 - 2010年

吾郷日出夫
脂質ラフト理解のためのスフィンゴミエリン代謝系酵素のX線結晶構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2005年 - 2006年

津下英明, 勝沼信彦, 櫻井純, 宮野雅司, 吾郷日出夫
脂質関連蛋白質の構造生物学研究

吾郷日出夫

基本情報

研究分野

経歴

学歴

委員歴

受賞

論文

MISC

講演・口頭発表等

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

メニュー

共著者の一覧