西田 洋巳

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研究者氏名
西田 洋巳
 
ニシダ ヒロミ
所属
富山県立大学
部署
工学部 生物工学科
職名
教授
学位
博士(農学)(東京大学)

研究キーワード

 
 

研究分野

 
 

経歴

 
2013年4月
 - 
現在
富山県立大学工学部生物工学科 教授
 
2005年11月
 - 
2013年3月
東京大学大学院農学生命科学研究科 特任准教授
 
2003年7月
 - 
2005年10月
理化学研究所ゲノム科学総合研究センター 研究員
 
1997年4月
 - 
2003年6月
東京大学分子細胞生物学研究所 助手
 
1996年4月
 - 
1997年3月
理化学研究所 基礎科学特別研究員
 
1994年4月
 - 
1996年3月
日本学術振興会 特別研究員 (DC, PD)
 

学歴

 
1990年4月
 - 
1995年3月
東京大学大学院 農学生命科学研究科 応用生命工学専攻
 
1988年4月
 - 
1990年3月
東京大学 農学部 農芸化学科
 
1986年4月
 - 
1988年3月
東京大学 教養学部 理科2類
 

論文

 
Kami S, Tsuchikado R, Nishida H*
AIMS Microbiology   5 347-357   2019年10月   [査読有り]
Akaike M, Miyagawa H, Kimura Y, Terasaki M, Kusaba Y, Kitagaki H, Nishida H*
Current Microbiology   in press    2019年9月   [査読有り]
Morita Y, Okumura M, Narumi I, Nishida H*
AIMS Microbiology   5 176-185   2019年8月   [査読有り]
Nishino K, Tsuchikado R, Nishida H*
FEMS Microbiology Letters   366 fnz087   2019年5月   [査読有り]
西田洋巳
富山県立大学紀要   29 77-83   2019年3月
Nishino K, Nishida H*
FEMS Microbiology Letters   366 fny282   2019年3月   [査読有り]
Morita Y, Nishida H*
Open Bioinformatics Journal   11 252-258   2018年11月   [査読有り]
Nishino K, Morita Y, Takahashi S, Okumura M, Shiratani S, Umemura K, Narumi I, Kondo C, Ochiai R, Oshima T, Nishida H*
Microbiology   164 1361-1371   2018年10月   [査読有り]
Nishino K, Takahashi S, Nishida H*
Journal of General and Applied Microbiology   64 117-120   2018年6月   [査読有り]
Morita Y, Narumi I, Nishida H
Bulletin of Toyama Prefectural University   28 41-43   2018年3月
Nakazawa M, Nishida H*
Jacobs Journal of Biotechnology and Bioengineering   3 014   2017年11月   [査読有り]
Terasaki M, Fukuyama A, Takahashi Y, Yamada M, Nishida H*
Current Microbiology   74 1432-1437   2017年11月   [査読有り]
Nishino K, Nishida H*
Journal of General and Applied Microbiology   63 203-206   2017年7月   [査読有り]
Nakamiya H, Ijima S, Nishida H*
AIMS Microbiology   3 136-142   2017年3月   [査読有り]
Shimizu T, Yin L, Yoshida A, Yokooji Y, Hachisuka S-I, Sato T, Tomita T, Nishida H, Atomi H, Kuzuyama T, Nishiyama M*
Biochemical Journal   474 105-122   2017年3月   [査読有り]
西田洋巳
富山県立大学紀要   27 44-47   2017年3月
畠俊郎, 高橋裕里香, 西田洋巳, 安田尚登
地盤工学ジャーナル   12 151-160   2017年3月   [査読有り]
Nakazawa M, Nishida H*
Journal of General and Applied Microbiology   63 58-61   2017年3月   [査読有り]
Nishida H*, Oshima T
Journal of General and Applied Microbiology   63 28-35   2017年3月   [査読有り]
Takahashi S, Takayanagi A, Takahashi Y, Oshima T, Nishida H*
AIMS Microbiology   2(2) 152-189   2016年5月   [査読有り]
Takahashi S, Nishida H
Bulletin of Toyama Prefectural University   26 27-30   2016年3月
Yamauchi K, Kondo S, Hamamoto M, Suzuki Y, Nishida H*
AIMS Microbiology   2 69-91   2016年3月   [査読有り]
Takayanagi A, Takahashi S, Nishida H*
Journal of General and Applied Microbiology   62(1) 14-17   2016年2月   [査読有り]
Takahashi S, Nishida H*
Journal of General and Applied Microbiology   61(6) 262-265   2016年1月   [査読有り]
Yamauchi K, Kondo S*, Hamamoto M, Takahashi Y, Ogura Y, Hayashi T, Nishida H*
Genome Announcements   3(3) e00220-15   2015年5月   [査読有り]
Nishida H
Journal of General and Applied Microbiology   61(1) 24-26   2015年3月   [査読有り]
西田洋巳
富山県立大学紀要   25 7-13   2015年3月
Takahashi Y, Shintani M, Takase N, Kazo Y, Kawamura F, Hara H, Nishida H, Okada K, Yamane H, Nojiri H*
Environmental Microbiology   17 134-155   2015年1月   [査読有り]
Nishida H
Recent Advamces in DNA & Gene Sequences   8(1) 10-14   2014年10月   [査読有り]
Nishida H*, Matsumoto T, Kondo S, Hamamoto M, Yoshikawa H
Journal of General and Applied Microbiology   60(1) 7-12   2014年2月   [査読有り]
Nishida H*, Katayama T, Suzuki Y, Kondo S, Horiuchi H
Gene   525(1) 5-10   2013年8月   [査読有り]
Ouchi T, Tomita T, Horie A, Yoshida A, Takahashi K, Nishida H, Lassak K, Taka H, Mineki R, Fujimura T, Kosono S, Nishiyama C, Masui R, Kuramitsu S, Albers S-V, Kuzuyama T, Nishiyama M*
Nature Chemical Biology   9(4) 277-283   2013年3月   [査読有り]
Nishida H
Report of the Noda Institute for Scientific Research   57 38-39   2013年   [招待有り]
Nishida H
Current Issues in Molecular Biology   15 19-24   2013年   [査読有り]
Nishida H
Frontiers in Microbiology   3 Art. no. 420   2012年11月   [査読有り]
Nishida H
ISRN Molecular Biology   2012 Art. ID 245706   2012年9月   [査読有り]
Nishida H*, Kondo S, Matsumoto T, Suzuki Y, Yoshikawa H, Taylor TD, Sugiyama J
Open Biology   2 Art. ID 120043   2012年   [査読有り]
Ueda K*, Nishida H, Beppu T
International Journal of Evolutionary Biology   2012 Art. ID 324549   2012年   [査読有り]
Nishida H*, Nishiyama M
International Journal of Evolutionary Biology   2012 Art. ID 745931   2012年   [査読有り]
Nishida H
International Journal of Evolutionary Biology   2012 Art. ID 342482   2012年   [査読有り]
Nishida H
The Scientific World Journal   2012 Art. ID 298174   2012年   [査読有り]
Nishida H
International Journal of Evolutionary Biology   2012 Art. ID 254941   2012年   [査読有り]
Nishida H*, Abe R, Nagayama T, Yano K
International Journal of Evolutionary Biology   2012 Art. ID 205274   2012年   [査読有り]
Nishida H*, Beppu T, Ueda K
Genomics   98(5) 370-375   2011年11月   [査読有り]
Shintani M, Tokumaru H, Takahashi Y, Miyakoshi M, Yamane H, Nishida H, Nojiri H*
Plasmid   66(2) 85-92   2011年7月   [査読有り]
Nishida H*, Yun CS
Mobile Genetic Elements   1(1) 78-79   2011年5月   [査読有り][招待有り]
Yun CS, Nishida H*
PLoS ONE   6 Art. ID e16548   2011年1月   [査読有り]
Matsumoto T, Yun CS, Yoshikawa H, Nishida H*
PLoS ONE   6 Art. ID e16372   2011年1月   [査読有り]
菌類の遺伝子プロモータ領域におけるクロマチン構造の比較に基づく系統分類学研究
西田洋巳
IFO Research Communications   (25) 41-53   2011年   [招待有り]
Nishida H*, Hamamoto M, Sugiyama J
Journal of General and Applied Microbiology   57(4) 243-246   2011年   [査読有り]
Nishida H, Kondo S, Nojiri H, Noma K, Oshima K
International Journal of Evolutionary Biology   2011 Art. ID 319479   2011年   [招待有り]
Nishida H*, Nagatsuka Y, Sugiyama J
Journal of General and Applied Microbiology   57(1) 63-67   2011年   [査読有り]
シンビオバクテリウムにみる微生物共生の深淵
上田賢志, 和辻智郎, 高野(白鳥)初美, 高野英晃, 西田洋巳, 別府輝彦
生物工学会誌   89 469-472   2011年   [招待有り]
Nishida H*, Yun CS
International Journal of Evolutionary Biology   2011 Art. ID 634505   2010年12月   [査読有り]
Oshima K, Ueda K, Beppu T, Nishida H*
International Journal of Evolutionary Biology   2011 Art. ID 376831   2010年12月   [査読有り]
Yun CS, Suzuki C, Naito K, Takeda T, Takahashi Y, Sai F, Terabayashi T, Miyakoshi M, Shintani M, Nishida H, Yamane H, Nojiri H*
Journal of Bacteriology   192(18) 4720-4731   2010年9月   [査読有り]
Shintani M, Takahashi Y, Tokumaru H, Kadota K, Hara H, Miyakoshi M, Naito K, Yamane H, Nishida H, Nojiri H*
Environmental Microbiology   12(6) 1413-1426   2010年6月   [査読有り]
西田洋巳
化学と生物   48(6) 379-380   2010年6月   [査読有り][招待有り]
Nishida H*, Motoyama T, Suzuki Y, Yamamoto S, Aburatani H, Osada H
PLoS ONE   5 Art. ID e9916   2010年3月   [査読有り]
Oshima K, Hoshi A, Ishii Y, Kakizawa S, Kawanishi T, Kojima N, Sugawara K, Ishii Y, Nishida H, Namba S
Japanese Journal of Mycoplasmology   36 74-77   2010年3月   [招待有り]
Gene transfer, synthetic organisms, and the origins of life
Nishida H
Journal of Cosmology   8 6   2010年   [査読有り][招待有り]
High adaptability of bacteria for extreme environments
Nishida H
Journal of Cosmology   13 3625-3627   2010年   [査読有り][招待有り]
西田洋巳, 別府輝彦, 上田賢志
化学と生物   47(11) 748-749   2009年11月   [査読有り][招待有り]
Nishida H*, Motoyama T, Yamamoto S, Aburatani H, Osada H
Bioinformatics   25(18) 2295-2297   2009年9月   [査読有り]
Miyakoshi M, Nishida H, Shintani M, Yamane H, Nojiri H*
BMC Genomics   10 Art. no. 12   2009年1月   [査読有り]
Nishida H, Beppu T, Ueda K*
Journal of Molecular Evolution   68(1) 90-96   2009年1月   [査読有り]
Nishida H
Comparative and Functional Genomics   2009 Art. ID 379317   2009年   [査読有り]
Nishida H
Open Systems Biology Journal   2 1-7   2009年   [査読有り]
Nishida H*, Kondo S, Suzuki T, Tsujimura Y, Komatsu S, Wakayama T, Hayashizaki Y
Mammalian Genome   19(10-12) 667-674   2008年10月   [査読有り]
Oshima K, Nishida H*
Journal of Molecular Evolution   66(5) 529-532   2008年5月   [査読有り]
海洋に分布する微生物の多様性に関する研究
西田洋巳
財団法人ソルト・サイエンス研究財団助成研究報告集 2006年度   285-291   2008年
Oshima K, Nishida H*
Journal of Molecular Evolution   65(3) 249-258   2007年9月   [査読有り]
Nishida H*, Ohnishi Y, Beppu T, Horinouchi S
Environmental Microbiology   9(8) 1986-1994   2007年8月   [査読有り]
Nishida H*, Narumi I
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry   71(4) 1015-1020   2007年4月   [査読有り]
野尻秀昭, 宮腰昌利, 新谷政己, 西田洋巳
化学と生物   45 635-643   2007年   [査読有り][招待有り]
Nishida H
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry   70(11) 2646-2652   2006年11月   [査読有り]
Nishida H*, Suzuki T, Kondo S, Miura H, Fujimura Y, Hayashizaki Y*
Chromosome Research   14(2) 203-211   2006年   [査読有り]
Katayama S, Tomaru Y, Kasukawa T, Waki K, Nakanishi M, Nakamura M, Nishida H, Yap CC, Suzuki M, Kawai J, Suzuki H, Carninci P*, Hayashizaki Y*, Wells C, Frith M, Ravasi T, Pang KC, Hallinan J, Mattick J, Hume DA, Lipovich L, Batalov S, Engström PG, Mizuno Y, Faghihi MA, Sandelin A, Chalk AM, Mottagui-Tabar S, Liang Z, Lenhard B, Wahlestedt C*
Science   309(5740) 1564-1566   2005年9月   [査読有り]
Nishida H*, Suzuki T, Ookawa H, Tomaru Y, Hayashizaki Y
BMC Genomics   6 Art. no. 108   2005年8月   [査読有り]
Nishida H*, Tomaru Y, Oho Y, Hayashizaki Y
BMC Genetics   6 Art. no. 23   2005年5月   [査読有り]
Nishida H*, Suzuki T, Tomaru Y, Hayashizaki Y
BMC Genetics   6 Art. no. 10   2005年2月   [査読有り]
西田洋巳
蛋白質核酸酵素   49(17) 2684-2687   2004年12月   [招待有り]
Lutzoni F*, Kauff F, Cox CJ, McLaughlin D, Celio G, Dentinger B, Padamsee M, Hibbett D, James TY, Baloch E, Grube M, Reeb V, Hofstetter V, Schoch C, Arnold AE, Miadlikowska J, Spatafora J, Johnson D, Hambleton S, Crockett M, Shoemaker R, Sung GH, Lücking R, Lumbsch T, O'Donnell K, Binder M, Diederich P, Ertz D, Gueidan C, Hansen K, Harris RC, Hosaka K, Lim YW, Matheny B, Nishida H, Pfister D, Rogers J, Rossman A, Schmitt I, Sipman H, Stone J, Sugiyama J, Yahr R, Vilgalys R
American Journal of Botany   91 1446-1480   2004年10月   [査読有り]
An KD, Nishida H*, Miura Y, Yokota A
BMC Evolutionary Biology   3 Art. no. 9   2003年5月   [査読有り]
Sobajima H, Takeda M, Sugimori M, Kobashi N, Kiribuchi K, Cho EM, Akimoto C, Yamaguchi T, Minami E, Shibuya N, Schaller F, Weiler EW, Yoshihara T, Nishida H, Nojiri H, Omori T, Nishiyama M, Yamane H*
Planta   216(4) 692-698   2003年2月   [査読有り]
Nishida H*, Narumi I
Microbiology   148(9) 2911-2914   2002年9月   [査読有り]
Sjamsuridzal W, Nishida H*, Yokota A
Journal of General and Applied Microbiology   48(2) 121-123   2002年4月   [査読有り]
An KD, Nishida H*, Miura Y, Yokota A
BMC Evolutionary Biology   2 Art. no. 6   2002年4月   [査読有り]
Nishida H
Bioinformatics   17(2) 189-191   2001年   [査読有り]
Nishida H
Bioinformatics   17(12) 1224-1225   2001年   [査読有り]
Ohno M, Shiratori H, Park MJ, Saitoh Y, Kumon Y, Yamashita N, Hirata A, Nishida H, Ueda K, Beppu T*
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology   50(5) 1829-1832   2000年9月   [査読有り]
Nishida H*, Ogura A, Yokota A, Yamaguchi I, Sugiyama J
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry   64(3) 606-609   2000年3月   [査読有り]
微生物の進化に興味がある者として
西田洋巳
SHINKA   10 40-41   2000年
西田 洋巳
日産科学振興財団研究報告書   23 169-171   2000年
菌類のDNAと系統進化
西田洋巳
国立科学博物館ニュース   (375) 8-9   2000年   [招待有り]
Nishida H*, Nishiyama M
Journal of Molecular Evolution   51(3) 299-302   2000年   [査読有り]
Nishida H, Nishiyama M*, Kobashi N, Kosuge T, Hoshino T, Yamane H
Genome Research   9(12) 1175-1183   1999年12月   [査読有り]
遺伝子の水平移動と進化
西田洋巳
SHINKA   9 76   1999年

書籍等出版物

 
DNA traffic in the environment
Nishida H, Oshima T (担当:編者)
Springer   2019年3月   
Dickinson M, Hodgetts J (eds) Phytoplasma: Methods and Protocols. Methods in Molecular Biology, vol. 938
Nishida H (pp. 319-327) (担当:分担執筆, 範囲:Phylogenetic analyses of phytoplasmas based on whole-genome comparison)
Humana Press   2013年   
Nishida H, Kondo S, Nojiri H, Noma K, Oshima K (eds) Special Issue on Evolutionary Mechanisms of Microbial Genomes 2012, International Journal of Evolutionary Biology
Hindawi Publishing Corporation   2012年   
Kurtzman CP, Fell JW, Boekhout T (eds) The Yeasts, a taxonomic study, 5th ed.
Nishida H, Robert V, Sugiyama J (pp. 1499-1502) (担当:分担執筆, 範囲:Mixia C.L. Kramer emend. H. Nishida, K. Ando, Y. Ando, Hirata & Sugiyama)
Elsevier, Amsterdam   2011年   
Nishida H, Kondo S, Nojiri H, Noma K, Oshima K (eds) Special Issue on Evolutionary Mechanisms of Microbial Genomes, International Journal of Evolutionary Biology
SAGE-Hindawi Access to Research   2011年   
杉山純多 (編) 菌類・細菌・ウイルスの多様性と系統
西田洋巳, 杉山純多 (pp. 111-120); 西田洋巳 (pp. 121-133); 西田洋巳 (pp. 219-221) (担当:分担執筆, 範囲:化学分類学的形質からみた多様性と系統; 遺伝情報からみた多様性と系統進化; 古生子嚢菌綱)
裳華房, 東京   2005年   
鈴木昭憲, 荒井綜一 (編) 農芸化学の事典
西田洋巳 (pp. 490-494) (担当:分担執筆, 範囲:進化)
朝倉書店, 東京   2003年   
日本の微生物分類-この20年
西田洋巳 (pp. 125-126); 西田洋巳 (pp. 129-130) (担当:分担執筆, 範囲:古生子嚢菌類; サビ菌類・菌じん類)
日本微生物分類研究会   2000年   
長谷川篤彦 (編) 獣医診療ハンドブック
西田洋巳, 杉山純多 (pp. 466-470) (担当:分担執筆, 範囲:菌類の系統分類)
インターズー   1999年   
Colwell RR, Simidu U, Ohwada K (eds) Microbial diversity in time and space
Sugiyama J, Nagahama T, Nishida H (pp. 41-51) (担当:分担執筆, 範囲:Fungal diversity and phylogeny with emphasis on 18S ribosomal DNA sequence divergence)
Plenum Press, New York   1996年   
Arai R, Kato M, Doi Y (eds) Biodiversity and Evolution
Sugiyama J, Nishida H (pp. 177-195) (担当:分担執筆, 範囲:The higher fungi: their evolutionary relationships and implications for fungal systematics)
National Science Museum Foundation, Tokyo, Japan   1995年   
遺伝生態の諸問題
杉山純多, 西田洋巳 (pp. 87-103) (担当:分担執筆, 範囲:高等菌類の系統進化:形態と分子から探る)
東北大学遺伝生態研究センター   1995年   
Reynolds DR, Taylor JW (eds) The Fungal Holomorph: mitotic, meiotic and pleomorphic speciation in fungal systematics
Sugiyama J, Nishida H, Suh S-O (pp. 261-269) (担当:分担執筆, 範囲:The paradigm of fungal diagnoses and descriptions in the era of molecular systematics: Saitoella complicata as an example)
CAB International, Wallingford, UK   1993年   

講演・口頭発表等

 
rodZ欠失のDeinococcus grandisのスフェロプラストはCa2+感受性が高まり巨大化しやすい
森田裕介, 奥村真衣, 鳴海一成, 西田洋巳
日本農芸化学会 関西・中部支部合同神戸大会   2019年9月22日   
金属イオンがバクテリアスフェロプラストの巨大化に与える影響
西田洋巳, 西野弘起
日本農芸化学会2019年度大会   2019年3月27日   
バクテリアのスフェロプラスト巨大化 [招待有り]
西田洋巳
日本農芸化学会2018年度大会シンポジウム「バクテリア細胞膜の機能および構造研究の新展開」   2018年3月18日   
アーキアのヒストンの分布はアーキアのゲノム塩基組成と関連している
西田洋巳, 大島拓
第12回日本ゲノム微生物学会年会   2018年3月6日   
日本酒に含まれるDNAの網羅的シークエンスに基づく製造過程のモニタリング
西田洋巳
富山県立大学リエゾンサポーター交流会   2017年11月15日   
海洋を漂うプラスミドDNAが生物進化に与える影響
西田洋巳
キヤノン財団第5回「理想の追求」シンポジウム   2017年7月28日   
お酒の中のDNA [招待有り]
西田洋巳
弘前大学食料科学研究所サイエンスカフェ   2017年2月19日   
日本酒に含まれるバクテリアDNA [招待有り]
西田洋巳
平成28年度第3回富山県立大学地域連携公開セミナー   2017年1月12日   
細菌スフェロプラスト巨大化
西田洋巳
第3回東京大学・富山県立大学生物工学合同セミナー   2016年11月22日   
巨大化スフェロプラストの基礎および応用研究
西田洋巳
平成28年度生物工学研究センター・ERATO研究成果合同発表会   2016年9月21日   
DNA sequence bias between exonic and intronic regions causes nucleosome density difference in the filamentous ascomycetes Aspergillus [招待有り]
Hiromi Nishida
1st International Caparica Conference in Splicing, Splicing 2016   2016年9月13日   
ヌクレオソーム形成とDNA塩基配列の偏り
西田洋巳
第2回東京大学・富山県立大学生物工学セミナー   2015年11月25日   
細胞工学とゲノム工学の融合を目指して
西田洋巳
富山県立大学生物工学研究センター成果発表会   2015年9月30日   
古生子嚢菌類Saitoella complicataのRNAマップ解析およびヌクレオソームマップ解析
山内健太, 近藤伸二, 浜本牧子, 鈴木穣, 西田洋巳
2015年度日本農芸化学会中部・関西支部合同大会   2015年9月20日   
古生子嚢菌類Saitoella complicataのゲノム解析
山内健太, 近藤伸二, 浜本牧子, 高橋裕里香, 小椋義俊, 林哲也, 鈴木穣, 西田洋巳
新学術領域「ゲノム支援」2015年度拡大班会議   2015年8月27日   
海洋を漂うプラスミドDNAが生物進化に与える影響
西田洋巳, 野尻秀昭, 高橋裕里香, 畠俊郎
キヤノン財団第3回「理想の追求」シンポジウム   2015年6月22日   
好気性海洋性紅色光合成細菌の細胞巨大化と脱巨大化
野尻茜, 荻田信二郎, 磯貝康弘, 西田洋巳
第9回日本ゲノム微生物学会年会   2015年3月8日   
微生物におけるサイズと機能 [招待有り]
西田洋巳
日本学術会議公開シンポジウム「分野横断型農学の新展開に向けて―物理学・数理学の視点とその重要性―」   2015年3月4日   
好気性紅色光合成細菌の細胞巨大化と脱巨大化
野尻茜, 西田洋巳
第5回醗酵学フォーラム   2014年11月23日   
海洋を漂うプラスミドDNAが生物進化に与える影響
西田洋巳
キャノン財団第2回「理想の追求」シンポジウム   2014年7月4日   
アスペルギルスのヌクレオソーム形成に関する研究
西田洋巳
野田産研研究助成研究成果報告会   2014年5月28日   
菌類におけるエキソン、イントロン、塩基組成とヌクレオソーム形成 [招待有り]
西田洋巳
日本農芸化学会2014年度大会 シンポジウム「微生物ゲノム設計の時代に塩基組成の機能と進化を再考する」   2014年3月30日   
菌類のヌクレオソームマップ解析から見えること
西田洋巳
第6回北陸合同バイオシンポジウム   2013年11月9日   
菌類ヌクレオソームマップ解析
西田洋巳
富山県立大学生物工学研究センター成果発表会   2013年10月18日   
ゲノムにおける塩基置換の偏り [招待有り]
西田洋巳
日本農芸化学会2013年度大会 シンポジウム「バクテリア・コード:バクテリアの基本OSとは何か?」   2013年3月27日   
ゲノム塩基配列の偏りとバクテリア、アーキアの進化 [招待有り]
西田洋巳
第35回日本分子生物学会年会 ワークショップ「原核生物における種の定義:新時代のゲノム微生物学から種の規定を考える」   2012年12月12日   
ゲノム塩基置換と生物進化 [招待有り]
西田洋巳
東京農業大学 バイオサイエンスセミナー   2012年11月29日   
ゲノム配列からみた系統 [招待有り]
西田洋巳
日本進化学会第14回東京大会 ワークショップ「種(species)とは何なのか?原核生物での根源的な問い」   2012年8月   
ゲノム塩基配列の偏り、機能、進化 [招待有り]
西田洋巳
宮崎大学IR推進機構セミナー「ゲノムを基盤とした次世代微生物学研究の展開」   2012年7月   
担子菌類のヌクレオソームマップ解析
西田洋巳, 近藤伸二, 松本貴嗣, 鈴木穣, 吉川博文, Todd D. Taylor, 杉山純多
第6回日本ゲノム微生物学会   2012年3月   
ゲノム進化における個を維持するシステム
西田洋巳
第6回日本ゲノム微生物学会 シンポジウム「原核微生物における生物種とは何か?: 新時代のゲノム微生物学から種の規定を考える」   2012年3月   
菌類重複遺伝子およびオルソログ遺伝子間におけるヌクレオソーム位置の比較
西田洋巳
日本農芸化学会2012年度大会   2012年3月   
微生物ゲノム塩基組成の深遠さ
西田洋巳
日本農芸化学会2012年度大会 シンポジウム「ゲノムを知って作る:ゲノムはどこに向かうのか?」   2012年3月   
Comparative studies of fungal nucleosome positioning [招待有り]
Nishida H
15th Fungal Genetics and Biology Conference of the Microbiological Society of Korea   2012年1月   
微生物ゲノム比較とその進化
西田洋巳
第2回醗酵学フォーラム   2011年11月   
菌類におけるヒストン遺伝子内イントロンの進化
西田洋巳, 尹忠銖
第11回糸状菌分子生物学コンファレンス   2011年11月   
Comparison of nucleosome positions in promoters of orthologous genes between Aspergillus fumigatus and Sacchromyces cerevisiae
Nishida H
4th International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology   2011年9月   
菌類のヌクレオソームマッピング比較解析 [招待有り]
西田洋巳
第5回日本ゲノム微生物学会若手の会研究会   2011年9月   
菌類のヌクレオソームマップ解析の意義 [招待有り]
西田洋巳
第32回糸状菌遺伝子研究会   2011年6月   
菌類の遺伝子プロモータ領域におけるクロマチン構造の比較に基づく系統分類学研究
西田洋巳
公益財団法人発酵研究所第5回助成研究報告会   2011年6月   
Nucleosomal DNA length and nucleosome positioning [招待有り]
Nishida H
2nd World DNA and Genome Day   2011年4月   
微生物ゲノム比較に基づく系統樹の作成方法
西田洋巳
微生物インフォマティクス・フォーラム研究交流会   2011年3月   
Genome-wide maps of nucleosomes of TSA-treated and untreated cells of Aspergillus fumigatus
Nishida H, Motoyama T, Suzuki Y, Yamamoto S, Aburatani H, Osada H
9th International Mycological Congress, Symposium "Fungal epigenetics"   2010年8月   
Genome-wide map of fungal nucleosomes by the massively parallel DNA sequencing [招待有り]
Nishida H
Seminar, Center for Informational Biology, Ochanomizu University   2010年5月   
トリコスタチンA処理のAspergillus fumigatusにおけるゲノムワイドヌクレオソームマップ解析
西田洋巳, 本山高幸, 鈴木穣, 山本尚吾, 油谷浩幸, 長田裕之
第4回日本ゲノム微生物学会   2010年3月   
比較ゲノム学アプローチによる微生物の代謝ネットワークの多様性解析 [招待有り]
西田洋巳
日本農芸化学会2010年度大会 シンポジウム「多面的アプローチによる微生物のエネルギー代謝研究の新化とモノづくりへの展開」   2010年3月   
Aspergillus fumigatusのヌクレオソームマップ解析 [招待有り]
西田洋巳, 本山高幸, 山本尚吾, 油谷浩幸, 長田裕之
第9回糸状菌分子生物学コンファレンス シンポジウム「ゲノム情報解析とその利用研究の最前線」   2009年11月   
カビの全ゲノムワイドヌクレオソームマップ解析
西田洋巳, 本山高幸, 山本尚吾, 油谷浩幸, 長田裕之
第3回日本ゲノム微生物学会   2009年3月   
枯草菌に水平伝播させたラン藻全ゲノムからの転写様式 [招待有り]
西田洋巳, 板谷光泰
日本農芸化学会2009年度大会   2009年3月   
ゲノム情報に基づく微生物機能解析 [招待有り]
西田洋巳
岡山大学次世代研究者・異分野研究連携コア育成支援事業「微生物研究における異分野融合」第4回講演会   2008年10月   
シアノバチルスのトランスクリプトーム解析 [招待有り]
西田洋巳, 板谷光泰
明治大学ワークショップ「大規模オミックス・データの利用と展望」   2008年9月   
微生物ゲノムとインフォマティクス [招待有り]
西田洋巳
第1回アグリバイオインフォマティクス研究会   2008年7月   
"シアノバチルス"におけるRNAマッピング
西田洋巳, 板谷光泰
第2回日本ゲノム微生物学会年会   2008年3月   
Exhaustive analysis of RNA expression in the cells containing of a genome combining the Synechocystis genome and the Bacillus genome [招待有り]
Nishida H, Itaya M
The University of Tokyo International Symposium, Frontier of Microbial and Plant Biotechnology in Environmental and Life Sciences   2007年12月   
微生物のポストゲノムもおもしろい [招待有り]
西田洋巳
第6回微生物研究会~微生物の潜在能力を探る~   2007年7月   
海洋に分布する微生物の多様性に関する研究
西田洋巳
ソルト・サイエンス研究財団第19回平成18年度助成研究発表会   2007年7月   
タイリングアレイを用いた網羅的検出の有用性 [招待有り]
西田洋巳
第2回機能ゲノミクス研究会   2007年4月   
微生物ゲノム情報を基盤とした微生物学の展開 [招待有り]
西田洋巳
農学生命情報科学の大学院教育研究ユニット第3回シンポジウム   2007年3月   
全ゲノム情報に基づくマイコプラズマ類の系統解析
西田洋巳, 大島研郎
日本農芸化学会2007年度大会   2007年3月   
ガンマブチロラクトン合成と受容の進化的関係 [招待有り]
西田洋巳, 大西康夫, 別府輝彦, 堀之内末治
日本進化学会2006年大会 ワークショップ「微生物の生き残り戦略と進化」   2006年8月   
菌類特異的遺伝情報の抽出
西田洋巳
本農芸化学会2006年度大会   2006年3月   
ヒトゲノムタイリングアレイを用いたヌクレオソーム密度に関する研究
西田洋巳, 鈴木貴紘, 近藤伸二, 林崎良英
第28回日本分子生物学会年会   2005年12月   
細胞のアイデンティティとその進化 [招待有り]
西田洋巳, 田中寛
日本農芸化学会2005年度大会 シンポジウム「細胞のアイデンティティとその進化」   2005年3月   
菌類特異的遺伝子を用いた研究:系統・進化・生態へのアプローチ [招待有り]
西田洋巳
理研シンポジウム「ポストゲノム時代の糸状菌遺伝子研究」   2002年10月   
アミノアジピン酸還元酵素大サブユニット遺伝子(lys2)について
西田洋巳
第22回微生物分類研究会   2002年9月   
DeinococcusとThermusのリジン生合成の相違
西田洋巳, 鳴海一成
日本農芸化学会2002年度大会   2002年3月   
菌類の進化を探る [招待有り]
西田洋巳
日本進化学会第3回大会 シンポジウム「生物の系統進化の最前線 -バクテリアから高等動物まで-」   2001年10月   
アミノ酸生合成の進化と多機能タンパク質
西田洋巳
日本農芸化学会2001年度大会   2001年3月   
What is characteristic of fungal lysine synthesis through the aminoadipic acid pathway? [招待有り]
Nishida H
Annual Meeting, 2000, of The Japan Society for Microbial Systematics - Microbial Systematics, Today and Tomorrow   2000年10月   
原核生物のアミノアジピン酸経路によるリシン合成の進化学的解析
西田洋巳, 西山真, 小橋信行, 小菅武英, 星野貴行, 山根久和, 小倉淳, 横田明
日本農芸化学会2000年度大会   2000年4月   
A prokaryotic gene cluster involved in synthesis of lysine through the aminoadipate pathway
Nishida H, Nishiyama M, Kobashi N, Kosuge T, Hoshino T, Yamane H, Yokota A
International Symposium "Evolution 2000" - Biodiversity in Network of Bioinformation from the Standpoint of Devo-Evo View   2000年3月   
Pyrococcusのリシン生合成に関与すると考えられる遺伝子クラスター
西田洋巳, 西山真
日本Archaebacteria研究会第12回講演会   1999年12月   
Evolution in the Archiascomycetes [招待有り]
Nishida H, Sugiyama J
XVI International Botanical Congress   1999年8月   
Molecular phylogeny and evolution of the urediniomycetes including Mixia and basidiomycetous yeasts [招待有り]
Nishida H, Sjamusuridzal W, Bauer R, Oberwinkler F, Kakishima M, Sugiyama J
Sixth International Symposium of the Mycological Society of Japan - Joint Symposium of MSJ/BMS (British Mycological Society)   1998年11月   
寄生菌類と宿主植物の進化―サビ菌類の場合
西田洋巳, Wellyzar Sjamsuridzal, 小川裕由, 柿嶌眞, 杉山純多
日本農芸化学会1998年度大会   1998年4月   
植物寄生菌類とその宿主の進化的関係
西田洋巳, Wellyzar Sjamsuridzal, 小川裕由, 柿嶌眞, 杉山純多
日本菌学会関東支部年次大会   1998年4月   
菌類系統解析の障壁を打ち砕いた分子系統 [招待有り]
西田洋巳
第14回糸状菌遺伝子研究会   1996年11月   
古生子嚢菌類の系統分類と進化 [招待有り]
西田洋巳, 田尻義人, 杉山純多
日本菌学会関東支部ミニシンポジウム「菌類系統分類学・進化学の最近の進歩」   1996年3月   
イントロンの多型と生物多様性:植物寄生菌類Protomyces属のグループIイントロンの進化学的解析
西田洋巳, 田尻義人, 杉山純多
日本農芸化学会1996年度大会   1996年3月   
高等菌類の系統と分子進化 [招待有り]
西田洋巳, 杉山純多
日本菌学会第39回大会シンポジウム「菌類の多様性:進化と生態」   1995年5月   
高等菌類Taphrina属菌種の多様性と宿主植物との進化的関係
西田洋巳, 杉山純多
本農芸化学会1994年度大会   1994年4月   
A major lineage, which connects the ascomycetes with the basidiomycetes, inferred from the molecular approaches: Taphrina, Protomyces, Saitoella, and related taxa [招待有り]
Nishida H, Sugiyama J
XV International Botanical Congress   1993年8月   
Horizontal transfer of the higher fungus Protomyces group I introns
Nishida H, Sugiyama J
First Annual Society for Molecular Biology and Evolution Conference   1993年7月   
タフリナ・プロトミケス両属の遺伝子レベルでの異同
西田洋巳, 杉山純多
日本菌学会第37回大会   1993年5月   
タフリナ・プロトミケスの系統進化的位置
西田洋巳, 杉山純多
日本農芸化学会1993年度大会   1993年4月   
高等菌類の系統と分子進化 [招待有り]
西田洋巳, 杉山純多
日本菌学会関東支部シンポジウム「菌類系統分類学研究の最近の展開」   1993年4月   
18S rRNA gene及びそこに含まれるグループIイントロンの分子進化
西田洋巳, 杉山純多
日本分子生物学会第15回大会   1992年12月   
高等菌類の系統進化 [招待有り]
西田洋巳
国立遺伝学研究所研究会「分子系統学と生物分類学の接点」   1992年8月   
タフリナ科菌類:高等菌類における第三の系統群
西田洋巳, 杉山純多
日本農芸化学会1992年度大会   1992年4月   
18S リボゾーム RNA に基づく高等菌類の系統 [招待有り]
西田洋巳, 杉山純多
酵母細胞研究会主催シンポジウム   1991年12月   
担子菌酵母のリボゾームRNA置換頻度と分子系統
西田洋巳, 朱尤洪, 杉山純多
日本農芸化学会1991年度大会   1991年4月   
Thermus由来のリンゴ酸脱水素酵素(MDH)の耐熱化機構の解析
西山真, 西田洋巳, 堀之内末治, 別府輝彦
日本農芸化学会1990年度大会   1990年3月   

担当経験のある科目

 
 

競争的資金等の研究課題

 
日本酒に混入・増殖する微生物の利活用による機能性日本酒造り
富山県: 大学連携加速化プロジェクト事業
研究期間: 2019年8月 - 2020年3月    代表者: 西田洋巳
日本酒に混入・増殖する微生物の利活用による機能性日本酒造り
富山県: 大学連携加速化プロジェクト事業
研究期間: 2018年7月 - 2019年3月    代表者: 西田洋巳
日本酒造りにおいて混入、増殖するバクテリアの日本酒への影響に関する研究
富山県立大学: 産学官連携研究費(生物工学研究センター特別研究)
研究期間: 2018年6月 - 2019年3月    代表者: 西田洋巳
日本酒に含まれるDNAの網羅的シークエンスに基づく製造過程のモニタリング
富山県立大学: 産学官連携研究費(生物工学研究センター特別研究)
研究期間: 2017年6月 - 2018年3月    代表者: 西田洋巳
バクテリア巨大化細胞への異種ゲノムDNAの導入方法の確立
日本学術振興会: 学術研究助成基金助成金
研究期間: 2016年4月 - 2018年3月    代表者: 西田洋巳
FEMS 2017
田村科学技術振興財団: 研究者海外派遣助成金
研究期間: 2017年7月       代表者: 西田洋巳
日本酒に含まれるDNAの網羅的シークエンスに基づく製造過程のモニタリング
富山県立大学: 産学官連携研究費(先行研究)
研究期間: 2016年6月 - 2017年3月    代表者: 西田洋巳
海洋を漂うプラスミドDNAが生物進化に与える影響
一般財団法人キヤノン財団: 研究助成プログラム「理想の追求」
研究期間: 2014年4月 - 2017年3月    代表者: 西田洋巳
富山の日本酒の現状と今後について考える
富山県立大学: 地域志向教育研究費
研究期間: 2015年6月 - 2016年3月    代表者: 西田洋巳
菌類のエキソン、イントロン構造の進化機構の解明
日本学術振興会: 学術研究助成基金助成金+ゲノム支援
研究期間: 2013年4月 - 2016年3月    代表者: 西田洋巳
DNA塩基配列比較に基づく富山湾に存在する微生物の多様性解析
富山県立大学: 地域志向教育研究費
研究期間: 2014年6月 - 2015年3月    代表者: 西田洋巳
微生物を用いた効率的な有用物質生産を可能にするゲノム改変方法の確立
富山県立大学: 重点領域研究遂行支援
研究期間: 2014年6月 - 2015年3月    代表者: 西田洋巳
微生物を用いた効率的な有用物質生産を可能にするゲノム改変方法の確立
富山県立大学: 重点領域研究遂行支援
研究期間: 2013年6月 - 2014年3月    代表者: 西田洋巳
菌類ヌクレオソーム位置情報データ公開システムの構築
富山県立大学: 研究教育成果情報発信
研究期間: 2013年6月 - 2014年3月    代表者: 西田洋巳
アスペルギルスのヌクレオソーム形成に関する研究
公益財団法人野田産業科学研究所: 研究助成
研究期間: 2012年4月 - 2013年3月    代表者: 西田洋巳
菌類の遺伝子プロモータ領域におけるクロマチン構造の比較に基づく系統分類学研究
公益財団法人発酵研究所: 研究助成
研究期間: 2008年4月 - 2011年3月    代表者: 西田洋巳
水環境中の微生物群相解析へのマイクロアレイの使用に関する研究
公益財団法人クリタ水・環境科学振興財団: 研究助成
研究期間: 2006年10月 - 2007年9月    代表者: 西田洋巳
海水に分布する微生物の多様性に関する研究
公益財団法人ソルト・サイエンス研究財団: 研究助成
研究期間: 2006年4月 - 2007年3月    代表者: 西田洋巳
菌類特異的遺伝子を指標にした菌類多様性に関する研究
日本学術振興会: 科学研究費補助金
研究期間: 2003年4月 - 2005年3月    代表者: 西田洋巳
菌類に分布するグループIイントロンの多様性に関する研究
公益財団法人日産科学振興財団: 研究助成
研究期間: 1996年4月 - 1997年3月    代表者: 西田洋巳