石井邦彦 (Kunihiko Ishii) - マイポータル

基本情報

所属: 特定国立研究開発法人理化学研究所田原分子分光研究室専任研究員

学位: 博士（理学）

J-GLOBAL ID: 200901044543770510
researchmap会員ID: 5000072541

外部リンク: https://spectroscopy.riken.jp/

研究分野

ナノテク・材料 / 基礎物理化学 /

経歴

2014年4月 - 現在

理化学研究所, 田原分子分光研究室, 専任研究員
2009年10月 - 2014年3月

理化学研究所, 田原分子分光研究室, 研究員
2006年4月 - 2009年9月

理化学研究所, 田原分子分光研究室, 特別任期制研究員
2003年4月 - 2006年3月

理化学研究所, 田原分子分光研究室, 協力研究員

学歴

1997年4月 - 2003年3月

東京大学大学院, 理学系研究科, 化学専攻
1993年4月 - 1997年3月

東京大学, 理学部, 化学科

論文

Probing Protein–DNA Interactions with Two-Dimensional Fluorescence Lifetime Correlation Spectroscopy Utilizing Protein-Induced Fluorescence Enhancement

Sandeep Yadav, Kunihiko Ishii, Tahei Tahara

The Journal of Physical Chemistry B 2025年10月30日
Evidence of a Three-State Mechanism in DNA Hairpin Folding

Brendan Cullinane, Kunihiko Ishii, Simi Kaur, Tahei Tahara, Randall H. Goldsmith

Journal of the American Chemical Society 2025年4月23日
Independent component analysis disentangles fluorescence signals from diffusing single molecules

Kunihiko Ishii, Miyuki Sakaguchi, Tahei Tahara

2025年3月10日
Quantifying Microsecond Solution-Phase Conformational Dynamics of a DNA Hairpin at the Single-Molecule Level

Alexander K. Foote, Kunihiko Ishii, Brendan Cullinane, Tahei Tahara, Randall H. Goldsmith

ACS Physical Chemistry Au 2024年7月24日
Pulsed-Interleaved-Excitation Two-Dimensional Fluorescence Lifetime Correlation Spectroscopy

Bidyut Sarkar, Kunihiko Ishii, Tahei Tahara

The Journal of Physical Chemistry B 2024年5月16日
A Toxicogenic Interaction between Intracellular Amyloid-β and Apolipoprotein-E

Arpan Dey, Aditi Verma, Uchit Bhaskar, Bidyut Sarkar, Mamata Kallianpur, Vicky Vishvakarma, Anand Kant Das, Kanchan Garai, Odity Mukherjee, Kunihiko Ishii …

ACS Chemical Neuroscience 2024年3月20日
Apolipoprotein-E transforms intracellular Amyloid-β oligomers to a more toxic state

Arpan Dey, Aditi Verma, Uchit Bhaskar, Bidyut Sarkar, Mamata Kallianpur, Vicky Visvakarma, Anand Kant Das, Kanchan Garai, Odity Mukherjee, Kunihiko Ishii …

2023年9月3日
Single Photon smFRET. III. Application to Pulsed Illumination

Matthew Safar, Ayush Saurabh, Bidyut Sarkar, Mohamadreza Fazel, Kunihiko Ishii, Tahei Tahara, Ioannis Sgouralis, Steve Pressé

2022年7月22日
Scanning Two-Dimensional Fluorescence Lifetime Correlation Spectroscopy: Conformational Dynamics of DNA Holliday Junction from Microsecond to Subsecond

Wooseok Heo, Kazuto Hasegawa, Kenji Okamoto, Yasushi Sako, Kunihiko Ishii, Tahei Tahara

The Journal of Physical Chemistry Letters 1249-1257 2022年2月10日
Microsecond Folding of preQ1 Riboswitch and Its Biological Significance Revealed by Two-Dimensional Fluorescence Lifetime Correlation Spectroscopy

Bidyut Sarkar, Kunihiko Ishii, Tahei Tahara

Journal of the American Chemical Society 143(21) 7968-7978 2021年6月2日
Microsecond Equilibrium Dynamics of Hairpin-Forming Oligonucleotides Quantified by Two-Color Two-Dimensional Fluorescence Lifetime Correlation Spectroscopy

Chao-Han Cheng, Kunihiko Ishii, Tahei Tahara

Journal of Physical Chemistry B 124(47) 10673-10681 2020年11月25日
Direct Photon-by-Photon Analysis of Time-Resolved Pulsed Excitation Data using Bayesian Nonparametrics

Meysam Tavakoli, Sina Jazani, Ioannis Sgouralis, Wooseok Heo, Kunihiko Ishii, Tahei Tahara, Steve Pressé

Cell Reports Physical Science 1(11) 100234-100234 2020年11月
A Continuous Time Representation of smFRET for the Extraction of Rapid Kinetics

Zeliha Kilic, Ioannis Sgouralis, Wooseok Heo, Kunihiko Ishii, Tahei Tahara, Steve Pressé

2020年8月29日
Microsecond Conformational Dynamics of Biopolymers Revealed by Dynamic-Quenching Two-Dimensional Fluorescence Lifetime Correlation Spectroscopy with Single Dye Labeling

Bidyut Sarkar, Kunihiko Ishii, Tahei Tahara

Journal of Physical Chemistry Letters 10(18) 5536-5541 2019年9月19日
Multifocus Fluorescence Correlation Spectroscopy with Spatially Separated Excitation Beams

Takuhiro Otosu, Kunihiko Ishii, Tahei Tahara

BULLETIN OF THE CHEMICAL SOCIETY OF JAPAN 92(9) 1495-1502 2019年9月
Origins of biological function in DNA and RNA hairpin loop motifs from replica exchange molecular dynamics simulation

Jacob B. Swadling, Kunihiko Ishii, Tahei Tahara, Akio Kitao

Physical Chemistry Chemical Physics 20(5) 2990-3001 2018年査読有り招待有り
Highly Heterogeneous Nature of the Native and Unfolded States of the B Domain of Protein A Revealed by Two-Dimensional Fluorescence Lifetime Correlation Spectroscopy

Takuhiro Otosu, Kunihiko Ishii, Hiroyuki Oikawa, Munehito Arai, Satoshi Takahashi, Tahei Tahara

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 121(22) 5463-5473 2017年6月査読有り
Correction of the afterpulsing effect in fluorescence correlation spectroscopy using time symmetry analysis

Kunihiko Ishii, Tahei Tahara

OPTICS EXPRESS 23(25) 32387-32400 2015年12月査読有り
Microsecond protein dynamics observed at the single-molecule level

Takuhiro Otosu, Kunihiko Ishii, Tahei Tahara

NATURE COMMUNICATIONS 6 2015年7月査読有り
1P055 二次元蛍光寿命相関分光法によるBdpA折りたたみ機構解明に向けた研究 : 2つのBdpA変異体による包括的解析(01C. 蛋白質 : 物性,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

Otosu Takuhiro, Ishii Kunihiko, Oikawa Hiroyuki, Arai Munehito, Takahashi Satoshi, Tahara Tahei

生物物理 54(1) S150 2014年

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MISC

Two-Dimensional Fluorescence Lifetime Correlation Spectroscopy on the Folding Mechanism of B Domain of Protein A

Takuhiro Otosu, Kunihiko Ishii, Hiroyuki Oikawa, Munehito Arai, Satoshi Takahashi, Tahei Tahara

BIOPHYSICAL JOURNAL 108(2) 501A-501A 2015年1月
Microsecond Conformational Dynamics of Cytochrome C Revealed by Two-Dimentional Fluorescence Lifetime Correlation Spectroscopy

Takuhiro Otosu, Kunihiko Ishii, Tahei Tahara

BIOPHYSICAL JOURNAL 106(2) 459A-459A 2014年1月
先端的な蛍光相関分光法を応用した生体分子のダイナミクスの解析

石井邦彦, 田原太平

生物物理 52(6) 295-298 2012年
水中での酸‐塩基中和反応のメカニズム時間分解赤外吸収分光による実時間追跡

石井邦彦

化学と工業 57(7) 757-757 2004年7月1日

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

新しい蛍光相関計測法による生体高分子ダイナミクスの不均一性と階層性の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2025年3月

石井邦彦
新しい蛍光相関計測法による生体高分子ダイナミクスの不均一性と階層性の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2025年3月

石井邦彦
先端的な超高速分光と非線形分光による多自由度複雑分子系の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2013年6月 - 2018年3月

田原太平, 竹内佐年, 石井邦彦, 山口祥一, 須藤雄気, 二本柳聡史, 倉持光
先端的な蛍光相関分光法を応用した生体分子の揺らぎ計測

文部科学省科学研究費補助金(新学術領域研究(研究領域提案型)) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2011年 - 2012年

石井邦彦
極限的分光計測による複雑系高次分子機能の研究

文部科学省科学研究費補助金(特定領域研究) 特定領域研究 2007年 - 2011年

田原太平, 竹内佐年, 山口祥一, 石井邦彦, 細井晴子, 森田明弘
無標識蛍光相関分光による生体高分子のナノ秒揺らぎの研究

文部科学省科学研究費補助金(新学術領域研究(研究領域提案型)) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2009年 - 2010年

石井邦彦
新規な非線形分光計測による新しい界面分子科学の開拓

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(A)) 基盤研究(A) 2007年 - 2009年

田原太平, 山口祥一, 石井邦彦, 渡邉秀和
複雑系の遅いダイナミクスの解明を目指した単一分子振動分光法の開発

文部科学省科学研究費補助金(若手研究(B)) 若手研究(B) 2007年 - 2008年

石井邦彦
極短光パルスを用いた反応性分子の振動コヒーレンスの研究

2003年 - 2005年
Study of vibrational coherence of reactive molecules using ultrashort light pulses

2003年 - 2005年

石井邦彦

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