中村寛夫 (Hiroo Nakamura) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人理化学研究所横浜事業所生命機能科学研究センター特別嘱託研究員

学位: 理学博士

J-GLOBAL ID: 200901005666036115
researchmap会員ID: 5000072647

研究分野

ライフサイエンス / 機能生物化学 /

経歴

2021年 - 現在

理化学研究所, 特別嘱託研究員
1994年 - 2021年

理化学研究所研究員、専任研究員
2001年 - 2012年

横浜市立大学大学院客員准教授
1992年 - 1994年

年米国カリフォルニア州立大学バークリー校博士研究員、
1990年 - 1992年

年国立岡崎共同研究機構基礎生物学研究所非常勤の講師、

学歴

- 1990年

東京大学, 理学系研究科, 植物学

論文

Structural basis for heme detoxification by an ATP-binding cassette-type efflux pump in gram-positive pathogenic bacteria.

Hiro Nakamura, Tamao Hisano, Md Mahfuzur Rahman, Takehiko Tosha, Mikako Shirouzu, Yoshitsugu Shiro

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 119(27) e2123385119 2022年7月5日
Architecture of the complete oxygen-sensing FixL-FixJ two-component signal transduction system

Gareth S. A. Wright, Akane Saeki, Takaaki Hikima, Yoko Nishizono, Tamao Hisano, Misaki Kamaya, Kohei Nukina, Hideo Nishitani, Hiro Nakamura, Masaki Yamamoto …

Science Signaling 11(525) 2018年4月査読有り
Pseudomonas aeruginosa overexpression system of nitric oxide reductase for in vivo and in vitro mutational analyses.

Raika Yamagiwa, Takuya Kurahashi, Mariko Takeda, Mayuho Adachi, Hiro Nakamura, Hiroyuki Arai, Yoshitsugu Shiro, Hitomi Sawai, Takehiko Tosha

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics 1859(5) 333-341 2018年2月査読有り
Regulatory Implications of Structural Changes in Tyr201 of the Oxygen Sensor Protein FixL

Yamawaki Takeo, Ishikawa Haruto, Mizuno Misao, Nakamura Hiro, Shiro Yoshitsugu, Mizutani Yasuhisa

BIOCHEMISTRY 55(29) 4027-4035 2016年7月26日査読有り
Crystal structure of bacterial haem importer complex in the inward-facing conformation.

Naoe, Y, Nakamura, N, Doi, A, Sawabe, M, Nakamura, H, Shiro, Y, Sugimoto, H

Nat. Commun. 7 13411 2016年査読有り
Structure of the response regulator ChrA in the haem-sensing two-component system of Corynebacterium diphtheriae.

Doi, A, Nakamura, H, Shiro, Y, Sugimoto, H

Acta Crystallogr. F Struct. Biol. Commun. 71(Pt 8) 966-971 2015年査読有り
緑膿菌由来一酸化窒素還元酵素の組換え体の調製とVal206の役割

山際来佳, 澤井仁美, 中村寛夫, 當舎武彦, 城宜嗣

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 87回 [3T09p-05] 2014年10月
Ultraviolet Resonance Raman Observations of the Structural Dynamics of Rhizobial Oxygen Sensor FixL on Ligand Recognition

Yano Shinji, Ishikawa Haruto, Mizuno Misao, Nakamura Hiro, Shiro Yoshitsugu, Mizutani Yasuhisa

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 117(49) 15786-15791 2013年12月12日査読有り
Structure of PAS-linked histidine kinase and the response regulator complex.

Yamada S, Sugimoto H, Kobayashi M, Ohno A, Nakamura H, Shiro Y

Structure (London, England : 1993) 17 1333-1344 2009年10月査読有り
Heme-dependent autophosphorylation of a heme sensor kinase, ChrS, from Corynebacterium diphtheriae reconstituted in proteoliposomes

Yoko Ito, Shoko Nakagawa, Ayako Komagata, Masao Ikeda-Saito, Yoshitsugu Shiro, Hiro Nakamura

FEBS LETTERS 583(13) 2244-2248 2009年7月査読有り
Separation of phosphoprotein isotypes having the same number of phosphate groups using phosphate-affinity SDS-PAGE

Kinoshita, Eiji, Kinoshita-Kikuta, Emiko, Matsubara, Mamoru, Yamada, Seiji, Nakamura, Hiro, Shiro, Yoshitsugu, Aoki, Yuri, Okita, Kouki, Koike, Tohru

PROTEOMICS 8(15) 2994-3003 2008年8月査読有り
FTIR study on the hydrogen bond structure of a key tyrosine residue in the flavin-binding blue light sensor TePixD from Thermosynechococcus elongatus

Ryouta Takahashi, Koji Okajima, Hiroyuki Suzuki, Hiro Nakamura, Masahiko Ikeuchi, Takumi Noguchi

Biochemistry 46(22) 6459-6467 2007年6月5日査読有り
Separation of a Phosphorylated Histidine Protein Using Phosphate Affinity Polyacrlamide Gel Electrophoresis

YAMADA Seiji, NAKAMURA Hiro, NAKAMURA Hiro, KINOSHITA Eiji, KINOSHITA-KIKUTA Emiko, KOIKE Tohru, SHIRO Yoshitsugu

Anal. Biochem. 360(1) 160-162 2007年
1P019 Crystal structure of histidine kinase and response regulator complex(1. Protein structure and dynamics (I),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Yamada Seiji, Sugimoto Hiroshi, Kobayashi Miki, Akiyama Shuji, Nakamura Hiro, Shiro Yoshitsugu

生物物理 46(2) S151 2006年
Roles of the Heme Distal Residues of FixL in O2 Sensing: A Single Convergent Structure of the Heme Moiety is Relevant to the Down-regulation of Kinase Activity

TANAKA Atsunari, TANAKA Atsunari, NAKAMURA Hiro, NAKAMURA Hiro, SHIRO Yoshitsugu, FUJII Hiroshi

Biochemistry 45(8) 2515-2523 2006年
The Signaling Pathway in Histidine Kinase and the Response Regulator Complex Revealed by X-ray Crystallography and Solution Scattering

YAMADA Seiji, AKIYAMA Shuji, SUGIMOTO Hiroshi, KUMITA Hideyuki, ITO Kazuki, FUJISAWA Tetsuro, NAKAMURA Hiro, NAKAMURA Hiro, SHIRO Yoshitsugu

J. Mol. Biol. 362(1) 123-139 2006年
2SB03 二成分制御系のPASドメイン(PASドメインの生物物理学)

山田斉爾, 中村寛夫, 城宜嗣

生物物理 45 S19 2005年
1P046 二成分情報伝達系タンパク質ヒスチジンキナーゼの情報伝達メカニズム(蛋白質 B) 構造・機能相関))

山田斉爾, 秋山修志, 杉本宏, 汲田英之, 伊藤和輝, 藤澤哲郎, 中村寛夫, 城宜嗣

生物物理 45 S43 2005年
Solution structure of the C-terminal transcriptional activator domain of FixJ from Sinorhizobium meliloti and its recognition of the fixK promoter

Kurashima-Ito K, Kasai Y, Hosono K, Tamura K, Oue S, Isogai M, Ito Y, Nakamura H, Shiro Y

Biochemistry 44(45) 14835-14844 2005年査読有り
Hybrid Respiration in the Denitrifying Mitochondria of Fusarium oxysporum

TAKAYA, Naoki, KUWAZAKI, Seigo, ADACHI, Yoshiaki, SUZUKI, Sawako, KIKUCHI, Tomoko, NAKAMURA, Hiro, SHIRO, Yoshitsugu, SHOUN, Hirofumi

The journal of biochemistry 133(4) 461-465 2003年4月査読有り

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MISC

膜内在性一酸化窒素還元酵素cNORの保存されたバリン残基の役割

YAMAGIWA Raika, YAMAGIWA Raika, SAWAI Hitomi, TOSHA Takehiko, NAKAMURA Hiro, ARAI Hiroyuki, SHIRO Yoshitsugu

生物物理(Web) 57(Supplement 1-2) 2017年
膜内在性一酸化窒素還元酵素における効率的なNO還元反応のための仕組み

山際来佳, 山際来佳, 澤井仁美, 當舎武彦, 中村寛夫, 新井博之, 城宜嗣

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 17th 2017年
膜貫通型一酸化窒素還元酵素の変異体解析によるNOおよびH+輸送経路の解明

山際来佳, 澤井仁美, 當舎武彦, 中村寛夫, 新井博之, 城宜嗣, 城宜嗣

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 16th 2016年
緑膿菌を用いた一酸化窒素還元酵素の組換え体調製と変異体解析

山際来佳, 澤井仁美, 當舎武彦, 中村寛夫, 新井博之, 城宜嗣

日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集 88回・38回 [1P0495]-[1P0495] 2015年12月
ADP reduces the oxygen-binding affinity of a sensory histidine kinase, FixL: The possibility of an enhanced reciprocating kinase reaction

H Nakamura, H Kumita, K Imai, T Iizuka, Y Shiro

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 101(9) 2742-2746 2004年3月
Interaction between sensor domain and histidine kinase domain of sensory histidine kinase in the two-component signaling system

H Kumita, S Yamada, H Nakamura, Y Shiro

JOURNAL OF INORGANIC BIOCHEMISTRY 96(1) 173-173 2003年7月
The uncoupling of oxygen sensing, phosphorylation signalling and transcriptional activation in oxygen sensor FixL and FixJ mutants

K Saito, E Ito, K Hosono, K Nakamura, K Imai, T Iizuka, Y Shiro, H Nakamura

MOLECULAR MICROBIOLOGY 48(2) 373-383 2003年4月
O-2-specific regulation of the ferrous heme-based sensor kinase FixL from Sinorhizobium meliloti and its aberrant inactivation in the ferric form

S Akimoto, A Tanaka, K Nakamura, Y Shiro, H Nakamura

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 304(1) 136-142 2003年4月
Chimeric sensory kinases containing O-2 sensor domain of FixL and histidine kinase domain from thermophile

H Kumita, S Yamada, H Nakamura, Y Shiro

BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS 1646(1-2) 136-144 2003年3月
Roles of non-covalent interactions in gas sensing by sensor histidine kinases of two-component regulatory systems.

RIKEN Review 46 39 2002年
Quantitative measurement of radioactive phosphorylated proteins in wet polyacrylamide gels

Hiro Nakamura, Ken Saito, Yoshitsugu Shiro

Analytical Biochemistry 294(2) 187-188 2001年7月15日
Roles of Ile209 and Ile210 on the heme pocket structure and regulation of histidine kinase activity of oxygen sensor FixL from Rhizobium meliloti

M Mukai, K Nakamura, H Nakamura, T Iizuka, Y Shiro

BIOCHEMISTRY 39(45) 13810-13816 2000年11月
Sensory mechanism of oxygen sensor FixL from Rhizobium meliloti: Crystallographic, mutagenesis and resonance Raman spectroscopic studies

H Miyatake, M Mukai, SY Park, S Adachi, K Tamura, H Nakamura, K Nakamura, T Tsuchiya, T Iizuka, Y Shiro

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 301(2) 415-431 2000年8月
Proton delivery in NO reduction by fungal nitric-oxide reductase - Cryogenic crystallography, spectroscopy, and kinetics of ferric-NO complexes of wild-type and mutant enzymes

H Shimizu, E Obayashi, Y Gomi, H Arakawa, SY Park, H Nakamura, S Adachi, H Shoun, Y Shiro

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 275(7) 4816-4826 2000年2月
Improved cardiac contractile functions in hypoxiareoxygenation in rats treated with low concentration Co2+

Hiroshi Endoh, Takaho Kaneko, Hiro Nakamura, Katsuhiko Doi, Eiji Takahashi

American Journal of Physiology - Heart and Circulatory Physiology 279(6) H2713-H2719 2000年
酸素センサー蛋白質FixLの結晶構造解析

宮武秀行, PARK S‐Y, 足立伸一, 田村浩二, 中村寛夫, 土屋輝昌, 飯塚哲太郎, 城宜嗣

日本生物物理学会年会講演予稿集 37th S105 1999年9月2日
共鳴ラマン分光法による酸素センサータンパク質FixLのCO結合型状態の研究

向井政博, 宮武秀行, 中村寛夫, 城宜嗣, 飯塚哲太郎

日本生物物理学会年会講演予稿集 37th S124 1999年9月2日
Iron coordination structures of oxygen sensor FixL characterized by FeK-edge extended x-ray absorption fine structure and resonance Raman spectroscopy

H Miyatake, M Mukai, S Adachi, H Nakamura, K Tamura, T Iizuka, Y Shiro, RW Strange, SS Hasnain

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 274(33) 23176-23184 1999年8月
Dynamic light-scattering and preliminary crystallographic studies of the sensor domain of the haem-based oxygen sensor FixL from Rhizobium meliloti

H Miyatake, M Kanai, S Adachi, H Nakamura, K Tamura, H Tanida, T Tsuchiya, T Iizuka, Y Shiro

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 55 1215-1218 1999年6月
Design and synthesis of a globin fold

Y Isogai, M Ota, T Fujisawa, H Izuno, M Mukai, H Nakamura, T Iizuka, K Nishikawa

BIOCHEMISTRY 38(23) 7431-7443 1999年6月

もっとみる

書籍等出版物

Physiological functions and molecular structures of new types of hemoproteins.

Molecular anatomy of cellular systems. Progress in biotechnology. Elsevier Science B. V. 2002年

所属学協会

蛋白質科学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

ヘムを解毒する病原菌のヘム排出ポンプの構造・機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2016年4月 - 2019年3月

中村寛夫, 久野玉雄
ヘム、酸素の生物学

2003年 - 2012年
生物における酸素適応と酸素センサーの分子機構

1994年 - 2008年

中村寛夫

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経歴

学歴

論文

MISC

書籍等出版物

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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