Shinji Masui

Profile Information

Affiliation: Associate Professor, Graduate Faculty of Interdisciplinary Research Faculty of Life and Environmental Sciences, Life Agriculture System (Advanced Biotechnology Center), University of Yamanashi

Degree: 博士（理学）(東京大学)

Researcher number: 20342850
J-GLOBAL ID: 200901049217325720
researchmap Member ID: 5000072946

External link: http://nerdb-re.yamanashi.ac.jp/Profiles/348/0034719/prof_e.html

Research Interests

Research Areas

Life sciences / Molecular biology / Molecular biology

Research History

Dec, 2018

特任准教授, 大学院総合研究部生命環境学域, 山梨大学
Apr, 2018 - Nov, 2018

特任准教授（産学公連携）, 大学院視覚機能再生外科学, 京都府立医科大学
Oct, 2011 - Mar, 2018

特定拠点講師, iPS細胞研究所, 京都大学
Aug, 2008 - Mar, 2012

研究員（兼任）, さきがけ, JST
Oct, 2006 - Sep, 2011

室長, 研究所細胞組織再生医学研究部形質転換ベクター開発研究室, 国立国際医療研究センター
Apr, 2001 - Sep, 2006

研究員, 発生・再生科学総合研究センター多能性幹細胞研究チーム, 理化学研究所
Apr, 1998 - Mar, 2001

特別研究員DC1, 日本学術振興会

Education

Apr, 1998 - Mar, 2001

生物科学専攻, 理学系研究科, The University of Tokyo
Apr, 1996 - Mar, 1998

生物科学専攻, 理学系研究科, The University of Tokyo

Papers

Direct Reprogramming Into Corneal Epithelial Cells Using a Transcriptional Network Comprising PAX6, OVOL2, and KLF4.

Koji Kitazawa, Takafusa Hikichi, Takahiro Nakamura, Masahiro Nakamura, Chie Sotozono, Shinji Masui, Shigeru Kinoshita

Cornea, 38 Suppl 1 S34-S41-S41, Nov, 2019 Peer-reviewed
Optimized conditions for the supplementation of human-induced pluripotent stem cell cultures with a GSK-3 inhibitor during embryoid body formation with the aim of inducing differentiation into mesodermal and cardiac lineage

Yoda K, Ohnuki Y, Masui S, Kurosawa H

Journal of Bioscience and Bioengineering, 129(3) 371-378, Oct 12, 2019 Peer-reviewed
Validation of common housekeeping genes as reference for qPCR gene expression analysis during iPS reprogramming process

Panina Y, Germond A, Masui S, Watanabe TM

Scientific Reports, 8(1) 8716-8716, Jun 7, 2018 Peer-reviewed
Srf destabilizes cellular identity by suppressing cell-type-specific gene expression programs.

Takashi Ikeda, Takafusa Hikichi, Hisashi Miura, Hirofumi Shibata, Kanae Mitsunaga, Yosuke Yamada, Knut Woltjen, Kei Miyamoto, Ichiro Hiratani, Yasuhiro Yamada …

Nature communications, 9(1) 1387-1387, Apr 11, 2018
網羅的ゲノム編集による細胞外シグナル起因性の細胞老化の制御

沖田喜樹, 渡辺亮, 堀田秋津, 升井伸治

生命科学系学会合同年次大会, 2017年度 [1P-1137], Dec, 2017 Peer-reviewed
核内アクチンとラミンから細胞核アーキテクチャーを解くアクチン-SRF経路が細胞同一性を不安定化させる

升井伸治, 池田隆, 堀田秋津

生命科学系学会合同年次大会, 2017年度 [2PW11-3], Dec, 2017 Peer-reviewed
Artificial acceleration of mammalian cell reprogramming by bacterial proteins

Ikeda T, Uchiyama I, Iwasaki M, Sasaki T, Nakagawa M, Okita K, Masui S

Genes to Cells, 22(10) 918-928, Aug 4, 2017 Peer-reviewed
OVOL2はヒト角膜上皮細胞の生物学的特徴を制御している

北澤耕司, 引地貴亮, 中村隆宏, 外園千恵, 木下茂, 升井伸治

日本眼科学会雑誌, 121(臨増) 220-220, Mar, 2017
PAX6、OVOL2、KLF4の転写因子ネットワークが角膜上皮細胞分化を制御している

村上怜, 北澤耕司, 引地貴亮, 中村隆宏, 外園千恵, 木下茂, 升井伸治

日本眼科学会雑誌, 121(臨増) 220-220, Mar, 2017
PAX6 regulates human corneal epithelium cell identity

Koji Kitazawa, Takafusa Hikichi, Takahiro Nakamura, Chie Sotozono, Shigeru Kinoshita, Shinji Masui

EXPERIMENTAL EYE RESEARCH, 154 30-38, Jan, 2017
OVOL2 maintains the transcriptional program of human corneal epithelium by suppressing epithelial-to-mesenchymal Transition

Kitazawa K, Hikichi T, Nakamura T, Mitsunaga K, Tanaka A, Nakamura M, Yamakawa T, Furukawa S, Takasaka M, Goshima N …

Cell Reports, 15(6) 1359-1368, Apr 28, 2016 Peer-reviewed
De novo CpG methylation on an artificial chromosome-like vector maintained for a long-term in mammalian cells

Keisuke Nishioka, Tsunao Kishida, Shinji Masui, Osam Mazda

BIOTECHNOLOGY LETTERS, 38(4) 731-740, Apr, 2016
アクチンは細胞のリプログラミングを制御する

池田隆, 引地貴亮, 渡辺亮, 堀田秋津, 升井伸治

日本細胞生物学会大会講演要旨集, 67回 145-145, Jun, 2015 Peer-reviewed
ヒト角膜上皮細胞分化を規定しているコア転写因子

北澤耕司, 引地貴亮, 池田隆, 中村隆宏, 上野盛夫, 川崎諭, 升井伸治, 木下茂

日本眼科学会雑誌, 119(臨増) 174-174, Mar, 2015
Induction of cells with cancer stem cell properties from nontumorigenic human mammary epithelial cells by defined reprogramming factors

M. Nishi, Y. Sakai, H. Akutsu, Y. Nagashima, G. Quinn, S. Masui, H. Kimura, K. Perrem, A. Umezawa, N. Yamamoto …

ONCOGENE, 33(5) 643-652, Jan, 2014
Kinetics of drug selection systems in mouse embryonic stem cells

Yuhki Nakatake, Setsuko Fujii, Shinji Masui, Toshimi Sugimoto, Satomi Torikai-Nishikawa, Kenjiro Adachi, Hitoshi Niwa

BMC Biotechnology, 13, Aug 7, 2013
Transcription factors interfering with dedifferentiation induce cell type-specific transcriptional profiles

Takafusa Hikichi, Ryo Matoba, Takashi Ikeda, Akira Watanabe, Takuya Yamamoto, Satoko Yoshitake, Miwa Tamura-Nakano, Takayuki Kimura, Masayoshi Kamon, Mari Shimura …

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 110(16) 6412-6417, Apr, 2013 Peer-reviewed
Intracellular reactivation of transcription factors fused with protein transduction domain.

Masamitsu Konno, Shinji Masui, Tatsuo S Hamazaki, Hitoshi Okochi

Journal of biotechnology, 154(4) 298-303, Jul 20, 2011
Eed/Sox2 regulatory loop controls ES cell self-renewal through histone methylation and acetylation

Hiroki Ura, Kazuhiro Murakami, Tadayuki Akagi, Keita Kinoshita, Shukuro Yamaguchi, Shinji Masui, Hitoshi Niwa, Hiroshi Koide, Takashi Yokota

EMBO JOURNAL, 30(11) 2190-2204, Jun, 2011
A Distinct Role for Pin1 in the Induction and Maintenance of Pluripotency

Mayuko Nishi, Hidenori Akutsu, Shinji Masui, Asami Kondo, Yoji Nagashima, Hirokazu Kimura, Kilian Perrem, Yasushi Shigeri, Masashi Toyoda, Akiko Okayama …

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 286(13) 11593-11603, Apr, 2011

Misc.

昆虫細胞内に共生するWolbachiaの蛋白質を用いた人為的な哺乳類細胞制御

池田隆, 内山郁夫, 岩崎未央, 佐々木哲彦, 升井伸治, 沖田圭介

日本応用動物昆虫学会大会講演要旨, 62nd 177, Mar 10, 2018
OVOL2 maintains a transcriptional program in human corneal epithelial cells

Koji Kitazawa, Takafusa Hikichi, Takahiro Nakamura, Chie Sotozono, Shigeru Kinoshita, Shinji Masui

INVESTIGATIVE OPHTHALMOLOGY & VISUAL SCIENCE, 58(8), Jun, 2017
PAX6, OVOL2, KLF4 coordinately contribute the reprogramming of the corneal epithelial cellsTranscription factors PAX6, OVOL2, and KLF4 coordinately contribute to the reprogramming of corneal epithelial cells

Rei Murakami, Koji Kitazawa, Takafusa Hikichi, Takahiro Nakamura, Chie Sotozono, Shigeru Kinoshita, Shinji Masui

INVESTIGATIVE OPHTHALMOLOGY & VISUAL SCIENCE, 58(8), Jun, 2017
Loss of human corneal epithelial cell identity exhibited by deletion of PAX6 using the CRISPR/Cas9 system

Koji Kitazawa, Takafusa Hikichi, Takahiro Nakamura, Chie Sotozono, Shigeru Kinoshita, Shinji Masui

INVESTIGATIVE OPHTHALMOLOGY & VISUAL SCIENCE, 57(12), Sep, 2016
A system development to induce any type of cell

Regenerative medicine, 8(3) 57-59, Aug, 2009
Cloned cells from the murine dermal papilla have hair-inducing ability

Aki Osada, Koji Kobayashi, Shinji Masui, Tatsuo S. Hamazaki, Hitoshi Okochi, Kazuki Yasuda

JOURNAL OF DERMATOLOGICAL SCIENCE, 54(2) 129-131, May, 2009
Forced expression of Tbx3 promotes LIF-independent self-renewal of mouse ES cells

Kazuya Ogawa, Daisuke Shimosato, Kadue Takahashi, Rika Yagi, Yayoi Toyooka, Shinji Masui, R. Matoba, Minoru S. Ko

DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 306(1) 391-392, Jun, 2007
誘導的ノックアウトES細胞で明らかになるSox2の機能

升井伸治, 中武悠樹, 矢木利香, 高橋一恵, 丹羽仁史

日本分子生物学会年会講演要旨集, 28th 707, Nov 25, 2005

Books and Other Publications

iPS細胞の樹立メカニズム

2015
任意細胞の誘導法開発

2015
初期化を制御する転写因子ネットワーク

2015
iPS細胞

(Role: Joint author)

診断と治療社, 2015
分化誘導系構築のためのストラテジー

2014
ダイレクト・リプログラミング機構

2014
生物学辞典第5版

岩波書店, 2013
任意細胞の樹立法の開発

2012
Function of Oct3/4 and Sox2 in Pluripotency

Masui S

Humana Press, 2011
iPS細胞が再生医療の扉を開く

升井伸治

シーアンドアール研究所, Oct 5, 2009 (ISBN: 9784863540392)
多能性幹細胞を維持する転写ネットワーク

2009
iPS細胞の成立機構

2009
任意細胞の樹立法開発

2008
多能性を維持する分子機構

2008
ES細胞の多能性維持

2007
To be the first to know: 電撃的遺伝子ターゲティング

2003
必殺・外来遺伝子導入法

2003
不退転のプラスミド構築法

2003
制限酵素の便利な使い方

2003
胚性幹細胞の未分化性維持機構

2001

Presentations

Screening of molecules that facilitate transition from mouse embryonic stem cells to early-embryonic-like cells

Aoi Murakami, Yoshitsugu Ohnuki, Shinji Masui, Hiroshi Kurosawa

JAACT2020 Fuchu, Nov 19, 2020, Japanese Association for Animal Cell Technology
Primitive endoderm cells promote proliferation and differentiation of pluripotent stem cells

Takumi Iwama, Yoshitsugu Ohnuki, Shinji Masui, Hiroshi Kurosawa

JAACT2020 Fuchu, Nov 19, 2020, Japanese Association for Animal Cell Technology
Novel Cyclic N-alkyl Peptides as BFGF Mimetics to Maintain the Pluripotency of Human Induced Pluripotent Stem Cells

Masashi Sato, Hiromi Tanaka, Yoshitsugu Ohnuki, Shinji Masui, Takashi Kawakami, Hiroshi Kurosawa

JAACT2020 Fuchu, Nov 18, 2020, Japanese Association for Animal Cell Technology
ヒト iPS 細胞の未分化増殖を可能にする新規ペプチド化合物の分子進化工学的スクリーニング法による探索及び人工 FGFR アゴニストとしての機能解析

佐藤将, 大貫喜嗣, 升井伸治, 川上隆史, 黒澤尋

第71回日本生物工学会大会, Sep 17, 2019
GSK-3β inhibitor treatment for human iPS cells to form mesoderm differentiation- promoted embryoid bodies

依田聖未, 大貫喜嗣, 升井伸治, 黒澤尋

日本組織培養学会第92回大会, Jul 7, 2019
細胞同一性を制御する転写因子

升井伸治

第41回日本分子生物学会年会, Nov 28, 2018, 日本分子生物学会 Invited
Molecular mechanisms regulating cellular identity

Masui S

The First International Symposium on Immunology and Tissue Regeneration in Okayama / 12th URA International Symposium, Oct 24, 2018, Okayama University Invited
Actin-Srf pathway destabilizes cellular identity by suppressing cell-type-specific gene expression programs

Masui S

Combio 2017, Dec 7, 2017, 日本分子生物学会, 日本生化学会 Invited
Srf destabilizes cellular identity by suppressing cell-type-specific gene expression programs

Masui S, Ikeda T, Hotta A

15th Stem Cell Research Symposium, May 26, 2017
βアクチンは細胞同一性を維持する

升井伸治

第16回日本再生医療学会総会, Mar 8, 2017, 日本再生医療学会 Invited
Actin-Srf pathway destabilizes cell identity

Masui S

Human Frontier Science Program Kick-off Symposium “Nuclear actin in the regulation of transcription and nuclear structure”, Jan 26, 2017 Invited
Hypoxia interferes with iPSC induction from nucleus pulposus cells

Hiraishi S, Sakai D, Ikeda T, Hikichi T, Masui S, Mochida J, Watanabe M

第31回日本整形外科学会基礎学術集会, Oct 14, 2016, 日本整形外科学会
Loss of human corneal epithelial cell identity exhibited by deletion of PAX6 using the CRISPR/Cas9 system

Kitazawa K, Hikichi T, Nakamura T, Sotozono C, Kinoshita S, Masui S

ARVO 2016 Annual Meeting, Sep 3, 2016, Association for Research in Vision and Ophthalmology
非モデル生物遺伝子を用いた新規分化状態維持メカニズム解析系の開発

池田隆, 菅野新一郎, 内山郁夫, 佐々木哲彦, 安井明, 中川誠人, 升井伸治

第68回日本細胞生物学会大会, Jun 15, 2016, 日本細胞生物学会, 日本ケミカルバイオロジー学会
異種生物を利用した新規遺伝子機能解析系

池田隆, 内山郁夫, 佐々木哲彦, 升井伸治

日本動物学会第86回大会, Sep 18, 2015, 日本動物学会
アクチンは細胞のリプログラミングを制御する

池田隆, 引地貴亮, 渡辺亮, 堀田秋津, 升井伸治

第67回日本細胞生物学会大会, Jul 1, 2015, 日本細胞生物学会
Actin regulates cellular reprogramming

Ikeda T, Hikichi T, Watanabe A, Hotta A, Masui S

13th Stem Cell Symposium, May 30, 2015
OVOL2 controls transcriptional programs of ectodermal lineage

Masui S, Kitazawa K, Kinoshita S

13th Stem Cell Symposium, May 30, 2015
異種生物を利用した新規遺伝子機能解析系の開発

池田隆, 内山郁夫, 重信秀治, 佐々木哲彦, 升井伸治

第59回日本応用動物昆虫学会大会, Mar 28, 2015, 日本応用動物昆虫学会
Direct conversion of fibroblasts to human corneal epithelial-like cells by defined factors

Kitazawa T, Hikichi T, Ikeda T, Nakamura T, Ueno M, Kawasaki S, Masui S, Kinoshita S

Asia-ARVO 2015, Feb 16, 2015, Association for Research in Vision and Ophthalmology Invited

Teaching Experience

Professional Memberships

Research Projects

A proposal for "anti-dementia dietary habits" based on healthy longevity epigenomics that links dietary habits and cognitive function

Grants-in-Aid for Scientific Research, Grant-in-Aid for Scientific Research (B), Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2021 - Mar, 2024
Basic development for reprogramming methods and translation of regenerative medicine in intervertebral disc cells

Grants-in-Aid for Scientific Research, Grant-in-Aid for Scientific Research (B), Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2020 - Mar, 2024
細胞非自律的に作用する遺伝子の網羅的同定法開発

科学研究費補助金, 基盤研究（C), 文部科学省, Apr, 2019 - Mar, 2022

升井伸治
ヒト多能性幹細胞株を均質にするための培地添加物

再生医療実用化研究事業, 再生医療（細胞治療）に資する品質を保持したヒト多能性幹細胞（iPS/ES細胞）作製のための基盤的研究, 国立研究開発法人日本医療研究開発機構, Apr, 2019 - Mar, 2021

升井伸治
ヒト多能性幹細胞株を均質にするための培地添加物

再生医療実用化研究事業, 再生医療（細胞治療）に資する品質を保持したヒト多能性幹細胞（iPS/ES細胞）作製のための基盤的研究, 国立研究開発法人日本医療研究開発機構, Apr, 2019 - Mar, 2021

升井伸治
Elucidation of undifferentiated maintaining mechanism of stem cell towards the control of stem cell aging

Grants-in-Aid for Scientific Research, Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory), Japan Society for the Promotion of Science, Jun, 2018 - Mar, 2020

Kuboki Takuo
Intervertebral disc regeneration and transcriptional control of nucleus pulpous progenitor cells by in silico pharmacogenesis and iPS technology

Grants-in-Aid for Scientific Research, Grant-in-Aid for Scientific Research (B), Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2016 - Mar, 2020

SAKAI Daisuke
網羅的ゲノム機能解析法の開発

生命科学研究助成, 武田科学振興財団生命科学研究助成, 2016 - 2016
細胞老化を制御する分子ネットワーク解析

内藤記念科学奨励金・研究助成, 公益財団法人内藤記念科学振興財団, 2015 - 2015
ｉＰＳ干渉の分子機構

科学研究費補助金, 基盤研究（Ｃ）, 文部科学省, 2012 - 2014
転写因子の組み合わせによる分化制御機構の解析

研究助成金, かなえ医薬振興財団, 2013 - 2013
分化細胞のエピゲノム構築機構解析

ライフサイエンス研究奨励, 武田科学振興財団生命科学研究助成, 2012 - 2012
任意細胞の樹立法開発

さきがけ, 科学技術振興機構, 2008 - 2011
多因子発現系を用いた迅速分化誘導法の開発

科学研究費補助金, 挑戦的萌芽研究, 文部科学省, 2010 - 2010
ES細胞特有の細胞増殖調節におけるUTF1遺伝子の役割

科学研究費助成事業, 特定領域研究, 日本学術振興会, 2008 - 2009

奥田晶彦, 升井伸治, 丸山昌良
安全に移植できる細胞を誘導するためのタンパク質導入法の開発

科学研究費補助金, 再生医療実用化研究事業, 厚生労働省, 2008 - 2009
幹細胞における無限自己複製の制御機構

特定領域研究（公募）, 文部科学省, 2008 - 2009
多因子疾患モデルマウスの効率的樹立法の開発

科学研究費補助金, 創薬基盤推進研究事業, 厚生労働省, 2007 - 2009
幹細胞自己複製における転写因子活性化機構

研究助成金, 病態代謝研究会, 2008 - 2008
非心組織からの心血管前駆細胞樹立法の開発

医学系研究奨励, 武田科学振興財団, 2007 - 2007

Industrial Property Rights

特願2009-237407 任意細胞の樹立法開発

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Education

Papers

Misc.

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