宮永顕正 (Akimasa Miyanaga) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院農学生命科学研究科准教授

学位: 博士(農学)(東京大学)

研究者番号: 10623126
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0003-2219-6051
J-GLOBAL ID: 200901081222052406
Researcher ID: C-1472-2015
researchmap会員ID: 5000090599

外部リンク: http://enzyme13.bt.a.u-tokyo.ac.jp/miya/miyanaga1.html

放線菌などの微生物が生産する天然化合物の生合成研究を行なっています。ポリケタイド化合物の複雑な炭素骨格が構築される仕組みに興味があり、ポリケタイド生合成酵素の構造解析や生化学的解析を進めています。

研究キーワード

研究分野

経歴

2023年4月 - 現在

東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 准教授
2016年4月 - 2023年3月

東京工業大学理学院, 助教
2012年4月 - 2016年3月

東京工業大学大学院理工学研究科, 助教
2011年6月 - 2012年3月

東京理科大学理工学部, 助教
2009年4月 - 2011年5月

カリフォルニア大学サンディエゴ校, 博士研究員
2006年4月 - 2009年3月

東京大学大学院農学生命科学研究科, 博士研究員

学歴

2001年4月 - 2006年3月

東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 応用生命工学専攻
- 2001年3月

東京大学, 農学部

委員歴

2023年4月 - 現在

日本農芸化学会関東支部, 支部幹事
2016年9月 - 2025年7月

天然物化学談話会, 世話人
2023年4月 - 2024年3月

日本農芸化学会, 2024年度大会実行委員
2022年12月 - 2022年12月

日本化学会第103春季年会プログラム編成委員

受賞

論文

Protecting Group Strategies in Natural Product Biosynthesis.

Akimasa Miyanaga, Yohei Katsuyama

Journal of natural products 89(1) 39-63 2026年1月23日査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Biosynthesis of Phenolic Lipids by Type III Polyketide Synthases

Akimasa Miyanaga, Yasuo Ohnishi

2026年
Structural insights into lacto-N-biose I recognition by a family 32 carbohydrate-binding module from Bifidobacterium bifidum.

Xinzhe Zhang, Naoki Sunagawa, Toma Kashima, Kiyohiko Igarashi, Akimasa Miyanaga, Shinya Fushinobu

FEBS letters 2025年11月7日査読有り
Crystal structure of plant γ-glutamyl peptidase 1: implications for sulfur metabolism and secondary metabolite biosynthesis.

Kosei Sone, Takehiro Ito, Hibiki Sawada, Chihaya Yamada, Toma Kashima, Akimasa Miyanaga, Naoko Ohkama-Ohtsu, Shinya Fushinobu

The FEBS journal 2025年11月2日査読有り
Ancestral sequence reconstruction as a tool for structural analysis of modular polyketide synthases.

Taichi Chisuga, Shota Takinami, Zengwei Liao, Masayuki Karasawa, Naruhiko Adachi, Masato Kawasaki, Toshio Moriya, Toshiya Senda, Tohru Terada, Fumitaka Kudo …

Nature communications 16(1) 6847-6847 2025年7月25日査読有り最終著者責任著者
Elucidation of interface interactions between a dehydratase domain and an acyl carrier protein in cremimycin polyketide synthase.

Kaede Kotagiri, Haruka Tachibana, Daisuke Kawasaki, Taichi Chisuga, Toma Kashima, Shinya Fushinobu, Fumitaka Kudo, Tadashi Eguchi, Akimasa Miyanaga

FEBS letters 599(8) 1159-1168 2025年4月査読有り最終著者責任著者
Biosynthetic Incorporation of Non-native Aryl Acid Building Blocks into Peptide Products Using Engineered Adenylation Domains.

Fumihiro Ishikawa, Maya Nohara, Akimasa Miyanaga, Satoki Kuramoto, Natsuki Miyano, Shumpei Asamizu, Fumitaka Kudo, Hiroyasu Onaka, Tadashi Eguchi, Genzoh Tanabe

ACS chemical biology 19(12) 2569-2579 2024年12月20日査読有り
The Post-Polyketide Synthase Modification Mechanism in Hitachimycin Biosynthesis.

Fumitaka Kudo, Kazuma Tsuboi, Mutsumi Ikezaki, Daiki Nagayama, Koichi Kawamura, Taishi Ando, Akimasa Miyanaga, Tadashi Eguchi

Chembiochem : a European journal of chemical biology e202400405 2024年6月7日査読有り
Engineering the Substrate Specificity of (S)-β-Phenylalanine Adenylation Enzyme HitB.

Dawei Wang, Akimasa Miyanaga, Taichi Chisuga, Fumitaka Kudo, Tadashi Eguchi

Chembiochem : a European journal of chemical biology e202400383 2024年5月28日査読有り責任著者
Substrate Specificity of Chondroitinase ABC-I Based on Analyses of Biochemical Reactions and Crystal Structure

Ippei Watanabe, Akimasa Miyanaga

Trends in Glycoscience and Glycotechnology 35(208) E94-E99 2023年11月25日査読有り最終著者責任著者
Structural Basis of Amide-Forming Adenylation Enzyme VinM in Vicenistatin Biosynthesis

Akimasa Miyanaga, Kenji Nagata, Joji Nakajima, Taichi Chisuga, Fumitaka Kudo, Tadashi Eguchi

ACS Chemical Biology 18(11) 2343-2348 2023年10月23日査読有り筆頭著者責任著者
Structure-Based Analysis of Transient Interactions between Ketosynthase-like Decarboxylase and Acyl Carrier Protein in a Loading Module of Modular Polyketide Synthase.

Taichi Chisuga, Satoshi Murakami, Akimasa Miyanaga, Fumitaka Kudo, Tadashi Eguchi

ACS chemical biology 18(6) 1398-1404 2023年6月16日査読有り責任著者
Unique Initiation and Termination Mechanisms Involved in the Biosynthesis of a Hybrid Polyketide-Nonribosomal Peptide Lyngbyapeptin B Produced by the Marine Cyanobacterium Moorena bouillonii.

Fumitaka Kudo, Takuji Chikuma, Mizuki Nambu, Taichi Chisuga, Shimpei Sumimoto, Arihiro Iwasaki, Kiyotake Suenaga, Akimasa Miyanaga, Tadashi Eguchi

ACS chemical biology 18(4) 875-883 2023年4月21日査読有り
Acyltransferase Domain Exchange between Two Independent Type I Polyketide Synthases in the Same Producer Strain of Macrolide Antibiotics.

Fumitaka Kudo, Kosuke Kishikawa, Kazuma Tsuboi, Takafusa Kido, Takeo Usui, Junko Hashimoto, Kazuo Shin-Ya, Akimasa Miyanaga, Tadashi Eguchi

Chembiochem : a European journal of chemical biology 24(6) e202200670 2023年3月14日査読有り
Structural Basis of Transient Interactions of Acyltransferase VinK with the Loading Acyl Carrier Protein of the Vicenistatin Modular Polyketide Synthase.

Akimasa Miyanaga, Koichi Kawada, Taichi Chisuga, Fumitaka Kudo, Tadashi Eguchi

Biochemistry 62(1) 17-21 2023年1月3日査読有り筆頭著者責任著者
Cross-Linking of the Nonribosomal Peptide Synthetase Adenylation Domain with a Carrier Protein Using a Pantetheine-Type Probe.

Akimasa Miyanaga, Fumitaka Kudo, Tadashi Eguchi

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2670 207-217 2023年査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Biochemical and crystallographic assessments of the effect of 4,6‐O‐disulfated disaccharide moieties in chondroitin sulfate E on chondroitinase <scp>ABC</scp> I activity

Ippei Watanabe, Akimasa Miyanaga, Hirotaka Hoshi, Kiyoshi Suzuki, Tadashi Eguchi

The FEBS Journal 290(9) 2379-2393 2022年12月7日査読有り
Recent advances in the structural analysis of adenylation domains in natural product biosynthesis

Akimasa Miyanaga, Fumitaka Kudo, Tadashi Eguchi

Current Opinion in Chemical Biology 102212-102212 2022年12月査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Recent advances in the structural biology of modular polyketide synthases and nonribosomal peptide synthetases.

Yohei Katsuyama, Akimasa Miyanaga

Current opinion in chemical biology 71 102223-102223 2022年10月17日査読有り招待有り最終著者
Structural Basis of Stereospecific Vanadium-Dependent Haloperoxidase Family Enzymes in Napyradiomycin Biosynthesis.

Percival Yang-Ting Chen, Sanjoy Adak, Jonathan R Chekan, David K Liscombe, Akimasa Miyanaga, Peter Bernhardt, Stefan Diethelm, Elisha N Fielding, Jonathan H George, Zachary D Miles …

Biochemistry 61(17) 1844-1852 2022年9月6日査読有り

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MISC

アミノグリコシド抗生物質ブチロシン生合成酵素の構造解析

坂本葵, 千菅太一, 宮永顕正, 工藤史貴, 江口正

Photon Factory Activity Report 2023 2024年4月
ポリケタイド合成酵素におけるケト合成酵素様脱炭酸酵素ドメインの構造解析

千菅太一, 永井瑛, 宮永顕正, 工藤史貴, 江口正

Photon Factory Activity Report 2021 2022年4月
アミノグリコシド抗生物質カナマイシン生合成酵素の構造解析

宮永顕正, 北山幸延, 工藤史貴, 江口正

Photon Factory Activity Report 2019 2020年4月
新規 GH ファミリー (GH162) に属する真核生物由来 β-1,2-グルカナーゼの結晶構造及び反応機構の解析

田中信清, 中島将博, 宮永顕正, 中井博之, 田口速男

Photon Factory Activity Report 2018 2019年
Bacteroides thetaiotaomicron 由来β-グルコシダーゼの結晶構造解析

中島将博, 田中信清, 宮永顕正, 中井博之, 田口速男

Photon Factory Activity Report 2018 2019年
タンパク質の結晶構造解析からわかること

宮永顕正

化学と教育 66(12) 578-579 2018年12月招待有り
新規なβ-アミノ酸生合成酵素の構造機能解析

宮永顕正, 千菅太一, 工藤史貴, 江口正

Photon Factory Activity Report 2017 PartB 2018年6月
酵素を試験管内で進化させる

宮永顕正

化学 73(4) 63 2018年3月招待有り
Lachnoclostridium phytofermentans由来1,2-β-オリゴグルカンホスホリラーゼの結晶構造解析

中島将博, 古川那由太, 宮永顕正, 中井博之, 田口速男

Photon Factory Activity Report 35 2017年
天然物生合成酵素によるキャリアータンパク質の認識機構

宮永顕正, 工藤史貴, 江口正

バイオサイエンスとインダストリー 74(5) 382-387 2016年9月招待有り
ポリケタイド化合物の分子多様性を生み出す生合成酵素の結晶構造解析

宮永顕正, 篠原雄治, 岩沢翔平, 工藤史貴, 江口正

Photon Factory Activity Report 2015 PartB 2016年3月
Listeria innocua由来β-グルコシダーゼの機能解析と構造解析

中島将博, 吉田龍太, 宮永顕正, 中井博之, 田口速男

Photon Factory Activity Report 33 2015年
β-アミノ酸含有マクロラクタム抗生物質の生合成

工藤史貴, 宮永顕正, 江口正

化学と生物 52(12) 830-835 2014年12月招待有り
ビセニスタチンの特異アミノ酸スターターユニット生合成酵素の結晶構造解析

宮永顕正, 篠原雄治, 工藤史貴, 江口正

Photon Factory Activity Report 2013 Part B 2014年7月
フラビン酵素による酸化反応がFavorskii転位反応を引き起こす

宮永顕正

ライフサイエンス新着論文レビュー 2013年11月招待有り
立体特異的2-ヒドロキシ酸脱水素酵素群の比較構造解析

宮永顕正, 中島将博, 田口速男

Photon Factory Activity Report 2012 Part B 2013年7月
フェノール性脂質の生合成に関わる新規な脂肪酸合成酵素

Miyanaga, A, Funa, N, Horinouchi, S

酵素工学ニュース 59 25-29 2008年招待有り
New structural insights on carbohydrate-active enzymes

Fushinobu, S, Hidaka, M, Miyanaga A, Imamura, H

J. Appl. Glycosci. 54(2) 95-102 2007年
GH54 alpha-L-アラビノフラノシダーゼの構造決定と機能解析

宮永顕正

博士論文 2006年3月
Crystal structure of GH54 alpha-L-arabinofuranosidase and unique function of CBM42 attached to it

Miyanaga, A, Koseki, T, Matsuzawa, H, Wakagi, T, Shoun, H, Fushinobu, S

J. Appl. Glycosci. 53(2) 143-148 2006年

書籍等出版物

酵素応用の技術と市場2025

シーエムシー出版編集部, 井上, 國世 (担当:分担執筆, 範囲:ポリケタイド合成酵素の反応とその応用)

シーエムシー出版 2025年8月 (ISBN: 9784781318714)
New Tide of Natural Product Chemistry (Ishikawa H. and Takayama H. ed.)

Miyanaga A (担当:分担執筆, 範囲:Biosynthesis of β-Amino Acid-Containing Macrolactam Polyketides)

Springer 2023年6月 (ISBN: 9789819917143) 査読有り
Biogenesis of Fatty Acids, Lipids and Membranes. Handbook of Hydrocarbon and Lipid Microbiology. (Geiger O. ed.)

Miyanaga A, Ohnishi Y (担当:分担執筆, 範囲:Type III Polyketide Synthases Responsible for Phenolic Lipid Synthesis, Phenolic Lipids Synthesized by Type III Polyketide Synthases)

Springer 2017年1月 (ISBN: 9783319436760)
Handbook of Hydrocarbon and Lipid Microbiology (Timmis, K.N., ed.)

Miyanaga A, Horinouchi S (担当:分担執筆, 範囲:Type III polyketide synthases responsible for phenolic lipid synthesis, Phenolic lipids synthesized by type III polyketide synthases.)

Springer 2010年 (ISBN: 9783540775881)

講演・口頭発表等

ポリケタイド化合物の生合成に関わる酵素群の構造と機能

第51回農芸化学「化学と生物」シンポジウム 2024年7月招待有り
Structural analysis of two unique adenylation enzymes in the biosynthesis of β-amino acid-containing macrolactam polyketides

10th US-Japan Seminar on the biosynthesis of Natural Products 2024年5月招待有り
マクロラクタム抗生物質ヒタチマイシンの生合成研究

第64回天然有機化合物討論会 2022年9月
カナマイシン生合成酵素KanD2とKanJの結晶構造解析

2020年度量子ビームサイエンスフェスタ 2021年3月
クレミマイシン生合成における3-アミノノナン酸ユニット構築に関わる酵素の構造機能解析

第61回天然有機化合物討論会 2019年9月
ヒタチマイシン生合成におけるポストPKS反応の解析

野田産業研究所 2017年度「奨励研究助成」成果報告 2019年5月
Structural basis of protein–protein interactions between acyltransferase and acyl carrier protein in trans-AT polyketide synthases

2nd China-Japan Joint Symposium on Natural Product Biosynthesis 2019年1月
ポリケタイド生合成におけるアシルキャリアータンパク質認識機構の解析

第19回酵素応用シンポジウム受賞講演 2018年6月招待有り
放線菌が生産するポリケタイド化合物のユニークな生合成マシナリー

第4回天然物化学研究会 2017年12月招待有り
ポリケタイド化合物の分子多様性を生み出す生合成酵素の構造機能研究

日本農芸化学会関東支部2017年度第1回支部例会 2017年7月招待有り
非天然マクロラクタム化合物の微生物発酵生産

発酵研究所第11回助成研究報告会 2017年6月
Structural analysis of macrolactam biosynthetic enzymes

The 2nd A3 Foresight Symposium on “Chemical & Synthetic Biology of Natural Products” 2017年5月
Structural analysis of vicenistatin biosynthetic enzymes for elucidating the β-amino acid incorporation mechanism

Directing Biosynthesis V 2017年3月
ポリケタイド化合物の分子多様性を生み出す生合成酵素の構造機能研究

日本農芸化学会2017年度大会受賞講演 2017年3月
Structural analysis of macrolactam biosynthetic enzymes

2nd US-Japan Seminar on the Biosynthesis of Natural Products for Young Researchers 2017年3月
Fluvirucin B2 生合成遺伝子クラスターの同定と機能解析

第31回日本放線菌学会 2016年9月
ポリケタイド生合成におけるアシルキャリアータンパク質認識機構

第60回日本薬学会関東支部大会 2016年9月招待有り
ポリケタイド生合成酵素の構造機能解析

日本農芸化学会2016年度大会シンポジウム 2016年3月招待有り
Functional and structural analysis of β-amino acid-activating adenylation enzymes in macrolactam biosynthesis

PACIFICHEM 2015 2015年12月
マクロラクタム抗生物質ビセニスタチン生合成酵素の構造機能解析に基づくβ-アミノ酸スターター部位構築機構の解明

第57回天然有機化合物討論会 2015年9月

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担当経験のある科目(授業)

所属学協会

2014年 - 現在

日本放線菌学会
2013年 - 現在

日本蛋白質科学会
2001年 - 現在

日本農芸化学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

実験科学と情報科学の融合によるモジュール型PKSの構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2025年4月 - 2029年3月

宮永顕正
クロスリンク反応を利用したポリケタイド合成酵素の構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2020年4月 - 2025年3月

宮永顕正
アシル基転移酵素によるキャリアータンパク質認識機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2017年4月 - 2021年3月

宮永顕正
ポリケタイド生合成におけるアシルキャリアータンパク質認識機構の解析

天野エンザイム科学技術振興財団 2018年8月

宮永顕正
ヒタチマイシン生合成におけるポストPKS反応の解析

野田産業科学研究所奨励研究助成 2017年4月 - 2018年3月

宮永顕正
ユニークな基質特異性を持つアシル基転移酵素の構造機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2015年4月 - 2017年3月

宮永顕正
非天然マクロラクタム化合物の微生物発酵生産

公益財団法人発酵研究所一般研究助成 2015年4月 - 2017年3月

宮永顕正
有用物質産生へ向けたATP依存型リガーゼの構造機能研究

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2013年4月 - 2015年3月

宮永顕正
タンパク質間相互作用解析を指向したクロスリンク法開発

東工大基金「研究の種発掘」支援 2014年2月 - 2015年1月

宮永顕正
多機能型シトクロム P450 モノオキシゲナーゼ GfsF の構造機能研究

農芸化学研究奨励会研究奨励金 2013年4月 - 2014年3月

宮永顕正
海洋放線菌の二次代謝産物生合成酵素の機能解析

日本学術振興会海外特別研究員 2009年4月 - 2011年3月
カビ・キノコの新規糖質関連酵素のX線結晶構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2005年 - 2005年

宮永顕正

産業財産権

特開2003-88384 新規なニトリルヒドラターゼ

宮永顕正, 伏信進矢, 若木高善, 伊藤潔
特開2004-261105 新規なニトリルヒドラターゼ

宮永顕正, 伏信進矢, 若木高善, 伊藤潔

社会貢献活動

天然からの贈り物〜抗生物質の発見と生合成

運営参加・支援

「生合成マシナリー」総括班（文部科学省新学術領域研究）サイエンスアゴラ2013 2013年11月
進化する天然物質！〜医薬品から最強の毒素まで〜

運営参加・支援

「生合成マシナリー」総括班（文部科学省新学術領域研究）サイエンスアゴラ2012 2012年11月

宮永顕正

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

委員歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

社会貢献活動

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