伊藤拓宏 (Takuhiro Ito) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人理化学研究所統合生命医科学研究センターチームディレクター

学位: 博士（理学）(東京大学)

J-GLOBAL ID: 200901041549747481
researchmap会員ID: 5000090937

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研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 /

論文

Human DHX29 detects non-optimal codon usage to regulate mRNA stability

Akira Fukao, Toshinobu Fujiwara, Wakana Iwasaki, Takuhiro Ito, Osamu Takeuchi, Masanori Yoshinaga, Tsutomu Suzuki, Daron M Standley, Michael C Bassik, Hirotaka Toh …

Science 2026年3月19日
Structural insights into the role of eIF3 in translation mediated by the HCV IRES.

Wakana Iwasaki, Kazuhiro Kashiwagi, Ayako Sakamoto, Madoka Nishimoto, Mari Takahashi, Kodai Machida, Hiroaki Imataka, Akinobu Matsumoto, Yuichi Shichino, Shintaro Iwasaki …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 122(49) e2505538122 2025年12月9日
Hypoxia-induced ribosomal RNA modifications in the peptidyl-transferase center contribute to anaerobic growth of bacteria

Kensuke Ishiguro, Karin Midorikawa, Naoki Shigi, Satoshi Kimura, Aivar Liiv, Takeshi Yokoyama, Takuhiro Ito, Mikako Shirouzu, Jaanus Remme, Kenjyo Miyauchi …

Molecular Cell 2025年12月
eIF2D promotes 40S ribosomal subunit recycling during intrinsic ribosome destabilization.

Kazuya Ichihara, Taichi Shiraishi, Yuhei Chadani, Yuki Kito, Chisa Shiraishi, Mina Hirata, Yuta Takahashi, Akinao Kobo, Atsushi Hatano, Masaki Matsumoto …

Nucleic acids research 53(22) 2025年11月26日
Structural analysis of a symbiotic system involving a Nanobdellati archaeon by cryo-electron tomography

Sakurako Goto-Ito, Shingo Kato, Mari Takahashi, Ayako Sakamoto, Atsushi Yamagata, Yongchan Lee, Haruhiko Ehara, Mayuko Sato, Kiminori Toyooka, Moriya Ohkuma …

The Journal of Biochemistry 179(1) 21-30 2025年10月29日
The interferon-stimulated gene product HERC5 inhibits human LINE-1 retrotransposition with an ISGylation-independent mechanism

Kei Nishimori, Ahmad Luqman-Fatah, Yuzo Watanabe, Mari Takahashi, Takuhiro Ito, Fuyuki Ishikawa, Tomoichiro Miyoshi

2025年9月10日
Girolline is a sequence context-selective modulator of eIF5A activity.

Tilman Schneider-Poetsch, Yongjun Dang, Wakana Iwasaki, Mayumi Arata, Yuichi Shichino, Ali Al Mourabit, Celine Moriou, Daniel Romo, Jun O Liu, Takuhiro Ito …

Nature communications 16(1) 223-223 2025年1月10日
DMDA-PatA mediates RNA sequence-selective translation repression by anchoring eIF4A and DDX3 to GNG motifs

Hironori Saito, Yuma Handa, Mingming Chen, Tilman Schneider-Poetsch, Yuichi Shichino, Mari Takahashi, Daniel Romo, Minoru Yoshida, Alois Fürstner, Takuhiro Ito …

Nature Communications 2024年9月2日
Sense codon-misassociated eRF1 elicits ribosome stalling and induction of quality control

Peixun Han, Mari Mito, Akira Yamashita, Takuhiro Ito, Shintaro Iwasaki

2024年9月1日
eIF4A1 enhances LARP1-mediated translational repression during mTORC1 inhibition.

Yuichi Shichino, Tomokazu Yamaguchi, Kazuhiro Kashiwagi, Mari Mito, Mari Takahashi, Takuhiro Ito, Nicholas T Ingolia, Keiji Kuba, Shintaro Iwasaki

Nature structural & molecular biology 2024年5月21日
Boric acid intercepts 80S ribosome migration from AUG-stop by stabilizing eRF1

Mayuki Tanaka, Takeshi Yokoyama, Hironori Saito, Madoka Nishimoto, Kengo Tsuda, Naoyuki Sotta, Hideki Shigematsu, Mikako Shirouzu, Shintaro Iwasaki, Takuhiro Ito …

Nature Chemical Biology 2024年1月24日
Switching on stress

Kazuhiro Kashiwagi, Takuhiro Ito

Nature Chemical Biology 2023年11月9日
Protection of eIF2B from inhibitory phosphorylated eIF2: A viral strategy to maintain mRNA translation during the PKR-triggered integrated stress response

Takuhiro Ito, Jennifer Deborah Wuerth, Friedemann Weber

Journal of Biological Chemistry 2023年11月
リボソームプロファイリングにおけるフットプリント伸長の解剖学的解析から明らかとなったバクテリアにおけるリボソームのコンフォメーション・ランドスケープ(Anatomy of footprint extension in ribosome profiling reveals a conformational landscape of ribosomes in bacteria)

藤博貴, 藤田智也, 横山武司, 田口英樹, 伊藤拓宏, 岩崎信太郎

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 96回 [1T12a-438)] 2023年10月
Nondomain biopolymers: Flexible molecular strategies to acquire biological functions

Kazuharu Arakawa, Tetsuro Hirose, Toshifumi Inada, Takuhiro Ito, Toshie Kai, Masaaki Oyama, Yukihide Tomari, Takao Yoda, Shinichi Nakagawa

Genes to Cells 2023年8月
A parasitic fungus employs mutated eIF4A to survive on rocaglate-synthesizing Aglaia plants

Mingming Chen, Naoyoshi Kumakura, Ryan Muller, Yuichi Shichino, Madoka Nishimoto, Mari Mito, Pamela Gan, Nicholas T. Ingolia, Ken Shirasu, Takuhiro Ito …

eLife 2022年7月4日
eIF4A阻害剤のRNA配列特異性に対する動的FMO解析

半田佑磨, 川嶋裕介, 古石誉之, 米持悦生, 伊藤拓宏, 斉藤大寛, 岩崎信太朗, 加藤幸一郎, 渡邉千鶴, 本間光貴 …

日本薬学会年会要旨集 142年会 27C-am11S 2022年3月
Conformational alterations in unidirectional ion transport of a light-driven chloride pump revealed using X-ray free electron lasers.

Toshiaki Hosaka, Takashi Nomura, Minoru Kubo, Takanori Nakane, Luo Fangjia, Shun-Ichi Sekine, Takuhiro Ito, Kazutaka Murayama, Kentaro Ihara, Haruhiko Ehara …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 119(9) 2022年3月1日
The landscape of translational stall sites in bacteria revealed by monosome and disome profiling.

Tomoya Fujita, Takeshi Yokoyama, Mikako Shirouzu, Hideki Taguchi, Takuhiro Ito, Shintaro Iwasaki

RNA (New York, N.Y.) 28(3) 290-302 2021年12月14日
A specific eIF4A paralog facilitates LARP1-mediated translation repression during mTORC1 inhibition

Yuichi Shichino, Mari Mito, Kazuhiro Kashiwagi, Mari Takahashi, Takuhiro Ito, Nicholas T. Ingolia, Shintaro Iwasaki

2021年9月19日

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MISC

C型肝炎ウイルスIRESを介した翻訳におけるeIF3の役割に関する構造生物学的考察

岩崎わかな, 松本有樹修, 岩崎信太郎, 今高寛晃, 今見考志, 伊藤拓宏

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 47th 2024年
リボソームプロファイリングを用いた原核生物の翻訳構造動態の解明

藤博貴, 藤田智也, 藤田智也, 横山武司, 横山武司, 田口英樹, 田口英樹, 伊藤拓宏, 岩崎信太郎, 岩崎信太郎

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 47th 2024年
eIF4A阻害剤のRNA配列特異性に対する分子動力学計算と量子化学計算を用いた解析

半田佑磨, 半田佑磨, 斉藤大寛, 斉藤大寛, 奥脇弘次, 古石誉之, 米持悦生, 加藤幸一郎, 渡邉千鶴, 本間光貴 …

日本薬学会年会要旨集(Web) 144th 2024年
リボソームプロファイリングのフットプリンティング拡張の分析から細菌のリボソーム構造的眺望

藤博貴, 藤田智也, 藤田智也, 横山武司, 横山武司, 田口英樹, 田口英樹, 伊藤拓宏, 岩崎信太郎, 岩崎信太郎

日本生化学会大会(Web) 96th 2023年
統合的ストレス応答における翻訳制御の構造生物学—Structural biology of translation regulation in the integrated stress response—特集翻訳制御の最前線

柏木一宏, 伊藤拓宏

細胞 54(12) 688-691 2022年11月
翻訳開始因子eIF4A1はLARP1による翻訳抑制を促進する

七野悠一, 水戸麻理, 柏木一宏, 高橋真梨, 伊藤拓宏, NICHOLAS Ingolia, 岩崎信太郎, 岩崎信太郎

日本プロテオーム学会大会プログラム・抄録集 2022 (Web) 2022年
翻訳開始因子複合体の阻害剤認識におけるRNA配列特異性のための動的FMO解析【JST・京大機械翻訳】

HANDA Yuma, KAWASHIMA Yusuke, FURUISHI Takayuki, YONEMOCHI Etsuo, ITO Takuhiro, SAITO Hironori, SAITO Hironori, IWASAKI Shintaro, IWASAKI Shintaro, WATANABE Chiduru …

CBI学会大会 2021 (CD-ROM) 2021年
eIF2B結合性ウイルスタンパク質NSsによる統合的ストレス応答抑制

池内与志穂, 岩崎信太郎, 伊藤拓宏

日本生化学会大会(Web) 94th 2021年
Rocaglamide Aによる配列特異的な翻訳阻害の構造基盤

岩崎わかな, 高橋真梨, INGOLIA Nicholas T, 岩崎信太郎, 伊藤拓宏

日本RNA学会年会要旨集 20th 34 2018年7月9日
抗体抗原複合体の立体構造解析のための低分子化抗体の無細胞タンパク質合成

松田貴意, 伊藤拓宏, 池田眞理子, 大沢登, 竹本千重, 新野睦子, 横山茂之, 黒澤良和, 白水美香子

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 39th 2016年
Structural insight into the eIF2-eIF2B interaction

Kazuhiro Kashiwagi, Takuhiro Ito, Shigeyuki Yokoyama

Acta Crystallographica Section A Foundations and Advances 70(a1) C1390-C1390 2014年8月5日
Crystallographic and mutational studies on the tRNA thiouridine synthetase TtuA (vol 81, pg 1232, 2013)

Hirofumi Nakagawa, Mitsuo Kuratani, Sakurako Goto-Ito, Takuhiro Ito, Kazushige Katsura, Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Shun-ichi Sekine, Naoki Shigi, Shigeyuki Yokoyama

PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS 82(7) 1551-1551 2014年7月
Structural basis of the glutaminyl-tRNA synthesis in bacteria

Takuhiro Ito, Shigeyuki Yokoyama

Seikagaku 83(11) 1047-1050 2011年
hU2AF^<65>の2つのRNA結合ドメインの立体構造解析

伊藤拓宏, 武藤裕, 横山茂之

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 21 445-445 1998年12月1日

共同研究・競争的資金等の研究課題

非ドメイン型バイオポリマーの立体構造・相互作用解析

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2021年9月 - 2026年3月

伊藤拓宏, 西増弘志
非ドメイン型バイオポリマー領域の組織運営

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2021年9月 - 2026年3月

中川真一, 廣瀬哲郎, 尾山大明, 稲田利文, 荒川和晴, 甲斐歳恵, 依田隆夫, 伊藤拓宏, 泊幸秀
リボソームの不均一性から生み出される細胞・組織特異的翻訳開始制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2025年3月

藤原俊伸, 三嶋雄一郎, 伊藤拓宏
リボソームの不均一性から生み出される細胞・組織特異的翻訳開始制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2025年3月

藤原俊伸, 三嶋雄一郎, 伊藤拓宏
複合体間の動的な相互作用による翻訳制御の構造基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2019年4月 - 2022年3月

伊藤拓宏
ウイルスが引き起こす非標準的な翻訳機構の構造基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2017年4月 - 2019年3月

伊藤拓宏
HCV IRESによるリボソーム・ハイジャックの分子機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2016年4月 - 2019年3月

伊藤拓宏, 今高寛晃, 重松秀樹, 横山武司, 柏木一宏
ピコルナウイルスの２Ａペプチドの終止コドン非依存的翻訳終結の構造基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2015年4月 - 2017年3月

伊藤拓宏
翻訳開始因子ｅＩＦ２Ｂの機能発現の構造基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2013年4月 - 2015年3月

伊藤拓宏
翻訳開始因子ｅＩＦ２の機能発現の構造的基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 2011年4月 - 2015年3月

伊藤拓宏
プラズマ援用生体物質結晶化

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2011年 - 2012年

伊藤剛仁, 伊藤拓宏, 横山茂之
転写・翻訳を担う超分子複合体RNAポリメラーゼおよびリボソームの結晶構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2008年 - 2011年

横山茂之, 関根俊一, 伊藤拓宏, 藤井佳史, 関根俊一, 伊藤拓宏, 藤井佳史
tRNA37位修飾反応の構造的基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2008年 - 2009年

伊藤拓宏

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