村上康文 (Yasufumi Murakami) - マイポータル

基本情報

学位: 薬学博士(東京大学)

連絡先: yasufumirs.noda.tus.ac.jp
J-GLOBAL ID: 200901089868575661
researchmap会員ID: 6000005006

研究キーワード

ゲノム生物学的な手法による遺伝子機能解析

研究分野

ライフサイエンス / ゲノム生物学 /

学歴

委員歴

2017年4月 - 2022年12月

Austin Journal of Cancer and Clinical Research, Member of Editorial Board
2017年4月 - 2022年12月

International Journal of Immunology and Immunotherapy, Member of Editorial Board
2017年4月 - 2022年12月

学会誌及び論文誌の編集者
2017年4月 - 2022年3月

International journal of Biomedical Engineerinig and Science, Member of Editorial Board
2017年4月 - 2022年3月

学会誌及び論文誌の編集者
2014年10月 - 2022年3月

ゲノム創薬医療フォーラム, 幹事
2017年4月 - 2021年12月

International Journal of Cancer & Cellular Biology Research, Editor
2017年4月 - 2021年12月

学会誌及び論文誌の編集者
2005年4月 - 2016年3月

首都圏バイオゲノムベンチャーネットワーク, 運営委員
2004年4月 - 2014年3月

DNA工学研究会, 代表
2003年4月 - 2004年3月

DNA工学研究会, 代表
2002年4月 - 2003年3月

ゲノム創薬フォーラム, 幹事
2002年4月 - 2003年3月

DNA工学研究会, 代表

論文

Dysfunction of poly(ADP-ribose) glycohydrolase induces a synthetic lethal effect in dual specificity phosphatase 22-deficient lung cancer cells.

Sasaki Y, Fujimori H, Hozumi M, Onodera T, Nozaki T, Murakami Y, Ashizawa K, Inoue K, Koizumi F, Masutani M

CANCER RES canres.1037.2018. doi: 10.1158 2019年5月査読有り
Identification of GA-Binding Protein Transcription Factor Alpha Subunit (GABPA) as a Novel Bookmarking Factor.

Goto S, Takahashi M, Yasutsune N, Inayama S, Kato D, Fukuoka M, Kashiwaba SI, Murakami Y

INT J MOL SCI 2019 Mar 4;20(5). pii: E1093. 2019年3月査読有り
Stratification of mouse vaginal epithelium 2. Identification of factors inducing stratification.

Takashina R, Nakajima T, Umezu T, Komatsu K, Banba T, Asada T, Ohse K, Murakami Y, Tomooka Y

BIOL REPROD 2018 Oct 1;99(4):727-734. doi: 2018年10月査読有り
Onset of deaminase APOBEC3B induction in response to DNA double-strand breaks.

Shimizu A, Fujimori H, Minakawa Y, Matsuno Y, Hyodo M, Murakami Y, Yoshioka K

BIOCHEM BIOPH REP. 2018 Oct 30;16:115-121. doi: 1 2018年10月査読有り
A multiplex RNA quantification method to determine the absolute amounts of mRNA without reverse transcription

Maasa Yokomori, Osamu Gotoh, Yasufumi Murakami, Kenzo Fujimoto, Akira Suyama

ANALYTICAL BIOCHEMISTRY 539 96-103 2017年12月査読有り
A multiplex RNA quantification method to determine the absolute amounts of mRNA without reverse transcription.

Yokomori M, Gotoh O, Murakami Y, Fujimoto K, Suyama A

ANAL BIOCHEM 2017 Dec 15;539:96-103. doi: 1 2017年5月査読有り
Gamma-irradiated quiescent cells repair directly induced double-strand breaks but accumulate persistent double-strand breaks during subsequent DNA replication

Minakawa Y, Atsumi Y, Shinohara A, Murakami Y, Yoshioka KI

Genes Cells. 2016 Jun 2. doi: 10.1111/gtc.1 2016年6月査読有り
PARG inhibitors and functional PARG inhibition models.

Apr

Current Protein Peptide Science 2016 Apr 19. 2016年4月査読有り
Proteomic analysis of cellular response induced by boron neutron capture reaction in human squamous cell carcinoma SAS cells

Sato A, Itoh T, Imamichi S, Kikuhara S, Fujimori H, Hirai T, Saito S, Sakurai Y, Tanaka H, Nakamura H …

APPLIED RADIATION AND ISOTOPES 106 113-219 2015年12月査読有り
A comprehensive analysis of radiosensitization targets; functional inhibition of DNA methyltransferase 3B radiosensitizes by disrupting DNA damage responses

Fujimori H, Sato A, Kikuhara S, Junhui W, Hirai T, Sasaki Y, Murakami Y, Okayasu R, Masutani M

Scientific Reports 5 18231 2015年12月査読有り
Immunization method for multi-pass membrane proteins using highly metastatic cell lines

Hiroyuki Satofuka, Yoko Okabe, Yuki Takano, Takahiko Utsugi, Masaya Ohtsu, Yasufumi Murakami

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 450(1) 99-104 2014年7月査読有り
A gain-of-function screen to identify genes that reduce lifespan in the adult of Drosophila melanogaster.

Nakayama M, Ishibashi T, Ishikawa HO, Sato H, Usui T, Okuda T, Yashiro H, Ishikawa H, Taikou Y, Minami A …

BMC GENETICS 2014年4月査読有り
Histological and biochemical analysis of DNA damage after BNCT in rat model

Mitsuko Masutani, Diaz Baiseitov, Tasuku Itoh, Takahisa Hirai, Kulzhan Berikkhanova, Yasufumi Murakami, Zhaxybay Zhumadilov, Yoshio Imahori, Masaharu Hoshi, Jun Itami

Applied Radiation and Isotopes 88 104-108 2014年査読有り
The H19 induction triggers trophoblast lineage commitment in mouse ES cells

Hiroaki Fujimori, Hiroaki Mukai, Yasufumi Murakami, Myriam Hemberger, Yoshitaka Hippo, Mitsuko Masutani

Biochemical and Biophysical Research Communications 436(2) 313-318 2013年6月28日査読有り
α-1,6-Fucosyltransferase (FUT8) Inhibits Hemoglobin Production during Differentiation of Murine and K562 Human Erythroleukemia Cells.

Sasaki H, Toda T, Furukawa T, Mawatari Y, Takaesu R, Shimizu M, Wada R, Kato D, Utsugi T, Ohtsu M …

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 288(23) 16839-16847 2013年6月査読有り
Interactomic approach for evaluating nucleophosmin-binding proteins as biomarkers for Ewing's sarcoma

Ayako Haga, Yoko Ogawara, Daisuke Kubota, Issay Kitabayashi, Yasufumi Murakami, Tadashi Kondo

ELECTROPHORESIS 34(11) 1670-1678 2013年6月査読有り
Trapping DNA replication origins from the human genome

Eki T, Murakami Y, Hanaoka F

Genes 4(2) 198-225 2013年4月査読有り
Identification of preferentially reactivated genes during early G1 phase using nascent mRNA as an index of transcriptional activity

Masashi Fukuoka, Ataru Uehara, Katsuya Niki, Shunya Goto, Dai Kato, Takahiko Utsugi, Masaya Ohtsu, Yasufumi Murakami

Biochemical and Biophysical Research Communications 430(3) 1005-1010 2013年1月18日査読有り
AP-1 is involved in ICOS gene expression downstream of TCR/CD28 and cytokine receptor signaling

Masashi Watanabe, Shinsuke Nakajima, Kazunobu Ohnuki, Shuhei Ogawa, Masakatsu Yamashita, Toshinori Nakayama, Yasufumi Murakami, Kazunari Tanabe, Ryo Abe

EUROPEAN JOURNAL OF IMMUNOLOGY 42(7) 1850-1862 2012年7月査読有り
The transcription factor AP-1 is involved in ICOS gene expression downstream of TCR/CD28 signaling and cytokine receptor signaling.

Watanabe M, Nakajima S, Kazunobu O, Ogawa S, Yamashita M, Nakayama T, Murakami Y, Tanabe K, Abe R

European Journal of Immunology 2012年4月査読有り

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MISC

DNAマイクロアレイ

BTJジャーナル (2005,12月号) 6-9 2005年12月
DNAマイクロアレイ

日経バイオビジネス (2005,6月号) 78-81 2005年6月
出葉酵母遺伝子の機能解析研究の展開

生体の科学 6 2002年11月
ポストゲノム時代における学際領域の展開

マテリアルインテグレーション 4 2002年3月
ゲノム解析研究の最前線（３）副題：ゲノムの多様性解析

現代化学 8 2002年3月
遺伝子発現制御ネットワーク解析のアプローチとその課題

遺伝子医学 6 2001年8月
２１世紀のゲノム科学の展開

現代科学 7 2001年2月
ポストゲノム技術の最新動向

バイオインダストリー (5) 9 2001年2月
創薬研究のパラダイムシフト

現代科学 6 2000年9月
ヒトゲノム解析プロジェクトの現段階

現代科学 7 2000年8月
DNAチップ技術の現状

現代科学 9 2000年7月
ゲノム解析多様性の現状

現代科学 8 2000年4月
ゲノム解析研究の最前線（２）副題：ゲノム解析と可能にした技術

現代化学 8 2000年2月
ゲノム解析研究の最前線（１）副題：ゲノム解析研究の現状と展望

現代化学 7 2000年1月
モデル生物ゲノム解析から機能への展開

実験医学 4 1999年10月

書籍等出版物

分子細胞生物学事典

川崎勝巳, 村上康文, 島田浩章, 田村浩二, 大津正也, 堀越正美, 三浦成敏, 十島二朗, 西村有平, 田中利男, 前田礼男, 松野健治, 友岡康弘, 山本一夫, 井上純一郎, 山本拓也, 北村大介, 浴俊彦, 目加田和之, 吉木淳, 菅澤薫, 桂進司, 加藤大 (担当:共著)

株式会社みみずく舎 2013年1月29日 (ISBN: 9784863991699)
個別化医療第12章抗体医薬の開発戦略と個別化医療を執筆

村上康文 (担当:共著)

（株）技術情報協会 2011年4月28日
クラーク分子生物学

田沼靖一監訳, 村上康文, 名で分担翻訳 (担当:共訳)

丸善出版社 2007年12月10日 (ISBN: 9784621079188)
ポストゲノムの分子生物学入門

村上康文, 浴俊彦, 宇津木孝彦, 田代文夫, 長谷川伸彦, 辻孝, 養王田正文, 小野田文俊, 宮崎智 (担当:共著)

講談社 2007年5月10日
シゲマツ先生の学問のすすめ

村上康文, 本川達雄, 武内ゆかり, 都築幹夫, 福田豊, 伊藤谷生, 土屋晋, 岡本伸之, 八木宏典, 半澤惠, 渡辺精一, 河原輝彦 (担当:監修)

岩崎書店 2006年4月10日
細胞生物学事典

石川 (担当:共著)

朝倉書店 2005年2月25日
ゲノム研究ハンドブック

厚井融也 (担当:共著)

羊土社 2004年10月25日
新・ラボマニュアル遺伝子工学

宇津木 (担当:共著)

丸善株式会社 2003年9月25日
ポストゲノムの分子生物学

(担当:共著)

東京化学同人 2003年7月25日
バイオインフォマティクスの実際

共著者数, 名代表編者 (担当:共著)

講談社 2003年1月10日
ゲノム解析は何をもたらすか

村上康文

東京化学同人 2002年10月3日
DNAチップ応用技術

31人 (担当:共著)

㈱CMC 2000年7月31日
ゲノム創薬の新潮流

21人 (担当:共著)

㈱CMC 2000年7月25日
ゲノム機能研究プロトコール “出芽酵母遺伝子の発現プロファイルの解析”

藤森文啓, 奥原康司, 村上康文 (担当:共著)

羊土社 2000年3月
ゲノム機能研究プロトコール “ゲノム機能解析の実際 -1酵母”

奥原康司, 藤森文啓, 村上康文 (担当:共著)

羊土社 2000年3月
ゲノム機能研究プロトコール “SNPsとゲノムの多様性解析”

古谷利夫, 村上康文 (担当:共著)

羊土社 2000年3月

講演・口頭発表等

Bookmarking候補転写因子の分裂期クロマチンへの結合能の評価

高橋将史, 後藤峻也, 安恒徳美, 稲山純生, 柏葉脩一郎, 村上康文

第40回日本分子生物学会年会 2018年12月7日
GABPAとヒストンアセチル化は早期G1期遺伝子に対してBookmarking因子として機能する

後藤峻也, 高橋将史, 安恒徳美, 稲山純生, 柏葉脩一郎, 村上康文

第40回日本分子生物学会年会 2017年12月9日
GABPAとヒストンアセチル化は早期G1期遺伝子に対してBookmarking因子として機能する

後藤峻也, 高橋将史, 安恒徳美, 稲山純生, 柏葉脩一郎, 村上康文

第40回日本分子生物学会年会 2017年12月8日
損傷乗り越え複製における hINO80 および UCH37 の機能解析

浅尾麻由, 遠山一文, 木戸まい子, 助乘崇紘, 加藤大, 村上康文

第40回日本分子生物学会年会 2017年12月6日
大腸がんで高発現する膜タンパク質S3の機能解析

小林真子, 古矢裕梨, 山崎萌香, 山根小幸, 加藤大, 柏葉脩一郎, 村上康文

第40回日本分子生物学会年会 2017年12月6日
早期G1期遺伝子上流領域に存在するユニークなDNA配列の機能解析

高橋将史, 村上康文, 柏葉脩一郎, 後藤峻也, 中里浩章, 安恒徳美, 藪崎名保恵

第３９回日本分子生物学会年会 2016年12月2日
Stra6は大腸がんの肝転移を抑制する

高橋賢太, 酒井宏晃, 佐藤愛, 大畑広和, 塩川大介, 村上康文, 岡本康司

第３９回日本分子生物学会年会 2016年12月2日
SP1 は GABPA と協調的に早期 G1 期における転写再活性化を促進し、分裂期における細胞周期進行に関与している

中里浩章, 後藤峻也, 高橋将史, 安恒徳美, 加藤大, 柏葉脩一郎, 村上康文

第３９回日本分子生物学会年会 2016年12月2日
GABPAは早期G1期における転写の再活性化を促進する

後藤峻也, 中里浩章, 高橋将史, 安恒徳美, 藪崎名保恵, 柏葉脩一郎, 村上康文

第３９回日本分子生物学会年会 2016年12月2日
静止状態の細胞は、ガンマ線で直接生じた二重鎖切断DNAは修復するが、次のDNA複製の間に修復し難い二重鎖切断DNAを蓄積する

皆川祐輔, 熱海悠子, 篠原彰, 村上康文, 吉岡研一

第３９回日本分子生物学会年会 2016年12月1日
An early inflammatory and immune cascade activation after BNCR in human cancer cells

Mitsuko Masutani, Shoji Imamichi, Tasuku Itoh, Akira Sato, Sota Kikuhara, Hiroaki Fujimori, Yasuhito Arai, Yasufumi Murakami, Jun Itami, Minoru Suzuki, Koji Ono, Yoshinori Sakurai, Hiroaki Tanaka, Shinichiro Masunaga

17th International Congress on Neutron Capture Therapy 2016年10月2日
Gamma-irradiated quiescent cells repair directly induced DSBs but accumulated persistent DSBs during subsequent DNA replication

皆川祐輔, 熱海悠子, 篠原彰, 村上康文, 吉岡研一

日本生化学会年会 2016年9月25日
"SP1はGABPAと相互作用してM/G1移行期における転写の再活性化を促進するSP1 promotes transcriptional reactivation at the M/G1 transition by "

中里浩章、後藤峻也、高橋将史、山内滉朗、加藤大、柏葉脩一郎、村上康文

第38回日本分子生物学会 2015年12月3日
"SP1はGABPAと相互作用してM/G1移行期における転写の再活性化を促進する SP1 promotes transcriptional reactivation at the M/G1 transition by "

中里浩章, 後藤峻也, 高橋将史, 山内滉朗, 加藤大, 柏葉脩一郎, 村上康文

第38回日本分子生物学会 2015年12月3日
"細胞膜上におけるTNF受容体と膜結合型及び可溶性TNF-αとの相互作用解析 Analysis of the interaction among TNF receptors and TNF-α on the cell surfaces"

高野祐生, 大城カンナ, 里深博幸, 大津正也, 柏葉脩一郎, 村上康文

第38回日本分子生物学会 2015年12月2日
乳がん細胞株の浸潤における膜タンパク質Ａの機能解析 Function analysis of membrane protein A in a breast cancer cell line invasion

伊藤陽子, 井上恵美里, 神田佑里子, 佐藤亜美, 西村翔太, 今井麻友美, 山本理生佑, 横田紗弓, 加藤大, 里深博幸, 柏葉脩一郎, 村上康文

第38回日本分子生物学会 2015年12月2日
"細胞膜上におけるTNF受容体と膜結合型及び可溶性TNF-αとの相互作用解析 Analysis of the interaction among TNF receptors and TNF-α on the cell surfaces"

高野祐生, 大城カンナ, 里深博幸, 大津正也, 柏葉脩一郎, 村上康文

第38回日本分子生物学会 2015年12月2日
"生細胞を用いた細胞膜上におけるTNF受容体とそのリガンドの親和性解析 Cell-based affinity analysis among TNF receptors and their ligands"

大城カンナ, 高野祐生, 里深博幸, 大津正也, 柏葉脩一郎, 村上康文

第38回日本分子生物学会 2015年12月2日
多核化の表現型を示すマウス温度感受性変異株の性状解析

古谷茉美, 八尾優太, 柏葉脩一郎, 村上康文

第38回日本分子生物学会 2015年12月1日
がん細胞生存関連因子SND1複合体の機能解析

田邉芽衣, Weis Melody, 村上康文, 河野隆志, 土屋直人

第38回日本分子生物学会 2015年12月1日

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

DNA マイクロアレイによる遺伝子発現制御機構の研究

受託研究 1999年 - 2007年
Approach to the mechanism of gene expression using DNA microarray system

Funded Research 1999年 - 2007年