沼田倫征 (Tomoyuki Numata) - マイポータル

基本情報

所属: 九州大学大学院農学研究院生物化学分野准教授

学位: 農学(九州大学)

J-GLOBAL ID: 200901016391614310
researchmap会員ID: 6000008679

外部リンク: http://www.aist.go.jp/RESEARCHERDB/cgi-bin/worker_detail.cgi?call=namae&rw_id=T78524473

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研究分野

経歴

2019年4月 - 現在

九州大学大学院農学研究院
2010年4月 - 2019年3月

産業技術総合研究所バイオメディカル研究部門
2016年1月 - 2019年1月

National Heart, Lung, and Blood Institute / NIH
2007年4月 - 2010年3月

産業技術総合研究所生物機能工学研究部門
2004年4月 - 2007年3月

東京工業大学大学院生命理工学研究科
2003年4月 - 2004年3月

九州大学大学院生物資源環境科学府

学歴

2000年4月 - 2003年3月

九州大学大学院生物資源環境科学府
1998年4月 - 2000年3月

九州大学大学院生物資源環境科学研究科
1994年4月 - 1998年3月

九州大学農学部

受賞

2014年3月

平成26年度農芸化学奨励賞日本農芸化学会

沼田倫征
2013年4月

平成25年度科学技術分野の文部科学大臣表彰若手科学者賞文部科学省

沼田倫征
2007年2月

平成18年度手島記念研究賞財団法人手島工業教育資金団

論文

Synthetic ligands for PreQ₁ riboswitches provide structural and mechanistic insights into targeting RNA tertiary structure.

Connelly CM, Numata T, Boer RE, Moon MH, Sinniah RS, Barchi JJ, Ferré-D'Amaré AR, Schneekloth JS J

Nature communications 10(1) 1501 2019年4月査読有り
Crystal Structures of Csm2 and Csm3 in the Type III-A CRISPR-Cas Effector Complex.

Takeshita D, Sato M, Inanaga H, Numata T

Journal of molecular biology 431(4) 748-763 2019年2月査読有り
Structure and Enzymatic Properties of a Two-Domain Family GH19 Chitinase from Japanese Cedar (Cryptomeria japonica) Pollen

Tomoya Takashima, Tomoyuki Numata, Toki Taira, Tamo Fukamizo, Takayuki Ohnuma

Journal of Agricultural and Food Chemistry 66(22) 5699-5706 2018年6月6日査読有り
Metabolic and chemical regulation of tRNA modification associated with taurine deficiency and human disease

Kana Asano, Takeo Suzuki, Ayaka Saito, Fan-Yan Wei, Yoshiho Ikeuchi, Tomoyuki Numata, Ryou Tanaka, Yoshihisa Yamane, Takeshi Yamamoto, Takanobu Goto, Yoshihito Kishita, Kei Murayama, Akira Ohtake, Yasushi Okazaki, Kazuhito Tomizawa, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki

Nucleic Acids Research 46(4) 1565-1583 2018年1月査読有り
Crystal structure and thermodynamic dissection of chitin oligosaccharide binding to the LysM module of chitinase-A from Pteris ryukyuensis

Takayuki Ohnuma, Toki Taira, Naoyuki Umemoto, Yoshihito Kitaoku, Morten Sorlie, Tomoyuki Numata, Tamo Fukamizo

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 494(3-4) 736-741 2017年12月査読有り
Chitin oligosaccharide binding to the lysin motif of a novel type of chitinase from the multicellular green alga, Volvox carteri

Yoshihito Kitaoku, Tamo Fukamizo, Tomoyuki Numata, Takayuki Ohnuma

PLANT MOLECULAR BIOLOGY 93(1-2) 97-108 2017年1月査読有り
Mechanism of chitosan recognition by CBM32 carbohydrate-binding modules from a Paenibacillus sp IK-5 chitosanase/glucanase

Shoko Shinya, Shigenori Nishimura, Yoshihito Kitaoku, Tomoyuki Numata, Hisashi Kimoto, Hideo Kusaoke, Takayuki Ohnuma, Tamo Fukamizo

BIOCHEMICAL JOURNAL 473(8) 1085-1095 2016年4月査読有り
A class III chitinase without disulfide bonds from the fern, Pteris ryukyuensis: crystal structure and ligand-binding studies

Yoshihito Kitaoku, Naoyuki Umemoto, Takayuki Ohnuma, Tomoyuki Numata, Toki Taira, Shohei Sakuda, Tamo Fukamizo

PLANTA 242(4) 895-907 2015年10月査読有り
Modulation of the transglycosylation activity of plant family GH18 chitinase by removing or introducing a tryptophan side chain

Naoyuki Umemoto, Takayuki Ohnuma, Takuo Osawa, Tomoyuki Numata, Tamo Fukamizo

FEBS LETTERS 589(18) 2327-2333 2015年8月査読有り
Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of the CRISPR-Cas RNA-silencing Cmr complex

Takuo Osawa, Hideko Inanaga, Tomoyuki Numata

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS 71(Pt 6) 735-740 2015年6月査読有り
Crystal Structure of the CRISPR-Cas RNA Silencing Cmr Complex Bound to a Target Analog

Takuo Osawa, Hideko Inanaga, Chikara Sato, Tomoyuki Numata

MOLECULAR CELL 58(3) 418-430 2015年5月査読有り
Crystal structures and inhibitor binding properties of plant class V chitinases: the cycad enzyme exhibits unique structural and functional features

Naoyuki Umemoto, Yuka Kanda, Takayuki Ohnuma, Takuo Osawa, Tomoyuki Numata, Shohei Sakuda, Toki Taira, Tamo Fukamizo

PLANT JOURNAL 82(1) 54-66 2015年4月査読有り
Mechanisms of the tRNA wobble cytidine modification essential for AUA codon decoding in prokaryotes

Tomoyuki Numata

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 79(3) 347-353 2015年3月査読有り
Crystal Structure of the Csm3-Csm4 Subcomplex in the Type III-A CRISPR-Cas Interference Complex

Tomoyuki Numata, Hideko Inanaga, Chikara Sato, Takuo Osawa

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 427(2) 259-273 2015年1月査読有り
Convergent evolution of AUA decoding in bacteria and archaea

Tsutomu Suzuki, Tomoyuki Numata

RNA BIOLOGY 11(12) 1586-1596 2014年12月査読有り
Crystal structure of a "loopless" GH19 chitinase in complex with chitin tetrasaccharide spanning the catalytic center.

Ohnuma T, Umemoto N, Nagata T, Shinya S, Numata T, Taira T, Fukamizo T

Biochimica et biophysica acta 1844(4) 793-802 2014年4月査読有り
Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of an active-site mutant of 'loopless' family GH19 chitinase from Bryum coronatum in a complex with chitotetraose

Takayuki Ohnuma, Naoyuki Umemoto, Toki Taira, Tamo Fukamizo, Tomoyuki Numata

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS 69(Pt 12) 1360-1362 2013年12月査読有り
Crystal Structure of the Cmr2-Cmr3 Subcomplex in the CRISPR-Cas RNA Silencing Effector Complex

Takuo Osawa, Hideko Inanaga, Tomoyuki Numata

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 425(20) 3811-3823 2013年10月査読有り
Complete subsite mapping of a "loopful" GH19 chitinase from rye seeds based on its crystal structure

Takayuki Ohnuma, Naoyuki Umemoto, Kaori Kondo, Tomoyuki Numata, Tamo Fukamizo

FEBS LETTERS 587(16) 2691-2697 2013年8月査読有り
Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of the Cmr2-Cmr3 subcomplex in the CRISPR-Cas RNA-silencing effector complex

Takuo Osawa, Hideko Inanaga, Tomoyuki Numata

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS 69(Pt 5) 585-587 2013年5月査読有り

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MISC

Crystal Structure of the CRISPR-Cas RNA Silencing Complex

沼田倫征

Photon Factory Highlights 2015 42-43 2016年
標的アナログと結合したCRISPR-Cas系のCmr複合体の結晶構造

沼田倫征, 大澤拓生

ライフサイエンス新着論文レビュー 2015年
標的類似体と結合したCRISPR-Cas系Cmr複合体の結晶構造

沼田倫征, 大澤拓生

日本結晶学会誌 57 317-323 2015年
結晶構造から見る古細菌tRNAIle2のアグマチニル化反応：新しいtRNAアンチコドン修飾メカニズムの解明

大澤拓生, 沼田倫征

化学と生物 50(7) 481-483 2012年
5. 「結晶構造解析から明らかとなったtRNAのアグマチニル化修飾機構

沼田倫征, 大澤拓生

日本結晶学会誌 54 213-219 2012年
AUAコドンの解読に不可欠なtRNAIleアグマチニル化修飾の分子基盤

沼田倫征

生化学 84(12) 1004-1008 2012年
2. 「tRNAをアグマチンで化学修飾するしくみ

大澤拓生, 沼田倫征

ライフサイエンス新着論文レビュー 2011年
tRNAチオ化修飾酵素によるアンチコドンウリジン硫化反応における構造的基盤の解明

沼田倫征, 濡木理

細胞工学 25 1176-1177 2006年
植物リボヌクレアーゼの基質認識機構

沼田倫征, 河野慎, 角田佳充, 木村誠

化学と生物 41 718-723 2003年

書籍等出版物

入門構造生物学 -放射光X線と中性子で最新の生命現象を読み解く

富田耕造, 沼田倫征 (担当:共著, 範囲:第4章生命現象の理解に迫る構造生物学研究，4.3 翻訳)

共立出版 2010年4月 (ISBN: 9784320057043)

共同研究・競争的資金等の研究課題

原核生物に特異的な遺伝子発現調節機構の解明

国際共同研究加速基金（国際共同研究強化） 2017年4月 - 2020年3月

沼田倫征
CRISPR-Casエフェクター複合体の構造機能解析

基盤研究 (B) 2016年4月 - 2020年3月

沼田倫征
CRISPRシステムにおけるエフェクター複合体の構造機能解析

新学術領域研究 (研究領域提案型) 2013年4月 - 2015年3月

沼田倫征
ミトコンドリアにおけるtRNAプロセシング機構の解明

若手研究 (A) 2011年4月 - 2015年3月

沼田倫征
CRISPRシステムにおけるAGO2様活性を有するRNP複合体の構造機能

新学術領域研究 (研究領域提案型) 2011年4月 - 2013年3月

沼田倫征
tRNAアンチコドンの転写後修飾における酵素反応機構の分子的基盤解明

若手研究 (A) 2008年4月 - 2011年3月

沼田倫征
RNAによる生命反応制御機構の構造的基盤の解明

戦略的創造研究推進事業さきがけ 2006年10月 - 2010年3月

沼田倫征
tRNAチオ化修飾経路における硫黄転移反応メカニズムの解明

若手研究 (B) 2006年4月 - 2008年3月

沼田倫征
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