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Profile Information

Affiliation: Chuo University

J-GLOBAL ID: 200901087696607555
researchmap Member ID: 6000013520

Research Interests

Research Areas

Life sciences / Structural biochemistry /

Research History

Apr, 2011

～日本女子大学理学部・非常勤講師
Apr, 2002 - Mar, 2011

理化学研究所ゲノム科学総合センター・客員研究員
Apr, 2008 - Mar, 2009

School of Science, Hokkaido University
Apr, 2008 - Mar, 2009

School of Pharmaceutical Sciences, Kitasato University
Apr, 2008

～中央大学理工学部生命科学科・准教授
Jun, 2003 - Mar, 2008

School of Pharmaceutical Sciences, Kitasato University
Apr, 2000 - May, 2003

School of Pharmaceutical Sciences, Kitasato University

Education

Awards

2004

フィジカルファーマフォーラム2004 奨励賞
2001

CBIポスター賞

Misc.

HUMAN FAMSD-BASE: High quality protein structure model database for the human genome using the FAMSD homology modeling method

Kanou K, Hirata H, Iwadate M, Terashi G, Umeyama H, Takeda-Shitaka M

Chem Pharm Bull, 58(1) 66-75, Jan, 2010
Method for predicting homology modeling accuracy from amino acid sequence alignment: Power Function

Iwadate M, Kanou K, Terashi G, Umeyama H, Takeda-Shitaka M

Chem Pharm Bull, 58(1) 1-10, Jan, 2010
Bioinformatics based Ligand-Docking and in-silico screening.

Takaya D, Takeda-Shitaka M, Terashi G, Kanou K, Iwadate M, Umeyama H

Chem Pharm Bull, 56(5) 742-744, May, 2008
fams-ace: A combined method to select the best model after remodeling all server models

Genki Terashi, Mayuko Takeda-Shitaka, Kazuhiko Kanou, Mitsuo Iwadate, Daisuke Takaya, Akio Hosoi, Kazuhiro Ohta, Hideaki Umeyama

PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, 69(Suppl8) 98-107, 2007
FAMS-ACE: Model selection from server results using original threading (3D1D) program and consensus

Mitsuo Iwadate

CASP7 Abstracts, 41-42, Nov, 2006
Human FAMSBASE, protein structural model database, with high frequency update

Mitsuo Iwadate

20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress Abstracts, 4P-B-082, Jun, 2006
RIEKN FAMSBASE

日本分子生物学会2006フォーラム分子生物学の未来要旨集, 216, 2006
Template based and free modeling in CASP7

第7回GSICシンポジウム CASP7:タンパク質立体構造予測法の最先端技巧, P.5, 2006
FAMS-ACE: Model selection from server results using original threading (3D1D) program and consensus

CASP7 Abstracts, 41-42, 2006
Human FAMSBASE, protein structural model database, with high frequency update

20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress Abstracts, 4P-B-082, 2006
Homology Modeling in CASP6 (Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction) Using CHIMERA and FAMS

Mayuko Takeda-Shitaka

Genome Informatics Poster Abstracts, 138-139, Dec, 2005
High Quality Protein Structure Prediction Server, SKE-FAMSD

Kazuhiko Kanou

Genome Informatics Poster Abstracts, 133-134, Dec, 2005
FAMSBASE of Human, Rat and Mouse Genomes with Model Quality Estimation

Mitsuo Iwadate

Genome Informatics Poster Abstracts, 18-19, Dec, 2005
Fully automated protein structure predictions at CASP6 using homology-modeling server SKE-FAMSD

Kazuhiko KANOU

25th ANNIVERSARY INTERNATIONAL CBI CONFERENCE YEAR 2005 PROCEEDINGS, p.89, Aug, 2005
FAMS Complex: A fully automated homology modeling system for protein comlex structures

Mayuko TAKEDA-SHITAKA

25th ANNIVERSARY INTERNATIONAL CBI CONFERENCE YEAR 2005 PROCEEDINGS, p.88, Aug, 2005
Protein Structure Prediction in the 6th round of Critical Assessment of Technique for Protein Structure Prediction (CASP6) unig CHIMERA and FAMS

Mayuko TAKEDA-SHITAKA

25th ANNIVERSARY INTERNATIONAL CBI CONFERENCE YEAR 2005 PROCEEDINGS, p.86, Aug, 2005
Protein-protein interaction sites predictionand protein-protein docking by the methods of MD, grid scoring and the pair-wise interaction potential in CAPRI Rounds 3-5

Genki Terashi

25th ANNIVERSARY INTERNATIONAL CBI CONFERENCE YEAR 2005 PROCEEDINGS, p.85, Aug, 2005
Homology Modeling in CASP6 (Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction) Using CHIMERA and FAMS

Genome Informatics Poster Abstracts, 138-139, 2005
High Quality Protein Structure Prediction Server, SKE-FAMSD

Genome Informatics Poster Abstracts, 133-134, 2005
FAMSBASE of Human, Rat and Mouse Genomes with Model Quality Estimation

Genome Informatics Poster Abstracts, 18-19, 2005

Presentations

構造予測関数とホモロジーモデリングシステムの構築

第9回国際バイオEXPO若手研究者発表大会, 2010
タンパク質構造予測関数とホモロジーモデリングシステムの構築

第22回バイオ情報学研究発表会, 2010
2006年CASP7コンテストにおける自動サーバによるタンパク質モデリング:日本、米国、欧州の実力

第34回構造活性相関シンポジウム要旨集,日本薬学会構造活性相関部会, 2006
RIEKN FAMSBASE

日本分子生物学会2006フォーラム分子生物学の未来要旨集,日本分子生物学会, 2006
Template based and free modeling in CASP7

第7回GSICシンポジウム CASP7:タンパク質立体構造予測法の最先端技巧,東京工業大学学術国際除法センター34回分子生物情報研究会, 2006
277生物種立体構造データベースFAMSBASEと複合体情報を含んだWebインターフェース ASMI Complex

第7回ワークショップ微生物ゲノム研究のフロンティア,文部科学省科学研究費特定領域研究「統合ゲノム」, 2005
３次元構造モデル評価を付加したヒトゲノムタンパク質立体構造データベース

第8回システムバイオロジー研究会,日本バイオインフォマティクス学会システムバイオロジー研究会, 2005
ヒト･ラット・マウスの高精度プロテオーム立体構造全自動モデリング・データベース・創薬

第33回構造活性相関シンポジウム要旨集,日本薬学会構造活性相関部会, 2005
ゲノム中の246生物種の立体構造データベースFAMSBASEとDNAマイクロアレイデータとの融合

第６回ワークショップ微生物ゲノム研究のフロンティア,文部科学省科学研究費特定領域研究「統合ゲノム」, 2004
ゲノム規模のタンパク質立体構造モデル構築

フィジカルファーマフォーラム2004 要旨集,日本薬学会物理系薬学部会, 2004
タンパク質立体構造モデリングツールPDFAMS Pro+

第一回東北大学バイオサイエンスシンポジウム,東北大学, 2004
タンパク質立体構造モデリングツール PDFAMS Pro+によるモデルの解析

情報計算化学生物（CBI）学会2004年大会予稿集,情報計算化学生物（CBI）学会, 2004
リガンドを含むタンパク質複合体の全自動モデリング法（FAMS Ligand & Complex）の開発

第31回構造活性相関シンポジウム要旨集,日本薬学会構造活性相関部会, 2003
Gタンパク結合受容体の立体構造データベースの構築

文部科学省科学研究費特定領域研究（Ｃ）「ゲノム情報科学の新展開」公開シンポジウム要旨集,ゲノム情報科学領域代表者高木利久, 2002
全ゲノム遺伝子タンパク質モデリングとデータベース

第4回ワークショップ微生物ゲノム研究のフロンティア,文部科学省科学研究費特定領域研究「統合ゲノム」, 2002
国際コンテストCASP4に参加して（２）:CASP4とCAFASP2におけるComparative ModelingとFold Recognition

タンパク質高次構造に基づくゲノム情報科学第一回公開ワークショップ要旨集,文部科学省科学研究費特定領域研究（Ｃ）「ゲノム情報科学の新展開」項目D03代表者郷通子, 2001
先端的蛋白質3次元構造モデリング:FAMS for CASP4 & CAFASP2

2001-1 ＮＭＲ研究会,高分子学会, 2001
CASP4における北里大グループによるモデリング結果

第一回日本蛋白質科学会年会プログラム要旨集,日本蛋白質科学会, 2001
Gタンパク結合受容体のモデリングデータベース

情報計算化学生物（CBI）学会2001年大会予稿集,情報計算化学生物（CBI）学会, 2001
Gタンパク質結合受容体（GPCR）のモデリングデータベース

第29回構造活性相関シンポジウム要旨集,日本薬学会医薬化学部会, 2001

Research Projects

タンパク質を始めとする生体分子の立体構造のその設計に関する研究

2008