MISC

2014年

国際標準化糖鎖構造表記法WURCSの開発

情報化学討論会講演要旨集
  • 山田 一作
  • ソロビヨワ イェレナ
  • 藤田 典昭
  • 奥田 修二郎
  • 川嵜 敏祐
  • 成松 久
  • 木下 聖子
  • 松原 正陽
  • 土屋 伸一郎
  • 新町 大輔
  • 藤田 晶大
  • 青木 信幸
  • 鹿内 俊秀
  • 鈴木 芳典
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2014
0
開始ページ
O10
終了ページ
O10
記述言語
日本語
掲載種別
DOI
10.11545/ciqs.2014.0_O10
出版者・発行元
公益社団法人 日本化学会・情報化学部会

糖鎖研究において産出された糖鎖データには様々な表現方法が存在しており、このことは近年のウェブ技術を利用したライフサイエンスデータベース間の連携の妨げとなっていた。そこで我々は、糖鎖構造に対する新たな表記法としてWURCS(Web3 Unique Representation of Carbohydrate Structures)を開発した。WURCSは、曖昧さを含むあらゆる糖鎖構造を一意に表せる線形表記法であり、URIとして利用可能である。併せて、糖鎖データベースの構造データからWURCSに変換するソフトウェアを開発した。これにより共通の糖鎖構造を含む分子の横断検索が可能となる。また、WURCS普及促進のためのWURCSWorkingGroupを組織し、国際標準化に向けた活動を行っている。

リンク情報
DOI
https://doi.org/10.11545/ciqs.2014.0_O10
J-GLOBAL
https://jglobal.jst.go.jp/detail?JGLOBAL_ID=201502215343704440
CiNii Articles
http://ci.nii.ac.jp/naid/130005146263
ID情報
  • DOI : 10.11545/ciqs.2014.0_O10
  • J-Global ID : 201502215343704440
  • CiNii Articles ID : 130005146263
  • identifiers.cinii_nr_id : 9000319553177

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