村井正俊 (Masatoshi Murai) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学大学院農学研究科応用生命科学専攻准教授

学位: 博士（農学）(京都大学)

ORCID ID: https://orcid.org/0000-0001-6601-2854
J-GLOBAL ID: 200901071670868489
researchmap会員ID: 6000017848

外部リンク: http://www.biofunc-chem.kais.kyoto-u.ac.jp/

細胞のエネルギー代謝を支えるミトコンドリアには、「呼吸鎖複合体」や「ミトコンドリア膜輸送体」と呼ばれる酸化的リン酸化（ATP合成）に必須の膜タンパク質が数多く含まれています。このようなエネルギー代謝に深く関与する一連の膜タンパク質について、特異的に作用する低分子化合物に注目し、「化学」と「生物」の両方の手法を用いて、その役割を解明することを目指しています。具体的には下記の３テーマで研究を行なっています。

1. ミトコンドリアNADH-キノン酸化還元酵素（複合体-I）の阻害剤結合部位の構造と機能の解明
2. エネルギー代謝に関与する酸化還元酵素の基質／阻害剤結合部位の同定
3. ミトコンドリア膜輸送体を標的とする低分子化合物の探索と作用機構研究

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 生物有機化学 /

経歴

学歴

2004年4月 - 2009年3月

京都大学, 大学院農学研究科, 応用生命科学専攻
2000年4月 - 2004年3月

京都大学, 農学部

委員歴

2023年4月 - 現在

日本農芸化学会, 和文誌編集委員
2021年4月 - 現在

日本農薬学会, 常任評議員（総務担当）
2018年4月 - 現在

日本農薬学会, 農薬バイオサイエンス委員会（学術小集会）委員
2021年4月 - 2022年3月

日本農芸化学会, 2022年度大会実行委員会（大会総務・ジュニア農芸化学会担当者代表）
2019年4月 - 2021年3月

日本農薬学会, 学会誌常任編集委員
2019年4月 - 2021年3月

日本農芸化学会関西支部, 開催校幹事（京都大学）

受賞

2019年3月

農芸化学奨励賞, ミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iの機能解明を目指した生物有機化学的研究, 日本農芸化学会

村井正俊

論文

Respiratory complex I in mitochondrial membrane catalyzes oversized ubiquinones

Ryo Ikunishi, Ryohei Otani, Takahiro Masuya, Kyoko Shinzawa-Itoh, Tomoo Shiba, Masatoshi Murai, Hideto Miyoshi

Journal of Biological Chemistry 105001-105001 2023年6月査読有り
Discovery of Bis-sulfonamides as Novel Inhibitors of Mitochondrial NADH-Quinone Oxidoreductase (Complex I)

Atsuhito Tsuji, Takahiro Masuya, Norihito Arichi, Shinsuke Inuki, Masatoshi Murai, Hideto Miyoshi, Hiroaki Ohno

ACS Medicinal Chemistry Letters 14(2) 211-216 2023年1月24日査読有り
Cryo-EM structures of Na+-pumping NADH-ubiquinone oxidoreductase from Vibrio cholerae

Jun-ichi Kishikawa, Moe Ishikawa, Takahiro Masuya, Masatoshi Murai, Yuki Kitazumi, Nicole L. Butler, Takayuki Kato, Blanca Barquera, Hideto Miyoshi

Nature Communications 13(1) 4082 2022年7月査読有り
Diverse reaction behaviors of artificial ubiquinones in mitochondrial respiratory complex I

Shinpei Uno, Takahiro Masuya, Oleksii Zdorevskyi, Ryo Ikunishi, Kyoko Shinzawa-Itoh, Jonathan Lasham, Vivek Sharma, Masatoshi Murai, Hideto Miyoshi

Journal of Biological Chemistry 298 102075-102075 2022年5月査読有り
Cryo-electron microscopy reveals how acetogenins inhibit mitochondrial respiratory complex I

Daniel N. Grba, James N. Blaza, Hannah R. Bridges, Ahmed-Noor A. Agip, Zhan Yin, Masatoshi Murai, Hideto Miyoshi, Judy Hirst

Journal of Biological Chemistry 298(3) 101602-101602 2022年3月査読有り
The side chain of ubiquinone plays a critical role in Na+ translocation by the NADH-ubiquinone oxidoreductase (Na+-NQR) from Vibrio cholerae

Moe Ishikawa, Takahiro Masuya, Seina Kuroda, Shinpei Uno, Nicole L. Butler, Sara Foreman, Masatoshi Murai, Blanca Barquera, Hideto Miyoshi

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics 148547-148547 2022年3月査読有り
Comprehensive understanding of multiple actions of anticancer drug tamoxifen in isolated mitochondria

Yufu Unten, Masatoshi Murai, Tomoki Koshitaka, Kotaro Kitao, Osamu Shirai, Takahiro Masuya, Hideto Miyoshi

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics 1863(2) 148520-148520 2021年12月査読有り
Natural tetramic acids elicit multiple inhibitory actions against mitochondrial machineries presiding over oxidative phosphorylation

Yufu Unten, Masatoshi Murai, Katsuyuki Sakai, Yukihiro Asami, Takenori Yamamoto, Takahiro Masuya, Hideto Miyoshi

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 85(12) 2368-2377 2021年10月8日査読有り責任著者
Traminines A and B, produced by Fusarium concentricum, inhibit oxidative phosphorylation in Saccharomyces cerevisiae mitochondria

Katsuyuki Sakai, Yufu Unten, Aoi Kimishima, Kenichi Nonaka, Takumi Chinen, Kazunari Sakai, Takeo Usui, Kazuro Shiomi, Masato Iwatsuki, Masatoshi Murai …

Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology 2021年8月3日査読有り
Specific chemical modification explores dynamic structure of the NqrB subunit in Na+-pumping NADH-ubiquinone oxidoreductase from Vibrio cholerae

Moe Ishikawa, Takahiro Masuya, Hinako Tanaka, Wataru Aoki, Noam Hantman, Nicole L. Butler, Masatoshi Murai, Blanca Barquera, Hideto Miyoshi

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics 1862(8) 148432-148432 2021年4月査読有り
Pinpoint Dual Chemical Cross-Linking Explores the Structural Dynamics of the Ubiquinone Reaction Site in Mitochondrial Complex I

Takahiro Masuya, Shinpei Uno, Masatoshi Murai, Hideto Miyoshi

Biochemistry 60(10) 813-824 2021年3月16日査読有り
Inhibitors of a Na+-pumping NADH-ubiquinone oxidoreductase play multiple roles to block enzyme function

Takahiro Masuya, Yuki Sano, Hinako Tanaka, Nicole L Butler, Takeshi Ito, Tatsuhiko Tosaki, Joel E. Morgan, Masatoshi Murai, Blanca Barquera, Hideto Miyoshi

Journal of Biological Chemistry 295(36) 12739-12754 2020年7月20日査読有り
Synthetic biology based construction of biological activity-related library of fungal decalin-containing diterpenoid pyrones.

Kento Tsukada, Shono Shinki, Akiho Kaneko, Kazuma Murakami, Kazuhiro Irie, Masatoshi Murai, Hideto Miyoshi, Shingo Dan, Kumi Kawaji, Hironori Hayashi …

Nature communications 11(1) 1830-1830 2020年4月14日査読有り
IACS-010759, a potent inhibitor of glycolysis-deficient hypoxic tumor cells, inhibits mitochondrial respiratory complex I through a unique mechanism

Tsuji A, Akao T, Masuya T, Murai M, Miyoshi H

The Journal of Biological Chemistry 295(21) 7481-7491 2020年4月査読有り
Exploring the binding pocket of quinone/inhibitors in mitochondrial respiratory complex I by chemical biology approaches

Murai M,

Biosci. Biotechnol. Biochem. 84 1322-1331 2020年4月査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Oversized ubiquinones as molecular probes for structural dynamics of the ubiquinone reaction site in mitochondrial respiratory complex I

Uno S, Masuya T, Shinzawa-Itoh K, Lasham J, Haapanen O, Shiba T, Inaoka DK, Sharma V, Murai M, Miyoshi H

The Journal of Biological Chemistry 295(8) 2449-2463 2020年2月査読有り
Photoaffinity labeling of respiratory complex I in bovine heart submitochondrial particles by photoreactive [125I]amilorides

Murai M, Miyoshi H

Bio-protocol 9(17) e3349 2019年9月査読有り招待有り
Fusaramin, an antimitochondrial compound produced by Fusarium sp., discovered using multidrug-sensitive Saccharomyces cerevisiae.

Katsuyuki Sakai, Yufu Unten, Masato Iwatsuki, Hirotaka Matsuo, Wataru Fukasawa, Tomoyasu Hirose, Takumi Chinen, Kenichi Nonaka, Takuji Nakashima, Toshiaki Sunazuka …

The Journal of antibiotics 72(9) 645-652 2019年9月査読有り
The antibiotic korormicin A kills bacteria by producing reactive oxygen species

Maynard A, Butler N L, Ito T, da Silva A J, Murai M, Chen T, Koffas M A G, Miyoshi H, Barquera B

Journal of Bacteriology 201(11) e00718-18 2019年5月査読有り
Defining the mechanism of action of S1QELs, specific suppressors of superoxide production in the quinone-reaction site in mitochondrial complex I

Banba A, Tsuji A, Kimura H, Murai M, Miyoshi H

The Journal of Biological Chemistry 294 6550-6561 2019年4月査読有り

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MISC

ミトコンドリア複合体-Iによる合成ユビキノンQTの還元はプロトン輸送と共役しない

奥田健司, 村井正俊, 油屋駿介, 青木航, 三芳秀人

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2016 2016年
トシル化学によるミトコンドリア複合体-Iのユビキノン結合部位の特異的メチル化

稲岡宏幸, 村井正俊, 桝谷貴洋, 油屋駿介, 青木航, 三芳秀人

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2016 2016年
ミトコンドリア複合体‐I阻害剤としてのアミロライド類の作用機構研究

村井正俊, 村上園実, 伊藤剛, 三芳秀人

日本農薬学会大会講演要旨集 40th 165 2015年3月18日
ミトコンドリア複合体‐Iのピンポイント化学修飾

桝谷貴洋, 村井正俊, 森坂裕信, 三芳秀人

日本農薬学会大会講演要旨集 40th 164 2015年3月18日
出芽酵母ミトコンドリアVDACにおけるユビキノン結合部位の同定

奥田絢香, 村井正俊, 三芳秀人

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2015 2D12A07 (WEB ONLY) 2015年3月5日
アミロライド類縁体のミトコンドリア複合体‐Iにおける結合部位の同定

伊藤剛, 村井正俊, 森坂裕信, 三芳秀人

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2015 2D12A09 (WEB ONLY) 2015年3月5日
新規eptaibol化合物であるFKI‐6324Aは害虫AAC遺伝子組換え酵母の増殖を抑制する

須賀拓弥, 浅見行弘, 橋本祥平, 岩月正人, 野中健一, 中島琢自, 渡邊善洋, 松本厚子, 菅原亮平, 塩月孝博 …

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2015 3E23P10 (WEB ONLY) 2015年3月5日
ミトコンドリア複合体‐Iのピンポイント化学修飾

桝谷貴洋, 村井正俊, 森坂裕信, 三芳秀人

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2015 2D12A10 (WEB ONLY) 2015年3月5日
コレラ菌ナトリウム輸送型NADH‐ユビキノン酸化還元酵素(Na⁺‐NQR)におけるユビキノン結合部位の同定

二ノ倉聡, 村井正俊, BARQUERA Blanca, 三芳秀人

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2015 2D12A11 (WEB ONLY) 2015年3月5日
ミトコンドリア複合体‐Iのピンポイント化学修飾

桝谷貴洋, 村井正俊, 森坂裕信, 三芳秀人

日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集 40th 60-61 2014年12月11日
ミトコンドリア複合体‐Iのメカニズム解明に向けた特異的化学修飾

三芳秀人, 桝谷貴洋, 村井正俊

生体膜と薬物の相互作用シンポジウム講演要旨集 36th 7-8 2014年11月20日
コエンザイムQ結合タンパク質Coq10の解析

川向誠, 崔鉄忠, 戒能智宏, 村井正俊, 三芳秀人

イソプレノイド研究会例会講演要旨集 24th 24 2014年9月12日
ミトコンドリア複合体‐Iの位置特異的化学修飾

桝谷貴洋, 村井正俊, 三芳秀人

日本農薬学会大会講演要旨集 39th 73 2014年3月13日
ミトコンドリア複合体‐I阻害剤としてのアミロライド類縁体の合成と作用機構の解明

村上園実, 伊藤剛, 土生沙綾子, 村井正俊, 三芳秀人

日本農薬学会大会講演要旨集 39th 74 2014年3月13日
ミトコンドリアNADH‐ユビキノン酸化還元酵素(複合体‐I)の部位特異的化学修飾

桝谷貴洋, 村井正俊, 三芳秀人

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2014 3A05P01 (WEB ONLY) 2014年3月5日
キナゾリンのミトコンドリアADP/ATP輸送体における結合部位の同定

浅野周, 村井正俊, 三芳秀人

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2014 3A05P02 (WEB ONLY) 2014年3月5日
ユビキノン結合性タンパク質Coq10におけるキノン結合部位の同定

松延広平, 村井正俊, 川向誠, 三芳秀人

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2014 3A05P03 (WEB ONLY) 2014年3月5日
病害虫ミトコンドリアに作用する天然物リガンドの探索

浅見行弘, 森美穂子, 須賀拓弥, 岩月正人, 中島琢自, 橋本祥平, 野中健一, 松本厚子, 弓削秀隆, 増間碌郎 …

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2014 2A06A14 (WEB ONLY) 2014年3月5日
合成ユビキノンプローブを用いたミトコンドリアタンパク質Coq10の解析

村井正俊, 松延広平, 川向誠, 三芳秀人

日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集 39th 60-61 2013年12月18日
ユビキノンプローブの合成とユビキノン結合性タンパク質Coq10の解析

村井正俊, 松延広平, 工藤佐和子, 川向誠, 三芳秀人

日本農芸化学会関西支部講演会講演要旨集 481st 99 2013年9月5日

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講演・口頭発表等

150

コレラ菌Na+輸送性NADH-キノン酸化還元酵素に対する阻害剤の作用機構の解明

石川萌, 岸川淳一, 桝谷貴洋, 村井正俊, 加藤貴之, Blanca Barquera, 三芳秀人

日本農芸化学会2024年度大会 2024年3月27日
合成ユビキノンプローブを用いた出芽酵母のユビキノン取り込みに関与するタンパク質の探索

水谷みらい, 黒田聖奈, 奥公秀, 桝谷貴洋, 村井正俊, 三芳秀人

日本農芸化学会2024年度大会 2024年3月26日
ミトコンドリア膜透過性遷移を阻害するイソオキサゾール類の作用機構研究

渡辺大賀, 桝谷貴洋, 村井正俊, 三芳秀人

日本農芸化学会2024年度大会 2024年3月26日
リン脂質-キナゾリン・ハイブリッド阻害剤を用いた呼吸鎖複合体-Iのキノン反応ポケットの解析

大谷燎平, 志村優介, 桝谷貴洋, 村井正俊, 三芳秀人

日本農芸化学会2024年度大会 2024年3月26日
コレラ菌Na+輸送型NADH-キノン酸化還元酵素の特異的化学修飾と動態観測

宮地咲野, 田中比奈子, 石川萌, Blanca Barquera, 桝谷貴洋, 村井正俊, 三芳秀人

日本農芸化学会2024年度大会 2024年3月25日
ミトコンドリア膜透過性遷移を阻害するイソオキサゾール類の作用機構研究

渡辺大賀, 桝谷貴洋, 三芳秀人, 村井正俊

日本農薬学会第49回大会 2024年3月15日
人工キノン類を用いた呼吸鎖複合体-Iのキノン反応部位に関する研究

桝谷貴洋, 生西凌, 大谷燎平, 村井正俊, 志波智生, 三芳秀人

日本生体エネルギー研究会第49回討論会 2023年12月16日
コレラ菌Na+輸送性NADH-キノン酸化還元酵素に対する阻害剤の作用機構の解明、

石川萌, 岸川淳一, 桝谷貴洋, 村井正俊, 加藤貴之, Blanca Barquera, 三芳秀人

日本生体エネルギー研究会第49回討論会 2023年12月15日
ミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iにおける脱共役ユビキノン類の作用機構

越高知生, 冨澤康平, 桝谷貴洋, 村井正俊, 三芳秀人

日本農芸化学会2023年度大会 2023年3月15日
人工キノン類を用いた呼吸鎖複合体-Iのキノン結合ポケットに関する研究

生西凌, 大谷燎平, 桝谷貴洋, 村井正俊, 志波智生, 三芳秀人

日本農芸化学会2023年度大会 2023年3月15日
ミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iを阻害するアセトゲニンの結合部位の同定

西田美咲, 桝谷貴洋, 村井正俊, 三芳秀人

日本農芸化学会2023年度大会 2023年3月15日
クライオ電子顕微鏡によるコレラ菌Na+輸送性NADH-ユビキノン酸化還元酵素の構造解明

石川萌, 岸川淳一, 桝谷貴洋, 村井正俊, 北隅優希, Nicole Butler, 加藤貴之, Blanca Barquera, 三芳秀人

日本農芸化学会2023年度大会 2023年3月15日
ミトコンドリア呼吸鎖複合体-I に対するロテノンの作用機構

桝谷貴洋, 村井正俊, 三芳秀人

日本農薬学会第49回大会 2023年3月16日招待有り
コレラ菌Na+輸送性NADH-ユビキノン酸化還元酵素におけるユビキノン側鎖の結合部位の同定

石川萌, 桝谷貴洋, 村井正俊, Nicole Butler, Blanca Barquera, 三芳秀人

日本農薬学会第48回大会 2023年3月9日
ミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iを阻害するアセトゲニンの結合部位の同定

西田美咲, 桝谷貴洋, 村井正俊, 三芳秀人

日本農薬学会第48回大会 2023年3月9日
人工キノン類を用いたミトコンドリア呼吸鎖複合体-I のユビキノン反応部位の特性解明

桝谷貴洋, 宇野晋平, 越高知生, 生西凌, 富澤康平, 大谷燎平, 奥田健司, 村井正俊, 三芳秀人

日本生体エネルギー研究会第48回討論会 2022年12月16日
コレラ菌Na+輸送性NADH-ユビキノン酸化還元酵素におけるユビキノン側鎖の結合部位の同定

石川萌, 桝谷貴洋, 村井正俊, Nicole L. Butler, Blanca Barquera, 三芳秀人

日本生体エネルギー研究会第48回討論会 2022年12月14日
クライオ電子顕微鏡を用いたコレラ菌Na+輸送性NADH-ユビキノン酸化還元酵素の構造解明

石川萌, 岸川淳一, 桝谷貴洋, 村井正俊, 北隅優希, Nicole L. Butler, 加藤貴之, Blanca Barquera, 三芳秀人

第60回日本生物物理学会年会 2022年9月29日
合成ユビキノンプローブを用いた出芽酵母のユビキノン取り込みに関与するタンパク質の探索

黒田聖奈, 村井正俊, 桝谷貴洋, 奥公秀, 三芳秀人

日本農芸化学会2022年度大会 2022年3月17日
抗がん剤タモキシフェンのラット肝臓ミトコンドリアにおける作用機構研究

運天優歩, 村井正俊, 越高知生, 北尾虎太郎, 白井理, 桝谷貴洋, 三芳秀人

日本農芸化学会2022年度大会 2022年3月17日

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主要な担当経験のある科目(授業)

2019年 - 現在

応用生命科学入門IV（学部1回生向け有機化学） (京都大学農学部応用生命科学科)
2009年12月 - 現在

有機化学実験（学部3回生向け実験講義） (京都大学農学部応用生命科学科)
2023年4月

生物有機化学I （農薬化学, 学部3回生対象） (京都大学農学部応用生命科学科)
2021年4月 - 2021年9月

基礎有機化学I（学部1回生向け有機化学, 全学共通科目） (京都大学)

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

ユビキノンの新しい整理機能の発掘を目指した細胞内動態の解明

文部科学省科研費補助金（基盤研究B） 2022年4月 - 2025年3月

村井正俊
コエンザイムQの新規生合成経路の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2017年4月 - 2021年3月

川向誠, 村井正俊, 戒能智宏
エポキシシクロへキセンジオン類によるADP/ATP輸送体の凝集メカニズムの解明

文部科学省科研費補助金（基盤研究C） 2018年4月 - 2021年3月

村井正俊
化学修飾で実現する「光駆動型」呼吸鎖複合体-Iの創成

上原記念生命科学財団研究奨励金 2018年4月 - 2019年3月

村井正俊
化学修飾によるミトコンドリア複合体-Iの「光駆動型プロトンポンプ」への変換

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2016年4月 - 2018年3月

三芳秀人, 村井正俊
合成ユビキノンプローブを駆使したミトコンドリアVDACの分子機構解明

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(C)) 基盤研究(C) 2015年4月 - 2018年3月

村井正俊
呼吸鎖複合体-Iの１分子計測を実現する特異的化学修飾法の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2014年4月 - 2017年3月

三芳秀人, 村井正俊, 古池晶, 藤原敬宏
ユビキノンが鍵因子となるミトコンドリア膜タンパク質の分子機構解明

文部科学省科学研究費補助金(若手研究(B)) 若手研究(B) 2013年4月 - 2015年3月

村井正俊
呼吸鎖酵素複合体ーＩの鍵サブユニットＮＤ１の機能解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2011年4月 - 2014年3月

三芳秀人, 村井正俊
プローブ分子の創製を基盤とするユビキノンの細胞内動態の解明

文部科学省科学研究費補助金(若手研究(B)) 若手研究(B) 2011年4月 - 2013年3月

村井正俊
光親和性標識法に基づくミトコンドリアNADH-ユビキノン酸化還元酵素（複合体-I）の構造と機能の解明

上原記念生命科学財団研究奨励金 2010年4月 - 2011年3月

村井正俊
阻害剤の作用機構研究を基盤とするミトコンドリア複合体-?の動態解明

文部科学省科学研究費補助金(若手研究(スタートアップ), 研究活動スタート支援) 若手研究(スタートアップ), 研究活動スタート支援 2009年9月 - 2011年3月

村井正俊
機能性ユビキノンプローブの合成と光親和性標識法に基づく標的膜タンパク質の解析

文部科学省特別研究員奨励費 2007年4月 - 2009年3月

村井正俊
Synthesis of functional ubiquione probes and analysis of ubiquinone-binding ptotein

2006年
Design synthesis of biologically active compounds acting at respiratory enzymes

2004年

村井正俊

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研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

委員歴

受賞

論文

MISC

講演・口頭発表等

主要な担当経験のある科目(授業)

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