牧野能士 (Takashi Makino) - マイポータル

基本情報

所属: 東北大学大学院生命科学研究科進化ゲノミクス分野教授

学位: 博士（理学）(2005年3月総合研究大学院大学)

J-GLOBAL ID: 201001061387304825
researchmap会員ID: 6000022541

外部リンク: https://www.lifesci.tohoku.ac.jp/evolgenomics

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 進化生物学 / 分子進化学

委員歴

2022年1月 - 現在

日本進化学会, 代議員

論文

Evolutionary changes of noncoding elements associated with transition of sexual mode in Caenorhabditis nematodes

Katsunori Tamagawa, Mehmet Dayi, Simo Sun, Rikako Hata, Taisei Kikuchi, Nami Haruta, Asako Sugimoto, Takashi Makino

Science Advances 10(37) 2024年9月13日
Highly regenerative species-specific genes improve age-associated features in the adult Drosophila midgut.

Hiroki Nagai, Yuya Adachi, Tenki Nakasugi, Ema Takigawa, Junichiro Ui, Takashi Makino, Masayuki Miura, Yu-Ichiro Nakajima

BMC biology 22(1) 157-157 2024年8月2日
Comparative genomics reveals convergent signals associated with the high metabolism and longevity in birds and bats.

Yuki Matsuda, Takashi Makino

Proceedings. Biological sciences 291(2029) 20241068-20241068 2024年8月
Convergent accelerated evolution of mammal-specific conserved non-coding elements in hibernators

Daiki Nakayama, Takashi Makino

Scientific Reports 14(1) 2024年5月23日
Conserved Genes in Highly Regenerative Metazoans Are Associated with Planarian Regeneration.

Shankar C R R Chereddy, Takashi Makino

Genome biology and evolution 16(5) 2024年5月2日
Detection of evolutionary conserved and accelerated genomic regions related to adaptation to thermal niches in Anolis lizards

Fuku Sakamoto, Shunsuke Kanamori, Luis M. Díaz, Antonio Cádiz, Yuu Ishii, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Takuro Nakayama, Takashi Makino, Masakado Kawata

Ecology and Evolution 14(3) 2024年3月7日
Genomic screening of fish‐specific genes in gnathostomes and their functions in fin development

Hidehiro Kudoh, Sayuri Yonei‐Tamura, Gembu Abe, Junichi Iwakiri, Masahiro Uesaka, Takashi Makino, Koji Tamura

Development, Growth & Differentiation 2024年3月4日
Double migration of the endangered Tricyrtis formosana (Liliaceae) in Japan.

Kaori Tsunenari, Takuro Ito, Masatsugu Yokota, Mayu Shibabayashi, Chiharu Endo, Kuo-Fang Chung, Yoshihisa Suyama, Ayumi Matsuo, Atsushi Abe, Akiyo Naiki …

Scientific reports 14(1) 957-957 2024年1月10日
Transcriptomic signatures associated with underlying rapid changes in the early phase brain of bi-directional sex change in Trimma okinawae

Katsunori Tamagawa, Tomoki Sunobe, Takashi Makino, Masakado Kawata

Royal Society Open Science 10(12) 2023年12月6日
Genomic adaptive potential to cold environments in the invasive red swamp crayfish

Daiki X. Sato, Yuki Matsuda, Nisikawa Usio, Ryo Funayama, Keiko Nakayama, Takashi Makino

iScience 107267-107267 2023年7月
RNA-seq analysis to identify genes related to resting egg production of panarctic Daphnia pulex

Natsumi Maruoka, Takashi Makino, Jotaro Urabe

BMC Genomics 24(1) 2023年5月17日
Differentially expressed genes associated with body size changes and transposable element insertions between Caenorhabditis elegans and its sister species, C. inopinata.

Kazuma Kawahara, Taruho Inada, Ryusei Tanaka, Mehmet Dayi, Takashi Makino, Shinichi Maruyama, Taisei Kikuchi, Asako Sugimoto, Masakado Kawata

Genome Biology and Evolution 2023年4月18日
Invasions of an obligate asexual daphnid species support the nearly neutral theory

Hajime Ohtsuki, Hirotomo Norimatsu, Takashi Makino, Jotaro Urabe

Scientific Reports 12(1) 2022年12月
Transcriptomic heterochrony and completely cleistogamous flower development in the mycoheterotrophic orchidGastrodia

Kenji Suetsugu, Kenji Fukushima, Takashi Makino, Shuka Ikematsu, Tomoaki Sakamoto, Seisuke Kimura

New Phytologist 237(1) 323-338 2022年10月17日
Massive expression of cysteine-containing proteins causes abnormal elongation of yeast cells by perturbing the proteasome

Shotaro Namba, Hisaaki Kato, Shuji Shigenobu, Takashi Makino, Hisao Moriya

G3 Genes|Genomes|Genetics 12(6) 2022年4月29日
Open reading frame dominance indicates protein-coding potential of RNAs.

Yusuke Suenaga, Mamoru Kato, Momoko Nagai, Kazuma Nakatani, Hiroyuki Kogashi, Miho Kobatake, Takashi Makino

EMBO reports e54321 2022年4月19日
Capturing hidden regulation based on noise change of gene expression level from single cell RNA-seq in yeast

Thoma Itoh, Takashi Makino

Scientific Reports 11(1) 22547-22547 2021年12月
Exploring the Loci Responsible for Awn Development in Rice through Comparative Analysis of All AA Genome Species

Kanako Bessho-Uehara, Yoshiyuki Yamagata, Tomonori Takashi, Takashi Makino, Hideshi Yasui, Atsushi Yoshimura, Motoyuki Ashikari

Plants 10(4) 725-725 2021年4月8日
Significant loss of genetic diversity and accumulation of deleterious genetic variation in a critically endangered azalea species, Rhododendron boninense, growing on the Bonin Islands

Yuji Isagi, Takashi Makino, Tomoko Hamabata, Ping-Lin Cao, Satoshi Narita, Yoshiteru Komaki, Kazuki Ktuita, Akiyo Naiki, Yoshiaki Kameyama, Toshiaki Kondo …

PLANT SPECIES BIOLOGY 35(3) 166-174 2020年7月査読有り
Genetic factors for short life span associated with evolution of the loss of flight ability

Atsushi Ikemoto, Daiki X. Sato, Takashi Makino, Masakado Kawata

Ecology and Evolution 10(12) 6020-6029 2020年5月29日査読有り

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MISC

四肢発生に関わる四足動物特異的な保存ゲノム配列の探索と解析

工藤栄大, 上坂将弘, 牧野能士, 田村宏治

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 46th 2023年
脊椎動物における形態進化に関する比較ゲノミクスおよび発生生物学的解析

関谷洸, 宮腰拓, 米井小百合, 阿部玄武, 田中良和, 牧野能士, 田村宏治

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年
ゲノム比較と発生学的手法を用いたアプローチから脊椎動物の形態進化を考察する

関谷洸, 宮腰拓, 米井小百合, 阿部玄武, 田中良和, 牧野能士, 田村宏治

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年
イトヨの海水適応に必須な遺伝子を遺伝学的視点から探る

日下部誠, 石川麻乃, Mark Ravinet, 吉田恒太, 牧野能士, 北野潤

月刊海洋 49(4) 187-195 2017年
小笠原諸島に侵入したグリーンアノールの進化的変化の検出と集団ゲノム解析

玉手智史, 森英章, COMPOSANO Brian J., LKRYSKO Kenneth, 舟山亮, 中山啓子, 牧野能士, 河田雅圭

日本生態学会大会講演要旨(Web) 63rd 2016年
小笠原諸島に侵入したグリーンアノールの進化的変化の検出と集団ゲノミクス解析

玉手智史, 森英章, KRYSKO Kenneth L., 牧野能士, 河田雅圭

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 17th 2015年
ゲノム内の遺伝子重複の進化がもたらす生物の適応力

河田雅圭, 牧野能士

化学と生物 53(11) 731-733 2015年
小笠原諸島に侵入したグリーンアノールの進化的変化の検出

玉手智史, 牧野能士, 森英章, KRYSKO Kenneth L., 河田雅圭

日本生態学会大会講演要旨(Web) 61st 2014年
重複遺伝子が生み出す生命システムのロバストネス

牧野能士

細胞工学 33(1) 73-78 2014年
生物が持つ遺伝子の数の話

牧野能士

まなびの杜 70 3-4 2014年
タンパク質間相互作用がタンパク質分子の進化に与える影響

牧野能士, 五條堀孝

生体の科学 58(5) 348-351 2007年
ゲノミクスの現状と展望

牧野能士, 五條堀孝

ファルマシア 42(1) 17-20 2006年

書籍等出版物

遺伝学の百科事典 : 継承と多様性の源 = Encyclopedia of genetics : origin of inheritance and diversity

日本遺伝学会

丸善出版 2022年1月 (ISBN: 9784621306604)
ヒトゲノム事典

井ノ上, 逸朗, 今西, 規, 河村, 正二, 斎藤, 成也, 颯田, 葉子, 田嶋, 敦

一色出版 2021年11月 (ISBN: 9784910389127)

講演・口頭発表等

Evolutionary approaches to the estimation of deleterious CNVs causing diseases

牧野能士

静岡がんセンター研究所リサーチカンファレンス 2022年12月21日招待有り
絶滅危惧種の保全優先度評価に向けたゲノム科学的アプローチ

牧野能士

水産育種研究会・定例シンポジウム 2022年12月10日招待有り
希少植物の絶滅危険度はゲノムの情報から読み取ることができる

牧野能士

日本生態学会企画集会 2022年3月招待有り
RNA-seq解析による希少植物のゲノム診断

牧野能士

種生物学会 2021年12月招待有り
低温環境に適応した侵略種アメリカザリガニのパラロガスゲノミクス

牧野能士

日本進化学会沖縄大会シンポジウム

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

ダイズ遺伝子の精密発現調節技術の開発

内閣府戦略的イノベーション創造プログラム第３期 2023年7月 - 2029年3月

吉田均(代表)
絶滅に瀕する島嶼陸産貝類の保全に向けた貝食性外来種防除技術の開発

環境省環境研究総合推進費 2024年4月 - 2027年3月

千葉聡(代表)
新たな限界発現系gTOW2.0で解き明かす発現制約メカニズムの全体像

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2027年3月

守屋央朗, 牧野能士
シングルセル解析による作物の転写制御システムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2023年4月 - 2026年3月

内藤健, 牧野能士, 川勝泰二, 黒羽剛
刺胞動物エダアシクラゲにおける枝分かれ形成機構の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年 - 2026年

熊野岳, 牧野能士
遺伝子近傍保存モジュールによる発現抑制機構の解明と分子育種への利用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2022年4月 - 2025年3月

吉田均, 黒羽剛, 川原善浩, 牧野能士
胴体切断可能な節足動物の再生過程におけるHRJDの機能解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2025年3月

牧野能士, 熊野岳
連続するアミノ酸（PolyX）が生み出す細胞毒性のメカニズム

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 挑戦的研究(萌芽) 2022年6月 - 2024年3月

守屋央朗, 牧野能士, 紀藤圭治
アノールトカゲを用いた温度ニッチシフトの進化機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2019年10月 - 2023年3月

河田雅圭, 赤司寛志, 牧野能士
体サイズの進化に伴って変化する性質と独立な性質：遺伝子改変線虫を用いて

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2016年4月 - 2018年3月

河田雅圭, 杉本亜砂子, 牧野能士, 丸山真一朗, 横山潤
グッピーにおける雌配偶者選好性の個体間変異と可塑性の進化機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2015年4月 - 2018年3月

河田雅圭, 牧野能士, 河村正二, 狩野賢司
トゲウオ淡水進出の鍵形質の遺伝基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2015年4月 - 2018年3月

北野潤, 牧野能士
化学量不均衡を避けるメカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2014年4月 - 2017年3月

守屋央朗, 牧野能士
遺伝子重複と生物の適応力の進化；酵母の進化実験系の確立による検証

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2014年4月 - 2016年3月

河田雅圭, 牧野能士
新たな気候帯への適応進化機構の解明：半砂漠地帯のキューバアノールトカゲを用いて

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2013年4月 - 2016年3月

河田雅圭, 牧野能士, 田村宏治, 瀧本岳, 長太伸章
山岳氷河の掘削試料から得られた樹木花粉のＤＮＡ分析による古森林遺伝学的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2012年4月 - 2016年3月

陶山佳久, 中澤文男, 牧野能士, 松木悠
異種トゲウオ間のゲノム不適合と生殖隔離の分子機構

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2011年4月 - 2016年3月

北野潤, 牧野能士
分布停滞および拡大に関わる進化的要因：チョウ類を用いての検証

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2012年4月 - 2015年3月

河田雅圭, 横山潤, 牧野能士, 長太伸章
遺伝子コピー数変異の野外集団解析による新たな疾病生態学の開拓

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2012年4月 - 2014年3月

河田雅圭, 牧野能士
酵母の量的均衡遺伝子が作るネットワークの全容解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2011年4月 - 2014年3月

守屋央朗, 牧野能士

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