小口祐伴 (Yusuke Oguchi) - マイポータル

基本情報

所属: 特定国立研究開発法人理化学研究所開拓研究本部科学技術振興機構・さきがけ研究員

学位: 博士(理学)(早稲田大学)

J-GLOBAL ID: 201001037121060442
researchmap会員ID: 6000023686

研究分野

論文

NanoSINC-seq dissects the isoform diversity in subcellular compartments of single cells.

Yusuke Oguchi, Yuka Ozaki, Mahmoud N Abdelmoez, Hirofumi Shintaku

Science advances 7(15) 2021年4月
Targeted permeabilization of the cell wall and extraction of charged molecules from single cells in intact plant clusters using a focused electric field

Sangamithirai Subramanian Parimalam, Mahmoud Nady Abdelmoez, Arata Tsuchida, Naoyuki Sotta, Mayuki Tanaka, Takashi Kuromori, Toru Fujiwara, Masami Yokota Hirai, Ryuji Yokokawa, Yusuke Oguchi …

The Analyst 146(5) 1604-1611 2021年
Development of a sequencing system for spatial decoding of DNA barcode molecules at single-molecule resolution.

Yusuke Oguchi, Hirofumi Shintaku, Sotaro Uemura

Communications biology 3(1) 788-788 2020年12月18日
Distinct Kinetics in Electrophoretic Extraction of Cytoplasmic RNA from Single Cells.

Mahmoud N Abdelmoez, Yusuke Oguchi, Yuka Ozaki, Ryuji Yokokawa, Hidetoshi Kotera, Hirofumi Shintaku

Analytical chemistry 92(1) 1485-1492 2020年1月7日
Length bias-free extraction of cytoplasmic RNA from single cells by electrical lysis and electrophoresis

Mahmoud N. Abdelmoez, Yusuke Oguchi, Yuka Ozaki, Ryuji Yokokawa, Hidetoshi Kotera, Hirofumi Shintaku

MHS 2019 - 30th 2019 International Symposium on Micro-NanoMechatronics and Human Science 2019年12月1日
Author Correction: A practical guide to intelligent image-activated cell sorting.

Akihiro Isozaki, Hideharu Mikami, Kotaro Hiramatsu, Shinya Sakuma, Yusuke Kasai, Takanori Iino, Takashi Yamano, Atsushi Yasumoto, Yusuke Oguchi, Nobutake Suzuki …

Nature protocols 14(11) 3273-3273 2019年11月
A practical guide to intelligent image-activated cell sorting.

Akihiro Isozaki, Hideharu Mikami, Kotaro Hiramatsu, Shinya Sakuma, Yusuke Kasai, Takanori Iino, Takashi Yamano, Atsushi Yasumoto, Yusuke Oguchi, Nobutake Suzuki …

Nature protocols 14(8) 2370-2415 2019年8月
Electrical Lysis and RNA Extraction from Single Cells Fixed by Dithiobis(succinimidyl propionate).

Sangamithirai Subramanian Parimalam, Yusuke Oguchi, Mahmoud N Abdelmoez, Arata Tsuchida, Yuka Ozaki, Ryuji Yokokawa, Hidetoshi Kotera, Hirofumi Shintaku

Analytical chemistry 90(21) 12512-12518 2018年11月6日査読有り
Intelligent Image-Activated Cell Sorting.

Nao Nitta, Takeaki Sugimura, Akihiro Isozaki, Hideharu Mikami, Kei Hiraki, Shinya Sakuma, Takanori Iino, Fumihito Arai, Taichiro Endo, Yasuhiro Fujiwaki …

Cell 175(1) 266-276 2018年9月20日
SINC-seq: correlation of transient gene expressions between nucleus and cytoplasm reflects single-cell physiology.

Mahmoud N Abdelmoez, Kei Iida, Yusuke Oguchi, Hidekazu Nishikii, Ryuji Yokokawa, Hidetoshi Kotera, Sotaro Uemura, Juan G Santiago, Hirofumi Shintaku

Genome biology 19(1) 66-66 2018年6月6日
Isotachophoresis-based RNA extraction from fixed single cells

Subramanian Parimalam Sangamithirai, Yusuke Oguchi, Mahmoud N. Abdelmoez, Arata Tsuchida, Yuka Ozaki, Ryuji Yokokawa, Hidetoshi Kotera, Hirofumi Shintaku

The Proceedings of the Symposium on Micro-Nano Science and Technology 2018.9 30am3PN37-30am3PN37 2018年
Mass spectrometric screening of ligands with lower off-rate from a clicked-based pooled library.

Satoshi Arai, Shota Hirosawa, Yusuke Oguchi, Madoka Suzuki, Atsushi Murata, Shin'ichi Ishiwata, Shinji Takeoka

ACS combinatorial science 14(8) 451-5 2012年8月13日
The role of tropomyosin domains in cooperative activation of the actin-myosin interaction.

Yusuke Oguchi, Junji Ishizuka, Sarah E Hitchcock-DeGregori, Shin'ichi Ishiwata, Masataka Kawai

Journal of molecular biology 414(5) 667-80 2011年12月16日
The bidirectional depolymerizer MCAK generates force by disassembling both microtubule ends.

Yusuke Oguchi, Seiichi Uchimura, Takashi Ohki, Sergey V Mikhailenko, Shin'ichi Ishiwata

Nature cell biology 13(7) 846-52 2011年5月22日
Insights into the mechanisms of myosin and kinesin molecular motors from the single-molecule unbinding force measurements.

Sergey V Mikhailenko, Yusuke Oguchi, Shin'ichi Ishiwata

Journal of the Royal Society, Interface 7 Suppl 3 S295-306 2010年6月6日
Key residues on microtubule responsible for activation of kinesin ATPase.

Seiichi Uchimura, Yusuke Oguchi, You Hachikubo, Shin'ichi Ishiwata, Etsuko Muto

The EMBO journal 29(7) 1167-75 2010年4月7日
Robust processivity of myosin V under off-axis loads.

Yusuke Oguchi, Sergey V Mikhailenko, Takashi Ohki, Adrian O Olivares, Enrique M De La Cruz, Shin'ichi Ishiwata

Nature chemical biology 6(4) 300-5 2010年4月
Load-dependent ADP binding to myosins V and VI: implications for subunit coordination and function.

Yusuke Oguchi, Sergey V Mikhailenko, Takashi Ohki, Adrian O Olivares, Enrique M De La Cruz, Shin'ichi Ishiwata

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 105(22) 7714-9 2008年6月3日
How the Load and the Nucleotide State Affect the Actin Filament Binding Mode of the Molecular Motor Myosin V.

Sergey V Mikhailenko, Yusuke Oguchi, Takashi Ohki, Togo Shimozawa, Adrian O Olivares, Enrique M De La Cruz, Shin'ichi Ishiwata

The journal of the Korean Physical Society 53(3) 1726-1730 2008年
2P152 微小管におけるキネシンとの相互作用部位のマッピング(分子モーター,ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)

内村誠一, 小口祐伴, 石渡信一, 武藤悦子

生物物理 47 S151 2007年

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MISC

Key Residues on Microtubules Responsible for Activation of Kinesin ATPase

Seiichi Uchimura, Yusuke Oguchi, You Hachikubo, Shin'ichi Ishiwata, Etsuko Muto

BIOPHYSICAL JOURNAL 98(3) 370A-370A 2010年1月

共同研究・競争的資金等の研究課題

1細胞内RNA分子とタンパク質分子の同時・多重空間分布解析に向けた基盤技術の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

小口祐伴
1細胞非増幅シーケンスを可能にするライブラリ調製法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2018年4月 - 2021年3月

小口祐伴
生物運動の制御基盤；化学力学フィードバックループ

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2010年4月 - 2016年3月

石渡信一, 武岡真司, 鈴木団, 宮崎牧人, 板橋岳志, 下山勲, 福田紀男, 島本勇太, 小口祐伴, 大山廣太郎, 新谷正嶺, 高木潤, 佐藤勝彦
染色体分配を制御する微小管脱重合因子の張力発生機構

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2011年4月 - 2012年3月

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共同研究・競争的資金等の研究課題

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