城田松之 (Matsuyuki Shirota) - マイポータル

基本情報

所属: 東北大学大学院医学系研究科・医学部附属創生応用医学研究センター脳神経科学コアセンター新医学領域創生分野講師

学位: 博士（生命科学）(東京大学)

J-GLOBAL ID: 201001029922447028
researchmap会員ID: 6000024824

外部リンク: http://db.tohoku.ac.jp/whois/detail/7304c9a50a372c986ee0f709e3a21349.html

研究分野

ライフサイエンス / 形態、構造 / 生物情報学

論文

A novel variant in the transmembrane 4 domain of ANO3 identified in a two-year-old girl with developmental delay and tremor.

Yu Aihara, Matsuyuki Shirota, Atsuo Kikuchi, Yu Katata, Yu Abe, Tetsuya Niihori, Ryo Funayama, Keiko Nakayama, Yoko Aoki, Shigeo Kure

Journal of human genetics 2022年9月27日
Novel POLE mutations identified in patients with IMAGE-I syndrome cause aberrant subcellular localisation and protein degradation in the nucleus.

Tomohiro Nakano, Yoji Sasahara, Atsuo Kikuchi, Kunihiko Moriya, Hidetaka Niizuma, Tetsuya Niihori, Matsuyuki Shirota, Ryo Funayama, Keiko Nakayama, Yoko Aoki, Shigeo Kure

Journal of medical genetics 59(11) 1116-22 2022年5月9日
幅広い臨床症状を呈したMECOM遺伝子変異を同定した2家系

新堀哲也, 田野島玲大, 笹原洋二, 佐藤篤, 入江正寛, 南條由佳, 舟山亮, 城田松之, 阿部太紀, 奥山祐子, 石井直人, 中山啓子, 呉繁夫, 今泉益栄, 青木洋子

日本小児科学会雑誌 126(2) 230-230 2022年2月
Heterozygous calcyclin-binding protein/Siah1-interacting protein (CACYBP/SIP) gene pathogenic variant linked to a dominant family with paucity of interlobular bile duct.

Miyako Kanno, Mitsuyoshi Suzuki, Ken Tanikawa, Chikahiko Numakura, Shu-Ichi Matsuzawa, Tetsuya Niihori, Yoko Aoki, Yoichi Matsubara, Satoshi Makino, Gen Tamiya, Satoshi Nakano, Ryo Funayama, Matsuyuki Shirota, Keiko Nakayama, Tetsuo Mitsui, Kiyoshi Hayasaka

Journal of human genetics 67(7) 393-397 2022年1月28日
Structural basis of the selective sugar transport in sodium-glucose cotransporters.

Kazuyo Kamitori, Matsuyuki Shirota, Yuichiro Fujiwara

Journal of molecular biology 167464-167464 2022年1月22日
Phenotypic heterogeneity in individuals with MECOM variants in 2 families.

Tetsuya Niihori, Reo Tanoshima, Yoji Sasahara, Atsushi Sato, Masahiro Irie, Yuka Saito-Nanjo, Ryo Funayama, Matsuyuki Shirota, Taiki Abe, Yuko Okuyama, Naoto Ishii, Keiko Nakayama, Shigeo Kure, Masue Imaizumi, Yoko Aoki

Blood advances 6(18) 5257-5261 2022年1月12日
Genetic loci for lung function in Japanese adults with adjustment for exhaled nitric oxide levels as airway inflammation indicator

Mitsuhiro Yamada, Ikuko N. Motoike, Kaname Kojima, Nobuo Fuse, Atsushi Hozawa, Shinichi Kuriyama, Fumiki Katsuoka, Shu Tadaka, Matsuyuki Shirota, Miyuki Sakurai, Tomohiro Nakamura, Yohei Hamanaka, Kichiya Suzuki, Junichi Sugawara, Soichi Ogishima, Akira Uruno, Eiichi N. Kodama, Naoya Fujino, Tadahisa Numakura, Tomohiro Ichikawa, Ayumi Mitsune, Takashi Ohe, Kengo Kinoshita, Masakazu Ichinose, Hisatoshi Sugiura, Masayuki Yamamoto

Communications Biology 4(1) 2021年12月
代謝プロファイルに影響を与える遺伝要因の網羅的解析

小柴生造, 元池育子, 三枝大輔, 井上仁, 菱沼英史, 青木裕一, 田高周, 城田松之, 木下賢吾, 山本雅之

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 94回 [P-837] 2021年11月
BRCA1/ATF1-mediated transactivation is involved in resistance to PARP inhibitors and cisplatin

Endo S, Yoshino Y, Shirota M, WatanabeG, Chiba N

Cancer Research Communications 1(2) 2021年11月査読有り
Wnt5a in cancer-associated fibroblasts promotes colorectal cancer progression.

Tomoaki Hirashima, Hideaki Karasawa, Takashi Aizawa, Takashi Suzuki, Akihiro Yamamura, Hideyuki Suzuki, Taiki Kajiwara, Hiroaki Musha, Ryo Funayama, Matsuyuki Shirota, Shinobu Ohnuma, Keiko Nakayama, Michiaki Unno

Biochemical and biophysical research communications 568 37-42 2021年9月3日
Alternative microexon splicing by RBFOX2 and PTBP1 is associated with metastasis in colorectal cancer.

Yasushi Mochizuki, Ryo Funayama, Matsuyuki Shirota, Yuna Kikukawa, Masahiro Ohira, Hideaki Karasawa, Minoru Kobayashi, Shinobu Ohnuma, Michiaki Unno, Keiko Nakayama

International journal of cancer 149(10) 1787-1800 2021年8月4日
Reduced PHOX2B stability causes axonal growth impairment in motor neurons with TARDBP mutations

Shio Mitsuzawa, Naoki Suzuki, Tetsuya Akiyama, Mitsuru Ishikawa, Takefumi Sone, Jiro Kawada, Ryo Funayama, Matsuyuki Shirota, Hiroaki Mitsuhashi, Satoru Morimoto, Kensuke Ikeda, Tomomi Shijo, Akiyuki Ohno, Naoko Nakamura, Hiroya Ono, Risako Ono, Shion Osana, Tadashi Nakagawa, Ayumi Nishiyama, Rumiko Izumi, Shohei Kaneda, Yoshiho Ikeuchi, Keiko Nakayama, Teruo Fujii, Hitoshi Warita, Hideyuki Okano, Masashi Aoki

Stem Cell Reports 16(6) 1527-1541 2021年6月8日
GWAS Identified IL4R and the Major Histocompatibility Complex Region as the Associated Loci of Total Serum IgE Levels in 9,260 Japanese Individuals.

Kosuke Shido, Kaname Kojima, Matsuyuki Shirota, Kenshi Yamasaki, Ikuko N Motoike, Atsushi Hozawa, Soichi Ogishima, Naoko Minegishi, Kozo Tanno, Fumiki Katsuoka, Gen Tamiya, Setsuya Aiba, Masayuki Yamamoto, Kengo Kinoshita

The Journal of investigative dermatology 141(11) 2749-2752 2021年4月14日
A novel deletion in the C-terminal region of HSPB8 in a family with rimmed vacuolar myopathy.

Aya Inoue-Shibui, Tetsuya Niihori, Michio Kobayashi, Naoki Suzuki, Rumiko Izumi, Hitoshi Warita, Kenju Hara, Matsuyuki Shirota, Ryo Funayama, Keiko Nakayama, Ichizo Nishino, Masashi Aoki, Yoko Aoki

Journal of human genetics 66(10) 965-972 2021年3月20日
jMorp updates in 2020: large enhancement of multi-omics data resources on the general Japanese population.

Shu Tadaka, Eiji Hishinuma, Shohei Komaki, Ikuko N Motoike, Junko Kawashima, Daisuke Saigusa, Jin Inoue, Jun Takayama, Yasunobu Okamura, Yuichi Aoki, Matsuyuki Shirota, Akihito Otsuki, Fumiki Katsuoka, Atsushi Shimizu, Gen Tamiya, Seizo Koshiba, Makoto Sasaki, Masayuki Yamamoto, Kengo Kinoshita

Nucleic acids research 49(D1) D536-D544 2021年1月8日
Identification and Validation of Combination Plasma Biomarker of Afamin, Fibronectin and Sex Hormone-Binding Globulin to Predict Pre-eclampsia.

Yasuo Uchida, Tomoya Higuchi, Matsuyuki Shirota, Satoshi Kagami, Daisuke Saigusa, Seizo Koshiba, Jun Yasuda, Gen Tamiya, Shinichi Kuriyama, Kengo Kinoshita, Nobuo Yaegashi, Masayuki Yamamoto, Tetsuya Terasaki, Junichi Sugawara

Biological & pharmaceutical bulletin 44(6) 804-815 2021年
Identification of critical genetic variants associated with metabolic phenotypes of the Japanese population

Seizo Koshiba, Ikuko N. Motoike, Daisuke Saigusa, Jin Inoue, Yuichi Aoki, Shu Tadaka, Matsuyuki Shirota, Fumiki Katsuoka, Gen Tamiya, Naoko Minegishi, Nobuo Fuse, Kengo Kinoshita, Masayuki Yamamoto

Communications Biology 3(1) 2020年12月
Correction: Biallelic GALM pathogenic variants cause a novel type of galactosemia.

Yoichi Wada, Atsuo Kikuchi, Natsuko Arai-Ichinoi, Osamu Sakamoto, Yusuke Takezawa, Shinya Iwasawa, Tetsuya Niihori, Hiromi Nyuzuki, Yoko Nakajima, Erika Ogawa, Mika Ishige, Hiroki Hirai, Hideo Sasai, Ryoji Fujiki, Matsuyuki Shirota, Ryo Funayama, Masayuki Yamamoto, Tetsuya Ito, Osamu Ohara, Keiko Nakayama, Yoko Aoki, Seizo Koshiba, Toshiyuki Fukao, Shigeo Kure

Genetics in medicine : official journal of the American College of Medical Genetics 22(7) 1281-1281 2020年7月
Longitudinal plasma amino acid profiling with maternal genomic background throughout human pregnancy

Matsuyuki Shirota, Daisuke Saigusa, Riu Yamashita, Yasutake Kato, Mitsuyo Matsumoto, Junya Yamagishi, Noriko Ishida, Kazuki Kumada, Yuji Oe, Hisaaki Kudo, Junji Yokozawa, Yoko Kuroki, Ikuko Motoike, Fumiki Katsuoka, Masao Nagasaki, Seizo Koshiba, Keiko Nakayama, Osamu Tanabe, Jun Yasuda, Shigeo Kure, Kengo Kinoshita, Hirohito Metoki, Shinichi Kuriyama, Nobuo Yaegashi, Masayuki Yamamoto, Junichi Sugawara

Medical Mass Spectrometry 4(1) 36-49 2020年4月16日査読有り
Metabolic and pathologic profiles of human LSS deficiency recapitulated in mice.

Yoichi Wada, Atsuo Kikuchi, Akimune Kaga, Naoki Shimizu, Junya Ito, Ryo Onuma, Fumiyoshi Fujishima, Eriko Totsune, Ryo Sato, Tetsuya Niihori, Matsuyuki Shirota, Ryo Funayama, Kota Sato, Toru Nakazawa, Keiko Nakayama, Yoko Aoki, Setsuya Aiba, Kiyotaka Nakagawa, Shigeo Kure

PLoS genetics 16(2) e1008628 2020年2月26日査読有り

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MISC

幅広い臨床症状を呈したMECOM遺伝子変異を同定した2家系

新堀哲也, 田野島玲大, 笹原洋二, 佐藤篤, 入江正寛, 南條由佳, 舟山亮, 城田松之, 阿部太紀, 奥山祐子, 石井直人, 中山啓子, 呉繁夫, 今泉益栄, 青木洋子

日本小児科学会雑誌 126(2) 230-230 2022年2月
代謝プロファイルに影響を与える遺伝要因の網羅的解析

小柴生造, 小柴生造, 小柴生造, 元池育子, 元池育子, 三枝大輔, 三枝大輔, 井上仁, 井上仁, 井上仁, 菱沼英史, 青木裕一, 青木裕一, 田高周, 田高周, 城田松之, 城田松之, 城田松之, 木下賢吾, 木下賢吾, 木下賢吾, 山本雅之, 山本雅之, 山本雅之

日本生化学会大会(Web) 94th 2021年
満期産脳性麻痺群の網羅的遺伝学的解析 17例中9例で候補遺伝子変異を同定

竹澤祐介, 菊池敦生, 萩野谷和裕, 新堀哲也, 沼田有里佳, 松, 乾健彦, 山村菜絵子, 宮林拓矢, 安西真衣, 鈴木智, 室本, 大久保幸宗, 遠藤若葉, 冨樫紀子, 小林康子, 大沼晃, 舟山亮, 城田松之, 中山啓子, 青木洋子, 呉繁夫

日本小児科学会雑誌 123(6) 1069-1070 2019年6月
次世代型プロテオミクスによる妊娠高血圧腎症の診断マーカーの同定

樋口友也, 内田康雄, 内田康雄, 加賀美智史, 城田松之, 城田松之, 三枝大輔, 三枝大輔, 小柴生造, 小柴生造, 栗山進一, 栗山進一, 菅原準一, 菅原準一, 寺崎哲也, 寺崎哲也

日本薬学会東北支部大会講演要旨集 58th 2019年
ゲノム情報と連携した日本人多層オミックス参照パネルの意義

小柴生造, 小柴生造, 元池育子, 元池育子, 三枝大輔, 三枝大輔, 井上仁, 井上仁, 城田松之, 城田松之, 青木裕一, 青木裕一, 田高周, 田高周, 斎藤智, 木下賢吾, 木下賢吾, 山本雅之, 山本雅之

糖尿病(Web) 61(Suppl) 2018年
A study of dynamics of palmitoylated Ankyrin-G around a lipid bilayer by coarse-grained simulations

Kondo XH, Fujiwara Y, Shirota M, Kinoshita K

Journal of Physiological Sciences 67(Supplement1) S43 2017年査読有り
多系統プロテイノパチー連鎖性hnRNPA1変異に起因する孤立性封入体ミオパチー(Isolated inclusion body myopathy caused by a multisystem proteinopathy-linked hnRNPA1 mutation)

井泉瑠美子, 割田仁, 新堀哲也, 高橋俊明, 竪山真規, 鈴木直輝, 西山亜由美, 城田松之, 舟山亮, 中山啓子, 三橋里美, 西野一三, 青木洋子, 青木正志

臨床神経学 56(Suppl.) S280-S280 2016年12月
マルチオミクスが解き明かす疾患生物学日本人多層オミックス参照パネルの拡張

小柴生造, 三枝大輔, 元池育子, 小島要, 城田松之, 齋藤智, 勝岡史城, 河合洋介, 山口由美, 田邉修, 長崎正郎, 安田純, 木下賢吾, 山本雅之

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 89回 [1S05-5] 2016年9月
日本人多層オミックス参照パネルの公開

小柴生造, 加藤恭丈, 三枝大輔, 元池育子, 城田松之, 斎藤智, 田邉修, 安田純, 木下賢吾, 山本雅之

日本生化学会大会(Web) 88th 4T21L-07(3P0816) (WEB ONLY)-07(3P0816)] 2015年12月
血漿プロテオームによる大規模住民コホート研究

加藤恭丈, 小柴生造, 五十嵐和彦, 山本雅之, 田邉修, 蝦名真行, 城田松之, 元池育子, 木下賢吾, 工藤久智, 信國宇洋, 峯岸直子, 三枝大輔

日本プロテオーム学会大会要旨集 2015 62-62 2015年
Effect of protein structure and genome sequence in variant analysis

Matsuyuki Shirota, Kengo Kinoshita

GENES & GENETIC SYSTEMS 89(6) 292-292 2014年12月
大規模住民コホート研究のためのLC‐MS/MS血漿プロテオーム解析の標準化

加藤恭丈, 蝦名真行, 城田松之, 木下賢吾, 五十嵐和彦, 田邉修, 山本雅之

日本生化学会大会(Web) 87th 3P-505 (WEB ONLY)-505] 2014年10月
LC/MSによる分離技術を基盤とした高感度メタボローム解析手法の開発と臨床応用に関する研究

三枝大輔, 城田松之, 小柴正造, 菅原準一, 田邉修, 本橋ほづみ, 山本雅之

BMSコンファレンス講演要旨集 41st 122-126 2014年7月7日
大規模コホートにおける血漿プロテオーム解析サンプルの標準化

加藤恭丈, 蝦名真行, 城田松之, 木下賢吾, 五十嵐和彦, 田邊修

日本プロテオーム学会大会要旨集 2014 111-111 2014年
Exploring the proton permeation pathway by using homology modeling and molecular dynamics simulation of the Hv1 proton channel

Matsuyuki Shirota, Susumu Chiba, Kota Kasahara, Kengo Kinoshita

JOURNAL OF PHYSIOLOGICAL SCIENCES 63 S55-S55 2013年
Prediction of Protein-Protein Complex Structures Using a Docking Server, surFit

Eiji Kanamori, Yuko Tsuchiya, Yoichi Murakami, Joy Sarmiento, Shide Liang, Daron Standley, Matsuyuki Shirota, Kengo Kinoshita, Haruki Nakamura

PROTEIN SCIENCE 21 178-178 2012年8月
タンパク質におけるアミノ酸ペアの出現頻度への制約の解析

城田松之, 木下賢吾

研究報告バイオ情報学（BIO） 2012(18) 1-2 2012年3月21日
ヒトゲノム構造・機能アノテーションデータベースSAHG(Structural Atlas of Human Genome)の構築

本野千恵, 中田淳一, 清水佳奈, 富井健太郎, 長野希美, 野口保, 廣明秀一, 雨宮崇之, 城田松之, 小池亮太郎, 白井剛, 木下賢吾, 太田元規

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 10th 2010年

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

蛋白質立体構造予測手法の開発

2006年4月 - 現在

城田松之

基本情報

研究分野

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MISC

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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