共同研究・競争的資金等の研究課題

2020年4月 - 2023年3月

ビッグデータを用いた全ゲノム情報解析による腎臓リハビリテーションの個別化構築

日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(B)  基盤研究(B)

課題番号
20H04034
体系的課題番号
JP20H04034
担当区分
研究分担者
配分額
(総額)
17,550,000円
(直接経費)
13,500,000円
(間接経費)
4,050,000円

American College of Medical Genetics and Genomics(ACMG)から発表されている625個の腎障害関連遺伝子の日本人における保有率調査のほか,ToMMoに登録されているビッグデータ(血清,尿,疫学情報,調査票情報)も用いて腎障害リスク因子を検討した。具体的には地域住民コホート67Kデータのうち、JPAV2のSNP情報が付与された集団を用い、腎障害関連遺伝子から導かれるrisk scoreとeGFRの関連を分析,同様にApoL1遺伝子多型とeGFRの関連の分析を進めた.またベースライン腎機能異常者(約5000名)のうち詳細二次調査における腎機能改善群と腎機能悪化群を比較し、腎機能悪化を予測するベースラインの危険因子を分析をした.この解析にはApoL1多型あるいは625個のSNPから計算されたPRSと生活習慣の組み合わせを用いた。研究 代表者である上月は,総括指揮,動物モデルの作成,各種測定値の
評価,心大血管・腎・骨格筋組織の評価,CKD患者の運動療法の指導・評価を行う.本研究に関しては東北メディカルメガバンクのゲノプラセンターの支援を受けて研究の実施を進めた.2021年度はCOVID-19感染症拡大のため,研究担当者が東北大学病院から東北公済病院(COVID-19感染症の受け入れ病院)へ2021年4月から転勤となり進められなかった時期もあったため.派遣スタッフを1名雇用した.本派遣スタッフは東北メディカルメガバンクでのスパコン利用のアカウント作成など,業務遂行の土台作成を進めた.

リンク情報
KAKEN
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20H04034
ID情報
  • 課題番号 : 20H04034
  • 体系的課題番号 : JP20H04034