佐々木慎二 (Shinji Sasaki) - マイポータル

基本情報

所属: 琉球大学農学部教授

学位: 博士 (獣医学) 麻布大学

研究者番号: 10365439
J-GLOBAL ID: 202001009168448299
researchmap会員ID: R000006077

和牛の生産性の向上を目指し、遺伝的不良形質（胎子や子牛の病気、生産の質の低下など）の遺伝的要因を遺伝学、ゲノム科学の手法を用いて特定するとともに、発症のメカニズムを解明し、農家が安心して和牛を生産できるよう全国の機関と協力して研究に取り組んでいます。また、最近は和牛の歴史にも興味を持ち、色々な方にお話を伺い古い資料を読みながら勉強しています。

研究キーワード

ゲノム科学、遺伝学、遺伝性疾患、和牛

研究分野

経歴

学歴

1995年

麻布大学獣医学研究科獣医学専攻
1989年

麻布大学獣医学部獣医学科

論文

Control of Recessive Genetic Disorders in Japanese Black Cattle Using DNA-Based Genetic Diagnostic Tests

Ogino, A., Miyazaki, Y., Suzuki, Y., Tahara, G., Sasaki, Shinji, Kurogi, K., Nurimoto, M.

Animal Science Journal 96(1) e70121 2025年10月査読有り
Multivariate Effects of SNPs on Environmental Streptococcal Mastitis Evaluated With an NGS-Based Association Study Using Targeted Resequencing in the Bovine MHC Region

Nagata, F., Lo, C., Saito, S., Matsuura, R., Watanuki, S., Hosomichi, K., Sasaki, Shinji, Kawata, R., Shimizu, H., Sone, T. …

HLA 106 e70333 2025年7月査読有り
Presence of a Deletion Mutation of Myostatin (MSTN) Gene Associated With Double-Muscling Phenotype in Japanese Black Cattle Population

Le, N. A. T., Kubo, R., Borjigin, L., Ibi, T., Sasaki, Shinji, Kunieda, T.

Animal Science Journal 96(1) e70055 2025年4月査読有り
Association of a non-synonymous variant of MLH3 gene involved in meiotic recombination with conception rate of Japanese Black cattle

Thu Nu Anh Le, Trung Ba Nguyen, Tsuji T., Ibi T., Sasaki S., Kunieda, T.

Animal Reproduction Science 64-6 2024年11月査読有り
A genome-wide association study reveals fetal genetic factor for gestation length on chromosome 21 in Japanese Black cattle

Kurose-Iwanaga, M, Muraki, E, Sasaki, S

Animal Science Journal 95(1) e14006 2024年査読有り
A potent allele marker related to low bull conception rate in Japanese Black bulls

Kinukawa, M, Ito, M, Uemoto, Y, Ogino, A, Haruta, S, Kurogi, K, Watanabe, T, Sasaki, S, Naniwa, Y, Uchiyama, K …

Animal 17 100804-100812 2023年査読有り
Comprehensive analysis of 124 transcriptomes from 31 tissues in developing, juvenile, and adult Japanese Black Cattle

Taichi Arishima, Hiroyuki Wakaguri, Ryotaro Nakashima, Seigo Sakakihara, Keisuke Kawashima, Yoshikazu Sugimoto, Yutaka Suzuki, Shinji Sasaki

DNA Research 29(5) 1-14 2022年査読有り
Identification of deleterious recessive haplotypes and candidate deleterious recessive mutations in Japanese Black cattle

Sasaki, S, Watanabe, T, Ibi, T, Hasegawa, K, Sakamoto, Y, Moriwaki, S, Kurogi, K, Ogino, A, Yasumori, T, Wakaguri, H …

Scientific Reports 11(1) 6687 2021年査読有り
Genetic variants of RNF212 involved in meiotic recombination rate and its relation with conception rate in Japanese Black cattle

Thu Nu Anh Le, Trung Ba Nguyen, Ripon Chandra Paul, Okada, Y, Tsuji, T, Ibi, T, Sasaki, S, Kunieda, T

The journal of Animal Genetics 49 15-19 2021年査読有り
Genetic diversity and genomic inbreeding in Japanese Black cows in the islands of Okinawa Prefecture evaluated using single-nucleotide polymorphism array

Suezawa, R, Nikadori, H, Sasaki, S.

Animal Science Journal 92 e13525 2021年査読有り
A 44-kb deleted-type copy number variation is associated with decreasing complement component activity and calf mortality in Japanese Black cattle

Sasaki, S. Miki, Y. Ibi, T. Wakaguri, H. Yoshida, Y. Sugimoto, Y. Suzuki, Y

BMC Genomics 22(1) 107 2021年査読有り
A genome-wide association study reveals a quantitative trait locus for calf mortality on chromosome 9 in Japanese Black cattle

Shinji Sasaki, Takayuki Ibi

Animal Genetics 52(2) 214-216 2021年査読有り
A long-term study of the effects of SLC12A1 homozygous mutation (g.62382825G>A, p.Pro372Leu) in Japanese Black cattle

Sakamoto, Y, Hasegawa, K, Moriwaki, S, Hara, Y, Hamada, Y, Sasaki, S

Animal Science Journal 91 e13415 2020年査読有り
Genotypes and allele frequencies of buried SNPs in a bovine single-nucleotide polymorphism array in Japanese Black cattle.

Shinji Sasaki, Eiji Muraki, Yoshinobu Inoue, Ryouhei Suezawa, Hideki Nikadori, Yuuichi Yoshida, Shouta Nariai, Ryoya Hideshima, Shiyunsuke Moriwaki, Ryotaro Nakashima …

Animal science journal 90(12) 1503-1509 2019年12月査読有り
Relationship between call rate per individual and genotyping accuracy of bovine single-nucleotide polymorphism array using deoxyribonucleic acid of various qualities.

Shinji Sasaki, Kanako Yoshinari, Katsuo Uchiyama, Masayuki Takeda, Takatoshi Kojima

Animal science journal 89(11) 1533-1539 2018年11月査読有り
Genome-wide association studies identified variants for taurine concentration in Japanese Black beef.

Nanae Sasago, Masayuki Takeda, Tsuyoshi Ohtake, Tsuyoshi Abe, Hironori Sakuma, Takatoshi Kojima, Shinji Sasaki, Yoshinobu Uemoto

Animal science journal 89(8) 1051-1059 2018年8月査読有り
Maternal variant in the upstream of FOXP3 gene on the X chromosome is associated with recurrent infertility in Japanese Black cattle.

Taichi Arishima, Shinji Sasaki, Tomohiro Isobe, Yoshihisa Ikebata, Shinichi Shimbara, Shogo Ikeda, Keisuke Kawashima, Yutaka Suzuki, Manabu Watanabe, Sumio Sugano …

BMC genetics 18(1) 103-103 2017年12月6日査読有り
Effect of two non-synonymous ecto-5'-nucleotidase variants on the genetic architecture of inosine 5'-monophosphate (IMP) and its degradation products in Japanese Black beef.

Yoshinobu Uemoto, Tsuyoshi Ohtake, Nanae Sasago, Masayuki Takeda, Tsuyoshi Abe, Hironori Sakuma, Takatoshi Kojima, Shinji Sasaki

BMC genomics 18(1) 874-874 2017年11月13日査読有り
Furosemide loading test in a case of homozygous solute carrier family 12, member 1 (SLC12A1) mutation (g.62382825G>A, p.Pro372Leu) in Japanese Black cattle.

Kiyotoshi Hasegawa, Shinji Sasaki, Yoichi Sakamoto, Akifumi Takano, Megumi Takayama, Tomoko Higashi, Yoshikazu Sugimoto, Yasuaki Yasuda

Animal science journal 88(10) 1459-1464 2017年10月査読有り
Single nucleotide polymorphisms in the bovine MHC region of Japanese Black cattle are associated with bovine leukemia virus proviral load.

Shin-Nosuke Takeshima, Shinji Sasaki, Polat Meripet, Yoshikazu Sugimoto, Yoko Aida

Retrovirology 14(1) 24-24 2017年4月4日査読有り

もっとみる

MISC

黒毛和種の遺伝子発現データベース〜遺伝性疾患に関与する遺伝子の機能解析の促進を目指して

佐々木慎二, 有島太一, 若栗浩幸, 鈴木穣

畜産技術 3月号 16-20 2023年
De Novo Genome Assembly of Japanese Black Cattle as Model of an Economically Relevant Animal

Sasaki, S, Haga, Y, Wakaguri, H, Abe, K, Suzuki, Y

Nanopore Sequencing Methods in Molecular Biology 2632 41-55 2023年
和牛ゲノムデータベースによる遺伝的不良形質の原因変異の迅速な解明、畜産技術の課題と展望

佐々木慎二, 鈴木穣

創立30周年記念誌（全国競馬・畜産振興会） 4-12 2021年
和牛のde novoゲノムアセンブリ、ロングリード WET&DRY解析ガイド

若栗浩幸, 今村聖実, 佐々木慎二, 鈴木穣

羊土社 165-176 2021年
黒毛和種におけるゲノム情報の活用の現状と課題(3):胚死滅に関与する遺伝的要因の解明

佐々木慎二

LIAJ News 187 14-16 2021年
黒毛和種におけるゲノム情報の活用の現状と課題(2):和牛ゲノムデータベース

佐々木慎二

LIAJ News 186 2-4 2021年
黒毛和種におけるゲノム情報の活用の現状と課題(1)

佐々木慎二

LIAJ News 185 2-4 2020年
和牛ゲノムデータベース協議会の立ち上げ

佐々木慎二、篠田満

畜産技術（10月号） 2020年
全ゲノムシーケンス

佐々木慎二

畜産技術 (6月号) 2020年
胚死滅を引き起こす遺伝的要因のゲノム解析

佐々木慎二

畜産技術 (7月号) 2020年
黒毛和種の多様体データベースの構築による遺伝性疾患の原因変異の迅速な解明

佐々木慎二

畜産技術 (11月号) 8-13 2018年
黒毛和種牛で続発した胎膜水腫の原因変異の解明と対策

長谷川清寿, 佐々木慎二, 東智子, 杉本喜憲

畜産技術 (8月号) 7-10 2017年
黒毛和種で発生した胎膜水腫の原因変異の解明

佐々木慎二, 長谷川清寿, 東智子, 杉本喜憲

臨床獣医 2017年
ウシのコピー数多型、Copy number variation in the cattle genome

佐々木慎二

The Journal of Animal Genetics 44 15-24 2016年

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

黒毛和種の臍ヘルニアの遺伝的要因の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2025年4月 - 2028年3月

佐々木慎二
黒毛和種の強化ゲノム情報の改善・活用事業

日本中央競馬会畜産振興事業、分担 2020年 - 2022年
和牛のゲノムデータベースと地域サンプルを活用した生産阻害因子解明のための解析プラットフォームの構築

イノベーション創出強化研究推進事業開発研究ステージ、分担 2018年 - 2020年
黒毛和種で子牛死亡を引き起こす遺伝的要因の解明

畜産ニューテック協会研究助成事業、研究代表 2020年
黒毛和種における線毛機能不全症候群の解析

旗影会研究助成、研究代表 2020年
沖縄県の島々の黒毛和種集団の多様性、近交度のゲノムの視点からの評価

伊藤記念財団助成、研究代表 2019年
和牛におけるSNP型判定データの品質管理プロトコールの確立

畜産ニューテック研究調査助成事業、研究代表 2018年
和牛の遺伝子多様体データベースの構築による子牛生産阻害因子の迅速な解明

農林水産業・食品産業科学技術研究推進事業発展融合ステージ、分担 2015年 - 2017年
黒毛和種で胚死滅を引き起こす遺伝的要因の解明

日本学術振興会・科研費、基盤研究(C)、研究代表 2014年 - 2016年
黒毛和種で致死に関与するゲノムコピー数多型の探索

伊藤記念財団助成、研究代表 2016年
和牛の胚死滅を引き起こす劣性変異の探索

生研センターイノベーション創出基礎的研究推進事業、分担 2012年 - 2014年
黒毛和種の雌牛における空胎期間を短縮させる遺伝的要因の解明

伊藤記念財団助成、研究代表 2014年
黒毛和種・雌牛の受胎率を向上させる遺伝的要因の解明：育種基盤の開発を目指して

旗影会研究助成、研究代表 2012年 - 2013年
黒毛和種・雌牛の繁殖能力を向上させるDNAマーカーの開発

興農会研究助成、研究代表 2013年
黒毛和種の胚死滅を引き起こす劣性変異の調査

興農会研究助成、研究代表 2012年
大脳皮質の神経細胞移動におけるネトリンとネトリン受容体の機能解析

日本学術振興会・科研費、若手研究(B)、研究代表 2007年 - 2008年
どのような分子によって大脳皮質神経細胞の移動終了は制御されるのか？

日本学術振興会、科研費、若手研究(B)、研究代表 2004年 - 2005年