佐々木慎二 (Shinji Sasaki) - マイポータル

基本情報

所属: 琉球大学農学部准教授

学位: 博士 (獣医学) 麻布大学

研究者番号: 10365439
J-GLOBAL ID: 202001009168448299
researchmap会員ID: R000006077

黒毛和種の生産性の向上を目指し、遺伝的不良形質（胎子・子牛死亡、生産の質の低下など）の原因をゲノム科学の手法を用いて特定するとともに、これらの発症の生理的メカニズムを解明し、農家が安心して黒毛和種を生産できるよう全国の機関（県、団体、農家、大学など）と協力して研究に取り組んでいます。

研究キーワード

ゲノム科学、遺伝学、遺伝性疾患、黒毛和種

研究分野

経歴

学歴

1995年

麻布大学獣医学研究科獣医学専攻
1989年

麻布大学獣医学部獣医学科

論文

Identification of deleterious recessive haplotypes and candidate deleterious recessive mutations in Japanese Black cattle

Sasaki, S, Watanabe, T, Ibi, T, Hasegawa, K, Sakamoto, Y, Moriwaki, S, Kurogi, K, Ogino, A, Yasumori, T, Wakaguri, H, Muraki, E, Miki, Y, Yoshida, Y, Inoue, Y, Tabuchi, I, Iwao, K, Arishima, T, Kawashima, K, Watanabe, M, Sugano, S, Sugimoto, Y, Suzuki, Y

Scientific Reports 11 6687 2021年査読有り
Genetic variants of RNF212 involved in meiotic recombination rate and its relation with conception rate in Japanese Black cattle

Thu Nu Anh Le, Trung Ba Nguyen, Ripon Chandra Paul, Okada, Y, Tsuji, T, Ibi, T, Sasaki, S, Kunieda, T

The journal of Animal Genetics 49 15-19 2021年査読有り
Genetic diversity and genomic inbreeding in Japanese Black cows in the islands of Okinawa Prefecture evaluated using single-nucleotide polymorphism array

Suezawa, R, Nikadori, H, Sasaki, S.

Animal Science Journal 92 e13525 2021年査読有り
A 44-kb deleted-type copy number variation is associated with decreasing complement component activity and calf mortality in Japanese Black cattle

Sasaki, S. Miki, Y. Ibi, T. Wakaguri, H. Yoshida, Y. Sugimoto, Y. Suzuki, Y

BMC Genomics 22 107 2021年査読有り
A genome-wide association study reveals a quantitative trait locus for calf mortality on chromosome 9 in Japanese Black cattle

Shinji Sasaki, Takayuki Ibi

Animal Genetics 52 214-216 2021年査読有り
A long-term study of the effects of SLC12A1 homozygous mutation (g.62382825G>A, p.Pro372Leu) in Japanese Black cattle

Sakamoto, Y, Hasegawa, K, Moriwaki, S, Hara, Y, Hamada, Y, Sasaki, S

Animal Science Journal 91 e13415 2020年査読有り
Genotypes and allele frequencies of buried SNPs in a bovine single-nucleotide polymorphism array in Japanese Black cattle.

Shinji Sasaki, Eiji Muraki, Yoshinobu Inoue, Ryouhei Suezawa, Hideki Nikadori, Yuuichi Yoshida, Shouta Nariai, Ryoya Hideshima, Shiyunsuke Moriwaki, Ryotaro Nakashima, Katsuo Uchiyama, Kanako Yoshinari, Masayuki Takeda, Takatoshi Kojima

Animal science journal 90(12) 1503-1509 2019年12月査読有り
Relationship between call rate per individual and genotyping accuracy of bovine single-nucleotide polymorphism array using deoxyribonucleic acid of various qualities.

Shinji Sasaki, Kanako Yoshinari, Katsuo Uchiyama, Masayuki Takeda, Takatoshi Kojima

Animal science journal 89(11) 1533-1539 2018年11月査読有り
Genome-wide association studies identified variants for taurine concentration in Japanese Black beef.

Nanae Sasago, Masayuki Takeda, Tsuyoshi Ohtake, Tsuyoshi Abe, Hironori Sakuma, Takatoshi Kojima, Shinji Sasaki, Yoshinobu Uemoto

Animal science journal 89(8) 1051-1059 2018年8月査読有り
Maternal variant in the upstream of FOXP3 gene on the X chromosome is associated with recurrent infertility in Japanese Black cattle.

Taichi Arishima, Shinji Sasaki, Tomohiro Isobe, Yoshihisa Ikebata, Shinichi Shimbara, Shogo Ikeda, Keisuke Kawashima, Yutaka Suzuki, Manabu Watanabe, Sumio Sugano, Kazunori Mizoshita, Yoshikazu Sugimoto

BMC genetics 18(1) 103-103 2017年12月6日査読有り
Effect of two non-synonymous ecto-5'-nucleotidase variants on the genetic architecture of inosine 5'-monophosphate (IMP) and its degradation products in Japanese Black beef.

Yoshinobu Uemoto, Tsuyoshi Ohtake, Nanae Sasago, Masayuki Takeda, Tsuyoshi Abe, Hironori Sakuma, Takatoshi Kojima, Shinji Sasaki

BMC genomics 18(1) 874-874 2017年11月13日査読有り
Furosemide loading test in a case of homozygous solute carrier family 12, member 1 (SLC12A1) mutation (g.62382825G>A, p.Pro372Leu) in Japanese Black cattle.

Kiyotoshi Hasegawa, Shinji Sasaki, Yoichi Sakamoto, Akifumi Takano, Megumi Takayama, Tomoko Higashi, Yoshikazu Sugimoto, Yasuaki Yasuda

Animal science journal 88(10) 1459-1464 2017年10月査読有り
Single nucleotide polymorphisms in the bovine MHC region of Japanese Black cattle are associated with bovine leukemia virus proviral load.

Shin-Nosuke Takeshima, Shinji Sasaki, Polat Meripet, Yoshikazu Sugimoto, Yoko Aida

Retrovirology 14(1) 24-24 2017年4月4日査読有り
Loss of maternal ANNEXIN A10 via a 34-kb deleted-type copy number variation is associated with embryonic mortality in Japanese Black cattle.

Shinji Sasaki, Takayuki Ibi, Takayuki Akiyama, Moriyuki Fukushima, Yoshikazu Sugimoto

BMC genomics 17(1) 968-968 2016年11月24日査読有り
A missense mutation in solute carrier family 12, member 1 (SLC12A1) causes hydrallantois in Japanese Black cattle.

Shinji Sasaki, Kiyotoshi Hasegawa, Tomoko Higashi, Yutaka Suzuki, Sumio Sugano, Yasuaki Yasuda, Yoshikazu Sugimoto

BMC genomics 17(1) 724-724 2016年9月9日査読有り
Identity of neocortical layer 4 neurons is specified through correct positioning into the cortex.

Koji Oishi, Nao Nakagawa, Kashiko Tachikawa, Shinji Sasaki, Michihiko Aramaki, Shinji Hirano, Nobuhiko Yamamoto, Yumiko Yoshimura, Kazunori Nakajima

eLife 5 2016年2月12日査読有り
A genome-wide association study reveals a quantitative trait locus for days open on chromosome 2 in Japanese Black cattle.

Shinji Sasaki, Takayuki Ibi, Takatoshi Kojima, Yoshikazu Sugimoto

Animal genetics 47(1) 102-5 2016年2月査読有り
Genome-wide identification of copy number variation using high-density single-nucleotide polymorphism array in Japanese Black cattle.

Shinji Sasaki, Toshio Watanabe, Shota Nishimura, Yoshikazu Sugimoto

BMC genetics 17 26-26 2016年1月25日査読有り
Polymorphisms associated with four reproductive traits have no adverse effects on meat traits in Japanese Black cattle

Sasaki, S, Uemoto, Y, Sasago, N, Abe, T, Nishimura, S, Sugimoto, Y

Anim Genet 47 386-387 2016年査読有り
Impact of QTL minor allele frequency on genomic evaluation using real genotype data and simulated phenotypes in Japanese Black cattle.

Yoshinobu Uemoto, Shinji Sasaki, Takatoshi Kojima, Yoshikazu Sugimoto, Toshio Watanabe

BMC genetics 16 134-134 2015年11月19日査読有り

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MISC

黒毛和種におけるゲノム情報の活用の現状と課題(3):胚死滅に関与する遺伝的要因の解明

佐々木慎二

LIAJ News 187 14-16 2021年
黒毛和種におけるゲノム情報の活用の現状と課題(2):和牛ゲノムデータベース

佐々木慎二

LIAJ News 186 2-4 2021年
黒毛和種におけるゲノム情報の活用の現状と課題(1)

佐々木慎二

LIAJ News 185 2-4 2020年
和牛ゲノムデータベース協議会の立ち上げ

佐々木慎二、篠田満

畜産技術（10月号） 2020年
全ゲノムシーケンス

佐々木慎二

畜産技術 (6月号) 2020年
胚死滅を引き起こす遺伝的要因のゲノム解析

佐々木慎二

畜産技術 (7月号) 2020年
黒毛和種の多様体データベースの構築による遺伝性疾患の原因変異の迅速な解明

佐々木慎二

畜産技術 (11月号) 8-13 2018年
黒毛和種牛で続発した胎膜水腫の原因変異の解明と対策

長谷川清寿, 佐々木慎二, 東智子, 杉本喜憲

畜産技術 (8月号) 7-10 2017年
黒毛和種で発生した胎膜水腫の原因変異の解明

佐々木慎二, 長谷川清寿, 東智子, 杉本喜憲

臨床獣医 2017年
Copy number variation in the cattle genome

佐々木慎二

The Journal of Animal Genetics 44 15-24 2016年

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

黒毛和種の強化ゲノム情報の改善・活用事業

日本中央競馬会畜産振興事業、分担 2020年 - 2022年
和牛のゲノムデータベースと地域サンプルを活用した生産阻害因子解明のための解析プラットフォームの構築

イノベーション創出強化研究推進事業開発研究ステージ、分担 2018年 - 2020年
黒毛和種で子牛死亡を引き起こす遺伝的要因の解明

畜産ニューテック協会研究助成事業、研究代表 2020年
黒毛和種における線毛機能不全症候群の解析財団法人旗影会研究助成

旗影会研究助成、研究代表 2020年
沖縄県の島々の黒毛和種集団の多様性、近交度のゲノムの視点からの評価

伊藤記念財団助成、研究代表 2019年
和牛におけるSNP型判定データの品質管理プロトコールの確立

畜産ニューテック研究調査助成事業、研究代表 2018年
和牛の遺伝子多様体データベースの構築による子牛生産阻害因子の迅速な解明

農林水産業・食品産業科学技術研究推進事業発展融合ステージ、分担 2015年 - 2017年
黒毛和種で胚死滅を引き起こす遺伝的要因の解明

日本学術振興会・科研費、基盤研究(C)、研究代表 2014年 - 2016年
黒毛和種で致死に関与するゲノムコピー数多型の探索

伊藤記念財団助成、研究代表 2016年
和牛の胚死滅を引き起こす劣性変異の探索

生研センターイノベーション創出基礎的研究推進事業、分担 2012年 - 2014年
黒毛和種の雌牛における空胎期間を短縮させる遺伝的要因の解明

伊藤記念財団助成、研究代表 2014年
黒毛和種・雌牛の受胎率を向上させる遺伝的要因の解明：育種基盤の開発を目指して

旗影会研究助成、研究代表 2012年 - 2013年
黒毛和種・雌牛の繁殖能力を向上させるDNAマーカーの開発

興農会研究助成、研究代表 2013年
黒毛和種の胚死滅を引き起こす劣性変異の調査

興農会研究助成、研究代表 2012年
大脳皮質の神経細胞移動におけるネトリンとネトリン受容体の機能解析

日本学術振興会・科研費、若手研究(B)、研究代表 2007年 - 2008年
どのような分子によって大脳皮質神経細胞の移動終了は制御されるのか？

日本学術振興会、科研費、若手研究(B)、研究代表 2004年 - 2005年