西垣功一 (Koichi Nishigaki) - マイポータル

基本情報

学位: 理学修士(東京大学)
理学博士(東京大学)

J-GLOBAL ID: 200901065823117780

外部リンク: http://gp.fms.saitama-u.ac.jp

研究キーワード

研究分野

経歴

1986年4月 - 2004年3月

, 埼玉大学工学部助教授生物物理学
1986年4月 - 2004年3月

,Associated Prof., Saitama University Biophysics
1976年7月 - 1986年3月

, 埼玉大学工学部助手環境化学基礎実験
1976年7月 - 1986年3月

,Assistant Prof., Saitama University Basic Experiments on Environmental Chemistry
埼玉大学教授

学歴

- 1976年

東京大学理学系研究科生物化学
- 1976年

Univ. of Tokyo Graduate School, Division of Science
- 1974年

東京大学理学系研究科生物化学
- 1974年

Univ. of Tokyo Graduate School, Division of Science
- 1972年

東京大学理学部生物化学
- 1972年

Univ. of Tokyo Faculty of Science

MISC

Toward the fast blind docking of a peptide to a target protein by using a four-body statistical pseudo-potential

Takuyo Aita, Koichi Nishigaki, Yuzuru Husimi

COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY 34(1) 53 - 62 2010年2月
Toward the fast blind docking of a peptide to a target protein by using a four-body statistical pseudo-potential

Takuyo Aita, Koichi Nishigaki, Yuzuru Husimi

COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY 34(1) 53 - 62 2010年2月
Development of Systemic in vitro Evolution and Its Application to Generation of Peptide-Aptamer-Based Inhibitors of Cathepsin E

Koichiro Kitamura, Chuya Yoshida, Yasunori Kinoshita, Tomoko Kadowaki, Yoko Takahashi, Takahiro Tayama, Tomoyo Kawakubo, Mohammed Naimuddin, Md. Salimullah, Naoto Nemoto, Kazunori Hanada, Yuzuru Husimi, Kenji Yamamoto, Koichi Nishigaki

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 387(5) 1186 - 1198 2009年4月
Development of Systemic in vitro Evolution and Its Application to Generation of Peptide-Aptamer-Based Inhibitors of Cathepsin E

Koichiro Kitamura, Chuya Yoshida, Yasunori Kinoshita, Tomoko Kadowaki, Yoko Takahashi, Takahiro Tayama, Tomoyo Kawakubo, Mohammed Naimuddin, Md. Salimullah, Naoto Nemoto, Kazunori Hanada, Yuzuru Husimi, Kenji Yamamoto, Koichi Nishigaki

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 387(5) 1186 - 1198 2009年4月
Host-parasite relations of bacteria and phages can be unveiled by Oligostickiness, a measure of relaxed sequence similarity

Shamim Ahmed, Ayumu Saito, Miho Suzuki, Naoto Nemoto, Koichi Nishigaki

BIOINFORMATICS 25(5) 563 - 570 2009年3月
Host-parasite relations of bacteria and phages can be unveiled by Oligostickiness, a measure of relaxed sequence similarity

Shamim Ahmed, Ayumu Saito, Miho Suzuki, Naoto Nemoto, Koichi Nishigaki

BIOINFORMATICS 25(5) 563 - 570 2009年3月
Rapid In Vitro Synthesis of Pico-mole Quantities of Peptides

Koichiro Kitamura, Chuya Yoshida, Md Salimullah, Yasunori Kinoshita, Miho Suzuki, Naoto Nemoto, Koichi Nishigaki

CHEMISTRY LETTERS 37(12) 1250 - 1251 2008年12月
Rapid In Vitro Synthesis of Pico-mole Quantities of Peptides

Koichiro Kitamura, Chuya Yoshida, Md Salimullah, Yasunori Kinoshita, Miho Suzuki, Naoto Nemoto, Koichi Nishigaki

CHEMISTRY LETTERS 37(12) 1250 - 1251 2008年12月
Rapid In Vitro Synthesis of Pico-mole Quantities of Peptides

Koichiro Kitamura, Chuya Yoshida, Md Salimullah, Yasunori Kinoshita, Miho Suzuki, Naoto Nemoto, Koichi Nishigaki

CHEMISTRY LETTERS 37(12) 1250 - 1251 2008年12月
Rapid In Vitro Synthesis of Pico-mole Quantities of Peptides

Koichiro Kitamura, Chuya Yoshida, Md Salimullah, Yasunori Kinoshita, Miho Suzuki, Naoto Nemoto, Koichi Nishigaki

CHEMISTRY LETTERS 37(12) 1250 - 1251 2008年12月
Molecular design guided by a local map of sequence space: DNA aptamers that inhibit cathepsin E

Chuya Yoshida, Akira Kuniwake, Mohammed Naimuddin, Koichi Nishigaki

OLIGONUCLEOTIDES 18(1) 1 - 8 2008年3月
Molecular design guided by a local map of sequence space: DNA aptamers that inhibit cathepsin E

Chuya Yoshida, Akira Kuniwake, Mohammed Naimuddin, Koichi Nishigaki

OLIGONUCLEOTIDES 18(1) 1 - 8 2008年3月
保健・環境にインパクトを与えるメタゲノム自動解析装置（GPロボット）の開発

西垣功一

総合研究機構研究プロジェクト研究成果報告書 6 (平成19年度) 2008年
高速分子進化のための基盤技術の開発 A1 進化リアクタープロセスの改良

西垣功一, 北村幸一郎, 武居修, 高橋陽子, 井上里美

埼玉県地域結集型共同研究事業事業終了報告書 43 - 44 2008年
高速分子進化のための基盤技術の開発 A2 配列空間適応歩行技術の展開

西垣功一, 相田拓洋, 二木類, 仲島日出男, 富永達矢, 後藤仁志

埼玉県地域結集型共同研究事業事業終了報告書 45 - 46 2008年
高速分子進化のための基盤技術の開発 A4 マイクロバイオ分析デバイスの開発

西垣功一, 鵜飼智文, SakthiKUMAR, 吉田泰彦, 前川透, 柏木邦宏, 東海林崇, 一木隆範

埼玉県地域結集型共同研究事業事業終了報告書 49 - 50 2008年
高速分子進化のための基盤技術の開発 A3 マイクロリアクターアレイ進化リアクターの開発

西垣功一, ManishBiyani, 辻幸香, 鈴木雅恵, 三井隆広

埼玉県地域結集型共同研究事業事業終了報告書 47 - 48 2008年
高速分子進化のための基盤技術の開発１ｆゲノムデータからの知識抽出手法の開発と評価

西垣功一, 佐藤直樹

埼玉県地域結集型共同研究事業事業終了報告書 51 2008年
保健・環境にインパクトを与えるメタゲノム自動解析装置（GPロボット）の開発

西垣功一

総合研究機構研究プロジェクト研究成果報告書 6 (平成19年度) 2008年
高速分子進化のための基盤技術の開発 A1 進化リアクタープロセスの改良

西垣功一, 北村幸一郎, 武居修, 高橋陽子, 井上里美

埼玉県地域結集型共同研究事業事業終了報告書 43 - 44 2008年

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書籍等出版物

猪飼篤他（編）、西垣功一(分担執筆）タンパク質の事典

朝倉書房 2008年
西垣功一情報創生過程としての進化・進化分子工学機能材料工学総論テキスト

2008年
猪飼篤他（編）、西垣功一(分担執筆）タンパク質の事典

朝倉書房 2008年
西垣功一情報創生過程としての進化・進化分子工学機能材料工学総論テキスト

2008年
大島泰郎他（編）、西垣功一（分担執筆）生化学辞典第4版

東京化学同人 2007年
大島泰郎他（編）、西垣功一（分担執筆）生化学辞典第4版

東京化学同人 2007年
伏見譲,西垣功一(共編著）進化・情報・かたち

培風館 2006年
伏見譲,西垣功一(共編著）進化・情報・かたち

培風館 2006年
養老猛司,和田昭允（著）/美宅成樹,西垣功一,伏見譲（編）科学は豹変する

培風館 2005年
養老猛司,和田昭允（著）/美宅成樹,西垣功一,伏見譲（編）科学は豹変する

培風館 2005年
西垣功一形の科学百科事典

朝倉書店 2004年
西垣功一形の科学百科事典

朝倉書店 2004年

講演・口頭発表等

132

タンパク質に超高度親和性を有するペプチドの解離定数測定 Measurement of the dissociation constant of peptides with a ultra-high affinity to a protein

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
異なる淘汰条件で再帰的に選択（スクリーニング）されたAβ結合ペプチドに関する親和性の研究 Study on the affinity of Aβ-binding peptide selected from recursively two different selection conditions ○上野-辻幸香1, 北村幸一郎2, 井口翔1, モハメドサリムラ3, 西垣功一1 (1埼大院・理工研, 2ジェナシス（株）, 3理研・オミックス基盤研究領域）

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
カテプシンＥ特異的結合ペプチドの診断薬応用 Application of cathepsin-E specific binding peptides for a diagnostic reagent kit.

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
高速分子進化「発達ライブラリー法」による中性条件下カテプシンE活性化ペプチドの淘汰 Selection of cathepsin E-activating peptides at a neutral pH using a progressive library method

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
ペプチドペア法によるカテプシンE活性化機能の効率的向上 Paired peptide method effective for advancing cathepsin E-activating activities of peptides.

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
cDNA/mRNA ディスプレイ（in vitro virus法）に最適なmRNA構造 Optimazation of mRNA for cDNA/mRNA display (in vitro virus)

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
新規ピューロマイシン・リンカーを用いたcDNAディスプレイ法の簡便で効率的な調整法 Simple and efficient preparation of cDNA display with a novel puromycin-linker DNA

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
GP法による昆虫ゲノム分類学は、古典的な表現型による分類とよく一致する Genome-based taxonomy of insects corresponds better with that of classical phenotype-based one: Genome profiling (GP) proach

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
形質による古典分類学を批准したゲノムによる分類学(Ⅱ) Classical Phenotype-Based Taxonomy Was Ratified by Genome-Based One(Ⅱ)

形の科学会誌 2009年
ペプチドペア法によるカテプシンＥ活性調節ペプチドの高機能化

2009年
タンパク質に超高度親和性を有するペプチドの解離定数測定 Measurement of the dissociation constant of peptides with a ultra-high affinity to a protein

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
異なる淘汰条件で再帰的に選択（スクリーニング）されたAβ結合ペプチドに関する親和性の研究 Study on the affinity of Aβ-binding peptide selected from recursively two different selection conditions ○上野-辻幸香1, 北村幸一郎2, 井口翔1, モハメドサリムラ3, 西垣功一1 (1埼大院・理工研, 2ジェナシス（株）, 3理研・オミックス基盤研究領域）

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
カテプシンＥ特異的結合ペプチドの診断薬応用 Application of cathepsin-E specific binding peptides for a diagnostic reagent kit.

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
高速分子進化「発達ライブラリー法」による中性条件下カテプシンE活性化ペプチドの淘汰 Selection of cathepsin E-activating peptides at a neutral pH using a progressive library method

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
ペプチドペア法によるカテプシンE活性化機能の効率的向上 Paired peptide method effective for advancing cathepsin E-activating activities of peptides.

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
cDNA/mRNA ディスプレイ（in vitro virus法）に最適なmRNA構造 Optimazation of mRNA for cDNA/mRNA display (in vitro virus)

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
新規ピューロマイシン・リンカーを用いたcDNAディスプレイ法の簡便で効率的な調整法 Simple and efficient preparation of cDNA display with a novel puromycin-linker DNA

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
GP法による昆虫ゲノム分類学は、古典的な表現型による分類とよく一致する Genome-based taxonomy of insects corresponds better with that of classical phenotype-based one: Genome profiling (GP) proach

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
形質による古典分類学を批准したゲノムによる分類学(Ⅱ) Classical Phenotype-Based Taxonomy Was Ratified by Genome-Based One(Ⅱ)

形の科学会誌 2009年
ペプチドペア法によるカテプシンＥ活性調節ペプチドの高機能化

2009年

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

マイクロバイオーム解析

ＪＳＴ先端計測分析技術・機器開発事業 2009年 - 2012年
新型マイクロアレイ

ＪＳＴ先端計測分析技術・機器開発事業 2009年 - 2012年
Microbiome analysis

JST Development of Systems and Technology for Advanced Measurement and Analysis 2009年 - 2012年
Novel-concept microarray

JST Development of Systems and Technology for Advanced Measurement and Analysis 2009年 - 2012年
ゲノム多様性

2008年 - 2012年
Genome diversity

2008年 - 2012年
ペプチド創薬

官民連携共同研究 2007年 - 2010年
Peptide drug design

Joint Public-Private Research 2007年 - 2010年
タンパク質創製

官民連携共同研究 2003年 - 2010年
Novel protein generation

Joint Public-Private Research 2003年 - 2010年
ゲノム変異

2007年
Genome mutation

2007年
DNAタイリング

2000年
DNA tiling

2000年
分子間相互作用

1993年
Molecular interaction

1993年
ゲノム進化

1990年
Genome evolution

1990年
ゲノム構造

1985年
Genome structure

1985年

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西垣功一

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研究分野

経歴

学歴

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

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