西垣功一 (Koichi Nishigaki) - マイポータル - researchmap

基本情報

学位: 理学修士(東京大学)
理学博士(東京大学)

J-GLOBAL ID: 200901065823117780
researchmap会員ID: 1000009507

外部リンク: http://gp.fms.saitama-u.ac.jp

研究キーワード

19

研究分野

9

経歴

5

1986年4月 - 2004年3月

, 埼玉大学工学部助教授生物物理学
1986年4月 - 2004年3月

,Associated Prof., Saitama University Biophysics
1976年7月 - 1986年3月

, 埼玉大学工学部助手環境化学基礎実験
1976年7月 - 1986年3月

,Assistant Prof., Saitama University Basic Experiments on Environmental Chemistry
埼玉大学, 教授

学歴

6

- 1976年

東京大学, 理学系研究科, 生物化学
- 1976年

Univ. of Tokyo, Graduate School, Division of Science
- 1974年

東京大学, 理学系研究科, 生物化学
- 1974年

Univ. of Tokyo, Graduate School, Division of Science
- 1972年

東京大学, 理学部, 生物化学
- 1972年

Univ. of Tokyo, Faculty of Science

MISC

70

Toward the fast blind docking of a peptide to a target protein by using a four-body statistical pseudo-potential

Takuyo Aita, Koichi Nishigaki, Yuzuru Husimi

COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY 34(1) 53-62 2010年2月
Development of Systemic in vitro Evolution and Its Application to Generation of Peptide-Aptamer-Based Inhibitors of Cathepsin E

Koichiro Kitamura, Chuya Yoshida, Yasunori Kinoshita, Tomoko Kadowaki, Yoko Takahashi, Takahiro Tayama, Tomoyo Kawakubo, Mohammed Naimuddin, Md. Salimullah, Naoto Nemoto …

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 387(5) 1186-1198 2009年4月
Host-parasite relations of bacteria and phages can be unveiled by Oligostickiness, a measure of relaxed sequence similarity

Shamim Ahmed, Ayumu Saito, Miho Suzuki, Naoto Nemoto, Koichi Nishigaki

BIOINFORMATICS 25(5) 563-570 2009年3月
Rapid In Vitro Synthesis of Pico-mole Quantities of Peptides

Koichiro Kitamura, Chuya Yoshida, Md Salimullah, Yasunori Kinoshita, Miho Suzuki, Naoto Nemoto, Koichi Nishigaki

CHEMISTRY LETTERS 37(12) 1250-1251 2008年12月
Molecular design guided by a local map of sequence space: DNA aptamers that inhibit cathepsin E

Chuya Yoshida, Akira Kuniwake, Mohammed Naimuddin, Koichi Nishigaki

OLIGONUCLEOTIDES 18(1) 1-8 2008年3月
保健・環境にインパクトを与えるメタゲノム自動解析装置（GPロボット）の開発

西垣功一

総合研究機構研究プロジェクト研究成果報告書 6 (平成19年度) 2008年
高速分子進化のための基盤技術の開発 A1 進化リアクタープロセスの改良

西垣功一, 北村幸一郎, 武居修, 高橋陽子, 井上里美

埼玉県地域結集型共同研究事業事業終了報告書 43-44 2008年
高速分子進化のための基盤技術の開発 A2 配列空間適応歩行技術の展開

西垣功一, 相田拓洋, 二木類, 仲島日出男, 富永達矢, 後藤仁志

埼玉県地域結集型共同研究事業事業終了報告書 45-46 2008年
高速分子進化のための基盤技術の開発 A4 マイクロバイオ分析デバイスの開発

西垣功一, 鵜飼智文, SakthiKUMAR, 吉田泰彦, 前川透, 柏木邦宏, 東海林崇, 一木隆範

埼玉県地域結集型共同研究事業事業終了報告書 49-50 2008年
高速分子進化のための基盤技術の開発 A3 マイクロリアクターアレイ進化リアクターの開発

西垣功一, ManishBiyani, 辻幸香, 鈴木雅恵, 三井隆広

埼玉県地域結集型共同研究事業事業終了報告書 47-48 2008年
高速分子進化のための基盤技術の開発１ｆゲノムデータからの知識抽出手法の開発と評価

西垣功一, 佐藤直樹

埼玉県地域結集型共同研究事業事業終了報告書 51 2008年
保健・環境にインパクトを与えるメタゲノム自動解析装置（GPロボット）の開発

西垣功一

総合研究機構研究プロジェクト研究成果報告書 6 (平成19年度) 2008年
高速分子進化のための基盤技術の開発 A1 進化リアクタープロセスの改良

西垣功一, 北村幸一郎, 武居修, 高橋陽子, 井上里美

埼玉県地域結集型共同研究事業事業終了報告書 43-44 2008年
高速分子進化のための基盤技術の開発 A2 配列空間適応歩行技術の展開

西垣功一, 相田拓洋, 二木類, 仲島日出男, 富永達矢, 後藤仁志

埼玉県地域結集型共同研究事業事業終了報告書 45-46 2008年
高速分子進化のための基盤技術の開発 A4 マイクロバイオ分析デバイスの開発

西垣功一, 鵜飼智文, SakthiKUMAR, 吉田泰彦, 前川透, 柏木邦宏, 東海林崇, 一木隆範

埼玉県地域結集型共同研究事業事業終了報告書 49-50 2008年
高速分子進化のための基盤技術の開発 A3 マイクロリアクターアレイ進化リアクターの開発

西垣功一, ManishBiyani, 辻幸香, 鈴木雅恵, 三井隆広

埼玉県地域結集型共同研究事業事業終了報告書 47-48 2008年
高速分子進化のための基盤技術の開発１ｆゲノムデータからの知識抽出手法の開発と評価

西垣功一, 佐藤直樹

埼玉県地域結集型共同研究事業事業終了報告書 51 2008年
Novel mutation assay with high sensitivity based on direct measurement of genomic DNA alterations: Comparable results to the ames test

Masae Futakami, Md Salimullah, Takashi Miura, Sumio Tokita, Koichi Nishigaki

JOURNAL OF BIOCHEMISTRY 141(5) 675-686 2007年5月
試験管内進化（in vitro evolution）によるプロテアーゼ阻害剤の開発

西垣功一, 北村幸一郎, 吉田昼也

細胞工学 26(11) 1284-1289 2007年
保健・環境にインパクトを与えるメタゲノム自動解析装置（GPロボット）の開発

西垣功一

総合研究機構研究プロジェクト研究成果報告書（平成18年度埼玉大学総合研究機構) 5 2007年

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書籍等出版物

12

猪飼篤他（編）、西垣功一(分担執筆）タンパク質の事典

朝倉書房 2008年
西垣功一情報創生過程としての進化・進化分子工学機能材料工学総論テキスト

2008年
猪飼篤他（編）、西垣功一(分担執筆）タンパク質の事典

朝倉書房 2008年
西垣功一情報創生過程としての進化・進化分子工学機能材料工学総論テキスト

2008年
大島泰郎他（編）、西垣功一（分担執筆）生化学辞典第4版

東京化学同人 2007年
大島泰郎他（編）、西垣功一（分担執筆）生化学辞典第4版

東京化学同人 2007年
伏見譲,西垣功一(共編著）進化・情報・かたち

培風館 2006年
伏見譲,西垣功一(共編著）進化・情報・かたち

培風館 2006年
養老猛司,和田昭允（著）/美宅成樹,西垣功一,伏見譲（編）科学は豹変する

培風館 2005年
養老猛司,和田昭允（著）/美宅成樹,西垣功一,伏見譲（編）科学は豹変する

培風館 2005年
西垣功一形の科学百科事典

朝倉書店 2004年
西垣功一形の科学百科事典

朝倉書店 2004年

講演・口頭発表等

132

タンパク質に超高度親和性を有するペプチドの解離定数測定 Measurement of the dissociation constant of peptides with a ultra-high affinity to a protein

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
異なる淘汰条件で再帰的に選択（スクリーニング）されたAβ結合ペプチドに関する親和性の研究 Study on the affinity of Aβ-binding peptide selected from recursively two different selection conditions ○上野-辻幸香1, 北村幸一郎2, 井口翔1, モハメドサリムラ3, 西垣功一1 (1埼大院・理工研, 2ジェナシス（株）, 3理研・オミックス基盤研究領域）

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
カテプシンＥ特異的結合ペプチドの診断薬応用 Application of cathepsin-E specific binding peptides for a diagnostic reagent kit.

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
高速分子進化「発達ライブラリー法」による中性条件下カテプシンE活性化ペプチドの淘汰 Selection of cathepsin E-activating peptides at a neutral pH using a progressive library method

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
ペプチドペア法によるカテプシンE活性化機能の効率的向上 Paired peptide method effective for advancing cathepsin E-activating activities of peptides.

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
cDNA/mRNA ディスプレイ（in vitro virus法）に最適なmRNA構造 Optimazation of mRNA for cDNA/mRNA display (in vitro virus)

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
新規ピューロマイシン・リンカーを用いたcDNAディスプレイ法の簡便で効率的な調整法 Simple and efficient preparation of cDNA display with a novel puromycin-linker DNA

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
GP法による昆虫ゲノム分類学は、古典的な表現型による分類とよく一致する Genome-based taxonomy of insects corresponds better with that of classical phenotype-based one: Genome profiling (GP) proach

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
形質による古典分類学を批准したゲノムによる分類学(Ⅱ) Classical Phenotype-Based Taxonomy Was Ratified by Genome-Based One(Ⅱ)

形の科学会誌 2009年
ペプチドペア法によるカテプシンＥ活性調節ペプチドの高機能化

2009年
タンパク質に超高度親和性を有するペプチドの解離定数測定 Measurement of the dissociation constant of peptides with a ultra-high affinity to a protein

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
異なる淘汰条件で再帰的に選択（スクリーニング）されたAβ結合ペプチドに関する親和性の研究 Study on the affinity of Aβ-binding peptide selected from recursively two different selection conditions ○上野-辻幸香1, 北村幸一郎2, 井口翔1, モハメドサリムラ3, 西垣功一1 (1埼大院・理工研, 2ジェナシス（株）, 3理研・オミックス基盤研究領域）

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
カテプシンＥ特異的結合ペプチドの診断薬応用 Application of cathepsin-E specific binding peptides for a diagnostic reagent kit.

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
高速分子進化「発達ライブラリー法」による中性条件下カテプシンE活性化ペプチドの淘汰 Selection of cathepsin E-activating peptides at a neutral pH using a progressive library method

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
ペプチドペア法によるカテプシンE活性化機能の効率的向上 Paired peptide method effective for advancing cathepsin E-activating activities of peptides.

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
cDNA/mRNA ディスプレイ（in vitro virus法）に最適なmRNA構造 Optimazation of mRNA for cDNA/mRNA display (in vitro virus)

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
新規ピューロマイシン・リンカーを用いたcDNAディスプレイ法の簡便で効率的な調整法 Simple and efficient preparation of cDNA display with a novel puromycin-linker DNA

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
GP法による昆虫ゲノム分類学は、古典的な表現型による分類とよく一致する Genome-based taxonomy of insects corresponds better with that of classical phenotype-based one: Genome profiling (GP) proach

第32回MBSJ日本分子生物学会年会プログラム 2009年
形質による古典分類学を批准したゲノムによる分類学(Ⅱ) Classical Phenotype-Based Taxonomy Was Ratified by Genome-Based One(Ⅱ)

形の科学会誌 2009年
ペプチドペア法によるカテプシンＥ活性調節ペプチドの高機能化

2009年

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所属学協会

18

共同研究・競争的資金等の研究課題

22

マイクロバイオーム解析

ＪＳＴ先端計測分析技術・機器開発事業 2009年 - 2012年
新型マイクロアレイ

ＪＳＴ先端計測分析技術・機器開発事業 2009年 - 2012年
Microbiome analysis

JST Development of Systems and Technology for Advanced Measurement and Analysis 2009年 - 2012年
Novel-concept microarray

JST Development of Systems and Technology for Advanced Measurement and Analysis 2009年 - 2012年
ゲノム多様性

2008年 - 2012年
Genome diversity

2008年 - 2012年
ペプチド創薬

官民連携共同研究 2007年 - 2010年
Peptide drug design

Joint Public-Private Research 2007年 - 2010年
タンパク質創製

官民連携共同研究 2003年 - 2010年
Novel protein generation

Joint Public-Private Research 2003年 - 2010年
ゲノム変異

2007年
Genome mutation

2007年
DNAタイリング

2000年
DNA tiling

2000年
分子間相互作用

1993年
Molecular interaction

1993年
ゲノム進化

1990年
Genome evolution

1990年
ゲノム構造

1985年
Genome structure

1985年

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産業財産権

10