OOKA Tadasuke

J-GLOBAL         Last updated: Nov 14, 2018 at 17:00
 
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Name
OOKA Tadasuke
Affiliation
Kagoshima University
Section
Graduate School of Medical and Dental Sciences Health Research Course

Research Interests

 
 

Research Areas

 
 

Academic & Professional Experience

 
Apr 2015
 - 
Today
lecturer, Department of Microbiology, Kagoshima University
 
 
   
 
Assistant Professor, University of Miyazaki Faculty of Medicine, School of Medicine, Infectious disease study course microbiological field,School of Madicine,Faculty of Madicine,University of Miyazaki
 
May 2003
 - 
Mar 2007
 Research Associate,Infectious disease study course microbiological field,School of Madicine,Faculty of Madicine,University of Miyazaki
 
Apr 2007
 - 
Today
 Assistant Professor,Infectious disease study course microbiological field,School of Madicine,Faculty of Madicine,University of Miyazaki
 

Education

 
 
 - 
1998
Ehime University
 
 
 - 
2002
Graduate School, Division of Medicine, Miyazaki Medical College
 
 
 - 
1996
Faculty of Science, Ehime University
 

Published Papers

 
Nakanaga K, Ogura Y, Toyoda A, Yoshida M, Fukano H, Fujiwara N, Miyamoto Y, Nakata N, Kazumi Y, Maeda S, Ooka T, Goto M, Tanigawa K, Mitarai S, Suzuki K, Ishii N, Ato M, Hayashi T, Hoshino Y
Scientific reports   8(1) 8218   May 2018   [Refereed]
Romão FT, Hernandes RT, Ooka T, Hayashi T, Sperandio V, Gomes TAT
Genome announcements   6(9)    Mar 2018   [Refereed]
Ogura Y, Gotoh Y, Itoh T, Sato MP, Seto K, Yoshino S, Isobe J, Etoh Y, Kurogi M, Kimata K, Maeda E, Piérard D, Kusumoto M, Akiba M, Tominaga K, Kirino Y, Kato Y, Shirahige K, Ooka T, Ishijima N, Lee KI, Iyoda S, Mainil JG, Hayashi T
Microbial genomics   3(11)    Nov 2017   [Refereed]
Ogawa Y, Shiraiwa K, Ogura Y, Ooka T, Nishikawa S, Eguchi M, Hayashi T, Shimoji Y
Applied and environmental microbiology   83(11)    Jun 2017   [Refereed]
Akter A, Ooka T, Gotoh Y, Yamamoto S, Fujita H, Terasoma F, Kida K, Taira M, Nakadouzono F, Gokuden M, Hirano M, Miyashiro M, Inari K, Shimazu Y, Tabara K, Toyoda A, Yoshimura D, Itoh T, Kitano T, Sato MP, Katsura K, Mondal SI, Ogura Y, Ando S, Hayashi T
Genome biology and evolution   9(1) 124-133   Jan 2017   [Refereed]

Misc

 
大岡 唯祐
日本食品微生物学会雑誌   34(3) 151-157   Sep 2017
Escherichia albertiiは大腸菌の近縁菌種として、2003年に新たに命名された新興下痢症原因菌の一つである。本菌はヒト下痢症患者などから分離されていた株の中に一定の割合で誤同定されていること、また、集団感染の原因菌として同定されたことにより、ヒト下痢症原因菌として認知されるようになった。本菌の細菌学的特徴やゲノム特性、疫学、臨床症状、最近の知見などを紹介した。
【次世代シーケンサーが可能にした感染学の新しい展開】 NGSを使ったゲノム解析の基礎研究への応用展開 個別菌ゲノム解析 PacBioの利用,annotationやその他の問題点
大岡 唯祐
化学療法の領域   33(7) 1374-1380   Jun 2017
次世代シーケンサー(NGS)の技術革新により,細菌の全ゲノム解析が迅速かつ低コストで行えるようになった。それにともない,得られた膨大な配列データの処理や遺伝子アノテーションを自動化するソフトウェアの開発も進み,さほど経験のない人でも比較的容易にゲノム解析が可能となっている。しかし,その反面,精度の低い配列データや十分に精査されていないアノテーション情報がデータベース上にあふれ,正確な解析の妨げになるという問題も生じている。今後,さらにNGSの配列解読速度が上がると予想されるが,公開されたデ...
【大腸菌O111による脳症】 腸管出血性大腸菌O111の進化と病原性
小椋 義俊, 大岡 唯祐, 林 哲也
神経内科   76(2) 155-163   Feb 2012
【遺伝子診療学(第2版) 遺伝子診断の進歩とゲノム治療の展望】 遺伝子診断(Genetic Diagnosis) 臨床遺伝子診断学研究の進歩と展望 細菌ゲノム解析の進歩
大岡 唯祐, 林 哲也
日本臨床   68(増刊8 遺伝子診療学) 144-149   Aug 2010
T. Ooka, Y. Ogura, Md. Asadulghani, M. Ohnishi, K. Nakayama, J. Terajima, H. Watanabe, T. Hayashi
Genome Res.   19 1809-1816   Jun 2009

Books etc

 
Genomic view on the evolution of enterohemorrhagic Escherichia coli (In Evolutionary Biology of Bacterial and Fungal Pathogens)
ASM Press. Washington, D.C.   Dec 2007   

Conference Activities & Talks

 
Acrosomal matrix protein MC41 is involved in sperm binding to zona pellucida during fertilization.
2006