特定のDNA断片をトランスジェニックマウス実験により機能を調べる研究と、ゲノム比較解析研究を行なった。ヒト系統特異的にある非コードDNA配列に正の自然淘汰が生じて新しい機能を獲得したと主張した米国の研究者の報告に対して、Sumiyama & Saitou (2011）はそのDNA配列がなくなってもヒトと同じ表現型が生じることを示して、変化が機能を失うタイプのもので中立進化だった可能性を示した。またBabarinde & Saitou (2013)はゲノム比較から、霊長類特異的に進化的に保存されている非コード領域が、他の哺乳類の系統（齧歯類、食肉類、鯨偶蹄類）よりもずっと多いことを示した。