白木賢太郎 (Kentaro SHIRAKI) - マイポータル

基本情報

所属: 筑波大学数理物質系教授

連絡先: shiraki.kentaro.gbu.tsukuba.ac.jp
J-GLOBAL ID: 200901027911434508
researchmap会員ID: 5000082680

外部リンク: https://sites.google.com/view/shiraki

研究キーワード

経歴

2004年9月 - 2007年3月

筑波大学, 物理工学系, 助教授
2001年8月 - 2004年8月

北陸先端科学技術大学院大学, 助手
1999年4月 - 2001年7月

科学技術振興事業団, 博士研究員
1996年4月 - 1999年3月

日本学術振興会, 特別研究員

学歴

- 1999年3月

大阪大学, 大学院理学研究科, 生物科学
- 1994年3月

大阪大学, 理学部, 生物学科

論文

237

A Nonequilibrium Simulation Framework for Reproducing Protein Aggregation in All-Atom Molecular Dynamics Simulations

IIJIMA, Moe, YOSHIDA, Toya, SHIRAKI, Kentaro, URA, Tomoto

The Journal of Physical Chemistry B 130(12) 3314-3321 2026年3月査読有り
Effects of Arginine on Hierarchical Protein Aggregation

Nishinami, Suguru, Kihara, Yoshiki, Akuta, Teruo, Shiraki, Kentaro, Arakawa, Tsutomu

PROTEIN JOURNAL 2026年2月査読有り
Arginine can either suppress or promote the aggregation of egg white proteins depending on solution conditions

NAKAMURA, Takumi, NOMOTO, Akira, TOMITA, Shunsuke, URA, Tomoto, SHIRAKI, Kentaro

International Journal of Biological Macromolecules 349 2026年2月査読有り責任著者
Additive-Based Protein Stabilization for Stress-Prone and Unstable Proteins

URA, Tomoto, NAKAMURA, Takumi, IIJIMA, Moe, YOSHIDA, Toya, SHIRAKI, Kentaro

Protein Expression and Purification 240 2026年1月査読有り
Mechanistic insights into the salting-in effect of divalent cations on proteins: Interactions with carboxyl groups and peptide bonds

YOSHIDA, Toya, URA, Tomoto, ARAKAWA, Tsutomu, SHIRAKI, Kentaro, HIRANO, Atsushi

Journal of Molecular Liquids 2026年1月査読有り
Mechanism of 1,6-hexanediol-induced protein droplet dissolution: Thermodynamic insights from amino acid solubility

ODA, Haruna, URA, Tomoto, ONO, Hideaki, TANAKA, Shinji, KAMEDA, Tomoshi, WADA, Momoyo, SHIRAKI, Kentaro, HIRANO, Atsushi

International Journal of Biological Macromolecules 339(1) 2025年12月査読有り
Differences and Similarities in Protein and Nucleic Acid Structures and Their Biological Interactions

ARAKAWA, Tsutomu, OYAMA, Taiji, URA, Tomoto, NISHINAMI, Suguru, SHIRAKI, Kentaro, AKUTA, Teruo

CURRENT ISSUES IN MOLECULAR BIOLOGY 47(12) 2025年12月査読有り
Non-ionic Detergent-Assisted Refolding of Protein from Protein-SDS Complex

AKUTA, Teruo, URA, Tomoto, OIKAWA, Takeshi, SHIBATA, Takashi, SHIRAKI, Kentaro, ARAKAWA, Tsutomu

The Protein Journal 2025年11月査読有り
Purification of Immunoglobulin A Using Mesoporous Zirconia Particles Coated with Phosphate

Kanoh, Shogo, Tabata, Koshiro, Saito, Shinji, Onuma, Erika, Usuda, Hatsuho, Shiraki, Kentaro, Kato, Katsuya, Hirano, Atsushi

ACS APPLIED MATERIALS & INTERFACES 17(36) 50891-50900 2025年9月査読有り
Amino acid interactions dependent on the polymerization of charged residues and surface properties of monolayers

Nomoto, Akira, Shiraki, Kentaro, Minamiki, Tsukuru

RSC APPLIED INTERFACES 2(4) 976-983 2025年7月査読有り
Elucidation of the Mutual Solubility of Amino Acids for the Rational Control of Phase-Separating Sequences

Nomoto, Akira, Sugai, Hiroka, Shiraki, Kentaro, Tomita, Shunsuke

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 129(28) 7099-7107 2025年7月査読有り
Polyphosphate as a novel aggregation suppressor of gamma globulin

Kasahara, Junpei, Furuki, Tomohiro, Aikawa, Shohei, Ueda, Hiroshi, Shiraki, Kentaro

JOURNAL OF PHARMACEUTICAL SCIENCES 114(7) 2025年7月査読有り
Polymer-engineered condensates for enzyme activation

URA, Tomoto, YOSHIDA, Toya, MIKAWA, Tsutomu, SHIRAKI, Kentaro

POLYMER JOURNAL 2025年4月査読有り
Exploring liquid-liquid phase separation in vitro and in vivo using multimodal nonlinear optical imaging

Murakami, Yusuke, Obuchi, Mia, Kamizawa, Hiroshi, Miyazaki, Shinichi, Kishimura, Akihiro, Oketani, Ryosuke, Hiramatsu, Kotaro, Leproux, Philippe, Hayashi, Yu, Shiraki, Kentaro …

ANALYTICAL SCIENCES 2025年3月査読有り
Thermal aggregation of immunoglobulin G depending on the charge state of protein-polyelectrolyte complexes

Nomoto, Akira, Shiraki, Kentaro

INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES 296 2025年3月査読有り
Analysis of interactions between amino acids and monolayers of charged side chains

Nomoto, Akira, Shiraki, Kentaro, Minamiki, Tsukuru

RSC APPLIED INTERFACES 2(1) 243-250 2025年1月査読有り
Thermal aggregation of antibodies depending on the charge state of protein-polyelectrolyte complexes

Nomoto, Akira, Shiraki, Kentaro

PROTEIN SCIENCE 33(1) 208-208 2024年12月査読有り
Monovalent Ion Effect on Liquid-Liquid Phase Separation of Aqueous Polyphosphate-Salt Mixtures

Furuki, Tomohiro, Togo, Azusa, Usuda, Hatsuho, Nobeyama, Tomohiro, Hirano, Atsushi, Shiraki, Kentaro

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 128(46) 11435-11440 2024年11月査読有り
The contrasting roles of co-solvents in protein formulations and food products

Arakawa, Tsutomu, Tomioka, Yui, Akuta, Teruo, Shiraki, Kentaro

BIOPHYSICAL CHEMISTRY 312 2024年9月査読有り
Reentrant condensation of a multicomponent cola/milk system induced by polyphosphate

Furuki, Tomohiro, Nobeyama, Tomohiro, Suetaka, Shunji, Matsui, Ryokei, Fukuoka, Tatsuhiko, Arai, Munehito, Shiraki, Kentaro

FOOD CHEMISTRY-X 21 2024年3月査読有り

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MISC

Detection of boson peak and fractal dynamics of disordered systems using terahertz spectroscopy

Mori, Tatsuya, Jiang, Yue, Fujii, Yasuhiro, Kitani, Suguru, Mizuno, Hideyuki, Koreeda, Akitoshi, Motoji, Leona, Tokoro, Hiroko, Shiraki, Kentaro, Yamamoto, Yohei …

PHYSICAL REVIEW E 102(2) 2020年8月査読有り

書籍等出版物

相分離生物学の全貌

白木, 賢太郎, 七野, 悠一

東京化学同人 2020年11月 (ISBN: 9784807913466)
相分離生物学

白木,賢太郎

東京化学同人 2019年8月 (ISBN: 9784807909650)
2015 40TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON INFRARED, MILLIMETER AND TERAHERTZ WAVES (IRMMW-THZ)

Hattori, Toshiaki, Aoki, Katsuyoshi, Shiraki, Kentaro (担当:分担執筆, 範囲:Terahertz Spectroscopic Study of Ion Effects on Protein Hydration)

IEEE 2015年 (ISBN: 9781479982721)
生物科学入門

白木賢太郎

東京化学同人 2009年12月
SECOND INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ATOMIC TECHNOLOGY

Tomita, Shunsuke, Hamada, Hiroyuki, Nagasaki, Yukio, Shiraki, Kentaro (担当:分担執筆, 範囲:Synergistic effect of polyethylene glycol with arginine on the prevention of heat-induced aggregation of lysozyme - art. no. 012022)

IOP PUBLISHING LTD 2008年1月

講演・口頭発表等

In vitro construction of enzyme assemblies that enhance enzyme activity

Ura, Tomoto, Sakakibara, Nanako, Yagi, Hiromasa, Tochio, Naoya, Kigawa, Takanori, Shiraki, Kentaro, Mikawa, Tsutomu

37th Annual Meeting of The-Protein-Society (TPS)
液液相分離による酵素集合体のin vitro構築

URA, Tomoto, TOMITA, Shunsuke, SAKAKIBARA, Nanako, YAGI, Hiromasa, TOCHIO, Naoya, KIGAWA, Takanori, MIKAWA, Tsutomu, SHIRAKI, Kentaro

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集
カチオン性高分子電解質の添加によるL-乳酸脱水素酵素の凝集抑制と活性維持

吉田, 桃也, 榊原, 菜々子, 浦, 朋人, 白木, 賢太郎

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集
高分子電解質による酸化還元酵素の活性化

榊原, 菜々子, 浦, 朋人, 白木, 賢太郎, 美川, 務

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)
酵素連続反応と連動した液滴の動的挙動

浦, 朋人, 冨田, 峻介, 白木, 賢太郎

第44回日本分子生物学会年会ワークショップ液-液相分離の酵素連続反応に対する効果 2021年12月1日
酵素反応と連動した液滴の動的挙動

浦, 朋人, 冨田, 峻介, 白木, 賢太郎

第94回日本生化学大会シンポジウム相分離メガネを通して見た酵素の機能 2021年11月5日
液滴によるL-乳酸酸化酵素の活性化

浦, 朋人, 香川, 亜子, 八木, 宏昌, 栃尾, 尚哉, 木川, 隆則, 美川, 務, 白木, 賢太郎

第21回日本蛋白質科学会年会ワークショップタンパク質の液液相分離―計測、制御、応用 2021年6月17日
酵素連続反応と液–液相分離

浦, 朋人, 白木, 賢太郎

第6回蛋白質工学研究会ワークショップ蛋白質医薬における相分離現象の理解と産業利用可能性 2020年9月4日
Fractal dimension, persistent homology dimension, and fractal dynamics in the terahertz region: the case of protein lysozyme

Mori, Tatsuya, Fujii, Yasuhiro, Kitani, Suguru, Yamamoto, Yohei, Shiraki, Kentaro, Koreeda, Akitoshi, Kojima, Seiji

Materials Research Meeting 2019 (MRM 2019) 2019年12月10日
Fractal dimension, persistent homology dimension, and fractal dynamics in the terahertz region: the case of protein lysozyme

Mori, Tatsuya, Fujii, Yasuhiro, Kitani, Suguru, Yamamoto, Yohei, Shiraki, Kentaro, Koreeda, Akitoshi, Kojima, Seiji

Materials Research Meeting 2019 (MRM 2019) 2019年12月10日
Terahertz Spectroscopy on Myoglobin: Boson Peak and Fracton

Mori, Tatsuya, Motoji, Leona, Fujii, Yasuhiro, Kitani, Suguru, Koreeda, Akitoshi, Shiraki, Kentaro, Yamamoto, Yohei, Kojima, Seiji

IRMMW-THz 2019 (44th International Conference on Infrared, Millimeter and Terahertz Waves) 2019年9月1日
Terahertz Spectroscopy on Myoglobin: Boson Peak and Fracton

Mori, Tatsuya, Motoji, Leona, Fujii, Yasuhiro, Kitani, Suguru, Koreeda, Akitoshi, Shiraki, Kentaro, Yamamoto, Yohei, Kojima, Seiji

IRMMW-THz 2019 (44th International Conference on Infrared, Millimeter and Terahertz Waves) 2019年9月1日
Terahertz Spectroscopic Study on Protein Myoglobin: Polymer-Like Behavior of Vibrational Density of States

Motoji, Leona, Mori, Tatsuya, Fujii, Yasuhiro, Koreeda, Akitoshi, Jiang, Yue, Shiraki, Kentaro, Yamamoto, Yohei, Kojima, Seiji

APS March Meeting 2019 2019年3月4日
液滴内で活性化される酵素の反応機構

浦, 朋人, 白木, 賢太郎

日本細胞生物学会大会(Web)
Terahertz time-domain spectroscopy of lyophilized protein lysozyme

Mori, Tatsuya, Fujii, Yasuhiro, Jiang, Yue, Motoji, Leona, Kitani, Suguru, Koreeda, Akitoshi, Shiraki, Kentaro, Yamamoto, Yohei, Kojima, Seiji

TGSW2018 (Tsukuba Global Science Week 2018) 2018年9月20日
Hydration of aqueous polymers investigated by terahertz spectroscopy and principal component analysis

Aoki, Katsuyoshi, Hata, Ryusuke, Kaneyasu, Junya F, Schwaab, Gerhard, Shiraki, Kentaro, Hattori, Toshiaki

2018 43rd International Conference on Infrared, Millimeter and Terahertz Waves 2018年9月9日
Detection of Boson Peak and Fractal Dynamics of Protein by Terahertz Time-Domain Spectroscopy

Mori, Tatsuya, Jiang, Yue, Fujii, Yasuhiro, Kitani, Suguru, Koreeda, Akitoshi, Motoji, Leona, Terao, Wakana, Shiraki, Kentaro, Yamamoto, Yohei, Kojima, Seiji

43rd International Conference on Infrared, Millimeter, and Terahertz Waves (IRMMW-THz) 2018年9月9日
Terahertz Time-Domain Spectroscopy of Protein Myoglobin: Detection of Boson Peak and Fracton

Motoji, Leona, Mori, Tatsuya, Fujii, Yasuhiro, Koreeda, Akitoshi, Shiraki, Kentaro, Yamamoto, Yohei, Kojima, Seiji

43rd International Conference on Infrared, Millimeter, and Terahertz Waves (IRMMW-THz) 2018年9月9日
液-液相分離と酵素連続反応

浦, 朋人, 白木, 賢太郎

第1回LLPS研究会 2018年8月31日
Detection of fractal dynamics of protein by terahertz spectroscopy

Mori, Tatsuya, Fujii, Yasuhiro, Jiang, Yue, Motoji, Leona, Terao, Wakana, Kitani, Suguru, Koreeda, Akitoshi, Shiraki, Kentaro, Yamamoto, Yohei, Kojima, Seiji

EUCMOS 2018 (XXXIV EUROPEAN CONGRESS ON MOLECULAR SPECTROSCOPY) 2018年8月19日

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所属学協会

- 現在

日本蛋白質科学会
- 現在

日本化学会

産業財産権

特願2010-188625 系媒体中へのカーボンナノチューブの分散方法、および分散させたカーボンナノチューブの精製方法

平野, 篤, 前田, 優, 赤阪, 健, 白木, 賢太郎
特願2009-245773 水系媒体中へのカーボンナノチューブの分散方法

平野, 篤, 前田, 優, 赤阪, 健, 白木, 賢太郎
特願2009-245387 βアミロイド線維生成阻害剤

白木, 賢太郎, 宇田謙
特許第5224515号水系溶媒中へのカーボンナノチューブの分散方法

Shiraki,Kentaro
特許5119545号蛋白質を含む液状組成物中における蛋白質の安定化方法

Shiraki,Kentaro