本野千恵 (Chie Motono) - マイポータル

基本情報

所属: 独立行政法人産業技術総合研究所産総研・早大　生体システムビッグデータ解析オープンイノベーションラボラトリ

J-GLOBAL ID: 200901023364660748
researchmap会員ID: 5000086286

外部リンク: http://www.aist.go.jp/RESEARCHERDB/cgi-bin/worker_detail.cgi?call=namae&rw_id=C52205062

研究分野

ライフサイエンス / 生物物理学 /

論文

The origin of esterase activity of Parkinson's disease causative factor DJ-1 implied by evolutionary trace analysis of its prokaryotic homolog HchA

Aiko Watanabe, Fumika Koyano, Kenichiro Imai, Yohei Hizukuri, Shizuka Ogiwara, Tomoya Ito, Jun Miyamoto, Chihiro Shibuya, Mayumi Kimura, Kazuya Toriumi …

Journal of Biological Chemistry 107476-107476 2024年6月査読有り
Atg15 is a vacuolar phospholipase that disintegrates organelle membranes.

Yasunori Watanabe, Yurina Iwasaki, Kyoka Sasaki, Chie Motono, Kenichiro Imai, Kuninori Suzuki

Cell reports 42(12) 113567-113567 2023年12月26日
A multipoint guidance mechanism for β-barrel folding on the SAM complex

Hironori Takeda, Jon V. Busto, Caroline Lindau, Akihisa Tsutsumi, Kentaro Tomii, Kenichiro Imai, Yu Yamamori, Takatsugu Hirokawa, Chie Motono, Iniyan Ganesan …

Nature Structural & Molecular Biology 30(2) 176-187 2023年1月5日査読有り
Imputation-free reconstructions of three-dimensional chromosome architectures in human diploid single-cells using allele-specified contacts

Yoshito Hirata, Arisa H. Oda, Chie Motono, Masanori Shiro, Kunihiro Ohta

Scientific Reports 12(1) 2022年12月査読有り
Phosprof: pathway analysis database of drug response based on phosphorylation activity measurements.

Harumi Kagiwada, Chie Motono, Katsuhisa Horimoto, Kazuhiko Fukui

Database : the journal of biological databases and curation 2022 2022年8月22日
Unfolding is the driving force for mitochondrial import and degradation of the Parkinson's disease-related protein DJ-1

Bruno Barros Queliconi, Waka Kojima, Mayumi Kimura, Kenichiro Imai, Chisato Udagawa, Chie Motono, Takatsugu Hirokawa, Shinya Tashiro, Jose M. M. Caaveiro, Kouhei Tsumoto …

Journal of Cell Science 134(22) 2021年11月15日
MDContactCom: a tool to identify differences of protein molecular dynamics from two MD simulation trajectories in terms of interresidue contacts.

Chie Motono, Shunsuke Yanagida, Miwa Sato, Takatsugu Hirokawa

Bioinformatics (Oxford, England) 2021年7月21日
Porin Associates with Tom22 to Regulate the Mitochondrial Protein Gate Assembly.

Haruka Sakaue, Takuya Shiota, Naoya Ishizaka, Shin Kawano, Yasushi Tamura, Kher Shing Tan, Kenichiro Imai, Chie Motono, Takatsugu Hirokawa, Kentaro Taki …

Molecular cell 73(5) 1044-1055 2019年3月7日査読有り
2P268 Protein binding pocket and ligand shape comparison(22A. Bioinformatics: Structural genomics,Poster)

Motono Chie, Hirokawa Takatsugu

生物物理 53(1) S203 2013年
SAHG, a comprehensive database of predicted structures of all human proteins.

Motono C, Nakata J, Koike R, Shimizu K, Shirota M, Amemiya T, Tomii K, Nagano N, Sakaya N, Misoo K …

Nucleic acids research 39(Database issue) D487-93 2011年1月査読有り
1P-236 MDシミュレーションとタンパク質のコンキャビティ形状比較を用いたバーチャルスクリーニング(生命情報科学-構造ゲノミクス,第47回日本生物物理学会年会)

Motono Chie, Hirokawa Takatsugu

生物物理 49 S99 2009年
2P-297 タンパク質立体構造予測モデルの評価関数の検討(生命情報科学・構造ゲノミクス,第46回日本生物物理学会年会)

Motono Chie, Hirokawa Takatsugu

生物物理 48 S121 2008年
The H-Invitational Database (H-InvDB), a comprehensive annotation resource for human genes and transcripts.

Genome Information Integration Project And H-Invitational, Yamasaki C, Murakami K, Fujii Y, Sato Y, Harada E, Takeda J, Taniya T, Sakate R, Kikugawa S …

Nucleic acids research 36(Database issue) D793-9 2008年1月査読有り
Molecular dynamics simulation of prion protein by large scale cluster computing

M Sekijima, C Motono, S Yamasaki, K Kaneko, Y Akiyama

HIGH PERFORMANCE COMPUTING 2858 476-485 2003年査読有り

MISC

疾患関連変異のタンパク質構造上の三次元分布に基づく新規機能部位の探索

本野千恵, 本野千恵, 土方敦司, 広川貴次, 広川貴次, 今井賢一郎

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 45th 2022年
3次元最短経路探索法と教師付き分子動力学計算によるタンパク質-リガンド結合予測

本野千恵, 小河原惇, 五味雅裕, 佐藤美和, 広川貴次

生体分子科学討論会講演要旨集 43rd 2016年
3次元最短経路探索法を取り入れたSupervised Molecular Dynamicsによるタンパク質-リガンド結合シミュレーション

小河原惇, 本野千恵, 五味雅裕, 佐藤美和, 広川貴次

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 16th 2016年
教師付分子動力学計算を取り入れたタンパク質-リガンド結合予測

本野千恵, 小河原惇, 五味雅裕, 佐藤美和, 広川貴次

メディシナルケミストリーシンポジウム講演要旨集 33rd 2015年
Thermodynamic and kinetic determinants of Thermotoga maritima cold shock protein stability : a structural and dynamic analysis

MOTONO C.

Proteins 71 655-669 2008年
1P241 タンパク質立体構造予測パイプラインFORTE-SUITE向け網羅的モデリング・構造評価システム(生命情報科学(構造ゲノミクス),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)

本野千恵, 広川貴次, 佐藤美和, 藤原康広, 三十尾潔高, 酒谷尚文, 富井健太郎, 秋山泰

生物物理 47 S83 2007年
Large-scale identification and characterization of alternative splicing variants of human gene transcripts using 56 419 completely sequenced and manually annotated full-length cDNAs

Jun-ichi Takeda, Yutaka Suzuki, Mitsuteru Nakao, Roberto A. Barrero, Kanako O. Koyanagi, Lihua Jin, Chie Motono, Hiroko Hata, Takao Isogai, Keiichi Nagai …

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 34(14) 3917-3928 2006年
The Molecular Dynamics Simulations of the Conformational Transition of Prion Protein from its Cellular Form to the Anomalous Form using the Earth Simulator

Annual Report of the Earth Simulator Center 2004-2005 2005年
Conformational transition of Prion Protein from its cellular form to the fibril form investigated by molecular dynamics simulations

M Sekijima, C Motono, T Noguchi, K Kaneko, Y Akiyama

BIOPHYSICAL JOURNAL 88(1) 36A-36A 2005年1月
Protein structure prediction using a variety of profile libraries and 3D verification

K Tomii, T Hirokawa, C Motono

PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS 61(S7) 114-121 2005年
Large-scale analysis of human alternative protein isoforms: pattern classification and correlation with subcellular localization signals

M Nakao, RA Barrero, Y Mukai, C Motono, M Suwa, K Nakai

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 33(8) 2355-2363 2005年
プリオンタンパク質の疾病関連遺伝子置換P102Lのダイナミクスに与える影響について

関嶋政和, 本野千恵, 野口保, 金子清俊, 秋山泰

生物物理 44(Suppl.1) S122-S122 2004年11月
Structural changes in flexible region of the prion protein induced by P102L substitution: Investigation through molecular dynamics simulations

M Sekijima, C Motono, T Noguchi, K Kaneko, Y Akiyama

PROTEIN SCIENCE 13 170-170 2004年8月
The Molecular Dynamics Simulations of the Conformational Transition of Prion Protein from its Cellular Form to the Anomalous Form using the Earth Simulator

Annual Report of the Earth Simulator Center April 2003 - March 2004 171-174 2004年
Molecular dynamics simulation of dimeric and monomeric forms of human prion protein: Insight into dynamics and properties

M Sekijima, C Motono, S Yamasaki, K Kaneko, Y Akiyama

BIOPHYSICAL JOURNAL 85(2) 1176-1185 2003年8月
Human Prion Protein(Hu PrP)monomerとdimerの分子動力学シミュレーションによる解析

関嶋政和, 本野千恵, 山崎智, 金子清俊, 秋山泰

生物物理 43 S90 2003年

共同研究・競争的資金等の研究課題

疾患関連変異のタンパク質構造上の三次元分布を基点とした未知の機能部位探索法の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2024年3月

今井賢一郎, 土方敦司, 本野千恵, 足達俊吾

本野千恵

基本情報

研究分野

論文

MISC

共同研究・競争的資金等の研究課題

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