嶋田一夫 (Ichio Shimada) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院薬学系研究科機能薬学専攻生命物理化学教授

J-GLOBAL ID: 200901038623878355
researchmap会員ID: 5000099194

論文

252

In situ structural biology using in-cell NMR.

Noritaka Nishida, Yutaka Ito, Ichio Shimada

Biochimica et biophysica acta. General subjects 1864(2) 129364-129364 2020年2月査読有り
Conformational equilibrium defines the variable induction of the multidrug-binding transcriptional repressor QacR.

Takeuchi K, Imai M, Shimada I

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 2019年9月査読有り
GDP dissociation is driven by the decreased conformational stability in the oncogenic N92I mutant of RAS-related C3 botulinum toxin substrate 1

Yuki Toyama, Kenji Kontani, Toshiaki Katada, Ichio Shimada

Science Advances 5(8) eaax1595 2019年8月査読有り
Frequency selective coherence transfer NMR spectroscopy to study the structural dynamics of high molecular weight proteins.

Toyama Y, Shimada I

Journal of magnetic resonance (San Diego, Calif. : 1997) 304 62-77 2019年7月査読有り
Function-related conformational dynamics of G protein-coupled receptors revealed by NMR.

Takumi Ueda, Yutaka Kofuku, Junya Okude, Shunsuke Imai, Yutaro Shiraishi, Ichio Shimada

Biophysical reviews 11(3) 409-418 2019年6月査読有り
Structural mechanism underlying G protein family-specific regulation of G protein-gated inwardly rectifying potassium channel.

Kano H, Toyama Y, Imai S, Iwahashi Y, Mase Y, Yokogawa M, Osawa M, Shimada I

Nature communications 10(1) 2008 2019年5月1日査読有り
Conformational landscape alternations promote oncogenic activities of Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 as revealed by NMR.

Toyama Y, Kontani K, Katada T, Shimada I

Science advances 5(3) eaav8945 2019年3月査読有り
GPCR drug discovery: integrating solution NMR data with crystal and cryo-EM structures.

Ichio Shimada, Takumi Ueda, Yutaka Kofuku, Matthew T Eddy, Kurt Wüthrich

Nature reviews. Drug discovery 18(1) 59-82 2019年1月査読有り
Phosphorylation-induced conformation of β₂-adrenoceptor related to arrestin recruitment revealed by NMR.

Shiraishi Y, Natsume M, Kofuku Y, Imai S, Nakata K, Mizukoshi T, Ueda T, Iwaï H, Shimada I

Nature communications 9(1) 194 2018年12月1日査読有り
Characterization of the multimeric structure of poly(A)-binding protein on a poly(A) tail

Ryoichi Sawazaki, Shunsuke Imai, Mariko Yokogawa, Nao Hosoda, Shin-Ichi Hoshino, Muneyo Mio, Kazuhiro Mio, Ichio Shimada, Masanori Osawa

Scientific Reports 8(1) 1455 2018年12月1日査読有り
Application of C-Terminal 7-Azabicyclo[2.2.1]heptane to Stabilize β-Strand-like Extended Conformation of a Neighboring α-Amino Acid.

Zhai L, Wang S, Nara M, Takeuchi K, Shimada I, Otani Y, Ohwada T

The Journal of organic chemistry 83(21) 13063-13079 2018年11月2日査読有り
Deuteration and selective labeling of alanine methyl groups of β₂-adrenergic receptor expressed in a baculovirus-insect cell expression system.

Kofuku Y, Yokomizo T, Imai S, Shiraishi Y, Natsume M, Itoh H, Inoue M, Nakata K, Igarashi S, Yamaguchi H …

Journal of biomolecular NMR 71(3) 185-192 2018年7月査読有り
Phosphoinositide binding by the PH domain in ceramide transfer protein (CERT) is inhibited by hyperphosphorylation of an adjacent serine-repeat motif

Sugiki, Toshihiko, Egawa, Daichi, Kumagai, Keigo, Kojima, Chojiro, Fujiwara, Toshimichi, Takeuchi, Koh, Shimada, Ichio, Hanada, Kentaro, Takahashi, Hideo

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 293(28) 11206-11217 2018年7月査読有り
Endogenous Membrane Receptor Labeling by Reactive Cytokines and Growth Factors to Chase Their Dynamics in Live Cells

Yousuke Takaoka, Shohei Uchinomiya, Daichi Kobayashi, Masataka Endo, Takahiro Hayashi, Yoshiaki Fukuyama, Haruko Hayasaka, Masayuki Miyasaka, Takumi Ueda, Ichio Shimada …

Chem 4(6) 1451-1464 2018年6月14日査読有り
Functional roles of Mg²⁺ binding sites in ion-dependent gating of a Mg²⁺ channel, MgtE, revealed by solution NMR.

Maruyama T, Imai S, Kusakizako T, Hattori M, Ishitani R, Nureki O, Ito K, Maturana AD, Shimada I, Osawa M

eLife 7 2018年4月査読有り
Balanced Regulation of Redox Status of Intracellular Thioredoxin Revealed by in-Cell NMR

Ayano Mochizuki, Arata Saso, Qingci Zhao, Satoshi Kubo, Noritaka Nishida, Ichio Shimada

Journal of the American Chemical Society 140(10) 3784-3790 2018年3月14日査読有り
Studying Proteins Inside Eukaryotic Cells in NMR

Shimada Ichio

BIOPHYSICAL JOURNAL 114(3) 399A 2018年2月2日査読有り
Nuclear magnetic resonance approaches for characterizing protein-protein interactions

Yuki Toyama, Yoko Mase, Hanaho Kano, Mariko Yokogawa, Masanori Osawa, Ichio Shimada

Methods in Molecular Biology 1684 115-128 2018年査読有り
Structural basis for the ethanol action on G-protein-activated inwardly rectifying potassium channel 1 revealed by NMR spectroscopy

Yuki Toyama, Hanaho Kano, Yoko Mase, Mariko Yokogawa, Masanori Osawa, Ichio Shimada

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 115(15) 3858-3863 2018年査読有り
A small-molecule compound inhibits a collagen-specific molecular chaperone and could represent a potential remedy for fibrosis

Shinya Ito, Koji Ogawa, Koh Takeuchi, Motoki Takagi, Masahito Yoshida, Takatsugu Hirokawa, Shoshiro Hirayama, Kazuo Shin-ya, Ichio Shimada, Takayuki Doi …

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 292(49) 20076-20085 2017年12月査読有り

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MISC

分子夾雑系での構造生物学 : in-cell NMR法による細胞内分子反応のリアルタイム観測 (特集分子夾雑化学 : 生命の理解・制御を加速する新しいコンセプト)

西田紀貴, 嶋田一夫

化学と工業 = Chemistry & chemical industry 72(5) 404-406 2019年5月
NMRを用いたG蛋白質共役型受容体の機能制御メカニズムの解析

上田卓見, 嶋田一夫

生物物理 59(4) 181-187 2019年
NMRで標的タンパク質の機能から創薬を (特集いかに創薬を進めるか)

上田卓見, 嶋田一夫

生体の科学 69(4) 315-319 2018年7月
核磁気共鳴法による膜タンパク質の機能に直結した動的構造平衡の解明 (第5土曜特集生命現象を観る : 革新的な構造生命科学が観せてくれる世界) -- (NMR(核磁気共鳴))

上田卓見, 嶋田一夫

医学のあゆみ 262(5) 443-453 2017年7月29日
NMR法による膜蛋白質の機能に直結した動的構造平衡の解明

上田卓見, 幸福裕, 嶋田一夫

Annual report = 低温センター年次報告 (9) 17-22 2017年
新規多次元NMRスペクトル再構成法の開発とGPCR研究への応用

上田卓見, 吉浦知絵, 幸福裕, 松本昌彦, 奥出順也, 近藤啓太, 白石勇太郎, 竹内恒, 嶋田一夫

Annual report = 低温センター年次報告 (7) 22-26 2015年
NMR法により明らかとなるタンパク質複合体の機能的運動性

竹内恒, 嶋田一夫

NMR : bulletin of the Nuclear Magnetic Resonance Society of Japan 5 83-89 2014年
2SBP-05 G タンパク質共役型内向き整流性カリウムイオンチャネル1(GIRK1)のG タンパク質による機能調節の構造基盤(シグナル伝達機構における構造細胞生物学的新展開,新学術領域研究「細胞シグナリング複合体によるシグナル検知・伝達・応答の構造的基礎」共催,シンポジウム,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

大澤匡範, 間瀬瑤子, 横川真梨子, 竹内恒, 嶋田一夫

生物物理 54(1) S131 2014年
NMR法を用いたGタンパク質共役型受容体の評価と機能解明

幸福裕, 上田卓見, 嶋田一夫

ファルマシア 50(5) 413-417 2014年
生細胞内での生命現象を観測するin-cell NMR技術の開発と応用 (特集バイオNMR : 細胞内分子の真の動的構造と相互作用を明らかにする) -- (In-cell NMR)

西田紀貴, 嶋田一夫

細胞工学 33(8) 825-829 2014年
巨大膜蛋白質と水溶性蛋白質との相互作用の解析-植物光合成の系への適用-

上田卓見, 嶋田一夫

生物物理 53(6) 301-304 2013年11月25日
溶液NMR法による膜タンパク質の機能調節メカニズムの解明

大澤匡範, 今井駿輔, 竹内恒, 嶋田一夫

生物物理 53(5) 236-241 2013年9月25日
NMRによる、光合成明反応膜蛋白質とプラストシアニンの電子輸送機構の解明

上田卓見, 嶋田一夫

Annual report = 低温センター年次報告 (5) 8-13 2013年
2SBP-03 ゲル包埋型バイオリアクターを用いた生細胞内蛋白質間相互作用のNMR観測(2SBP 新学術領域「過渡的複合体が関わる生命現象の統合的理解」共催,過渡的複合体が関わる生命現象の統合的理解,シンポジウム,日本生物物理学会第51回年会(2013年度))

西田紀貴, 嶋田一夫

生物物理 53(1) S97 2013年
動的構造解析による膜タンパク質の機能解明 (特集先端的異分野融合を核とした構造生命科学の飛躍に向けて)

嶋田一夫

学術の動向 : SCJフォーラム 17(12) 40-42 2012年12月
動的構造解析による膜タンパク質の機能解明

嶋田一夫

学術の動向 17(12) 12_40-12_42 2012年
NMR法を用いたタンパク質の構造解析のためのランタニド導入法の発展

徳永裕二, 嶋田一夫

分光研究 = Journal of the spectroscopical research of Japan 59(1) 22-23 2010年2月15日
ソフトな相互作用による膜インターフェイスの機能制御

阿久津秀雄, 嶋田一夫, 白川昌宏

生化學 80(10) 2008年10月25日
ＮＭＲによる膜タンパク質・リガンド相互作用解析

嶋田一夫

日本プロテオーム学会大会要旨集 2007 39-39 2007年
細胞内セラミド輸送分子CERTの機能メカニズムの構造生物学的解析

杉木俊彦, 寺沢宏明, 熊谷圭悟, 花田賢太郎, 酉島正弘, 嶋田一夫

脂質生化学研究 48 187-190 2006年6月8日

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