黒川理樹 (Riki KUROKAWA) - マイポータル

基本情報

所属: 埼玉医科大学医学部ゲノム基礎医学教授

学位: 理学修士(東京大学)
理学博士(東京大学)

研究者番号: 70170107
J-GLOBAL ID: 200901059193852214
researchmap会員ID: 5000100128

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 分子生物学 /

委員歴

2018年2月 - 現在

カリフォルニア大学サンディエゴ校医学部外部評価委員, 外部評価委員
2017年6月 - 現在

認定ＮＰＯ法人日本ホルモンステーション, 評議委員
2016年4月 - 現在

日本内分泌学会, 評議員
2008年4月 - 現在

日本国際賞推薦委員, 日本国際賞受賞候補者の推薦
2015年8月 - 2016年7月

特別研究員等審査会専門委員及び国際事業委員会書面審査員・書面評価員, 専門委員及び書面審査員・書面評価員
2014年8月 - 2015年7月

特別研究員等審査会専門委員及び国際事業委員会書面審査員・書面評価員, 専門委員及び書面審査員・書面評価員
2011年12月 - 2012年11月

科学研究費委員会専門委員, 専門委員
2011年12月 - 2012年11月

科学研究費新学術領域研究専門委員会専門委員主査, 主査
2010年12月 - 2011年11月

科学研究費委員会専門委員, 専門委員
2009年12月 - 2010年11月

科学研究費新学術領域研究専門委員会専門委員, 専門委員

受賞

1993年6月

Nichols Institute New Investigator Award(アメリカ内分泌学会)
1990年10月

第2回学会賞(歯科基礎医学会)
1990年6月

第2回小原賞(岩手医科大学)

論文

130

Identification of Long Noncoding RNA Recognized by RNA-Binding Protein TLS/FUS: Purification of RNAs by Affinity Chromatography of GST-TLS

Naomi Ueda, Ryoma Yoneda, Riki Kurokawa

Biomedical Sciences 8(4) 144-156 2022年12月15日査読有り責任著者
Potential Inhibitor Against Phase Separation, 1,6-hexanediol Specifically Binds to Beta Actin in Nuclear Extract of Human Cell Line

Naomi Ueda, Yuki Hirose, Ryoma Yoneda, Toshikazu Bando, Riki Kurokawa

Biomedical Sciences 6 88-97 2020年11月4日査読有り責任著者
Direct visualization of the conformational change of FUS/TLS upon binding to promoter-associated non-coding RNA

Nesreen Hamad, Hiroki Watanabe, Takayuki Uchihashi, Riki Kurokawa, Takashi Nagata and Masato Katahira

Chemical communications (Cambridge, England) 56 9134-9137 2020年7月3日査読有り
RNA sequence and length contribute to RNA-induced conformational change of TLS/FUS

Nesreen Hamad, Tsukasa Mashima, Yudai Yamaoki, Keiko Kondo, Ryoma Yoneda, Takanori Oyoshi, Riki Kurokawa, Takashi Nagata, Masato Katahira

Scientific reports of the Istituto superiore di sanità 10 2629 2020年2月14日査読有り
ヘテロクロマチン形成の分子機構ヌクレオソームコアの柔軟性と相分離

黒川理樹

実験医学 38(4) 572-574 2020年2月招待有り
Versatile Regulator or Integrator RNA-binding Protein TLS/FUS Works for Phase Separation on Regulation of the Human Genome - In Relation to Liposarcoma and ALS

Riki Kurokawa

Biomedical Sciences 6(1) 5-16 2020年2月査読有り
Versatility of RNA-Binding Proteins in Living Cells

Kurokawa, R*., Takeuchi, A., Shiina, N., Katahira, M., Yamashita, T. …

Biomedical Sciences 5(1) 7-13 2019年8月査読有り
相分離が細胞核の変動を感知してゲノムを再構成する核質の凝縮が遺伝子制御の原動力となる

黒川理樹

実験医学 37(4) 547-549 2019年3月招待有り
Conference&Workshop開催しましたNo.3 創設者の想いを継いで、ゲノム医学の未来を拓く

黒川理樹

実験医学 37(1) 122-125 2019年1月招待有り
Affinity Profiles Categorize RNA-Binding Proteins into Distinctive Groups

Naomi Ueda, Riki Kurokawa

Biomedical Sciences 4(3) 24-31 2018年11月査読有り最終著者
タンパク質の相分離が長期記憶を形成する分子機構

黒川理樹

実験医学 36(14) 2364-2366 2018年9月招待有り
Multiplicity in Long Noncoding RNA in Living Cells

Kurokawa, R*., Komiya, R., Oyoshi, T., Matsuno, Y., Tani, H. …

Biomedical Sciences 4(2) 18-23 2018年8月査読有り
Arginine methylation of translocated in liposarcoma (TLS) inhibits its binding to long noncoding RNA, abrogating TLS-mediated repression of CBP/p300 activity.

Cui, W., Yoneda, R., Ueda, N., and Kurokawa, R.

Journal of Biological Chemistry 293(28) 10937-10948 2018年5月査読有り
タンパク質凝集の検出とプリオン形質の制御を可能にする遺伝的手法の開発

黒川理樹

実験医学 36(3) 399-401 2018年2月筆頭著者
Plastic roles of phenylalanine and tyrosine residues of TLS/FUS in complex formation with the G-quadruplexes of telomeric DNA and TERRA.

Kondo, K., Mashima, T., Oyoshi, T., Yagi, R., Kurokawa, R. …

Scientific Reports 8(2864) 2018年2月査読有り
ヒストンＨ３のメチル化抑制が脂質代謝を介して線虫を長寿にする

黒川理樹

実験医学 35(14) 2372-2374 2017年9月筆頭著者
Biotin-Lys-His Blocks Aggregation of RNA-binding Protein TLS, a Cause of Amyotrophic Lateral Sclerosis.

Ueda, N., Kashiwazaki, G., Bando, T., and Kurokawa, R.

Biomedical Sciences 3(4) 67-77 2017年9月査読有り責任著者
私のメンター～受け継がれる研究の心～第38回Christopher K. Glass Frontier Spiritを秘めた紳士

黒川理樹

実験医学 35(13) 2302-2306 2017年8月筆頭著者
tRNA脱メチル化酵素による翻訳制御の発見―グルコース濃度により翻訳を制御する仕組み

黒川理樹

実験医学 35(3) 439-440 2017年2月筆頭著者
遺伝子の転写にはトポイソメラーゼ1によるDNAねじれの解消が必要だった

黒川理樹

実験医学 34(11) 1766-1767 2016年7月筆頭著者

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書籍等出版物

Long Noncoding RNAs: Structures and Functions In: Kurokawa,R. (eds.)

Kurokawa, R.

Springer-Japan 2015年7月
,Long Noncoding RNAs: Structures and Functions In: Kurokawa,R. (eds.)

Kurokawa, R.

Springer-Japan 2015年7月
Long Noncoding RNAs: Structures and Functions In: Kurokawa,R. (eds.)

Kurokawa, R

Springer-Japan 2015年7月
Generation of functional long noncoding RNA through transcription and natural selection. In: Mallick, B. (eds.),Regulatory RNAs

Kurokawa, R.

Springer Berlin Heidelberg 2012年1月
Promoter-associated noncoding RNA from the CCND1 promoter. In: Vancura, A. (ed),Transcriptional Regulation: Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology

Song, X., Wang, X., Arai, S., and Kurokawa, R.

Human Press, New York, USA 2012年1月
Promoter-associated noncoding RNA from the CCND1 promoter. In: Vancura, A. (ed) Transcriptional Regulation: Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology

Song, X, Wang, X, Arai, S, Kurokawa, R

Human Press, New York, USA 2012年1月
Generation of functional long noncoding RNA through transcription and natural selection. In: Mallick, B. (eds.) Regulatory RNAs

Kurokawa, R

Springer Berlin Heidelberg 2012年1月
Promoter-associated long noncoding RNAs repress transcription through a RNA binding protein TLS. In: Collins, L.J. (ed),RNA Infrastructure and Networks: Advances in Experimental Medicine and Biology

Kurokawa, R.

Springer New York, USA 2011年7月
Promoter-associated long noncoding RNAs repress transcription through a RNA binding protein TLS. In: Collins, L.J. (ed) RNA Infrastructure and Networks: Advances in Experimental Medicine and Biology

Kurokawa, R

Springer New York, USA 2011年7月
CREB Binging Protein-coactivator complexes. In: Conn, P.M. and Means, A.R. (eds),Handbook of Cell Signaling

Kurokawa, R., and Glass, C.K.

Elsevier Science, USA 2003年
CREB Binging Protein-coactivator complexes. In: Conn, P.M. and Means, A.R. (eds) Handbook of Cell Signaling

Kurokawa, R, Glass, C.K

Elsevier Science, USA 2003年
CREB Binging Protein-coactivator complexes. In: Conn, P.M. and Means, A.R. (eds),Molecular Regulation.

Kurokawa, R., and Glass, C.K.

The Humana Press, New Jersey 2000年
CREB Binging Protein-coactivator complexes. In: Conn, P.M. and Means, A.R. (eds) Molecular Regulation.

Kurokawa, R, Glass, C.K

The Humana Press, New Jersey 2000年

講演・口頭発表等

Quest for novel long non-coding RNAs with inhibitory activity against phase separation

黒川理樹

第45回分子生物学会年会 2022年12月2日
Transcription regulatory lncRNA represses phase separation of TLS/FUS-Molecular linkage of lncRNA to phase separation by TLS in cellular functions-

黒川理樹

第44回日本分子生物学会年会 2021年12月
相分離・凝集体形成の抑制因子1,6-hexanediolの作用機構と生理的意義の解明

黒川理樹

第43回日本分子生物学会年会 2020年12月
多機能分子TLS/FUS-脂肪肉腫の融合遺伝子、家族性ALSの原因遺伝子、そして、相分離の中心的分子としての役割

黒川理樹

第42回日本分子生物学会年会 2019年12月5日
家族性ALSの原因遺伝子産物TLS/FUSの凝集を抑える分子BLH

黒川理樹

第17回RCGMフロンティアシンポジウム～基礎研究から臨床医学への飛翔～ 2019年9月14日
Arginine methylation of RNA binding protein TLS inhibits binding to long noncoding RNA, repressing the histone acetyltransferase activity.

Kurokawa, R.

Keystone Symposia 2019年2月26日
Arginine methylation of RNA binding protein TLS inhibits binding to long noncoding RNA, repressing the histone acetyltransferase activity アルギニンメチル化によるRNA結合タンパク質TLS機能の制御機構

黒川理樹

第41回日本分子生物学会年会 2018年11月28日
腫瘍増殖を制御する長鎖非コードRNAの作用機構と核酸医薬への応用

黒川理樹

第1回埼玉医科大学研究ブランディングシンポジウム 2018年9月8日
長鎖非コードRNAの生理機能を実験的に検証する

黒川理樹

第40回日本分子生物学会年会ワークショップ 2017年12月6日
メチル化シグナルによる非コードRNA機能のグローバルな制御機構の解明

黒川理樹

第15回RCGMフロンティアシンポジウム「疾患解析技術が拓く未来の医療」 2017年12月2日
長鎖非コードRNA研究はunmet needsを満たせるのか？

黒川理樹

"未来へのバイオ技術" 勉強会「長鎖非コードRNA研究の進歩と可能性」 2017年11月27日招待有り
長鎖非コードRNAの生理機能と内分泌疾患-lncRNA研究は日常臨床に役立つのか?-

黒川理樹

第90回日本内分泌学会学術総会 2017年4月20日
Elucidation of structure and function of low-molecular weight compounds co-crystallization with RNA binding proteins with in silico analysis

黒川理樹

第39回日本分子生物学会年会 2016年12月1日
Function of noncoding RNA binding protein in the human genome

◎(黒川理樹)

第14回RCGMフロンティア国際シンポジウム「幹細胞とがん細胞の共通点から未来医療を考える」 2016年11月12日
特異的結合タンパク質の解析から長鎖非コードRNAの機能を探索する

第38回日本分子生物学会年会 2015年12月2日
長鎖非コードRNA機能とRNA結合タンパク質

◎(黒川理樹)

第13回RCGMフロンティアシンポジウム「ゲノム医学が拓く疾患研究の新境地」 2015年10月31日
Emerging study on long noncoding RNA epigenetics

◎(黒川理樹)

第12回RCGMフロンティア国際シンポジウム「ゲノム医学の進歩と次世代技術」 2014年11月1日
Transcriptional regulation by the long non-coding RNA transcribed from cyclin D1 promoter via protein arginine methylation of RNA-biding protein TLS.

◎Fujimoto, K., Suzuki, S., (Kurokawa, R.)

IIAS Research Conference 2014 Chromatin Decoding 2014年5月13日
Long noncoding RNAによる遺伝子発現制御

黒川理樹

第51回日本臨床分子医学会学術集会シンポジウム 2014年4月11日招待有り
Mechanism of Transcription of Long Noncoding RNA.

◎(Kurokawa, R.)

Keystone Symposia 2014年3月1日

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所属学協会

2017年4月 - 現在

日本ホルモンステーション
2004年4月 - 現在

日本分子生物学会
1992年6月 - 現在

アメリカ内分泌学会
1986年4月 - 現在

日本癌学会
1984年4月 - 現在

歯科基礎医学会
1984年4月 - 現在

日本生化学会
1984年4月 - 現在

日本内分泌学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

長鎖非コードRNAによるTLS相分離を介した新規の転写抑制機構の解明

2022年度基盤研究（C）一般 2022年4月
RNA結合タンパク質TLSのメチルグリオキサール修飾により生成する最終糖化産物AGEが誘導する糖尿病性神経症の発症機構の研究

第一三共株式会社第一三共奨学寄付プログラム第一三共奨学寄付プログラム 2021年4月 - 2022年3月
核磁気共鳴分光法を用いた相分離阻害の分子機構の解析と生理的意義の解明

京都大学エネルギー理工学研究所ゼロエミッションエネルギー研究拠点 2021年4月 - 2022年3月
RNA結合タンパク質TLSの糖化による糖尿病性神経障害の発症機構の研究

第一三共株式会社第一三共奨学寄付プログラム 2020年10月 - 2021年3月

黒川理樹
RNA結合タンパク質TLSの糖化による糖尿病性神経障害の発症機構の研究

2020年10月 - 2021年3月
核磁気共鳴分光法を用いた相分離阻害剤によるRNA結合タンパク質の構造変化の解析

京都大学エネルギー理工学研究所ゼロエミッションエネルギー研究拠点 2020年4月 - 2021年3月

黒川理樹
腫瘍増殖を抑制する長鎖非コードRNAから核酸医薬品を開発する基礎研究

第一三共株式会社第一三共奨学寄付プログラム 2019年10月 - 2020年3月

黒川理樹
アルギニンメチル化による長鎖非コードRNAのグローバルな制御機構の解明

学内グラント奨励 2018年5月 - 2019年3月
アルギニンメチル化による長鎖非コードRNAのグローバルな制御機構の解明

学内グラント 2017年9月 - 2018年8月
アルギニンメチル化による長鎖非コードRNA結合の抑制と生理的意義の解明

文部科学省基盤研究（C） 2018年4月 - 2021年3月

(◎黒川理樹)
長鎖非コードRNAの薬効配列を核酸医薬品へ応用する基礎的な研究

第一三共株式会社第一三共奨学寄付プログラム 2017年10月 - 2018年3月

(◎黒川理樹)
次世代医療を指向するゲノム医学総合研究拠点の創生と展開

文部科学省平成25年度私立大学戦略的研究基盤形成支援事業 2013年4月 - 2018年3月
長鎖非コードRNAによる腫瘍増殖抑制の解析と核酸医薬への応用

第一三共株式会社第一三共奨学寄付プログラム 2016年10月 - 2017年3月

(◎黒川理樹)
メチル化シグナルによる長鎖非コードRNA機能の発現機構の解明

文部科学省基盤研究（B）基盤研究(B) 2013年4月 - 2016年3月

黒川理樹, 藤本健太, 松下明生, 小川純人
筋萎縮性側索硬化症原因遺伝子TLSのメチル化異常による発症機構の解明と治療法開発

文部科学省挑戦的萌芽研究 2011年4月 - 2013年3月
非コードＲＮＡの転写機構の解明

文部科学省基盤研究（B） 2010年4月 - 2013年3月
ゲノム医学を基盤とした疾患の診断・治療標的の包括的解明と臨床応用への総合研究拠点

文部科学省平成20年度私立大学戦略的研究基盤形成支援事業 2008年4月 - 2013年3月
非コードRNA依存性転写制御機構の解析

財)内藤記念科学振興財団第37回内藤記念特定研究助成金 2008年12月 - 2010年3月
転写抑制性非コードRNAの機能解析

財)内藤記念科学振興財団第40回内藤記念科学奨励金(研究助成) 2008年12月 - 2010年3月
エストロゲン受容体機能を制御する非コードRNAの解析

財)病態代謝研究会研究助成金 2008年12月 - 2010年3月

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産業財産権

特願2013-099962 抗ＴＬＳモノクローナル抗体及びその製造方法、ハイブリドーマ及びその製造方法、並びに抗ＴＬＳモノクローナル抗体含有組成物

黒川理樹, 藤本健太

学術貢献活動

N6-methyladenosine reader RBMX is essential for motor cortex excitatory neuron survival in amyotrophic lateral sclerosis

査読

2023年9月16日 - 2023年9月19日
A small de novo CNV deletion of the paternal copy of FOXF1, leaving lncRNA FENDRR intact, provides insight into their bi-directional promoter region

査読

2023年9月15日 - 2023年9月16日
Transfer Learning allows accurate RBP target site prediction with limited sample sizes

査読

2023年8月19日 - 2023年8月21日
RNA BINDING PROPERTIES OF SOX FAMILY MEMBERS

査読

2023年5月15日 - 2023年5月16日
NanoLuc luciferase as fluorogen-activating protein for GFP chromophore based fluorogens

査読

2023年3月28日 - 2023年3月29日
Characterization of platelet-related genes and constructing signature combined with immune-related genes for predicting outcomes and immunotherapy response in lung squamous cell carcinoma

査読

2023年3月28日 - 2023年3月28日
LncRNA ABHD11-AS1 activates EGFR signaling to promote cervical cancer progression by preventing FUS-mediated degradation of ABHD11 mRNA

査読

2023年3月13日 - 2023年3月14日
Deciphering the Prognostic and Therapeutic Significance of Cell Cycle Regulator CENPF: a Dual Biomarker of Prognosis and Immune Microenvironment for Liposarcoma Patients

査読

2023年2月11日 - 2023年2月12日
Studies on the proteinaceous structure present on the surface of the Saccharomyces cerevisiae spore wall

査読

2023年1月6日 - 2023年1月9日
Optimization of Biotinylated RNA or DNA Pull-down Assays for Detection of Binding Proteins: Examples of IRP1, IRP2, HuR, AUF1, and Nrf2

査読

2022年12月22日 - 2022年12月23日
CircAFF1 is a circular RNA with a role in alveolar rhabdomyosarcoma cell migration

査読

2022年11月15日 - 2022年11月16日
ILF3 prion-like domain regulates gene expression and fear memory under chronic stress

査読

2022年10月28日 - 2022年10月29日
The dynamic poly(A) tail acts as a signal hub in mRNA metabolism

査読

2022年10月27日 - 2022年10月28日
Pathogenic Roles of RNA Binding Proteins in Sarcomas

査読

2022年7月25日 - 2022年7月26日
The multivalent polyampholyte domain of Nst1, a P-body-associated Saccharomyces cerevisiae protein, provides a platform for interacting with P-body components

査読, その他

2022年5月30日 - 2022年6月1日
Long noncoding RNAs as orchestrators of CD4 + T-cell fate

査読, その他

2022年4月21日 - 2022年4月23日

社会貢献活動

Biomedical Sciences Editor-in-Chief

その他

2015年4月 - 現在
Pathogenic Roles of RNA Binding Proteins in Sarcomas Review

編集, その他

Cancers 2022年7月23日 - 2022年7月25日
International Journal of Molecular Sciences review

その他

2022年5月31日 - 2022年6月1日
Frontiers in Cell and Developmental Biology Review

その他

2022年4月21日 - 2022年4月21日
Poly(ADP-ribosyl)ation inhibition: a promising approach for ccRCC therapy review

その他

Cancer 2021年8月10日 - 2021年8月10日
Aberrant phase separation of FUS leads to lysosome sequestering and acidification review

その他

Frontiers in Cell and Developmental Biology, section Signaling 2021年8月5日 - 2021年8月5日
The Journal of Biochemistry

その他

2021年5月6日 - 2021年5月7日
Aging

その他

2020年11月23日 - 2020年11月29日
Aging

その他

2020年9月28日 - 2020年10月5日
Aging

その他

2020年5月22日 - 2020年5月29日
Aging review

その他

2020年2月17日 - 2020年2月21日
学位論文審査・副査

その他

2020年2月
Transcription review

その他

2019年8月
Aging review

その他

2019年4月
BioMed Research International review

その他

2018年7月
The Journal of Biochemistry review

その他

2017年11月
Biochemistry (Moscow) review

その他

2017年9月
Biochemistry (Moscow) review

その他

2017年9月
OMICS review

その他

2016年1月
BBA review

その他

2015年7月

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メディア報道

Pathogenic Roles of RNA Binding Proteins in Sarcomas Review

Cancers 2022年7月23日新聞・雑誌